Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6339
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6339, 429 aa
1>>>pF1KE6339 429 - 429 aa - 429 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7797+/- 0.001; mu= 14.7027+/- 0.060
mean_var=68.3461+/-13.608, 0's: 0 Z-trim(103.8): 27 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.155138
statistics sampled from 7583 (7601) to 7583 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 2.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10125.1 SLC30A4 gene_id:7782|Hs108|chr15 ( 429) 2779 631.3 5.6e-181
CCDS1743.1 SLC30A3 gene_id:7781|Hs108|chr2 ( 388) 797 187.7 1.8e-47
CCDS30644.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 ( 372) 505 122.3 8e-28
CCDS272.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 ( 323) 439 107.5 2e-23
CCDS55272.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 ( 320) 432 105.9 5.8e-23
CCDS6322.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 ( 369) 432 106.0 6.6e-23
CCDS3996.1 SLC30A5 gene_id:64924|Hs108|chr5 ( 765) 264 68.5 2.6e-11
>>CCDS10125.1 SLC30A4 gene_id:7782|Hs108|chr15 (429 aa)
initn: 2779 init1: 2779 opt: 2779 Z-score: 3362.7 bits: 631.3 E(32554): 5.6e-181
Smith-Waterman score: 2779; 100.0% identity (100.0% similar) in 429 aa overlap (1-429:1-429)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAGSGAWKRLKSMLRKDDAPLFLNDTSAFDFSDEAGDEGLSRFNKLRVVVADDGSEAPER
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CCDS10 MAGSGAWKRLKSMLRKDDAPLFLNDTSAFDFSDEAGDEGLSRFNKLRVVVADDGSEAPER
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PVNGAHPTLQADDDSLLDQDLPLTNSQLSLKVDSCDNCSKQREILKQRKVKARLTIAAVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PVNGAHPTLQADDDSLLDQDLPLTNSQLSLKVDSCDNCSKQREILKQRKVKARLTIAAVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YLLFMIGELVGGYIANSLAIMTDALHMLTDLSAIILTLLALWLSSKSPTKRFTFGFHRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YLLFMIGELVGGYIANSLAIMTDALHMLTDLSAIILTLLALWLSSKSPTKRFTFGFHRLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VLSAMISVLLVYILMGFLLYEAVQRTIHMNYEINGDIMLITAAVGVAVNVIMGFLLNQSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VLSAMISVLLVYILMGFLLYEAVQRTIHMNYEINGDIMLITAAVGVAVNVIMGFLLNQSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 HRHSHSHSLPSNSPTRGSGCERNHGQDSLAVRAAFVHALGDLVQSVGVLIAAYIIRFKPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HRHSHSHSLPSNSPTRGSGCERNHGQDSLAVRAAFVHALGDLVQSVGVLIAAYIIRFKPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 YKIADPICTYVFSLLVAFTTFRIIWDTVVIILEGVPSHLNVDYIKEALMKIEDVYSVEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YKIADPICTYVFSLLVAFTTFRIIWDTVVIILEGVPSHLNVDYIKEALMKIEDVYSVEDL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 NIWSLTSGKSTAIVHIQLIPGSSSKWEEVQSKANHLLLNTFGMYRCTIQLQSYRQEVDRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NIWSLTSGKSTAIVHIQLIPGSSSKWEEVQSKANHLLLNTFGMYRCTIQLQSYRQEVDRT
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 CANCQSSSP
:::::::::
CCDS10 CANCQSSSP
>>CCDS1743.1 SLC30A3 gene_id:7781|Hs108|chr2 (388 aa)
initn: 772 init1: 423 opt: 797 Z-score: 965.9 bits: 187.7 E(32554): 1.8e-47
Smith-Waterman score: 797; 37.2% identity (69.6% similar) in 349 aa overlap (79-425:39-383)
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 VVADDGSEAPERPVNGAHPTLQADDDSLLDQDLPLTNSQLSLKVDSCDNCSKQREILKQR
. :: .. . . : : .
