Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6336
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6336, 430 aa
1>>>pF1KE6336 430 - 430 aa - 430 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9497+/-0.000592; mu= 0.8588+/- 0.036
mean_var=253.8849+/-51.532, 0's: 0 Z-trim(113.6): 65 B-trim: 365 in 2/52
Lambda= 0.080493
statistics sampled from 22928 (22975) to 22928 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.269), width: 16
Scan time: 6.040
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016856544 (OMIM: 608953) PREDICTED: tektin-2 is ( 430) 2768 335.3 1.9e-91
XP_011539560 (OMIM: 608953) PREDICTED: tektin-2 is ( 430) 2768 335.3 1.9e-91
XP_005270810 (OMIM: 608953) PREDICTED: tektin-2 is ( 430) 2768 335.3 1.9e-91
NP_055281 (OMIM: 608953) tektin-2 [Homo sapiens] ( 430) 2768 335.3 1.9e-91
NP_444515 (OMIM: 609002) tektin-1 [Homo sapiens] ( 418) 720 97.4 7.2e-20
XP_011522290 (OMIM: 612683) PREDICTED: tektin-3 is ( 490) 659 90.4 1.1e-17
XP_011522291 (OMIM: 612683) PREDICTED: tektin-3 is ( 490) 659 90.4 1.1e-17
NP_114104 (OMIM: 612683) tektin-3 [Homo sapiens] ( 490) 659 90.4 1.1e-17
XP_016880443 (OMIM: 612683) PREDICTED: tektin-3 is ( 490) 659 90.4 1.1e-17
XP_016880444 (OMIM: 612683) PREDICTED: tektin-3 is ( 324) 574 80.4 7.6e-15
XP_011522292 (OMIM: 612683) PREDICTED: tektin-3 is ( 324) 574 80.4 7.6e-15
XP_011522329 (OMIM: 609002) PREDICTED: tektin-1 is ( 348) 442 65.1 3.3e-10
>>XP_016856544 (OMIM: 608953) PREDICTED: tektin-2 isofor (430 aa)
initn: 2768 init1: 2768 opt: 2768 Z-score: 1762.8 bits: 335.3 E(85289): 1.9e-91
Smith-Waterman score: 2768; 100.0% identity (100.0% similar) in 430 aa overlap (1-430:1-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQEARVLRNETNNQTIWDEHDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQEARVLRNETNNQTIWDEHDN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RTRLVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDALTQMKESAEQNLQAKNLPLDVAIECLTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTRLVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDALTQMKESAEQNLQAKNLPLDVAIECLTLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQQKVSQAFEQLCLLQEVQQQLNSDHRGKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQQKVSQAFEQLCLLQEVQQQLNSDHRGKM
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQWDDFSRFNKDRAEAEMKAATELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQWDDFSRFNKDRAEAEMKAATELR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVYSELKWQEKNTLEEIAELQEDIRHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVYSELKWQEKNTLEEIAELQEDIRHL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 EEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQYGLTDEVHQLEATIAALKQKLAQAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQYGLTDEVHQLEATIAALKQKLAQAQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 DALDALCKHLARLQADIACKANSMLLDTKCMDTRRKLTVPAERFVPEVDTFTRTTNSTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DALDALCKHLARLQADIACKANSMLLDTKCMDTRRKLTVPAERFVPEVDTFTRTTNSTLS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE6 PLKSCQLELA
::::::::::
XP_016 PLKSCQLELA
430
>>XP_011539560 (OMIM: 608953) PREDICTED: tektin-2 isofor (430 aa)
initn: 2768 init1: 2768 opt: 2768 Z-score: 1762.8 bits: 335.3 E(85289): 1.9e-91
Smith-Waterman score: 2768; 100.0% identity (100.0% similar) in 430 aa overlap (1-430:1-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQEARVLRNETNNQTIWDEHDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQEARVLRNETNNQTIWDEHDN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RTRLVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDALTQMKESAEQNLQAKNLPLDVAIECLTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RTRLVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDALTQMKESAEQNLQAKNLPLDVAIECLTLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQQKVSQAFEQLCLLQEVQQQLNSDHRGKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQQKVSQAFEQLCLLQEVQQQLNSDHRGKM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQWDDFSRFNKDRAEAEMKAATELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQWDDFSRFNKDRAEAEMKAATELR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVYSELKWQEKNTLEEIAELQEDIRHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVYSELKWQEKNTLEEIAELQEDIRHL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 EEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQYGLTDEVHQLEATIAALKQKLAQAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQYGLTDEVHQLEATIAALKQKLAQAQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 DALDALCKHLARLQADIACKANSMLLDTKCMDTRRKLTVPAERFVPEVDTFTRTTNSTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DALDALCKHLARLQADIACKANSMLLDTKCMDTRRKLTVPAERFVPEVDTFTRTTNSTLS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE6 PLKSCQLELA
