Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6293
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6293, 244 aa
1>>>pF1KE6293 244 - 244 aa - 244 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4403+/-0.000843; mu= 12.8938+/- 0.050
mean_var=64.8159+/-14.015, 0's: 0 Z-trim(105.6): 51 B-trim: 51 in 1/49
Lambda= 0.159306
statistics sampled from 8465 (8515) to 8465 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16
Scan time: 2.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44054.1 SLC2A5 gene_id:6518|Hs108|chr1 ( 244) 1613 379.5 1.1e-105
CCDS99.1 SLC2A5 gene_id:6518|Hs108|chr1 ( 501) 1225 290.5 1.4e-78
CCDS98.2 SLC2A7 gene_id:155184|Hs108|chr1 ( 512) 742 179.5 3.8e-45
CCDS33616.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 ( 499) 600 146.8 2.5e-35
CCDS46673.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 ( 496) 596 145.9 4.7e-35
CCDS13818.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 ( 503) 596 145.9 4.8e-35
CCDS74828.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 ( 535) 596 145.9 5e-35
CCDS477.1 SLC2A1 gene_id:6513|Hs108|chr1 ( 492) 561 137.9 1.2e-32
CCDS3406.1 SLC2A9 gene_id:56606|Hs108|chr4 ( 511) 550 135.3 7.4e-32
CCDS3407.1 SLC2A9 gene_id:56606|Hs108|chr4 ( 540) 538 132.6 5.2e-31
CCDS11097.1 SLC2A4 gene_id:6517|Hs108|chr17 ( 509) 532 131.2 1.3e-30
CCDS8586.1 SLC2A3 gene_id:6515|Hs108|chr12 ( 496) 500 123.8 2.1e-28
CCDS66302.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 535) 496 122.9 4.2e-28
CCDS66301.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 497) 495 122.7 4.6e-28
CCDS8585.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 520) 495 122.7 4.8e-28
CCDS3215.1 SLC2A2 gene_id:6514|Hs108|chr3 ( 524) 365 92.8 4.7e-19
CCDS66300.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 411) 277 72.6 4.7e-13
>>CCDS44054.1 SLC2A5 gene_id:6518|Hs108|chr1 (244 aa)
initn: 1613 init1: 1613 opt: 1613 Z-score: 2010.8 bits: 379.5 E(32554): 1.1e-105
Smith-Waterman score: 1613; 100.0% identity (100.0% similar) in 244 aa overlap (1-244:1-244)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETYYGRTGE
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CCDS44 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETYYGRTGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAILMGCSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAILMGCSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGILVAQIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGILVAQIF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMSLGGPSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMSLGGPSC
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PEPT
::::
CCDS44 PEPT
>>CCDS99.1 SLC2A5 gene_id:6518|Hs108|chr1 (501 aa)
initn: 1225 init1: 1225 opt: 1225 Z-score: 1524.0 bits: 290.5 E(32554): 1.4e-78
Smith-Waterman score: 1225; 100.0% identity (100.0% similar) in 191 aa overlap (1-191:1-191)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETYYGRTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETYYGRTGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAILMGCSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 FMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAILMGCSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGILVAQIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 VATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGILVAQIF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMSLGGPSC
:::::::::::
CCDS99 GLRNLLANVDGWPILLGLTGVPAALQLLLLPFFPESPRYLLIQKKDEAAAKKALQTLRGW
190 200 210 220 230 240
>>CCDS98.2 SLC2A7 gene_id:155184|Hs108|chr1 (512 aa)
initn: 736 init1: 736 opt: 742 Z-score: 923.9 bits: 179.5 E(32554): 3.8e-45
Smith-Waterman score: 742; 59.6% identity (86.3% similar) in 183 aa overlap (9-191:15-197)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETY
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CCDS98 MENKEAGTPPPIPSREGRLQPTLLLATLSAAFGSAFQYGYNLSVVNTPHKVFKSFYNETY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YGRTGEFMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAI
