Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6094
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6094, 326 aa
1>>>pF1KE6094 326 - 326 aa - 326 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6286+/-0.0012; mu= 14.1202+/- 0.071
mean_var=140.0861+/-44.369, 0's: 0 Z-trim(102.7): 406 B-trim: 819 in 2/45
Lambda= 0.108362
statistics sampled from 6526 (7065) to 6526 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 2.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 2110 342.3 3.1e-94
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1367 226.2 3e-59
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1340 221.9 5.3e-58
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1316 218.1 7.1e-57
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1312 217.5 1.1e-56
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1299 215.5 4.5e-56
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1292 214.4 9.6e-56
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1262 209.7 2.5e-54
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1240 206.3 2.7e-53
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1169 195.2 5.9e-50
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1103 184.8 7.5e-47
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1093 183.3 2.2e-46
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1088 182.5 3.8e-46
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1062 178.5 7e-45
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1053 177.0 1.7e-44
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1047 176.1 3.2e-44
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1045 175.8 4.1e-44
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1045 175.8 4.1e-44
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1042 175.3 5.6e-44
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1038 174.7 8.6e-44
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1033 173.9 1.5e-43
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1032 173.7 1.6e-43
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1029 173.3 2.3e-43
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1022 172.2 4.8e-43
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1020 171.9 6.1e-43
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1017 171.4 8.3e-43
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1017 171.4 8.4e-43
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1013 170.8 1.3e-42
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1007 169.8 2.5e-42
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1006 169.7 2.8e-42
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1003 169.2 3.8e-42
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 995 168.0 9.1e-42
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 994 167.8 1e-41
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 985 166.4 2.7e-41
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 982 165.9 3.7e-41
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 982 166.0 3.9e-41
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 977 165.1 6.4e-41
CCDS31536.1 OR9G1 gene_id:390174|Hs108|chr11 ( 305) 976 165.0 7e-41
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 969 163.9 1.6e-40
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 965 163.3 2.3e-40
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 965 163.3 2.4e-40
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 964 163.1 2.6e-40
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 963 163.0 3e-40
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 962 162.8 3.3e-40
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 961 162.6 3.6e-40
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 961 162.7 3.7e-40
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 960 162.5 4.1e-40
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 958 162.2 5e-40
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 958 162.2 5e-40
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 957 162.0 5.6e-40
>>CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 (326 aa)
initn: 2110 init1: 2110 opt: 2110 Z-score: 1805.2 bits: 342.3 E(32554): 3.1e-94
Smith-Waterman score: 2110; 100.0% identity (100.0% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGFLSPMHPCRPPTQRRMAAGNHSTVTEFILKGLTKRADLQLPLFLLFLGIYLVTIVGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGFLSPMHPCRPPTQRRMAAGNHSTVTEFILKGLTKRADLQLPLFLLFLGIYLVTIVGNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GMITLICLNSQLHTPMYYFLSNLSLMDLCYSSVITPKMLVNFVSEKNIISYAGCMSQLYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GMITLICLNSQLHTPMYYFLSNLSLMDLCYSSVITPKMLVNFVSEKNIISYAGCMSQLYF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 FLVFVIAECYMLTVMAYDRYVAICHPLLYNIIMSHHTCLLLVAVVYAIGLIGSTIETGLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLVFVIAECYMLTVMAYDRYVAICHPLLYNIIMSHHTCLLLVAVVYAIGLIGSTIETGLM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LKLPYCEHLISHYFCDILPLMKLSCSSTYDVEMTVFFSAGFNIIVTSLTVLVSYTFILSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LKLPYCEHLISHYFCDILPLMKLSCSSTYDVEMTVFFSAGFNIIVTSLTVLVSYTFILSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENVASVFYTTVIPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENVASVFYTTVIPM
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF
::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF
310 320
>>CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 (346 aa)
initn: 793 init1: 793 opt: 1367 Z-score: 1177.1 bits: 226.2 E(32554): 3e-59
Smith-Waterman score: 1367; 63.6% identity (87.2% similar) in 327 aa overlap (1-326:24-345)
10 20 30
pF1KE6 MGFLSPMHPCRPPTQRRMAAGNHSTVTEFILKGLTKR
: :::: . :..:::: ::: ::.::: :::..
