FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6095, 326 aa
1>>>pF1KE6095 326 - 326 aa - 326 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2640+/-0.0014; mu= 10.3617+/- 0.082
mean_var=134.0808+/-42.801, 0's: 0 Z-trim(100.9): 368 B-trim: 770 in 2/44
Lambda= 0.110762
statistics sampled from 5868 (6310) to 5868 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.518), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16
Scan time: 1.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 2109 349.5 2.2e-96
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1699 284.0 1.2e-76
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1615 270.6 1.4e-72
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1139 194.4 9.8e-50
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1119 191.2 8.9e-49
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CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1099 188.1 8.4e-48
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1091 186.8 2e-47
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1078 184.7 8.6e-47
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CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1061 182.0 5.5e-46
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1049 180.1 2.1e-45
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1044 179.3 3.6e-45
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 1043 179.1 4.1e-45
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1042 179.0 5e-45
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1039 178.5 6.3e-45
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1035 177.8 9.8e-45
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1034 177.7 1.1e-44
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1026 176.4 2.6e-44
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1025 176.2 3e-44
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1019 175.3 5.8e-44
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1017 174.9 7.1e-44
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 1017 174.9 7.2e-44
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1012 174.1 1.3e-43
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1009 173.7 1.7e-43
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CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1005 173.0 2.7e-43
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CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 ( 325) 1005 173.0 2.8e-43
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1004 172.9 3.1e-43
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1002 172.5 3.8e-43
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1000 172.2 4.7e-43
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 999 172.1 5.3e-43
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 995 171.4 8.5e-43
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 993 171.1 1e-42
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 991 170.8 1.3e-42
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 990 170.6 1.4e-42
CCDS7782.1 OR5P2 gene_id:120065|Hs108|chr11 ( 322) 990 170.6 1.5e-42
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 987 170.2 2e-42
CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 ( 313) 986 170.0 2.2e-42
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 984 169.7 3e-42
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 983 169.5 3.1e-42
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 981 169.2 3.9e-42
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 978 168.7 5.4e-42
CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 ( 310) 977 168.5 6e-42
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 972 167.7 1e-41
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 970 167.4 1.3e-41
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 970 167.5 1.4e-41
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 969 167.3 1.5e-41
>>CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 (326 aa)
initn: 2109 init1: 2109 opt: 2109 Z-score: 1843.9 bits: 349.5 E(32554): 2.2e-96
Smith-Waterman score: 2109; 99.7% identity (100.0% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSGLPSDMDLYKLQLNNFTEVTMFILISFTEEFDVQVFLFLLFLAIYLFTLIGNLGLVVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSGLPSDMDLYKLQLNNFTEVTMFILISFTEEFDVQVFLFLLFLAIYLFTLIGNLGLVVP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISFLGCATQMFLACTFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISFLGCATQMFLACTFG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGILHATIHTVATFSLSF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS31 TTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVASILHATIHTVATFSLSF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEIVTILIVLISYGFILLAILKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEIVTILIVLISYGFILLAILKM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 QSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTSDNDMIVSIFYTIVIPMLNPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTSDNDMIVSIFYTIVIPMLNPI
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 IYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
310 320
>>CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 (340 aa)
initn: 1680 init1: 1659 opt: 1699 Z-score: 1489.6 bits: 284.0 E(32554): 1.2e-76
Smith-Waterman score: 1699; 82.6% identity (94.0% similar) in 317 aa overlap (1-317:19-335)
10 20 30 40
pF1KE6 MSGLPSDMDLYKLQLNNFTEVTMFILISFTEEFDVQVFLFLL
:. : : .:.:. :.: :::::::: .::..:..:::::::
CCDS31 MDSTFTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTDDFELQVFLFLL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 FLAIYLFTLIGNLGLVVPIIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAKNK
:.::::::::::::::: .: : :::.::::::.::::::.:::::::::::::::::::
CCDS31 FFAIYLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAKNK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 SISFLGCATQMFLACTFGTTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYV
::::.::::::.: ::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SISFIGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 AGILHATIHTVATFSLSFCGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEIVT
::::::::: :::::::::::::::::::.:::::::::::::. :::.:::::::::::
CCDS31 AGILHATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEIVT
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 ILIVLISYGFILLAILKMQSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTSDN
::::::: ::::.::::.::.::.:.:::::.::::::::::::: :.::::::.::.
CCDS31 ILIVLISCDFILLSILKMHSAKGRQKAFSTCGSHLTGVTIYHGTILVSYMRPSSSYASDH
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320
pF1KE6 DMIVSIFYTIVIPMLNPIIYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
:.::::::::::: :::::::::::.::.:.:..:
CCDS31 DIIVSIFYTIVIPKLNPIIYSLRNKEVKKAVKKMLKLVYK
310 320 330 340
>>CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 (359 aa)
initn: 1628 init1: 1604 opt: 1615 Z-score: 1416.7 bits: 270.6 E(32554): 1.4e-72
Smith-Waterman score: 1615; 75.5% identity (93.5% similar) in 323 aa overlap (8-326:31-353)
10 20 30
pF1KE6 MSGLPSDMDLYKLQLN----NFTEVTMFILISFTEEF
: ..:. :. : ::::.:.: .::...
