Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6093
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6093, 326 aa
1>>>pF1KE6093 326 - 326 aa - 326 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4783+/-0.00111; mu= 15.1250+/- 0.065
mean_var=127.5570+/-38.683, 0's: 0 Z-trim(103.7): 379 B-trim: 851 in 2/46
Lambda= 0.113559
statistics sampled from 7053 (7528) to 7053 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 1.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 ( 326) 2200 372.4 2.7e-103
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 2170 367.5 8.2e-102
CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 ( 326) 2157 365.4 3.6e-101
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 1379 237.9 8.5e-63
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 1267 219.5 2.8e-57
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 1240 215.2 6.3e-56
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 950 167.6 1.2e-41
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 943 166.4 2.6e-41
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 933 164.8 8.1e-41
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 903 159.9 2.5e-39
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 900 159.4 3.4e-39
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 887 157.3 1.5e-38
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 887 157.3 1.5e-38
CCDS34363.1 OR11A1 gene_id:26531|Hs108|chr6 ( 315) 883 156.6 2.4e-38
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 882 156.4 2.7e-38
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 880 156.1 3.3e-38
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 878 155.8 4.2e-38
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 873 155.0 7.7e-38
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 869 154.3 1.2e-37
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 867 154.0 1.5e-37
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 864 153.5 2.1e-37
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 864 153.5 2.1e-37
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 863 153.3 2.3e-37
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 854 151.9 6.4e-37
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 851 151.4 9e-37
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 851 151.4 9e-37
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 847 150.7 1.4e-36
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 845 150.4 1.9e-36
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 843 150.1 2.2e-36
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 842 149.9 2.5e-36
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 839 149.4 3.5e-36
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 839 149.4 3.6e-36
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 836 148.9 4.9e-36
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 831 148.1 9e-36
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 827 147.4 1.4e-35
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 825 147.1 1.7e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 824 147.0 2e-35
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 824 147.0 2e-35
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 822 146.7 2.5e-35
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 820 146.3 3.1e-35
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 819 146.1 3.4e-35
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 819 146.1 3.5e-35
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 817 145.8 4.3e-35
CCDS30902.1 OR6K2 gene_id:81448|Hs108|chr1 ( 324) 816 145.7 4.9e-35
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 816 145.7 5.1e-35
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 814 145.3 6.2e-35
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 812 145.0 7.6e-35
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 811 144.8 8.7e-35
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 808 144.3 1.2e-34
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 ( 313) 804 143.7 1.9e-34
>>CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 (326 aa)
initn: 2200 init1: 2200 opt: 2200 Z-score: 1967.9 bits: 372.4 E(32554): 2.7e-103
Smith-Waterman score: 2200; 99.4% identity (100.0% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLFTTTYVLTITGNGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS74 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLFTTTYALTITGNGAI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AFVLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AFVLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLISQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKAM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LGMPSSTGRHKVFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPLF
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPLF
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 NPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
310 320
>>CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 (326 aa)
initn: 2170 init1: 2170 opt: 2170 Z-score: 1941.3 bits: 367.5 E(32554): 8.2e-102
Smith-Waterman score: 2170; 98.2% identity (99.4% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLFTTTYVLTITGNGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::
CCDS32 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFTCEWTIQIFLFSLFTTTYALTITGNGAI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AFVLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFFF
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AFVLWCDWRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLCAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLISQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKAM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS32 MPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LGMPSSTGRHKVFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPLF
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPLF
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 NPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
310 320
>>CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 (326 aa)
initn: 2157 init1: 2157 opt: 2157 Z-score: 1929.8 bits: 365.4 E(32554): 3.6e-101
Smith-Waterman score: 2157; 97.5% identity (98.8% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLFTTTYVLTITGNGAI
::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.:::::::::
CCDS76 MCPLTLHVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLFTTIYALTITGNGAI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AFVLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AFVLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLISQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKAM
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS76 KPFCGPNIIDHVVCDPGPLFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LGMPSSTGRHKVFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPLF
:::::::::::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSPLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPLF
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 NPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
310 320
>>CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 (330 aa)
initn: 1379 init1: 1379 opt: 1379 Z-score: 1240.9 bits: 237.9 E(32554): 8.5e-63
Smith-Waterman score: 1379; 64.0% identity (85.5% similar) in 311 aa overlap (11-321:14-324)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLFTTTYVLTITGN
: .. : .. ::.::.: :: . .: .::.. . :.::. ::
CCDS32 MFFIIHSLVTSVFLTALGPQNRTMHFVTEFVLLGFHGQREMQSCFFSFILVLYLLTLLGN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 GAIAFVLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFY
:::. .. :::::::::..::::.::::::.:::::.::::.::: :.:::.:::::::
CCDS32 GAIVCAVKLDRRLHTPMYILLGNFAFLEIWYISSTVPNMLVNILSEIKTISFSGCFLQFY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 FFFSLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILCWVCGFLWFLIPIVL
:::::::.::..:.:::.:.:::::::: ::.::::.. :: .::: ::: . .::::
CCDS32 FFFSLGTTECFFLSVMAYDRYLAICRPLHYPSIMTGKFCIILVCVCWVGGFLCYPVPIVL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 ISQMPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVL
:::.::::::::::.:::::: ::: :.::: .:.:::..:..::: :: :.::::::.
