FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6096, 326 aa
1>>>pF1KE6096 326 - 326 aa - 326 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7043+/-0.00119; mu= 13.7179+/- 0.070
mean_var=146.5940+/-47.508, 0's: 0 Z-trim(101.8): 363 B-trim: 408 in 1/47
Lambda= 0.105929
statistics sampled from 6265 (6676) to 6265 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.541), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 2.420
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 1027 169.6 2.9e-42
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CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 834 140.1 2.2e-33
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 834 140.1 2.2e-33
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CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 827 139.0 4.6e-33
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CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 822 138.3 8.5e-33
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CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 821 138.1 8.7e-33
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 821 138.1 8.8e-33
>>CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 (335 aa)
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Smith-Waterman score: 1054; 47.9% identity (77.1% similar) in 328 aa overlap (1-325:5-332)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MVLNVYCCFFQISDIQTMKINQTILKEFILVGFSVYPHVQTFLFVVFFCLYLLTLA
.... :. . .: . : :.. ::.:.::: ..: :::::. :::. :.
CCDS30 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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::. :... .:.:::::::.::. :: ::: ::..:.:::: .::. :.:: . :.::
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120 130 140 150 160 170
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CCDS30 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLAAACAIGGFLASLTVV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 ALIFRDSFCRPNLVKHFFCHMLAVIRLSCIDSNHTEFIITLISVSGLLGTLLLIILTDVF
:.: :: : :.:.:: . ::: :.: ... .::.: . .: :. .:.: .. .
CCDS30 NLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNEFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYLC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 IISTVLRIPSAEGKQKAFTTCASHLTVVIIHFGFASIVYLKPEA---SGDDTLIAVPYTV
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CCDS30 ILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYTI
250 260 270 280 290 300
300 310 320
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CCDS30 VTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
310 320 330
>>CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 (318 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVLNVYCCFFQISDIQTMKINQTILKEFILVGFSVYPHVQTFLFVVFFCLYLLTLAGNLI
. :.. . .::::::::.::.: .::..:. .::.:: :::.
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IMGLTWVDRSLHTPMYLFLSALSFSETCYTLTIVPKMLEDLLAKDRSISVTGCSLQMCFF
::. .: .::::::::::: ::: :: ::..:.:.:: :::. .:::. .:. :: :
CCDS12 IMATVWSERSLHTPMYLFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFS
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pF1KE6 LGLGGTNCIILTLMGYDRFLAICNPLRYPLLMTNIVCGQLVASACTAGFFISLTETALIF
...: :. ..::.:::::..:::.:::: .::. :. ::. . ..:. .... :. ::
CCDS12 FSFGFTHSFLLTVMGYDRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIF
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190 200 210 220 230
pF1KE6 RDSFCRPNLVKHFFCHMLAVIRLSCIDSNHTEFI-ITLISVSGLLGTLLLIILTDVFIIS
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CCDS12 HLAFCGHKEIHHFACHVPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVA
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TVLRIPSAEGKQKAFTTCASHLTVVIIHFGFASIVYLKPEASGD---DTLIAVPYTVITP
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CCDS12 AILKIPSAEGRNKAFSTCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTP
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 FLSPIIFSLRNKDMKNAFRRMMGNTVALKK
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CCDS12 FLSPIIFSLRNKELKVAMKKTFFSKLYPEKNVMM
290 300 310
>>CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 (315 aa)
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pF1KE6 MVLNVYCCFFQISDIQTMKINQTILKEFILVGFSVYPHVQTFLFVVFFCLYLLTLAGNLI
. .:.: ..::::::::..::.: .::..:. .::.:: :::.
CCDS12 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLL
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pF1KE6 IMGLTWVDRSLHTPMYLFLSALSFSETCYTLTIVPKMLEDLLAKDRSISVTGCSLQMCFF
::. .: .::::::::::: .:: :: ::..:.:.:: :::. .:::. .:. :: :
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pF1KE6 LGLGGTNCIILTLMGYDRFLAICNPLRYPLLMTNIVCGQLVASACTAGFFISLTETALIF
...: :. ..::.:::::..:::.:::: .::. :. ::. . ..: .... :. ::
CCDS12 FSFGFTHSFLLTVMGYDRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIF
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pF1KE6 RDSFCRPNLVKHFFCHMLAVIRLSCIDS-NHTEFIITLISVSGLLGTLLLIILTDVFIIS
. .:: . ..::.::. ...:.: .. . . . :. . .::: .:::.:. .::..
