Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6336
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6336, 430 aa
1>>>pF1KE6336 430 - 430 aa - 430 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8252+/-0.00138; mu= 1.1693+/- 0.081
mean_var=206.0553+/-41.805, 0's: 0 Z-trim(105.9): 44 B-trim: 61 in 1/51
Lambda= 0.089347
statistics sampled from 8681 (8700) to 8681 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 2.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS401.1 TEKT2 gene_id:27285|Hs108|chr1 ( 430) 2768 370.0 2.5e-102
CCDS11083.1 TEKT1 gene_id:83659|Hs108|chr17 ( 418) 720 106.0 7.3e-23
CCDS11169.1 TEKT3 gene_id:64518|Hs108|chr17 ( 490) 659 98.2 1.9e-20
CCDS2005.1 TEKT4 gene_id:150483|Hs108|chr2 ( 435) 642 95.9 8e-20
CCDS10542.1 TEKT5 gene_id:146279|Hs108|chr16 ( 485) 566 86.2 7.8e-17
>>CCDS401.1 TEKT2 gene_id:27285|Hs108|chr1 (430 aa)
initn: 2768 init1: 2768 opt: 2768 Z-score: 1950.5 bits: 370.0 E(32554): 2.5e-102
Smith-Waterman score: 2768; 100.0% identity (100.0% similar) in 430 aa overlap (1-430:1-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQEARVLRNETNNQTIWDEHDN
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CCDS40 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQEARVLRNETNNQTIWDEHDN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RTRLVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDALTQMKESAEQNLQAKNLPLDVAIECLTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 RTRLVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDALTQMKESAEQNLQAKNLPLDVAIECLTLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQQKVSQAFEQLCLLQEVQQQLNSDHRGKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 ESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQQKVSQAFEQLCLLQEVQQQLNSDHRGKM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQWDDFSRFNKDRAEAEMKAATELR
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CCDS40 ETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQWDDFSRFNKDRAEAEMKAATELR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVYSELKWQEKNTLEEIAELQEDIRHL
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CCDS40 EATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVYSELKWQEKNTLEEIAELQEDIRHL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 EEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQYGLTDEVHQLEATIAALKQKLAQAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 EEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQYGLTDEVHQLEATIAALKQKLAQAQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 DALDALCKHLARLQADIACKANSMLLDTKCMDTRRKLTVPAERFVPEVDTFTRTTNSTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 DALDALCKHLARLQADIACKANSMLLDTKCMDTRRKLTVPAERFVPEVDTFTRTTNSTLS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE6 PLKSCQLELA
::::::::::
CCDS40 PLKSCQLELA
430
>>CCDS11083.1 TEKT1 gene_id:83659|Hs108|chr17 (418 aa)
initn: 687 init1: 687 opt: 720 Z-score: 523.9 bits: 106.0 E(32554): 7.3e-23
Smith-Waterman score: 720; 33.7% identity (63.6% similar) in 398 aa overlap (1-397:1-397)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQEARVLRNETNNQTIWDEHDN
:: : ..: .: .:: . :. ::. :... :.. : .: .. : .. :
CCDS11 MAKL-LQPPPKFLPSEWHIANKNQYHRADAQRSRSERLVAESQRLVDEIEKTTRKSQSDV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RTRLVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDALTQMKESAEQNLQAKNLPLDVAIECLTLR
.: .:.. :. ::. :: : .: : : .: :. :.. . :: .. ::. :
CCDS11 NKKLEQRLEEVQFWKKELDDKLEQLVNVTDDLLIYKIRLEKALETLKEPLHITETCLAYR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQQKVSQAFEQLCLLQEVQQQLNSDHRGKM
:.: ::.:.: :: :: ::.:.:.. : . . .: ::. . . .. .:..: . :.
CCDS11 EKRIGIDLVHDTVEHELIKEAEIIQGIMALLTRTLEEASEQIRMNRSAKYNLEKDLKDKF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQWDDFSRFNKDRAEAEMKAATELR
.: :: :.::: :::: . . .:. .:..:..: ::: : ..:. . . . :.
CCDS11 VALTIDDICFSLNNNSPNIRYSENAVRIEPNSVSLEDWLDFSSTNVEKADKQRNNSLMLK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVYSELKWQEKNTLEEIAELQEDIRHL
. ...: :.:. : ... ::.. :.. . . ..: . ...:::: ...: :
CCDS11 ALVDRILSQTANDLRKQCDVVDTAFKNGLKDTKDARDKLADHLAKVMEEIASQEKNITAL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 EEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQYGLTDEVHQLEATIAALKQKLAQAQ
:. . . :..:::::.::.::::::::: ::: : ::... ..: ::. :::::
CCDS11 EKAILDQEGPAKVAHTRLETRTHRPNVELCRDVAQYRLMKEVQEITHNVARLKETLAQAQ
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE6 DALDALCKHLARLQADIACKANSMLLD-TKCMDTRRKLTVPAERFVPEVDTFTRTTNSTL
: .: .. :: .: : :.. .: . ::. :...
