Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6340
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6340, 352 aa
1>>>pF1KE6340 352 - 352 aa - 352 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1975+/-0.000938; mu= 12.0286+/- 0.056
mean_var=95.0170+/-19.189, 0's: 0 Z-trim(107.9): 181 B-trim: 65 in 1/49
Lambda= 0.131575
statistics sampled from 9675 (9886) to 9675 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.679), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16
Scan time: 2.230
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9037.1 KERA gene_id:11081|Hs108|chr12 ( 352) 2381 462.3 2.8e-130
CCDS1438.1 PRELP gene_id:5549|Hs108|chr1 ( 382) 1247 247.0 1.9e-65
CCDS30976.1 FMOD gene_id:2331|Hs108|chr1 ( 376) 813 164.6 1.2e-40
CCDS6696.1 OMD gene_id:4958|Hs108|chr9 ( 421) 807 163.5 2.9e-40
CCDS9038.1 LUM gene_id:4060|Hs108|chr12 ( 338) 747 152.1 6.4e-37
CCDS55602.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 642) 500 105.4 1.4e-22
CCDS573.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 661) 500 105.4 1.4e-22
CCDS54226.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19 ( 510) 472 100.0 4.7e-21
CCDS12300.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19 ( 512) 472 100.0 4.7e-21
CCDS56578.1 ECM2 gene_id:1842|Hs108|chr9 ( 643) 445 94.9 2e-19
CCDS6698.1 ECM2 gene_id:1842|Hs108|chr9 ( 699) 445 94.9 2.1e-19
CCDS14721.1 BGN gene_id:633|Hs108|chrX ( 368) 425 91.0 1.7e-18
CCDS55601.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 ( 519) 382 82.9 6.6e-16
CCDS8057.1 FLRT1 gene_id:23769|Hs108|chr11 ( 674) 382 83.0 8.1e-16
CCDS54225.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19 ( 421) 365 79.6 5.2e-15
CCDS13121.1 FLRT3 gene_id:23767|Hs108|chr20 ( 649) 365 79.7 7.4e-15
CCDS11568.1 CHAD gene_id:1101|Hs108|chr17 ( 359) 341 75.0 1.1e-13
CCDS9877.1 FLRT2 gene_id:23768|Hs108|chr14 ( 660) 344 75.8 1.2e-13
CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs108|chr7 ( 653) 341 75.2 1.7e-13
CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs108|chr19 ( 713) 338 74.6 2.8e-13
CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 335 74.1 5.2e-13
CCDS46715.1 CHADL gene_id:150356|Hs108|chr22 ( 762) 331 73.3 7.4e-13
CCDS58930.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 724) 309 69.1 1.3e-11
CCDS43276.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 757) 309 69.1 1.3e-11
CCDS75204.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 784) 309 69.2 1.4e-11
>>CCDS9037.1 KERA gene_id:11081|Hs108|chr12 (352 aa)
initn: 2381 init1: 2381 opt: 2381 Z-score: 2452.3 bits: 462.3 E(32554): 2.8e-130
Smith-Waterman score: 2381; 100.0% identity (100.0% similar) in 352 aa overlap (1-352:1-352)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAGTICFIMWVLFITDTVWSRSVRQVYEVHDSDDWTIHDFECPMECFCPPSFPTALYCEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MAGTICFIMWVLFITDTVWSRSVRQVYEVHDSDDWTIHDFECPMECFCPPSFPTALYCEN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RGLKEIPAIPSRIWYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 RGLKEIPAIPSRIWYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 KKLLFLFLEDNELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 KKLLFLFLEDNELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NAFQRDTFKGLKNLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 NAFQRDTFKGLKNLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FLRLNHNKLSDEGLPSRGFDVSSILDLQLSHNQLTKVPRISAHLQHLHLDHNKIKSVNVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 FLRLNHNKLSDEGLPSRGFDVSSILDLQLSHNQLTKVPRISAHLQHLHLDHNKIKSVNVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE6 VICPSPSMLPAERDSFSYGPHLRYLRLDGNEIKPPIPMALMTCFRLLQAVII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VICPSPSMLPAERDSFSYGPHLRYLRLDGNEIKPPIPMALMTCFRLLQAVII