::::::::::
XP_011 PLKSCQLELA
430
>>XP_005270810 (OMIM: 608953) PREDICTED: tektin-2 isofor (430 aa)
initn: 2768 init1: 2768 opt: 2768 Z-score: 1762.8 bits: 335.3 E(85289): 1.9e-91
Smith-Waterman score: 2768; 100.0% identity (100.0% similar) in 430 aa overlap (1-430:1-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQEARVLRNETNNQTIWDEHDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQEARVLRNETNNQTIWDEHDN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RTRLVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDALTQMKESAEQNLQAKNLPLDVAIECLTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RTRLVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDALTQMKESAEQNLQAKNLPLDVAIECLTLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQQKVSQAFEQLCLLQEVQQQLNSDHRGKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQQKVSQAFEQLCLLQEVQQQLNSDHRGKM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQWDDFSRFNKDRAEAEMKAATELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQWDDFSRFNKDRAEAEMKAATELR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVYSELKWQEKNTLEEIAELQEDIRHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVYSELKWQEKNTLEEIAELQEDIRHL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 EEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQYGLTDEVHQLEATIAALKQKLAQAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQYGLTDEVHQLEATIAALKQKLAQAQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 DALDALCKHLARLQADIACKANSMLLDTKCMDTRRKLTVPAERFVPEVDTFTRTTNSTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DALDALCKHLARLQADIACKANSMLLDTKCMDTRRKLTVPAERFVPEVDTFTRTTNSTLS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE6 PLKSCQLELA
::::::::::
XP_005 PLKSCQLELA
430
>>NP_055281 (OMIM: 608953) tektin-2 [Homo sapiens] (430 aa)
initn: 2768 init1: 2768 opt: 2768 Z-score: 1762.8 bits: 335.3 E(85289): 1.9e-91
Smith-Waterman score: 2768; 100.0% identity (100.0% similar) in 430 aa overlap (1-430:1-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQEARVLRNETNNQTIWDEHDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQEARVLRNETNNQTIWDEHDN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RTRLVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDALTQMKESAEQNLQAKNLPLDVAIECLTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RTRLVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDALTQMKESAEQNLQAKNLPLDVAIECLTLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQQKVSQAFEQLCLLQEVQQQLNSDHRGKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQQKVSQAFEQLCLLQEVQQQLNSDHRGKM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQWDDFSRFNKDRAEAEMKAATELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQWDDFSRFNKDRAEAEMKAATELR
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250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVYSELKWQEKNTLEEIAELQEDIRHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVYSELKWQEKNTLEEIAELQEDIRHL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 EEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQYGLTDEVHQLEATIAALKQKLAQAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQYGLTDEVHQLEATIAALKQKLAQAQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 DALDALCKHLARLQADIACKANSMLLDTKCMDTRRKLTVPAERFVPEVDTFTRTTNSTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DALDALCKHLARLQADIACKANSMLLDTKCMDTRRKLTVPAERFVPEVDTFTRTTNSTLS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE6 PLKSCQLELA
::::::::::
NP_055 PLKSCQLELA
430
>>NP_444515 (OMIM: 609002) tektin-1 [Homo sapiens] (418 aa)
initn: 687 init1: 687 opt: 720 Z-score: 477.7 bits: 97.4 E(85289): 7.2e-20
Smith-Waterman score: 720; 33.7% identity (63.6% similar) in 398 aa overlap (1-397:1-397)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQEARVLRNETNNQTIWDEHDN
:: : ..: .: .:: . :. ::. :... :.. : .: .. : .. :
NP_444 MAKL-LQPPPKFLPSEWHIANKNQYHRADAQRSRSERLVAESQRLVDEIEKTTRKSQSDV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RTRLVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDALTQMKESAEQNLQAKNLPLDVAIECLTLR
.: .:.. :. ::. :: : .: : : .: :. :.. . :: .. ::. :
NP_444 NKKLEQRLEEVQFWKKELDDKLEQLVNVTDDLLIYKIRLEKALETLKEPLHITETCLAYR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQQKVSQAFEQLCLLQEVQQQLNSDHRGKM
:.: ::.:.: :: :: ::.:.:.. : . . .: ::. . . .. .:..: . :.
NP_444 EKRIGIDLVHDTVEHELIKEAEIIQGIMALLTRTLEEASEQIRMNRSAKYNLEKDLKDKF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQWDDFSRFNKDRAEAEMKAATELR
.: :: :.::: :::: . . .:. .:..:..: ::: : ..:. . . . :.