CCDS66 MIIYKQGITFLQKENNNTIHLNTMFFLSPAE-----THQRMAAENHSFVTKFILVGLTEK
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 ADLQLPLFLLFLGIYLVTIVGNLGMITLICLNSQLHTPMYYFLSNLSLMDLCYSSVITPK
..:::::::.:::::.::..::::::::: :.:.:::::: :::.::..:.:.:.:::::
CCDS66 SELQLPLFLVFLGIYVVTVLGNLGMITLIGLSSHLHTPMYCFLSSLSFIDFCHSTVITPK
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 MLVNFVSEKNIISYAGCMSQLYFFLVFVIAECYMLTVMAYDRYVAICHPLLYNIIMSHHT
::::::.::::::: ::.::::::::.::::.::..:::: ::::: ::::.::.:...
CCDS66 MLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAYDGYVAICSPLLYSIIISNKA
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 CLLLVAVVYAIGLIGSTIETGLMLKLPYCEH-LISHYFCDILPLMKLSCSSTYDVEMTVF
:. :. :::.:::: .. . : :... .:. .:.:::::.. ..:::::::: :. ..
CCDS66 CFSLILVVYVIGLICASAHIGCMFRVQFCKFDVINHYFCDLISILKLSCSSTYINELLIL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 FSAGFNIIVTSLTVLVSYTFILSSILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYL
. .:.::.: :::.: :: ::..::: : ::::::::::::::..::..:.::.:::::
CCDS66 IFSGINILVPSLTILSSYIFIIASILRIRYTEGRSKAFSTCSSHISAVSVFFGSAAFMYL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KE6 KPSTISSLTQENVASVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF
.::..::. : .:.::::: :.:::::::::::::.:..:..::: . :
CCDS66 QPSSVSSMDQGKVSSVFYTIVVPMLNPLIYSLRNKDVHVALKKTLGKRTFL
300 310 320 330 340
>>CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1360 init1: 758 opt: 1340 Z-score: 1154.8 bits: 221.9 E(32554): 5.3e-58
Smith-Waterman score: 1340; 64.4% identity (88.9% similar) in 306 aa overlap (18-322:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGFLSPMHPCRPPTQRRMAAGNHSTVTEFILKGLTKRADLQLPLFLLFLGIYLVTIVGNL
:.. :.:.:::::: ::... .:::::::::::::.::.::::
CCDS73 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GMITLICLNSQLHTPMYYFLSNLSLMDLCYSSVITPKMLVNFVSEKNIISYAGCMSQLYF
:: ::: :.:.::::::::::.::..:.:.:.:::::::::::.::::::: ::.::::
CCDS73 GMTTLIWLSSHLHTPMYYFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 FLVFVIAECYMLTVMAYDRYVAICHPLLYNIIMSHHTCLLLVAVVYAIGLIGSTIETGLM
::::.::::.::..::::::.::: ::::..:.:...:. :. :: :::. ....:: :
CCDS73 FLVFAIAECHMLAAMAYDRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE6 LKLPYCEH-LISHYFCDILPLMKLSCSSTYDVEMTVFFSAGFNIIVTSLTVLVSYTFILS
... .:. ::.:::::.:::.:::::: : .. .. ..:::.: :::.: :: ::..
CCDS73 FRVQFCKFDLINHYFCDLLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENVASVFYTTVIP
::: : .::::::::::::::. :: .:.::.:::::.::.:::. : .:.::::: ..:
CCDS73 SILHIRSTEGRSKAFSTCSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVP
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 MLNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF
::::::::::::.:.....: :.
CCDS73 MLNPLIYSLRNKDVHVSLKKMLQRRTLL
290 300 310
>>CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1315 init1: 734 opt: 1316 Z-score: 1134.5 bits: 218.1 E(32554): 7.1e-57
Smith-Waterman score: 1316; 65.0% identity (86.1% similar) in 309 aa overlap (18-325:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGFLSPMHPCRPPTQRRMAAGNHSTVTEFILKGLTKRADLQLPLFLLFLGIYLVTIVGNL
:.. ::::::::.:.:::..:.:::::: :::::: ::.::::
CCDS31 MGVKNHSTVTEFLLSGLTEQAELQLPLFCLFLGIYTVTVVGNL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GMITLICLNSQLHTPMYYFLSNLSLMDLCYSSVITPKMLVNFVSEKNIISYAGCMSQLYF
.::..: :: :::::::::::.::..:.::::::::::: .:. . :::.::: ::.:
CCDS31 SMISIIRLNRQLHTPMYYFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 FLVFVIAECYMLTVMAYDRYVAICHPLLYNIIMSHHTCLLLVAVVYAIGLIGSTIETGLM
: : ::.:::::..:: ::::::: :::: .::: ..: ::::.:...:. ..:. : .