310 320 330 340 350
>>CCDS1438.1 PRELP gene_id:5549|Hs108|chr1 (382 aa)
initn: 1419 init1: 740 opt: 1247 Z-score: 1288.4 bits: 247.0 E(32554): 1.9e-65
Smith-Waterman score: 1247; 57.3% identity (84.8% similar) in 316 aa overlap (41-352:72-382)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 VLFITDTVWSRSVRQVYEVHDSDDWTIHDFECPMECFCPPSFPTALYCENRGLKEIPAIP
.:: ::.:::.::.::::..:.:...:.::
CCDS14 PTPSFPQPDEPAEPTDLPPPLPPGPPSIFPDCPRECYCPPDFPSALYCDSRNLRKVPVIP
50 60 70 80 90 100
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 SRIWYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQLKKLLFLFLED
:: :::::::.: .: . :.::: ::::::..:.: . :.. .: .: :.::..:
CCDS14 PRIHYLYLQNNFITELPVESFQNATGLRWINLDNNRIRK--IDQRVLEKLPGLVFLYMEK
110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 NELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVDNAFQRDTFKG
:.:::::: :::.::::.:..:..:::: :.::.:::: :::::.:.: :..:. :::.:
CCDS14 NQLEEVPSALPRNLEQLRLSQNHISRIPPGVFSKLENLLLLDLQHNRLSDGVFKPDTFHG
160 170 180 190 200 210
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 LKNLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVAFLRLNHNKLS
::::::::.:.: ::.::::.:. ::.::.:.:: ::..::. .:..::.:::.:::.
CCDS14 LKNLMQLNLAHNILRKMPPRVPTAIHQLYLDSNKIETIPNGYFKSFPNLAFIRLNYNKLT
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 DEGLPSRGFDVSSILDLQLSHNQLTKVPRISAHLQHLHLDHNKIKSVNVSVICPSPSMLP
:.:::. .:..:..: :.::::....:: :. .:.::.:..:.:...: . :::. :
CCDS14 DRGLPKNSFNISNLLVLHLSHNRISSVPAINNRLEHLYLNNNSIEKINGTQICPND--LV
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350
pF1KE6 AERDSFSYG----PHLRYLRLDGNEIKPPIPMALMTCFRLLQAVII
: .: :: ::::::::::: .:::::. :: ::::::.:.:
CCDS14 AFHD-FSSDLENVPHLRYLRLDGNYLKPPIPLDLMMCFRLLQSVVI
340 350 360 370 380
>>CCDS30976.1 FMOD gene_id:2331|Hs108|chr1 (376 aa)
initn: 889 init1: 492 opt: 813 Z-score: 843.3 bits: 164.6 E(32554): 1.2e-40
Smith-Waterman score: 865; 41.9% identity (75.4% similar) in 313 aa overlap (41-352:75-376)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 VLFITDTVWSRSVRQVYEVHDSDDWTIHDFECPMECFCPPSFPTALYCENRGLKEIPAIP
.::.:: :::.::::.::.::.:: .: .:
CCDS30 YPYETYEPYPYGVDEGPAYTYGSPSPPDPRDCPQECDCPPNFPTAMYCDNRNLKYLPFVP
50 60 70 80 90 100
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 SRIWYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQLKKLLFLFLED
::. :.:.::: : .: : :.::: : :: :. :.::. . . ..:.:..: :.:.
CCDS30 SRMKYVYFQNNQITSIQEGVFDNATGLLWIALHGNQITSDKVGRKVFSKLRHLERLYLDH
110 120 130 140 150 160
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 NELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVDNAFQRDTFKG
:.: ..:.::::::..:.: .:..::.:.... .::::: : ::.:.. . . ....:
CCDS30 NNLTRMPGPLPRSLRELHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHNEIQEVG---SSMRG
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 LKNLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVAFLRLNHNKLS
:..:. :... : ::..: ::. ::....:.. .:..:: ::. ..::.::.:.
CCDS30 LRSLILLDLSYNHLRKVPDGLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFRGAPKLLYVRLSHNSLT
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 DEGLPSRGFDVSSILDLQLSHNQLTKVPRISAHLQHLHLDHNKIKSVNVSVICPSPSMLP
..:: : :. ::.:.:.::.::: :.: ....:..:.:. :.:. ..: .: ...