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pF1KE6 TVLRIPSAEGKQKAFTTCASHLTVVIIHFGFASIVYLKPEASGD---DTLIAVPYTVITP
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CCDS12 DILKIPSAEGRNKAFSTCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTP
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300 310 320
pF1KE6 FLSPIIFSLRNKDMKNAFRRMMGNTVALKK
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CCDS12 FLSPIIFSLRNKELKVAMKRTFLSTLYSSGT
290 300 310
>>CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 (315 aa)
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pF1KE6 MVLNVYCCFFQISDIQTMKINQTILKEFILVGFSVYPHVQTFLFVVFFCLYLLTLAGNLI
.:.: ..::::::::..::.: .::..:. .::.:: :::.
CCDS32 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLL
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pF1KE6 IMGLTWVDRSLHTPMYLFLSALSFSETCYTLTIVPKMLEDLLAKDRSISVTGCSLQMCFF
::. .: .:::: :::::: :::..: ::..:.:.:: :::. .:::. .:. :: :
CCDS32 IMATVWSERSLHMPMYLFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFS
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...: :. ..::.:::::..:::.:::: .::. : :. . ..:. .... :. ::
CCDS32 FSFGFTHSFLLTVMGYDRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIF
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pF1KE6 RDSFCRPNLVKHFFCHMLAVIRLSCIDSNHTEFI-ITLISVSGLLGTLLLIILTDVFIIS
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CCDS32 HLAFCGHKEIHHFFCHVPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVA
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pF1KE6 TVLRIPSAEGKQKAFTTCASHLTVVIIHFGFASIVYLKPEASGD---DTLIAVPYTVITP
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CCDS32 AILKIPSAEGRNKAFSTCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTP
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300 310 320
pF1KE6 FLSPIIFSLRNKDMKNAFRRMMGNTVALKK
::::::::::::..: :...
CCDS32 FLSPIIFSLRNKELKVAMKKTCFTKLFPQNC
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>>CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 (313 aa)
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pF1KE6 MVLNVYCCFFQISDIQTMKINQTILKEFILVGFSVYPHVQTFLFVVFFCLYLLTLAGNLI
..:.:...::...::: ..: .:::.:. :::.::. : :
CCDS30 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAI
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:.. .::.::::::.::. :: :: :::..:::::: :::.. ..:: ::..:: :
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: .:... ..:. :::::..:::::::: .:: . :: :.:.::. :: .::. :.:.:
CCDS30 LFFGSSHSFLLAAMGYDRYMAICNPLRYSVLMGHGVCMGLMAAACACGFTVSLVTTSLVF
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pF1KE6 RDSFCRPNLVKHFFCHMLAVIRLSCIDSNHTEFIITLISVSGLLGTLLLIILTDVFIIST
. : : ..:::: . :..:. :. ....: ...: .:. ::::... . :::.
CCDS30 HLPFHSSNQLHHFFCDISPVLKLASQHSGFSQLVIFMLGVFALVIPLLLILVSYIRIISA
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pF1KE6 VLRIPSAEGKQKAFTTCASHLTVVIIHFGFASIVYLKPEA---SGDDTLIAVPYTVITPF
.:.:::. :. :.:.:::::: :: .:.. ::..::.:.. :..::::.: ::..::.
CCDS30 ILKIPSSVGRYKTFSTCASHLIVVTVHYSCASFIYLRPKTNYTSSQDTLISVSYTILTPL
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pF1KE6 LSPIIFSLRNKDMKNAFRRMMGNTVALKK
..:.:.:::::..:.:.:: .:.:
CCDS30 FNPMIYSLRNKEFKSALRRTIGQTFYPLS
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>>CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 (314 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVLNVYCCFFQISDIQTMKINQTILKEFILVGFSVYPHVQTFLFVVFFCLYLLTLAGNLI
:.. .::::::: ..: .:::.:. ::: :..:.
CCDS30 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANVT
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70 80 90 100 110 120
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::.. . .:::::: :: :::::.:::..:.:..: ::. ..:: .:. :. ::
CCDS30 IMAVIRFSWTLHTPMYGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQLFFF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LGLGGTNCIILTLMGYDRFLAICNPLRYPLLMTNIVCGQLVASACTAGFFISLTETALIF
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CCDS30 LGFACTNCLLIAVMGYDRYVAICHPLRYTLIINKRLGLELISLSGATGFFIALVATNLIC
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RDSFCRPNLVKHFFCHMLAVIRLSCIDSNHTEFIITLISVSGLLGTLLLIILTDVFIIST
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CCDS30 DMRFCGPNRVNHYFCDMAPVIKLACTDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGFIVNT
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE6 VLRIPSAEGKQKAFTTCASHLTVVIIHFGFASIVYLKPE---ASGDDTLIAVPYTVITPF
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CCDS30 ILKIPSAEGK-KAFVTCASHLTVVFVHYGCASIIYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTVVTPL
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 LSPIIFSLRNKDMKNAFRRMMGNTVALKK
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CCDS30 LNPLVYSLRNKEVKTALKRVLGMPVATKMS
290 300 310
>>CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 (316 aa)
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10 20 30 40 50
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: .:..:: : :::..: :. .::.... ..:.:: :::
CCDS32 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNL
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CCDS32 LIMATIWIEHRLHTPMYLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFF
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pF1KE6 FLGLGGTNCIILTLMGYDRFLAICNPLRYPLLMTNIVCGQLVASACTAGFFISLTETALI
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CCDS32 SFMFGFTHSFLLLVMGYDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIV
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pF1KE6 FRDSFCRPNLVKHFFCHMLAVIRLSCIDSNHTEFI-ITLISVSGLLGTLLLIILTDVFII
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CCDS32 FHLTFCGSNVIHHFFCHVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIV
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 STVLRIPSAEGKQKAFTTCASHLTVVIIHFGFASIVYLKPE---ASGDDTLIAVPYTVIT
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CCDS32 AAILRIPSAEGRHKTFSTCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFT
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300 310 320
pF1KE6 PFLSPIIFSLRNKDMKNAFRRMMGNTVALKK
:::::::::::::..:::. .