CCDS11 AELKGLHRRQLALQEEIQVKENTIYIDEVLCMQMRKSIPLRDGEDHGVWAGGLRPDAVC
360 370 380 390 400 410
420 430
pF1KE6 SPLKSCQLELA
>>CCDS11169.1 TEKT3 gene_id:64518|Hs108|chr17 (490 aa)
initn: 636 init1: 636 opt: 659 Z-score: 480.5 bits: 98.2 E(32554): 1.9e-20
Smith-Waterman score: 659; 31.3% identity (63.5% similar) in 386 aa overlap (11-395:93-478)
10 20 30 40
pF1KE6 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRDASHQIRQ
:. ::. .. ... .: :...:
CCDS11 PSVAPYCTRSQRVSENTMLPFVSNRTTFFTRYTPDDWYRSNLTNYQESNTSRHNSEKLRV
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 EARVLRNETNNQTIWDEHDNRTRLVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDALTQMKESAE
.. : .. .:: . :. : ::.. .. :: . . : .. .: .:::..:. :
CCDS11 DTSRLIQDKYQQTRKTQADTTQNLGERVNDIGFWKSEIIHELDEMIGETNALTDVKKRLE
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 QNLQAKNLPLDVAIECLTLRESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQQKVSQAFE
. :. . ::.:: ::: ::.: ::.:.: :: .: ::..: .. .. ....:.
CCDS11 RALMETEAPLQVARECLFHREKRMGIDLVHDEVEAQLLTEVDTILCCQERMKLHLDKAIA
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 QLCLLQEVQQQLNSDHRGKMETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQWDD
:: . :..:..: :. . .:: : : : ... :: .. ..:
CCDS11 QLAANRASQHELEKDLSDKQTAYRIDDKCHHLRNTSDGVGYFRGVERVDATVSVPESWAK
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 FSRFNKDRAEAEMKAATELREATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVYSELK
:. : :...: :...::. .. : ::. : ....: .:. : . ....
CCDS11 FTDDNILRSQSERAASAKLRDDIENLLVVTANEMWNQFNKVNLSFTNRIAETADAKNKIQ
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 WQEKNTLEEIAELQEDIRHLEEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQYGLTD
. .::.:: . . :. ... .. : ::...:::. :: :::.:::::.:: :..
CCDS11 THLAKTLQEIFQTEMTIESIKKAIKDKTAFLKVAQTRLDERTRRPNIELCRDMAQLRLVN
370 380 390 400 410 420
350 360 370 380 390
pF1KE6 EVHQLEATIAALKQKLAQAQDALDALCKHLARLQADIACKANSMLLDT-KCMDTRRKLTV
:::... :: .:.:.: .:.:.:..: . : :. :.: ::::. .: :::. :.
CCDS11 EVHEVDDTIQTLQQRLRDAEDTLQSLVHIKATLEYDLAVKANSLYIDQEKCMSMRKSYPN
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430
pF1KE6 PAERFVPEVDTFTRTTNSTLSPLKSCQLELA
CCDS11 TLRLVGFC
490
>>CCDS2005.1 TEKT4 gene_id:150483|Hs108|chr2 (435 aa)
initn: 709 init1: 587 opt: 642 Z-score: 469.4 bits: 95.9 E(32554): 8e-20
Smith-Waterman score: 642; 31.0% identity (64.2% similar) in 397 aa overlap (1-396:29-424)
10 20 30
pF1KE6 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQR
.:: : . :. . : .: : : .: .:
CCDS20 MAQTVPPCELPCKEYDVARNTGAYTSSGLATASFRTSK-YLLEEWFQNCYARYHQAFADR
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 DASHQIRQEARVLRNETNNQTIWDEHDNRTRLVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDAL
: :.. :.:.. : .::. . ..:. . ::.. .. :: :.. . : :: . :
CCDS20 DQSERQRHESQQLATETQALAQRTQQDSTRTVGERLQDTHSWKSELQREMEALAAETNLL
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 TQMKESAEQNLQAKNLPLDVAIECLTLRESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQ
.:. :. :.: ..:.... . : :: :. ..:.: :: :: ::.:.:. .. :.