CCDS30 NNGLASNTFNSSSLLELDLSYNQLQKIPPVNTNLENLYLQGNRINEFSISSFCTVVDVV-
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350
pF1KE6 AERDSFSYGPHLRYLRLDGNEIK-PPIPMALMTCFRLLQAVII
.:: .:. ::::::::: .: :.:: . . :
CCDS30 ----NFS---KLQVLRLDGNEIKRSAMPADAPLCLRLASLIEI
350 360 370
>>CCDS6696.1 OMD gene_id:4958|Hs108|chr9 (421 aa)
initn: 1011 init1: 670 opt: 807 Z-score: 836.4 bits: 163.5 E(32554): 2.9e-40
Smith-Waterman score: 866; 44.0% identity (73.1% similar) in 309 aa overlap (42-350:62-360)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 LFITDTVWSRSVRQVYEVHDSDDWTIHDFECPMECFCPPSFPTALYCENRGLKEIPAIPS
: ::::: .::...::.:: :: :: ::
CCDS66 DQEPDDDYQTGFPFRQNVDYGVPFHQYTLGCVSECFCPTNFPSSMYCDNRKLKTIPNIPM
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 RIWYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQLKKLLFLFLEDN
.: :::: : ::.. . : :::.:. :::..::: . :. :....: .:: : :: :
CCDS66 HIQQLYLQFNEIEAVTANSFINATHLKEINLSHNKIKSQKIDYGVFAKLPNLLQLHLEHN
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 ELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVDNAFQRDTFKGL
.::: : :::.:::.: :. :..:.. .....: :::.::: : : :. .. : .
CCDS66 NLEEFPFPLPKSLERLLLGYNEISKLQTNAMDGLVNLTMLDLCYNYLHDSLLKDKIFAKM
160 170 180 190 200 210
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 KNLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVAFLRLNHNKLSD
..:::::. .: :..::: ::.. : : :.:::: .:::.::. .::. ::..::::.:
CCDS66 EKLMQLNLCSNRLESMPPGLPSSLMYLSLENNSISSIPEKYFDKLPKLHTLRMSHNKLQD
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 EGLPSRGFDVSSILDLQLSHNQLTKVPRISAHLQHLHLDHNKIKSVNVSVICPSPSMLPA
.: :.. .:..:...::.: .. : .:.::.:..:.:...:..:.:::
CCDS66 --IPYNIFNLPNIVELSVGHNKLKQAFYIPRNLEHLYLQNNEIEKMNLTVMCPSI-----
280 290 300 310 320
320 330 340 350
pF1KE6 ERDSFSYGPHLRYLRLDGNEIKPPIPMALMTCFRLLQAVII
: . : :: :.:.: :..: :: .. :: ....
CCDS66 --DPLHYH-HLTYIRVDQNKLKEPISSYIFFCFPHIHTIYYGEQRSTNGQTIQLKTQVFR
330 340 350 360 370 380
CCDS66 RFPDDDDESEDHDDPDNAHESPEQEGAEGHFDLHYYENQE
390 400 410 420
>>CCDS9038.1 LUM gene_id:4060|Hs108|chr12 (338 aa)
initn: 757 init1: 370 opt: 747 Z-score: 776.3 bits: 152.1 E(32554): 6.4e-37
Smith-Waterman score: 790; 39.4% identity (74.0% similar) in 312 aa overlap (42-352:37-337)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 LFITDTVWSRSVRQVYEVHDSDDWTIHDFECPMECFCPPSFPTALYCENRGLKEIPAIPS
: :: :: :.:.:.::.. :: .: .:
CCDS90 TLFLALIGGTSGQYYDYDFPLSIYGQSSPNCAPECNCPESYPSAMYCDELKLKSVPMVPP
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 RIWYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQLKKLLFLFLEDN
: ::::.:: :. : :: :::.:.:.:. :..: . : :. ..:.::.: : .. :
CCDS90 GIKYLYLRNNQIDHIDEKAFENVTDLQWLILDHNLLENSKIKGRVFSKLKQLKKLHINHN
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 ELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVDNAFQRDTFKGL
.: : .:::.:::.:::..::.... :.: .: :::.. ::.:.: ..: . .::::
CCDS90 NLTESVGPLPKSLEDLQLTHNKITKL--GSFEGLVNLTFIHLQHNRLKEDAVSA-AFKGL
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 KNLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVAFLRLNHNKLSD
:.: :... : . .: ::.. . :.::::.: .::..::. . . .:::.::.:.:
CCDS90 KSLEYLDLSFNQIARLPSGLPVSLLTLYLDNNKISNIPDEYFKRFNALQYLRLSHNELAD
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 EGLPSRGFDVSSILDLQLSHNQLTKVPRISAHLQHLHLDHNKIKSVNVSVICPSPSMLPA
:.:. .:.:::...:.::.:.: ..: .. .:.. .:. :.... ... .: ..:
CCDS90 SGIPGNSFNVSSLVELDLSYNKLKNIPTVNENLENYYLEVNQLEKFDIKSFC---KIL--
250 260 270 280 290
320 330 340 350
pF1KE6 ERDSFSYGPHLRYLRLDGNEI-KPPIPMALMTCFRLLQAVII
.::. ....::::::.: . .: .. :.:. . : .