CCDS32 PFLSPIIFSLRNKELKNAINKNFYRKFCPPSS
290 300 310
>>CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 (320 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE6 MVLNVYCCFFQISDIQTMKI-NQTILKEFILVGFSVYPHVQTFLFVVFFCLYLLTLAGNL
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CCDS11 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLAGNI
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pF1KE6 IIMGLTWVDRSLHTPMYLFLSALSFSETCYTLTIVPKMLEDLLAKDRSISVTGCSLQMCF
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CCDS11 IIVTIIRMDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPISLAGCATQMFF
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pF1KE6 FLGLGGTNCIILTLMGYDRFLAICNPLRYPLLMTNIVCGQLVASACTAGFFISLTETALI
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CCDS11 FVTFGITNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIGLIVAITQVTSV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FRDSFCRPNLVKHFFCHMLAVIRLSCIDSNHTEFIITLISVSGLLGTLLLIILTDVFIIS
:: :: : :::: . :..:::::.. .:.. .::: :. . :.... :.:::
CCDS11 FRLPFC-ARKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIIS
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pF1KE6 TVLRIPSAEGKQKAFTTCASHLTVVIIHFGFASIVYLKPEASGD---DTLIAVPYTVITP
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CCDS11 TILKIASVEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITP
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 FLSPIIFSLRNKDMKNAFRRMMGNTVALKK
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CCDS11 LLNPVVYTLRNKEVKDALCRAVGGKFS
300 310 320
>>CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 (316 aa)
initn: 934 init1: 530 opt: 976 Z-score: 830.0 bits: 161.8 E(32554): 6.5e-40
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CCDS12 MPGQNYRTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNL
10 20 30 40
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.::. .:..: ::::::::: :::.:: .:..:.:.:: ::: :::. ..:..:: :
CCDS12 LIMATVWIERRLHTPMYLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFF
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pF1KE6 FLGLGGTNCIILTLMGYDRFLAICNPLRYPLLMTNIVCGQLVASACTAGFFISLTETALI
. .: :. ..: .::::....::.::.: .::. :..::: . ..: ... : ..
CCDS12 SFMFGFTHSFLLMVMGYDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMV
110 120 130 140 150 160
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pF1KE6 FRDSFCRPNLVKHFFCHMLAVIRLSCIDSNHTEFI-ITLISVSGLLGTLLLIILTDVFII
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CCDS12 FHLTFCGSNVIHHFLCHVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 STVLRIPSAEGKQKAFTTCASHLTVVIIHFGFASIVYLKPE---ASGDDTLIAVPYTVIT
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CCDS12 AAILRIPSAEGRHKTFSTCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFT
230 240 250 260 270 280
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pF1KE6 PFLSPIIFSLRNKDMKNAFRRMMGNTVALKK
:::::::::::::..:::. .
CCDS12 PFLSPIIFSLRNKELKNAINKNFCRRFCPLSS
290 300 310
>>CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 (312 aa)
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CCDS30 MERVNETVVREVIFLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAI
10 20 30 40
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pF1KE6 IMGLTWVDRSLHTPMYLFLSALSFSETCYTLTIVPKMLEDLLAKDRSISVTGCSLQMCFF
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CCDS30 IISTIVLDRALHIPMYFFLAILSCSEICYTFIIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSF
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CCDS30 LFLGCSHSFLLAVMGYDRYIAICNPLRYSVLMGHGVCMGLVAAACACGFTVAQIITSLVF
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CCDS30 HLPFYSSNQLHHFFCDIAPVLKLASHHNHFSQIVIFMLCTLVLAIPLLLILVSYVHILSA
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pF1KE6 VLRIPSAEGKQKAFTTCASHLTVVIIHFGFASIVYLKPEA---SGDDTLIAVPYTVITPF
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