CCDS31 FCVCVISECYMLAAMACDRYVAICSPLLYRVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE6 LKLPYC-EHLISHYFCDILPLMKLSCSSTYDVEMTVFFSAGFNIIVTSLTVLVSYTFILS
:.: .: ..:.::::::.::.:::::::: :. .: .:::...::::...::.:::.
CCDS31 LRLSFCGSNIIKHYFCDIVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENVASVFYTTVIP
::: : . .:: ::::::::::.:: ::::: :::::.. ::::::.:.::::::::
CCDS31 SILRIHSKKGRCKAFSTCSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVIL
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 MLNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF
:::::::::::.::. :..: :: :.
CCDS31 MLNPLIYSLRNNEVRNALMKLLRRKISLSPG
290 300 310
>>CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1284 init1: 866 opt: 1312 Z-score: 1131.2 bits: 217.5 E(32554): 1.1e-56
Smith-Waterman score: 1312; 64.3% identity (88.9% similar) in 305 aa overlap (18-321:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGFLSPMHPCRPPTQRRMAAGNHSTVTEFILKGLTKRADLQLPLFLLFLGIYLVTIVGNL
: : :.: :::::: ::: . ..: :::.::: .:.::.::::
CCDS31 MLARNNSLVTEFILAGLTDHPEFQQPLFFLFLVVYIVTMVGNL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GMITLICLNSQLHTPMYYFLSNLSLMDLCYSSVITPKMLVNFVSEKNIISYAGCMSQLYF
:.: :. :::.::::::::: :::..:::::::.:::::.::::.::::::.:::.::.:
CCDS31 GLIILFGLNSHLHTPMYYFLFNLSFIDLCYSSVFTPKMLMNFVSKKNIISYVGCMTQLFF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 FLVFVIAECYMLTVMAYDRYVAICHPLLYNIIMSHHTCLLLVAVVYAIGLIGSTIETGLM
:: :::.:::::: ::::::::::.::::.. :::..: .:. ..: .:: :.: .:: :
CCDS31 FLFFVISECYMLTSMAYDRYVAICNPLLYKVTMSHQVCSMLTFAAYIMGLAGATAHTGCM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE6 LKLPYCE-HLISHYFCDILPLMKLSCSSTYDVEMTVFFSAGFNIIVTSLTVLVSYTFILS
:.: .: ..:.::.::::::..:::.::: :..:.. .:.::.: : :.:.::.::..
CCDS31 LRLTFCSANIINHYLCDILPLLQLSCTSTYVNEVVVLIVVGINIMVPSCTILISYVFIVT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENVASVFYTTVIP
::: :..:.::::::::::::. :...:.::.::::.: :. .:. : .:.:::::.:.:
CCDS31 SILHIKSTQGRSKAFSTCSSHVIALSLFFGSAAFMYIKYSS-GSMEQGKVSSVFYTNVVP
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 MLNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF
::::::::::::.::.:..:.:
CCDS31 MLNPLIYSLRNKDVKVALRKALIKIQRRNIF
290 300 310
>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 (308 aa)
initn: 708 init1: 689 opt: 1299 Z-score: 1120.2 bits: 215.5 E(32554): 4.5e-56
Smith-Waterman score: 1299; 63.6% identity (86.0% similar) in 308 aa overlap (18-324:1-308)
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
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CCDS31 GMILLIAVSPLLHTPMYYFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKNTILYSECMVQLFF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
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CCDS31 FVVFVVAEGYLLTAMAYDRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
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CCDS31 MKLSFCKSHIINHYFCDVLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILY
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pF1KE6 SILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENVASVFYTTVIP
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CCDS31 SILHIRSSEGRSKAFGTCSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIP
230 240 250 260 270 280
300 310 320
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CCDS31 MLNPLIYSLRNKDVKKALRKVLVGK
290 300
>>CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 (313 aa)
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10 20 30 40 50 60
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: : :.: :::::: ::: . ... :::.::: ::.::.::::