CCDS90 --GPLSYS-KIKHLRLDGNRISETSLPPDMYECLRVANEVTLN
300 310 320 330
>>CCDS55602.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 (642 aa)
initn: 465 init1: 354 opt: 500 Z-score: 518.8 bits: 105.4 E(32554): 1.4e-22
Smith-Waterman score: 500; 34.8% identity (66.3% similar) in 270 aa overlap (42-308:97-364)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 LFITDTVWSRSVRQVYEVHDSDDWTIHDFECPMECFCPPSFPTALYCENRGLKEIPA-IP
:: .: : : .. : . :.:.:. .:
CCDS55 LSPEENEFAEEEPVLVLSPEEPGPGPAAVSCPRDCAC--SQEGVVDCGGIDLREFPGDLP
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 SRIWYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQLKKLLFLFLED
. .: :::: .: : . . .:. .::..:..:. :. . :. .: .: .:.: .
CCDS55 EHTNHLSLQNNQLEKIYPEELSRLHRLETLNLQNNRLTSRGLPEKAFEHLTNLNYLYLAN
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 NELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVDNAFQRDTFKG
:.: .: :: .: ....: : ...: ::.. :: . :.::::.: .. . :.:
CCDS55 NKLTLAPRFLPNALISVDFAANYLTKIYGLTFGQKPNLRSVYLHNNKLADAGLPDNMFNG
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 LKNLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVAFLRLNHNKLS
.:. : ...: ::..: .:: ..: : ::..: :: . :. . .. : :..: :.
CCDS55 SSNVEVLILSSNFLRHVPKHLPPALYKLHLKNNKLEKIPPGAFSELSSLRELYLQNNYLT
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300
pF1KE6 DEGLPSRGF-DVSSILDLQLSHNQLTKVPR-ISAHLQHLHLDHNKIKSVNVSVICPSPSM
:::: .. : .::. :.:: :.:..:: . : :::..: :.::...:. : :.
CCDS55 DEGLDNETFWKLSSLEYLDLSSNNLSRVPAGLPRSLVLLHLEKNAIRSVDANVLTPIRSL
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350
pF1KE6 LPAERDSFSYGPHLRYLRLDGNEIKPPIPMALMTCFRLLQAVII
CCDS55 EYLLLHSNQLREQGIHPLAFQGLKRLHTVHLYNNALERVPSGLPRRVRTLMILHNQITGI
370 380 390 400 410 420
>--
initn: 490 init1: 268 opt: 321 Z-score: 335.2 bits: 71.4 E(32554): 2.4e-12
Smith-Waterman score: 340; 28.8% identity (64.6% similar) in 243 aa overlap (102-330:369-611)
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 RIWYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQLKKLLFLFLEDN
:..:.. . ::. :.. ::.: . : .:
CCDS55 SLVLLHLEKNAIRSVDANVLTPIRSLEYLLLHSNQLREQGIHPLAFQGLKRLHTVHLYNN
340 350 360 370 380 390
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 ELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVDNAFQRDTFKGL
::.::: ::: .. :.. .:... : . :.. : :.:. :.... .::.:. :
CCDS55 ALERVPSGLPRRVRTLMILHNQITGIGREDFATTYFLEELNLSYNRITSPQVHRDAFRKL
400 410 420 430 440 450
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 KNLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVAFLRLNHNKLSD
. : .:... : :...:: :: :. : . : . .. .. . . .. : :. :.: .