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CCDS98 FERHATFMDGKLMLLLWSCTVSMFPLGGLLGSLLVGLLVDSCGRKGTLLINNIFAIIPAI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LMGCSRVATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGI
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CCDS98 LMGVSKVAKAFELIVFSRVVLGVCAGISYSALPMYLGELAPKNLRGMVGTMTEVFVIVGV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LVAQIFGLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMS
..::::.:. .:.: :
CCDS98 FLAQIFSLQAILGNPAGWPVLLALTGVPALLQLLTLPFFPESPRYSLIQKGDEATARQAL
190 200 210 220 230 240
>>CCDS33616.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 (499 aa)
initn: 595 init1: 595 opt: 600 Z-score: 747.7 bits: 146.8 E(32554): 2.5e-35
Smith-Waterman score: 600; 50.8% identity (79.3% similar) in 179 aa overlap (8-186:10-185)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETYYGRT
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CCDS33 MLHALLRSRMIQGR---ILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQART
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 GEFMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAILMGC
:: . : . :.::. ::..:.::..:.::.:::. .::: .:: :::: . :::.:
CCDS33 GEPLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFGF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SRVATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGILVAQ
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CCDS33 SRKAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMGQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 IFGLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMSLGGP
. :::.::
CCDS33 VVGLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRLR
180 190 200 210 220 230
>>CCDS46673.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 (496 aa)
initn: 595 init1: 595 opt: 596 Z-score: 742.8 bits: 145.9 E(32554): 4.7e-35
Smith-Waterman score: 596; 50.8% identity (79.7% similar) in 177 aa overlap (10-186:9-182)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETYYGRTGE
.::. :. : :..:..::.:::.. .:.:.: .:.: :::. .::::
CCDS46 MRALRRLIQGRILLLTICA---AGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQARTGE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAILMGCSR
. : . :.::. ::..:.::..:.::.:::. .::: .:: :::: . :::.: ::
CCDS46 PLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFGFSR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGILVAQIF
: :::.:...:::::. :::: :. :::::: :::.::::... .: ..::...:.
CCDS46 KAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMGQVV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMSLGGPSC
:::.::
CCDS46 GLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRLRGS
180 190 200 210 220 230
>>CCDS13818.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 (503 aa)
initn: 595 init1: 595 opt: 596 Z-score: 742.7 bits: 145.9 E(32554): 4.8e-35
Smith-Waterman score: 596; 50.8% identity (79.7% similar) in 177 aa overlap (10-186:16-189)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETY
.::. :. : :..:..::.:::.. .:.:.: .:.: :::.
CCDS13 MEDELEPSLRPRTQIQGRILLLTICA---AGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETW
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YGRTGEFMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAI
.:::: . : . :.::. ::..:.::..:.::.:::. .::: .:: :::: . ::
CCDS13 QARTGEPLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LMGCSRVATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGI
:.: :: : :::.:...:::::. :::: :. :::::: :::.::::... .: ..::
CCDS13 LFGFSRKAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LVAQIFGLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMS
...:. :::.::
CCDS13 VMGQVVGLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAAL
180 190 200 210 220 230
>>CCDS74828.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 (535 aa)
initn: 619 init1: 595 opt: 596 Z-score: 742.3 bits: 145.9 E(32554): 5e-35
Smith-Waterman score: 596; 50.8% identity (79.7% similar) in 177 aa overlap (10-186:16-189)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETY
.::. :. : :..:..::.:::.. .:.:.: .:.: :::.