CCDS17 GLETTRLVSPRDRGGAGGSLRLKSLFTEPSEPLPEESKPVEMPFHHCHRDPLPPPGLTPE
10 20 30 40 50 60
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 KVKAR--LTIAAVLYLLFMIGELVGGYIANSLAIMTDALHMLTDLSAIILTLLALWLSSK
...:: : : .. ..:: ::.::::.:.:::::::: :.:.:..... .:..::::..
CCDS17 RLHARRQLYAACAVCFVFMAGEVVGGYLAHSLAIMTDAAHLLADVGSMMGSLFSLWLSTR
70 80 90 100 110 120
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 SPTKRFTFGFHRLEVLSAMISVLLVYILMGFLLYEAVQRTIHMNYEINGDIMLITAAVGV
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CCDS17 PATRTMTFGWHRSETLGALASVVSLWMVTGILLYLAFVRLLHSDYHIEGGAMLLTASIAV
130 140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 AVNVIMGFLLNQSGHRHSHSHSLPSNSPTRGSGCERNHGQDSLAVRAAFVHALGDLVQSV
.:..:.:.:.:.: :::. .: . : :. . .:::::::.::::.::
CCDS17 CANLLMAFVLHQAGPPHSHGSRGAEYAPLE-EGPEEPLPLGNTSVRAAFVHVLGDLLQSF
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 GVLIAAYIIRFKPEYKIADPICTYVFSLLVAFTTFRIIWDTVVIILEGVPSHLNVDYIKE
::: :. .: :::.:: :::: :..::. . .: . :.. :..::.: ... . ...
CCDS17 GVLAASILIYFKPQYKAADPISTFLFSICALGSTAPTLRDVLRILMEGTPRNVGFEPVRD
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 ALMKIEDVYSVEDLNIWSLTSGKSTAIVHIQLIPGSSSKWEEVQSKANHLLLNTFGMYRC
.:... : ....:..:.:: .: .:. . :.. : : ..:. : . ::. :
CCDS17 TLLSVPGVRATHELHLWALTLTYHVASAHLAI--DSTADPEAVLAEASSRLYSRFGFSSC
310 320 330 340 350 360
410 420
pF1KE6 TIQLQSYRQEVDRTCANCQSSSP
:.:...:. :. . : ::
CCDS17 TLQVEQYQPEMAQ-CLRCQEPPQA
370 380
>>CCDS30644.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 (372 aa)
initn: 867 init1: 505 opt: 505 Z-score: 613.0 bits: 122.3 E(32554): 8e-28
Smith-Waterman score: 913; 39.0% identity (71.6% similar) in 387 aa overlap (56-428:2-371)
30 40 50 60 70 80
pF1KE6 TSAFDFSDEAGDEGLSRFNKLRVVVADDGSEAPERP-VNGAHPTLQADDDSLLDQD---L
:: :. . :.:.... :: .. .
CCDS30 MEAKEKQHLLDARPAIRSYTGSLWQEGAGWI
10 20 30
90 100 110 120 130
pF1KE6 PLTNSQLSLKV-----DSCDNCSKQREIL-----KQRKVKARLTIAAVLYLLFMIGELVG
:: :.:.. .: .: :. :. :.. .: .:... :::::::.::
CCDS30 PLPRPGLDLQAIELAAQSNHHCHAQKGPDSHCDPKKGKAQRQLYVASAICLLFMIGEVVG
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 GYIANSLAIMTDALHMLTDLSAIILTLLALWLSSKSPTKRFTFGFHRLEVLSAMISVLLV
::.:.:::.:::: :.:::.......:..::.::. :: ..::..: :.:.:..::: .
CCDS30 GYLAHSLAVMTDAAHLLTDFASMLISLFSLWMSSRPATKTMNFGWQRAEILGALVSVLSI
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE6 YILMGFLLYEAVQRTIHMNYEINGDIMLITAAVGVAVNVIMGFLLNQSGHRHSHSHSLPS
... : :.: ::.: : .:::.: ::::.. .::::.:::. :.:::: :::. .