CCDS31 MLARNNSLVTEFILAGLTDHPEFRQPLFFLFLVIYIVTMVGNL
10 20 30 40
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CCDS31 FLFFVISECYMLTSMAYDRYVAICNPLLYKVTMSHQVCSMLTFAAYIMGLAGATAHTGCM
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CCDS31 SILHIKSTQGRSKAFSTCSSHVIALSLFFGSAAFMYIKYSS-GSMEQGKVSSVFYTNVVP
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CCDS31 MLNPLIYSLRNKDVKVALRKALIKIQRRNIF
290 300 310
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Smith-Waterman score: 1262; 60.0% identity (86.5% similar) in 310 aa overlap (18-326:1-310)
10 20 30 40 50 60
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CCDS84 MAAENSSFVTQFILAGLTDQPGVQIPLFFLFLGFYVVTVVGNL
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CCDS84 GLITLIRLNSHLHTPMYFFLYNLSFIDFCYSSVITPKMLMSFVLKKNSISYAGCMTQLFF
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CCDS84 FLFFVVSESFILSAMAYDRYVAICNPLLYMVTMSPQVCFLLLLGVYGMGFAGAMAHTACM
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pF1KE6 LKLPYC-EHLISHYFCDILPLMKLSCSSTYDVEMTVFFSAGFNIIVTSLTVLVSYTFILS
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CCDS84 MGVTFCANNLVNHYMCDILPLLECACTSTYVNELVVFVVVGIDIGVPTVTIFISYALILS
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CCDS84 SIFHIDSTEGRSKAFSTCSSHIIAVSLFFGSGAFMYLKPFSLLAMNQGKVSSLFYTTVVP
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pF1KE6 MLNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF
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CCDS84 MLNPLIYSLRNKDVKVALKKILNKNAFS
290 300 310
>>CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 (310 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MAAKN-SSVTEFILEGLTHQPGLRIPLFFLFLGFYTVTVVGNL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
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CCDS31 GLITLIGLNSHLHTPMYFFLFNLSLIDFCFSTTITPKMLMSFVSRKNIISFTGCMTQLFF
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pF1KE6 FLVFVIAECYMLTVMAYDRYVAICHPLLYNIIMSHHTCLLLVAVVYAIGLIGSTIETGLM
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CCDS31 FCFFVVSESFILSAMAYDRYVAICNPLLYTVTMSCQVCLLLLLGAYGMGFAGAMAHTGSI
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CCDS31 MNLTFCADNLVNHFMCDILPLLELSCNSSYMNELVVFIVVAVDVGMPIVTVFISYALILS
170 180 190 200 210 220
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CCDS31 SILHNSSTEGRSKAFSTCSSHIIVVSLFFGSGAFMYLKPLSILPLEQGKVSSLFYTIIVP
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.:::::::::::.::.:...:: :.:
CCDS31 VLNPLIYSLRNKDVKVALRRTLGRKIFS
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CCDS31 MTLRNSSSVTEFILVGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVFTVVGNL
10 20 30 40
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CCDS31 GLITLIGINPSLHTPMYFFLFNLSFIDLCYSCVFTPKMLNDFVSE-SIISYVGCMTQLFF
50 60 70 80 90 100
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pF1KE6 FLVFVIAECYMLTVMAYDRYVAICHPLLYNIIMSHHTCLLLVAVVYAIGLIGSTIETGLM
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CCDS31 FCFFVNSECYVLVSMAYDRYVAICNPLLYMVTMSPRVCFLLMFGSYVVGFAGAMAHTGSM
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pF1KE6 LKLPYCE-HLISHYFCDILPLMKLSCSSTYDVEMTVFFSAGFNIIVTSLTVLVSYTFILS
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CCDS31 LRLTFCDSNVIDHYLCDVLPLLQLSCTSTHVSELVFFIVVGVITMLSSISIVISYALILS
170 180 190 200 210 220
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pF1KE6 SILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENVASVFYTTVIP
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CCDS31 NILCIPSAEGRSKAFSTWGSHIIAVALFFGSGTFTYLTTSFPGSMNHGRFASVFYTNVVP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]