CCDS55 RLLRSLDLSGNRLHTLPPGLPRNVHVLKVKRNELAALARGALVGMAQLRELYLTSNRLRS
460 470 480 490 500 510
260 270 280 290 300
pF1KE6 EGLPSRGF-DVSSILDLQLSHNQLTKVPR-ISAHLQHLHLDHNKIKSVNVSVICPSPSM-
..: :.. :.. . :... ::::..:. . :..:.:..:::..: .... .:..
CCDS55 RALGPRAWVDLAHLQLLDIAGNQLTEIPEGLPESLEYLYLQNNKISAVPANAFDSTPNLK
520 530 540 550 560 570
310 320 330 340 350
pF1KE6 ----------LPAERDS-FSYGPHLRYLRLDGNEIKPPIPMALMTCFRLLQAVII
. . :: : ::. : ..::
CCDS55 GIFLRFNKLAVGSVVDSAFRRLKHLQVLDIEGNLEFGDISKDRGRLGKEKEEEEEEEEEE
580 590 600 610 620 630
CCDS55 EETR
640
>>CCDS573.1 PODN gene_id:127435|Hs108|chr1 (661 aa)
initn: 465 init1: 354 opt: 500 Z-score: 518.6 bits: 105.4 E(32554): 1.4e-22
Smith-Waterman score: 500; 34.8% identity (66.3% similar) in 270 aa overlap (42-308:116-383)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 LFITDTVWSRSVRQVYEVHDSDDWTIHDFECPMECFCPPSFPTALYCENRGLKEIPA-IP
:: .: : : .. : . :.:.:. .:
CCDS57 LSPEENEFAEEEPVLVLSPEEPGPGPAAVSCPRDCAC--SQEGVVDCGGIDLREFPGDLP
90 100 110 120 130 140
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 SRIWYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQLKKLLFLFLED
. .: :::: .: : . . .:. .::..:..:. :. . :. .: .: .:.: .
CCDS57 EHTNHLSLQNNQLEKIYPEELSRLHRLETLNLQNNRLTSRGLPEKAFEHLTNLNYLYLAN
150 160 170 180 190 200
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 NELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVDNAFQRDTFKG
:.: .: :: .: ....: : ...: ::.. :: . :.::::.: .. . :.:
CCDS57 NKLTLAPRFLPNALISVDFAANYLTKIYGLTFGQKPNLRSVYLHNNKLADAGLPDNMFNG
210 220 230 240 250 260
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 LKNLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVAFLRLNHNKLS
.:. : ...: ::..: .:: ..: : ::..: :: . :. . .. : :..: :.
CCDS57 SSNVEVLILSSNFLRHVPKHLPPALYKLHLKNNKLEKIPPGAFSELSSLRELYLQNNYLT
270 280 290 300 310 320
260 270 280 290 300
pF1KE6 DEGLPSRGF-DVSSILDLQLSHNQLTKVPR-ISAHLQHLHLDHNKIKSVNVSVICPSPSM
:::: .. : .::. :.:: :.:..:: . : :::..: :.::...:. : :.
CCDS57 DEGLDNETFWKLSSLEYLDLSSNNLSRVPAGLPRSLVLLHLEKNAIRSVDANVLTPIRSL
330 340 350 360 370 380
310 320 330 340 350
pF1KE6 LPAERDSFSYGPHLRYLRLDGNEIKPPIPMALMTCFRLLQAVII
CCDS57 EYLLLHSNQLREQGIHPLAFQGLKRLHTVHLYNNALERVPSGLPRRVRTLMILHNQITGI
390 400 410 420 430 440
>--
initn: 490 init1: 268 opt: 321 Z-score: 335.0 bits: 71.4 E(32554): 2.4e-12
Smith-Waterman score: 340; 28.8% identity (64.6% similar) in 243 aa overlap (102-330:388-630)
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 RIWYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQLKKLLFLFLEDN
:..:.. . ::. :.. ::.: . : .:
CCDS57 SLVLLHLEKNAIRSVDANVLTPIRSLEYLLLHSNQLREQGIHPLAFQGLKRLHTVHLYNN
360 370 380 390 400 410
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 ELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVDNAFQRDTFKGL
::.::: ::: .. :.. .:... : . :.. : :.:. :.... .::.:. :
CCDS57 ALERVPSGLPRRVRTLMILHNQITGIGREDFATTYFLEELNLSYNRITSPQVHRDAFRKL
420 430 440 450 460 470
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 KNLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVAFLRLNHNKLSD
. : .:... : :...:: :: :. : . : . .. .. . . .. : :. :.: .