CCDS30 WVVTGVLVYLAVERLISGDYEIDGGTMLITSGCAVAVNIIMGLTLHQSGHGHSHGTT---
160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 NSPTRGSGCERNHGQDSLAVRAAFVHALGDLVQSVGVLIAAYIIRFKPEYKIADPICTYV
:. ... .:::::.:..::..::.:::.::::. :::::: .:::::.:
CCDS30 -----------NQQEENPSVRAAFIHVIGDFMQSMGVLVAAYILYFKPEYKYVDPICTFV
210 220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 FSLLVAFTTFRIIWDTVVIILEGVPSHLNVDYIKEALMKIEDVYSVEDLNIWSLTSGKST
::.:: ::. :. :......::.:. .. ... :...: : ....:.::.:: .. .
CCDS30 FSILVLGTTLTILRDVILVLMEGTPKGVDFTAVRDLLLSVEGVEALHSLHIWALTVAQPV
260 270 280 290 300 310
380 390 400 410 420
pF1KE6 AIVHIQLIPGSSSKWEEVQSKANHLLLNTFGMYRCTIQLQSYRQEVDRTCANCQSSSP
::: . .... . : . :. : . : .. :::...: ... . : ::. :
CCDS30 LSVHIAIAQNTDA--QAVLKTASSRLQGKFHFHTVTIQIEDYSEDM-KDCQACQGPSD
320 330 340 350 360 370
>>CCDS272.1 SLC30A2 gene_id:7780|Hs108|chr1 (323 aa)
initn: 640 init1: 376 opt: 439 Z-score: 534.2 bits: 107.5 E(32554): 2e-23
Smith-Waterman score: 643; 40.0% identity (73.2% similar) in 250 aa overlap (179-428:90-322)
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 TDLSAIILTLLALWLSSKSPTKRFTFGFHRLEVLSAMISVLLVYILMGFLLYEAVQRTIH
.:.:.:..::: .... : :.: ::.: :
CCDS27 DSHCDPKKGKAQRQLYVASAICLLFMIGEVVEILGALVSVLSIWVVTGVLVYLAVERLIS
60 70 80 90 100 110
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 MNYEINGDIMLITAAVGVAVNVIMGFLLNQSGHRHSHSHSLPSNSPTRGSGCERNHGQDS
.:::.: ::::.. .::::.:::. :.:::: :::. . :. ...
CCDS27 GDYEIDGGTMLITSGCAVAVNIIMGLTLHQSGHGHSHGTT--------------NQQEEN
120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 LAVRAAFVHALGDLVQSVGVLIAAYIIRFKPEYKIADPICTYVFSLLVAFTTFRIIWDTV
.:::::.:..::..::.:::.::::. :::::: .:::::.:::.:: ::. :. :..
CCDS27 PSVRAAFIHVIGDFMQSMGVLVAAYILYFKPEYKYVDPICTFVFSILVLGTTLTILRDVI
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 VIILEGVPSHLNVDYIKEALMKIEDVYSVEDLNIWSLTSGKSTAIVHIQLIPGSSSKWEE
....::.:. .. ... :...: : ....:.::.:: .. . ::: . .... .
CCDS27 LVLMEGTPKGVDFTAVRDLLLSVEGVEALHSLHIWALTVAQPVLSVHIAIAQNTDA--QA
230 240 250 260 270 280
390 400 410 420
pF1KE6 VQSKANHLLLNTFGMYRCTIQLQSYRQEVDRTCANCQSSSP
: . :. : . : .. :::...: ... . : ::. :
CCDS27 VLKTASSRLQGKFHFHTVTIQIEDYSEDM-KDCQACQGPSD
290 300 310 320
>>CCDS55272.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 (320 aa)
initn: 799 init1: 426 opt: 432 Z-score: 525.8 bits: 105.9 E(32554): 5.8e-23
Smith-Waterman score: 815; 40.2% identity (70.6% similar) in 333 aa overlap (95-425:4-316)
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AHPTLQADDDSLLDQDLPLTNSQLSLKVDSCDNCSKQRE--ILKQRKVKARLTIAAVLYL
: . :: : . .: .: :... .