CCDS20 LAQKQRLERALDATEVPFSITTDNLQCRERREHPNLVRDHVETELLKEAELIRNIQELLK
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 QKVSQAFEQLCLLQEVQQQLNSDHRGKMETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGS
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CCDS20 RTIMQAVSQIRLNREHKETCEMDWSDKMEAYNIDETCGRHHSQSTEVQAHPYSTTFQESA
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 TTLQQWDDFSRFNKDRAEAEMKAATELREATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREM
.: . :.. : ::. : :...:: . . .:...:. : :...:: .: .:.
CCDS20 STPETRAKFTQDNLCRAQRERLASANLRVLVDCILRDTSEDLRLQCDAVNLAFGRRCEEL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 EKVYSELKWQEKNTLEEIAELQEDIRHLEEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRD
: . .:. . ..::.::.. .... :.. .. : :....::: :..:::.:::::
CCDS20 EDARYKLHHHLHKTLREITDQEHNVAALKQAIKDKEAPLHVAQTRLYLRSHRPNMELCRD
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 QAQYGLTDEVHQLEATIAALKQKLAQAQDALDALCKHLARLQADIACKANSMLLDT-KCM
::. : .::..:. ...::..:: .:...: : :. ::: .::...: :::
CCDS20 AAQFRLLSEVEELNMSLTALREKLLEAEQSLRNLEDIHMSLEKDIAAMTNSLFIDRQKCM
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KE6 DTRRKLTVPAERFVPEVDTFTRTTNSTLSPLKSCQLELA
: .
CCDS20 AHRTRYPTILQLAGYQ
420 430
>>CCDS10542.1 TEKT5 gene_id:146279|Hs108|chr16 (485 aa)
initn: 512 init1: 512 opt: 566 Z-score: 415.8 bits: 86.2 E(32554): 7.8e-17
Smith-Waterman score: 566; 31.3% identity (61.0% similar) in 390 aa overlap (11-395:88-473)
10 20 30
pF1KE6 MATLSVKPSRRFQLPDWHTNSYLLSTNAQLQRD-ASHQIR
:.. :: .. : .:. .: ::.
CCDS10 IANVQTCPDESTSTLRPPTILPTLRSALFSRYSPHDWDQSNQLQVRGAEASRLWASRLTD
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 QEARVLRNETNNQTIWDEHDNRTR-LVERIDTVNRWKEMLDKCLTDLDAEIDALTQMKES
. :.:... .: . ... : : .:.. .. :: :. : : .: . : .:.
CCDS10 DSMRLLQDK--DQLTHQMQEGTCRNLGQRLSDIGFWKSELSYELDRLLTENQNLETVKRR
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 AEQNLQAKNLPLDVAIECLTLRESRRDIDVVKDPVEDELHKEVEVIEATKKALQQKVSQA
: . : ::.::.::: ::.: ::.:.: :: .: .::.... .. .. :..:
CCDS10 LECAANEVNCPLQVALECLYHREKRIGIDLVHDNVEKNLIREVDLLKCCQEQMR-KLAQR
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 FE-QLCLLQEVQQQLNSDHRGKMETLEIDRGCLSLNLRSPNISLKVDPTRVPDGSTTLQQ
.. :. ...:. :. : . : . ::. :..: : ::. .. ::. .. .
CCDS10 IDIQMRDNRDAQHVLERDLEDKSSAQCIDEKCFNLRNTSDCISFFHGMEKI-DGTISVPE
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 -WDDFSRFNKDRAEAEMKAATELREATALTIAETNNELEAQRVATEFAFRKRLREMEKVY
: :: : ... . .::: . . .... : . :..:: :. :. :
CCDS10 TWAKFSNDNIKHSQNMRANSIQLREEAEHLFETLSDQMWRQFTDTNLAFNARISEVTDVK
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 SELKWQEKNTLEEIAELQEDIRHLEEDLRTKLLSLKLSHTRLEARTYRPNVELCRDQAQY
..:. : .::.:: . .. : ::... .: ::...:::: :: :::.::::: :
CCDS10 NKLQTQLAKTLQEIFQAENTIMLLERSIMAKEGPLKVAQTRLECRTRRPNMELCRDIPQL
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 GLTDEVHQLEATIAALKQKLAQAQDALDALCKHLARLQADIACKANSMLLDT-KCMDTRR
:..:: .. :. .:: .: ..::.:. : ::. ..: :::.. .: ::: :.
CCDS10 KLVNEVFTIDDTLQTLKLRLRETQDTLQLLVMTKCRLEHELAIKANTLCIDKEKCMGMRK
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430
pF1KE6 KLTVPAERFVPEVDTFTRTTNSTLSPLKSCQLELA
CCDS10 TFPCTPRLVGHT
480
430 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 12:13:51 2016 done: Tue Nov 8 12:13:51 2016
Total Scan time: 2.990 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]