CCDS57 RLLRSLDLSGNRLHTLPPGLPRNVHVLKVKRNELAALARGALVGMAQLRELYLTSNRLRS
480 490 500 510 520 530
260 270 280 290 300
pF1KE6 EGLPSRGF-DVSSILDLQLSHNQLTKVPR-ISAHLQHLHLDHNKIKSVNVSVICPSPSM-
..: :.. :.. . :... ::::..:. . :..:.:..:::..: .... .:..
CCDS57 RALGPRAWVDLAHLQLLDIAGNQLTEIPEGLPESLEYLYLQNNKISAVPANAFDSTPNLK
540 550 560 570 580 590
310 320 330 340 350
pF1KE6 ----------LPAERDS-FSYGPHLRYLRLDGNEIKPPIPMALMTCFRLLQAVII
. . :: : ::. : ..::
CCDS57 GIFLRFNKLAVGSVVDSAFRRLKHLQVLDIEGNLEFGDISKDRGRLGKEKEEEEEEEEEE
600 610 620 630 640 650
CCDS57 EETR
660
>>CCDS54226.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19 (510 aa)
initn: 637 init1: 339 opt: 472 Z-score: 491.5 bits: 100.0 E(32554): 4.7e-21
Smith-Waterman score: 472; 34.0% identity (63.0% similar) in 262 aa overlap (42-300:44-303)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 LFITDTVWSRSVRQVYEVHDSDDWTIHDFECPMECFCPPSFPTALYCENRGLKEIPAIPS
::..: :: .. :.. :. .: .
CCDS54 LLLPGPPPVAGLEDAAFPHLGESLQPLPRACPLRCSCPRV--DTVDCDGLDLRVFPDNIT
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 RI-WYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQLKKLLFLFLED
: .: :::: .. .: . . . :: .::..: :.. :. :. .: .: : .
CCDS54 RAAQHLSLQNNQLQELPYNELSRLSGLRTLNLHNNLISSEGLPDEAFESLTQLQHLCVAH
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 NELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVDNAFQRDTFKG
:.: .:. :::::. .:: :.: .: ::.. : . :.::.: . .. :.:.:
CCDS54 NKLSVAPQFLPRSLRVADLAANQVMEIFPLTFGEKPALRSVYLHNNQLSNAGLPPDAFRG
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 LKNLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVAFLRLNHNKLS
. . :....: : .:: :: . .: :.:: : .:.. .. .. : :.::.:.
CCDS54 SEAIATLSLSNNQLSYLPPSLPPSLERLHLQNNLISKVPRGALSRQTQLRELYLQHNQLT
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300
pF1KE6 DEGLPSRGFD-VSSILDLQLSHNQLTKVPR-ISAHLQHLHLDHNKIKSVNVSVICPSPSM
: :: . :. . :. :.::::::: :: . : ::: .:.:..:...
CCDS54 DSGLDATTFSKLHSLEYLDLSHNQLTTVPAGLPRTLAILHLGRNRIRQVEAARLHGARGL
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350
pF1KE6 LPAERDSFSYGPHLRYLRLDGNEIKPPIPMALMTCFRLLQAVII
CCDS54 RYLLLQHNQLGSSGLPAGALRPLRGLHTLHLYGNGLDRVPPALPRRLRALVLPHNHVAAL
320 330 340 350 360 370
>>CCDS12300.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19 (512 aa)
initn: 637 init1: 339 opt: 472 Z-score: 491.5 bits: 100.0 E(32554): 4.7e-21
Smith-Waterman score: 472; 34.0% identity (63.0% similar) in 262 aa overlap (42-300:46-305)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 LFITDTVWSRSVRQVYEVHDSDDWTIHDFECPMECFCPPSFPTALYCENRGLKEIPAIPS
::..: :: .. :.. :. .: .
CCDS12 LLLPGPPPVAGLEDAAFPHLGESLQPLPRACPLRCSCPRV--DTVDCDGLDLRVFPDNIT
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 RI-WYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQLKKLLFLFLED
: .: :::: .. .: . . . :: .::..: :.. :. :. .: .: : .