CCDS31 MSYSIYKSTVNIPLSHGVVHSFCHNMNCNFMHIFKFVLDFNMKNVTEVTLFVLKGFTDNL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 DVQVFLFLLFLAIYLFTLIGNLGLVVPIIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKM
..:...:.::::::::::.:::::.. .: : ::.::::::..:: .:.:::.:.::.:
CCDS31 ELQTIFFFLFLAIYLFTLMGNLGLILVVIRDSQLHKPMYYFLSMLSSVDACYSSVITPNM
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 LVNFLAKNKSISFLGCATQMFLACTFGTTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVY
::.: .::: ::::::..:.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LVDFTTKNKVISFLGCVAQVFLACSFGTTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVY
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 VPLITASYVAGILHATIHTVATFSLSFCGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFY
.:::.::::::::::::::::::::::::.::::.:::..::::::: ::::. :::.::
CCDS31 MPLINASYVAGILHATIHTVATFSLSFCGANEIRRVFCDIPPLLAISYSDTHTNQLLLFY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 FVGSIEIVTILIVLISYGFILLAILKMQSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVR
::::::.:::::::::::.:::::::: :::::::::::::::::::.::.:::::::::
CCDS31 FVGSIELVTILIVLISYGLILLAILKMYSAEGRRKVFSTCGAHLTGVSIYYGTILFMYVR
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320
pF1KE6 PSSSYTSDNDMIVSIFYTIVIPMLNPIIYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
:::::.::.:::::::::::::.:::.::::::::::...:... .: :::.
CCDS31 PSSSYASDHDMIVSIFYTIVIPLLNPVIYSLRNKDVKDSMKKMFGKNQVINKVYFHTKK
310 320 330 340 350
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1184 init1: 1135 opt: 1139 Z-score: 1006.4 bits: 194.4 E(32554): 9.8e-50
Smith-Waterman score: 1139; 55.4% identity (81.5% similar) in 314 aa overlap (8-320:1-314)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSGLPSDMDLYK-LQLNNFTEVTMFILISFTEEFDVQVFLFLLFLAIYLFTLIGNLGLVV
: :.: .. : :::: :.:...... :.: :: ::: ::. ...::::..:
CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PIIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISFLGCATQMFLACTF
: :. ::.:::.::. :::.:. ::. ::::::::..:.::.::: :::.:... .:
CCDS31 LIKIDLCLHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 GTTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGILHATIHTVATFSLS
::::::: ::::::.::.::::: : .: :. ::..:..:: .:.::: :: ::
CCDS31 LGTECFLLAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FCGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEIVTILIVLISYGFILLAILK
:::::.: : .:. :::: .:::::: .... : . : : ..:::::: :..:.::
CCDS31 FCGSNRINHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 MQSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTSDNDMIVSIFYTIVIPMLNP
: : :::.:.::::...: .:::. :::::::.::.:::. ..: .::.:::..::.:::
CCDS31 MPSLEGRHKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNP
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 IIYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
.::::.:::::.:.:..: ..
CCDS31 LIYSLKNKDVKKALKKILWKHIL
300 310
>>CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1110 init1: 1086 opt: 1119 Z-score: 989.2 bits: 191.2 E(32554): 8.9e-49
Smith-Waterman score: 1119; 54.9% identity (82.6% similar) in 304 aa overlap (13-316:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSGLPSDMDLYKLQLNNFTEVTMFILISFTEEFDVQVFLFLLFLAIYLFTLIGNLGLVVP
.. .: . .: :.:...:.. ...: :: .:::.:.... .:::..:
CCDS31 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISFLGCATQMFLACTFG
: :. ::.:::.::. ::: :.::::.. :::::..::::::: : ::: :... : :.
CCDS31 IRMDYQLHTPMYFFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGILHATIHTVATFSLSF
.::.::..::.::: :: :::::.:.:: :: :.:. :..:: : :: . .: : :
CCDS31 DSECLLLSVMAFDRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEIVTILIVLISYGFILLAILKM
:::::: : ::..:::: .: :::.: .:..: : ::. :: :.::: .:.:..:..
CCDS31 CGSNEINHFFCDIPPLLLLSRSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEI
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 QSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTSDNDMIVSIFYTIVIPMLNPI
.::::: :..::: .::..:.:..::.:::: ::::::. :.: ..:.:::.:.:::::.
CCDS31 HSAEGRFKALSTCTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPL
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 IYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
::::::::::::.:.:
CCDS31 IYSLRNKDVKEALKKLKNKILF
290 300 310
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1144 init1: 1095 opt: 1108 Z-score: 979.6 bits: 189.5 E(32554): 3e-48
Smith-Waterman score: 1108; 54.2% identity (81.4% similar) in 301 aa overlap (17-317:7-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSGLPSDMDLYKLQLNNFTEVTMFILISFTEEFDVQVFLFLLFLAIYLFTLIGNLGLVVP
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300 310
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CCDS41 IRADTSLNTPMYFFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFM
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CCDS41 IYSLQNKEVKEALKKIIINKN
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CCDS31 LTECFLLAAMAYDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDF
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