CCDS55 MYHCHSGSKPTEKGANEYAYAKWKLCSASAICF
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LFMIGELVGGYIANSLAIMTDALHMLTDLSAIILTLLALWLSSKSPTKRFTFGFHRLEVL
.:::.:.:::.::.:::..::: :.: ::....:.:..:::::: :.::.:::.:: :.:
CCDS55 IFMIAEVVGGHIAGSLAVVTDAAHLLIDLTSFLLSLFSLWLSSKPPSKRLTFGWHRAEIL
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SAMISVLLVYILMGFLLYEAVQRTIHMNYEINGDIMLITAAVGVAVNVIMGFLLNQSGHR
.:..:.: .... : :.: : .: .. .:.:.. .:.:... .::.:... .:.:
CCDS55 GALLSILCIWVVTGVLVYLACERLLYPDYQIQATVMIIVSSCAVAANIVLTVVLHQRCLG
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 HSHSHSLPSNSPTRGSGCERNHGQDSLAVRAAFVHALGDLVQSVGVLIAAYIIRFKPEYK
:.:.. : . .:::::::::::: ::..:::.: :: ::::::
CCDS55 HNHKEV-----------------QANASVRAAFVHALGDLFQSISVLISALIIYFKPEYK
160 170 180 190
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 IADPICTYVFSLLVAFTTFRIIWDTVVIILEGVPSHLNVDYIKEALMKIEDVYSVEDLNI
:::::::..::.:: .:. :. : ....::::. :: . .:: .. .. : ::..:.:
CCDS55 IADPICTFIFSILVLASTITILKDFSILLMEGVPKSLNYSGVKELILAVDGVLSVHSLHI
200 210 220 230 240 250
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 WSLTSGKSTAIVHIQLIPGSSSKWEEVQSKANHLLLNTFGMYRCTIQLQSYRQEVDRTCA
:::: .. .:. . .:. :. . . : ..: :. :::..: .. : :
CCDS55 WSLTMNQVILSAHVATAASRDSQV--VRREIAKALSKSFTMHSLTIQMESPVDQ-DPDCL
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 NCQSSSP
:.
CCDS55 FCEDPCD
320
>>CCDS6322.1 SLC30A8 gene_id:169026|Hs108|chr8 (369 aa)
initn: 799 init1: 426 opt: 432 Z-score: 524.8 bits: 106.0 E(32554): 6.6e-23
Smith-Waterman score: 815; 40.2% identity (70.6% similar) in 333 aa overlap (95-425:53-365)
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AHPTLQADDDSLLDQDLPLTNSQLSLKVDSCDNCSKQRE--ILKQRKVKARLTIAAVLYL
: . :: : . .: .: :... .
CCDS63 ESVELQQKPVNKDQCPRERPEELESGGMYHCHSGSKPTEKGANEYAYAKWKLCSASAICF
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LFMIGELVGGYIANSLAIMTDALHMLTDLSAIILTLLALWLSSKSPTKRFTFGFHRLEVL
.:::.:.:::.::.:::..::: :.: ::....:.:..:::::: :.::.:::.:: :.:
CCDS63 IFMIAEVVGGHIAGSLAVVTDAAHLLIDLTSFLLSLFSLWLSSKPPSKRLTFGWHRAEIL
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SAMISVLLVYILMGFLLYEAVQRTIHMNYEINGDIMLITAAVGVAVNVIMGFLLNQSGHR
.:..:.: .... : :.: : .: .. .:.:.. .:.:... .::.:... .:.:
CCDS63 GALLSILCIWVVTGVLVYLACERLLYPDYQIQATVMIIVSSCAVAANIVLTVVLHQRCLG
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 HSHSHSLPSNSPTRGSGCERNHGQDSLAVRAAFVHALGDLVQSVGVLIAAYIIRFKPEYK
:.:.. : . .:::::::::::: ::..:::.: :: ::::::
CCDS63 HNHKEV-----------------QANASVRAAFVHALGDLFQSISVLISALIIYFKPEYK
210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 IADPICTYVFSLLVAFTTFRIIWDTVVIILEGVPSHLNVDYIKEALMKIEDVYSVEDLNI
:::::::..::.:: .:. :. : ....::::. :: . .:: .. .. : ::..:.:
CCDS63 IADPICTFIFSILVLASTITILKDFSILLMEGVPKSLNYSGVKELILAVDGVLSVHSLHI
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 WSLTSGKSTAIVHIQLIPGSSSKWEEVQSKANHLLLNTFGMYRCTIQLQSYRQEVDRTCA
:::: .. .:. . .:. :. . . : ..: :. :::..: .. : :
CCDS63 WSLTMNQVILSAHVATAASRDSQV--VRREIAKALSKSFTMHSLTIQMESPVDQ-DPDCL
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 NCQSSSP
:.