NP_444 VALTIDDICFSLNNNSPNIRYSENAVRIEPNSVSLEDWLDFSSTNVEKADKQRNNSLMLK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVYSELKWQEKNTLEEIAELQEDIRHL
. ...: :.:. : ... ::.. :.. . . ..: . ...:::: ...: :
NP_444 ALVDRILSQTANDLRKQCDVVDTAFKNGLKDTKDARDKLADHLAKVMEEIASQEKNITAL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 EEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQYGLTDEVHQLEATIAALKQKLAQAQ
:. . . :..:::::.::.::::::::: ::: : ::... ..: ::. :::::
NP_444 EKAILDQEGPAKVAHTRLETRTHRPNVELCRDVAQYRLMKEVQEITHNVARLKETLAQAQ
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE6 DALDALCKHLARLQADIACKANSMLLD-TKCMDTRRKLTVPAERFVPEVDTFTRTTNSTL
: .: .. :: .: : :.. .: . ::. :...
NP_444 AELKGLHRRQLALQEEIQVKENTIYIDEVLCMQMRKSIPLRDGEDHGVWAGGLRPDAVC
360 370 380 390 400 410
420 430
pF1KE6 SPLKSCQLELA
>>XP_011522290 (OMIM: 612683) PREDICTED: tektin-3 isofor (490 aa)
initn: 636 init1: 636 opt: 659 Z-score: 438.5 bits: 90.4 E(85289): 1.1e-17
Smith-Waterman score: 659; 31.3% identity (63.5% similar) in 386 aa overlap (11-395:93-478)
10 20 30 40
pF1KE6 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQ
:. ::. .. ... .: :...:
XP_011 PSVAPYCTRSQRVSENTMLPFVSNRTTFFTRYTPDDWYRSNLTNYQESNTSRHNSEKLRV
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 EARVLRNETNNQTIWDEHDNRTRLVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDALTQMKESAE
.. : .. .:: . :. : ::.. .. :: . . : .. .: .:::..:. :
XP_011 DTSRLIQDKYQQTRKTQADTTQNLGERVNDIGFWKSEIIHELDEMIGETNALTDVKKRLE
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 QNLQAKNLPLDVAIECLTLRESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQQKVSQAFE
. :. . ::.:: ::: ::.: ::.:.: :: .: ::..: .. .. ....:.
XP_011 RALMETEAPLQVARECLFHREKRMGIDLVHDEVEAQLLTEVDTILCCQERMKLHLDKAIA
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 QLCLLQEVQQQLNSDHRGKMETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQWDD
:: . :..:..: :. . .:: : : : ... :: .. ..:
XP_011 QLAANRASQHELEKDLSDKQTAYRIDDKCHHLRNTSDGVGYFRGVERVDATVSVPESWAK
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 FSRFNKDRAEAEMKAATELREATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVYSELK
:. : :...: :...::. .. : ::. : ....: .:. : . ....
XP_011 FTDDNILRSQSERAASAKLRDDIENLLVVTANEMWNQFNKVNLSFTNRIAETADAKNKIQ
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 WQEKNTLEEIAELQEDIRHLEEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQYGLTD
. .::.:: . . :. ... .. : ::...:::. :: :::.:::::.:: :..
XP_011 THLAKTLQEIFQTEMTIESIKKAIKDKTAFLKVAQTRLDERTRRPNIELCRDMAQLRLVN
370 380 390 400 410 420
350 360 370 380 390
pF1KE6 EVHQLEATIAALKQKLAQAQDALDALCKHLARLQADIACKANSMLLDT-KCMDTRRKLTV
:::... :: .:.:.: .:.:.:..: . : :. :.: ::::. .: :::. :.
XP_011 EVHEVDDTIQTLQQRLRDAEDTLQSLVHIKATLEYDLAVKANSLYIDQEKCMSMRKSYPN
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430
pF1KE6 PAERFVPEVDTFTRTTNSTLSPLKSCQLELA
XP_011 TLRLVGFC
490
>>XP_011522291 (OMIM: 612683) PREDICTED: tektin-3 isofor (490 aa)
initn: 636 init1: 636 opt: 659 Z-score: 438.5 bits: 90.4 E(85289): 1.1e-17
Smith-Waterman score: 659; 31.3% identity (63.5% similar) in 386 aa overlap (11-395:93-478)
10 20 30 40
pF1KE6 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQ
:. ::. .. ... .: :...:
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Smith-Waterman score: 659; 31.3% identity (63.5% similar) in 386 aa overlap (11-395:93-478)
10 20 30 40
pF1KE6 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]