CCDS32 ISQLPFCGPNIIDHLVCDPGPLFALACISAPSTELICYTFNSMIIFGPFLSILGSYTLVI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KAMLGMPSSTGRHKVFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVT
.:.: .::..:: :.:::::::: :::: :..:::::::: :. .::::: :: :. .:
CCDS32 RAVLCIPSGAGRTKAFSTCGSHLMVVSLFYGTLMVMYVSPTSGNPAGMQKIITLVYTAMT
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 PLFNPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
:..:::::::.::..: ::..:::
CCDS32 PFLNPLIYSLRNKDMKDALKRVLGLTVSQN
310 320 330
>>CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 (324 aa)
initn: 1267 init1: 1267 opt: 1267 Z-score: 1141.8 bits: 219.5 E(32554): 2.8e-57
Smith-Waterman score: 1267; 62.6% identity (83.1% similar) in 302 aa overlap (19-320:14-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLFTTTYVLTITGNGAI
:. .:.:::: :: : ::::::::: . ::::. :::::
CCDS32 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AFVLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFFF
... :. ::::::..::::.::::::::::.:.::::.::. : :::.::::::::::
CCDS32 IYAVRCNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLISQ
::::.:::.:.:::.:.:::::.:: :: ::: .. .::: .::. ::: . ::: :::
CCDS32 SLGTTECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYISQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKAM
.:::::::::: .:: : .::.:. :: . . :: ::::.: . ..:. :: :.: :.
CCDS32 LPFCGPNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LGMPSSTGRHKVFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPLF
. .::..::.:.::::::::.:::: :...::::::: : : .::: :: :...::::
CCDS32 FQVPSAAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLF
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 NPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
:::::.:.::..: :::.::
CCDS32 NPLIYTLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
300 310 320
>>CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 (345 aa)
initn: 1253 init1: 1230 opt: 1240 Z-score: 1117.6 bits: 215.2 E(32554): 6.3e-56
Smith-Waterman score: 1240; 60.8% identity (83.3% similar) in 306 aa overlap (17-322:41-345)
10 20 30 40
pF1KE6 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLF
:..: .:.. ::: :: : ::.:: ::
CCDS32 INLIPHLCLHRHSVIAGAFTIHRHMKIFNSPSNSSTFTG-FILLGFPCPREGQILLFVLF
20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 TTTYVLTITGNGAIAFVLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKN
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110 120 130 140 150 160
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170 180 190 200 210 220
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CCDS32 GFIWFLIPIVNISQMSFCGSRIIDHFLCDPAPLLTLTCKKGPVIELVFSVLSPLPVFMLF
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230 240 250 260 270 280
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250 260 270 280 290 300
290 300 310 320
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CCDS32 KTVTLFYSVVTPLLNPVIYSLRNKDMRKALKKFWGT
310 320 330 340
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CCDS53 LRIPTSRGRHKAFSTCAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFF
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CCDS53 NPAIYCLRNKEVKEAFRKTVMGRCHYPRDVQD
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CCDS30 NPIIYSLRNKEIIKAIKRTIFQKGDKASLAHL
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CCDS30 FLVVCLDSRLHTPMYHFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTISFSGCLLQIYFFH
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CCDS30 SLGATECYLLTAMAYDRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLAGPVVEISLISR
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CCDS30 LPFCGPNRIQHVFCDFPPVLSLACTDTSINVLVDFVINSCKILATFLLILCSYVQIICTV
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CCDS30 NPFIYSLRNKEIKEAVRRQLKRIGILA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]