CCDS63 FCEDPCD
>>CCDS3996.1 SLC30A5 gene_id:64924|Hs108|chr5 (765 aa)
initn: 253 init1: 185 opt: 264 Z-score: 316.5 bits: 68.5 E(32554): 2.6e-11
Smith-Waterman score: 400; 27.5% identity (62.5% similar) in 309 aa overlap (120-411:425-727)
90 100 110 120 130 140
pF1KE6 LKVDSCDNCSKQREILKQRKVKARLTIAAVLYLLFMIGELVGGYIANSLAIMTDALHMLT
: ::: . :: : ..:::....:..:::
CCDS39 SSQSIPRFIKESLKQILEESDSRQIFYFLCLNLLFTFVELFYGVLTNSLGLISDGFHMLF
400 410 420 430 440 450
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 DLSAIILTLLALWLSSKSPTKRFTFGFHRLEVLSAMISVLLVYILMGFLLYEAVQRTIHM
: ::... :.: .: . :. :..:. :.:.::..:. :.. .. :...:.: : :
CCDS39 DCSALVMGLFAALMSRWKATRIFSYGYGRIEILSGFINGLFLIVIAFFVFMESVARLIDP
460 470 480 490 500 510
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 NYEINGDIMLITAAVGVAVNVIMGFLLNQSGHRHSHSHSLPSNSPTRGSGCERNHGQD--
:.. .. ... :. ::.: :. . .: :.:. : : . : .. ::..
CCDS39 P-ELDTHMLTPVSVGGLIVNLI-GICAFSHAHSHAHGASQGSCHSSDHSHSHHMHGHSDH
520 530 540 550 560 570
270 280 290 300 310
pF1KE6 -------------SLAVRAAFVHALGDLVQSVGVLIAAYIIRFKPEYKIADPICTYVFSL
. .:..:.:.:.: . :.::.... .:. . . ::::.:. ...
CCDS39 GHGHSHGSAGGGMNANMRGVFLHVLADTLGSIGVIVSTVLIE-QFGWFIADPLCSLFIAI
580 590 600 610 620 630
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 LVAFTTFRIIWDTVVIILEGVPSHLNVD-YIK-EALMKIEDVYSVEDLNIWSLTSGKSTA
:. ... .: :. ..: .: . . . .: : ..::: . : .: ..: ... ..
CCDS39 LIFLSVVPLIKDACQVLLLRLPPEYEKELHIALEKIQKIEGLISYRDPHFWRHSASIVAG
640 650 660 670 680 690
380 390 400 410 420
pF1KE6 IVHIQLIPGSSSKWEEVQSKANHLLLNTFGMYRCTIQLQSYRQEVDRTCANCQSSSP
.:::. .:. :. . .:. :. :::..
CCDS39 TIHIQV---TSDVLEQRIVQQVTGILKDAGVNNLTIQVEKEAYFQHMSGLSTGFHDVLAM
700 710 720 730 740
CCDS39 TKQMESMKYCKDGTYIM
750 760
429 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 12:15:33 2016 done: Tue Nov 8 12:15:33 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]