CCDS74 MEDELEPSLRPRTQIQGRILLLTICA---AGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETW
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YGRTGEFMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAI
.:::: . : . :.::. ::..:.::..:.::.:::. .::: .:: :::: . ::
CCDS74 QARTGEPLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LMGCSRVATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGI
:.: :: : :::.:...:::::. :::: :. :::::: :::.::::... .: ..::
CCDS74 LFGFSRKAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LVAQIFGLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMS
...:. :::.::
CCDS74 VMGQVVGLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAAL
180 190 200 210 220 230
>>CCDS477.1 SLC2A1 gene_id:6513|Hs108|chr1 (492 aa)
initn: 551 init1: 529 opt: 561 Z-score: 699.4 bits: 137.9 E(32554): 1.2e-32
Smith-Waterman score: 561; 43.7% identity (80.0% similar) in 190 aa overlap (1-190:1-184)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETYYGRTGE
:: ..... ::: :... :.: .:.:.:::....:.: ....:::.:. : ::
CCDS47 MEPSSKKLT-GRLMLAVGGAVL-----GSLQFGYNTGVINAPQKVIEEFYNQTWVHRYGE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAILMGCSR
. :: :::..:..: ::.:::. :: .::.:::....:. :....: :.::: :.
CCDS47 SILPTTLTTLWSLSVAIFSVGGMIGSFSVGLFVNRFGRRNSMLMMNLLAFVSAVLMGFSK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGILVAQIF
.. :::..:..:...:. :.... ::::.::..: ::::::.. :: :.::::.::.:
CCDS47 LGKSFEMLILGRFIIGVYCGLTTGFVPMYVGEVSPTALRGALGTLHQLGIVVGILIAQVF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLTGWMSLGGPSC
:: ....: :
CCDS47 GLDSIMGNKDLWPLLLSIIFIPALLQCIVLPFCPESPRFLLINRNEENRAKSVLKKLRGT
180 190 200 210 220 230
>>CCDS3406.1 SLC2A9 gene_id:56606|Hs108|chr4 (511 aa)
initn: 538 init1: 538 opt: 550 Z-score: 685.5 bits: 135.3 E(32554): 7.4e-32
Smith-Waterman score: 550; 45.9% identity (78.9% similar) in 185 aa overlap (2-186:12-196)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFY
:..:.. :. . : .:.: .:::::: ::::...::.:. .. ::
CCDS34 MKLSKKDRGEDEESDSAKKKLDWSCSLLVASLAGAFGSSFLYGYNLSVVNAPTPYIKAFY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 NETYYGRTGEFMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSI
::.. : :. .. ::::::::::.: .::..:.:.: . . .::: .:: :: :.:
CCDS34 NESWERRHGRPIDPDTLTLLWSVTVSIFAIGGLVGTLIVKMIGKVLGRKHTLLANNGFAI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 VPAILMGCSRVATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFI
:.::.:: : .::..:..:...:: .::. .:.::::.:..::..::.:: : .::
CCDS34 SAALLMACSLQAGAFEMLIVGRFIMGIDGGVALSVLPMYLSEISPKEIRGSLGQVTAIFI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 TVGILVAQIFGLRNLLANVDGEFRTSREHPHPFTTTLGPLLVFQSHHHRTGLSADWSLLT
.:....:..:: .::
CCDS34 CIGVFTGQLLGLPELLGKESTWPYLFGVIVVPAVVQLLSLPFLPDSPRYLLLEKHNEARA
190 200 210 220 230 240
>>CCDS3407.1 SLC2A9 gene_id:56606|Hs108|chr4 (540 aa)
initn: 538 init1: 538 opt: 538 Z-score: 670.2 bits: 132.6 E(32554): 5.2e-31
Smith-Waterman score: 538; 48.2% identity (80.6% similar) in 170 aa overlap (17-186:56-225)
10 20 30 40
pF1KE6 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLM
: .:.: .:::::: ::::...::.:. .
CCDS34 PPGPGRALLECDHLRSGVPGGRRRKDWSCSLLVASLAGAFGSSFLYGYNLSVVNAPTPYI
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 QQFYNETYYGRTGEFMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNN
. ::::.. : :. .. ::::::::::.: .::..:.:.: . . .::: .:: ::
CCDS34 KAFYNESWERRHGRPIDPDTLTLLWSVTVSIFAIGGLVGTLIVKMIGKVLGRKHTLLANN
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 IFSIVPAILMGCSRVATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVP
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CCDS34 GFAISAALLMACSLQAGAFEMLIVGRFIMGIDGGVALSVLPMYLSEISPKEIRGSLGQVT
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