CCDS12 RAAQHLSLQNNQLQELPYNELSRLSGLRTLNLHNNLISSEGLPDEAFESLTQLQHLCVAH
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 NELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVDNAFQRDTFKG
:.: .:. :::::. .:: :.: .: ::.. : . :.::.: . .. :.:.:
CCDS12 NKLSVAPQFLPRSLRVADLAANQVMEIFPLTFGEKPALRSVYLHNNQLSNAGLPPDAFRG
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 LKNLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVAFLRLNHNKLS
. . :....: : .:: :: . .: :.:: : .:.. .. .. : :.::.:.
CCDS12 SEAIATLSLSNNQLSYLPPSLPPSLERLHLQNNLISKVPRGALSRQTQLRELYLQHNQLT
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300
pF1KE6 DEGLPSRGFD-VSSILDLQLSHNQLTKVPR-ISAHLQHLHLDHNKIKSVNVSVICPSPSM
: :: . :. . :. :.::::::: :: . : ::: .:.:..:...
CCDS12 DSGLDATTFSKLHSLEYLDLSHNQLTTVPAGLPRTLAILHLGRNRIRQVEAARLHGARGL
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350
pF1KE6 LPAERDSFSYGPHLRYLRLDGNEIKPPIPMALMTCFRLLQAVII
CCDS12 RYLLLQHNQLGSSGLPAGALRPLRGLHTLHLYGNGLDRVPPALPRRLRALVLPHNHVAAL
320 330 340 350 360 370
>>CCDS56578.1 ECM2 gene_id:1842|Hs108|chr9 (643 aa)
initn: 403 init1: 371 opt: 445 Z-score: 462.4 bits: 94.9 E(32554): 2e-19
Smith-Waterman score: 457; 33.8% identity (62.3% similar) in 308 aa overlap (48-335:298-603)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 VWSRSVRQVYEVHDSDDWTIHDFECPMECFCPPSFPTALYCENRGLKEIPAIPS-RIWYL
: :. : . : : : .:: . . .: :
CCDS56 EDPVRGDMFRMPSRSPLPAPPRGTLRLPSGCSLSYRT-ISCINAMLTQIPPLTAPQITSL
270 280 290 300 310 320
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 YLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQLKKLLFLFLEDNELEEV
: .: : .::.. :.. .:. ..:.::.::. :: :.. ::::. : .. :.: ..
CCDS56 ELTGNSIASIPDEAFNGLPNLERLDLSKNNITSSGIGPKAFKLLKKLMRLNMDGNNLIQI
330 340 350 360 370 380
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 PSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVDNAFQRDTFKGLKNLMQ
:: :: .::.:.. .:... : . ..:.:..:. :.:..:.: . . .:: ::.:
CCDS56 PSQLPSTLEELKVNENNLQAIDEESLSDLNQLVTLELEGNNLSEANVNPLAFKPLKSLAY
390 400 410 420 430 440
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 LNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVAFLRLNHNKLSDEGL-P
: ..:: .: .: ::.. .:.:.::.:: : : :: :. . : .::. .. . :
CCDS56 LRLGKNKFRIIPQGLPGSIEELYLENNQIEEITEICFNHTRKINVIVLRYNKIEENRIAP
450 460 470 480 490 500
260 270 280 290 300
pF1KE6 SRGFDVSSILDLQLSHNQLTKVPR-ISAHLQHLHLDHNKIKSVNVSV---ICPSPSML--
.. .. ...::.:.: .:: . : :: : :.:. . : . :. .:
CCDS56 LAWINQENLESIDLSYNKLYHVPSYLPKSLLHLVLLGNQIERIPGYVFGHMEPGLEYLYL
510 520 530 540 550 560
310 320 330 340 350
pF1KE6 --------PAERDSFSYGPH--LRYLRLDGNEIK--PPIPMALMTCFRLLQAVII
.: :: :: . :: : :: :..: ::
CCDS56 SFNKLADDGMDRVSF-YGAYHSLRELFLDHNDLKSIPPGIQEMKALHFLRLNNNKIRCVS
570 580 590 600 610 620
CCDS56 DAVLETVTNRSDVAFPLW
630 640
352 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 12:16:08 2016 done: Tue Nov 8 12:16:08 2016
Total Scan time: 2.230 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]