Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6092
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6092, 326 aa
1>>>pF1KE6092 326 - 326 aa - 326 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3858+/-0.0011; mu= 15.6171+/- 0.065
mean_var=120.6920+/-35.490, 0's: 0 Z-trim(104.1): 374 B-trim: 871 in 2/46
Lambda= 0.116744
statistics sampled from 7248 (7710) to 7248 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 1.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 2221 385.8 2.5e-107
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 ( 326) 2180 378.9 3e-105
CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 ( 326) 2147 373.3 1.4e-103
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 1390 245.8 3.4e-65
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 1286 228.3 6.4e-60
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 1260 224.0 1.4e-58
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 963 173.9 1.5e-43
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 954 172.4 4.3e-43
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 952 172.0 5.4e-43
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 921 166.8 2e-41
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 912 165.3 5.7e-41
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 907 164.5 1.1e-40
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 902 163.6 1.8e-40
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 897 162.8 3.3e-40
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 895 162.4 4.1e-40
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 893 162.1 5.4e-40
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 886 160.9 1.2e-39
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 884 160.6 1.5e-39
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 884 160.6 1.5e-39
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 882 160.3 1.9e-39
CCDS34363.1 OR11A1 gene_id:26531|Hs108|chr6 ( 315) 874 158.9 4.9e-39
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 870 158.2 7.7e-39
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 869 158.1 8.6e-39
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 868 157.9 9.7e-39
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 868 157.9 9.7e-39
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 863 157.1 1.7e-38
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 863 157.1 1.8e-38
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 859 156.4 2.9e-38
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 854 155.5 5e-38
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 852 155.2 6.3e-38
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 847 154.4 1.2e-37
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 845 154.0 1.4e-37
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 844 153.9 1.6e-37
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 843 153.7 1.8e-37
CCDS30902.1 OR6K2 gene_id:81448|Hs108|chr1 ( 324) 842 153.5 2.1e-37
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 841 153.4 2.3e-37
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 839 153.0 2.9e-37
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 834 152.2 5.2e-37
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 833 152.0 6e-37
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 833 152.1 6.2e-37
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 826 150.8 1.3e-36
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 826 150.8 1.3e-36
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 826 150.8 1.3e-36
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 825 150.7 1.5e-36
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 824 150.5 1.7e-36
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 824 150.5 1.7e-36
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 824 150.5 1.7e-36
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 823 150.3 1.9e-36
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 ( 313) 823 150.3 1.9e-36
CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 ( 313) 820 149.8 2.6e-36
>>CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 (326 aa)
initn: 2221 init1: 2221 opt: 2221 Z-score: 2040.3 bits: 385.8 E(32554): 2.5e-107
Smith-Waterman score: 2221; 100.0% identity (100.0% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFTCEWTIQIFLFSLFTTTYALTITGNGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFTCEWTIQIFLFSLFTTTYALTITGNGAI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AFVLWCDWRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AFVLWCDWRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLCAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLCAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLISQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPLF
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 NPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
310 320
>>CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 (326 aa)
initn: 2180 init1: 2180 opt: 2180 Z-score: 2003.0 bits: 378.9 E(32554): 3e-105
Smith-Waterman score: 2180; 98.8% identity (99.4% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFTCEWTIQIFLFSLFTTTYALTITGNGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLFTTTYALTITGNGAI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AFVLWCDWRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFFF
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AFVLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLCAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLISQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKAV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS74 MPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKAM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPLF
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 NPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
310 320
>>CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 (326 aa)
initn: 2147 init1: 2147 opt: 2147 Z-score: 1973.0 bits: 373.3 E(32554): 1.4e-103
Smith-Waterman score: 2147; 97.5% identity (98.2% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFTCEWTIQIFLFSLFTTTYALTITGNGAI
::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::::::
CCDS76 MCPLTLHVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFSCEWTIQIFLFSLFTTIYALTITGNGAI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AFVLWCDWRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFFF
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AFVLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLCAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLISQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKAV
::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KPFCGPNIIDHVVCDPGPLFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPLF
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSPLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPLF
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 NPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
310 320
>>CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 (330 aa)
initn: 1390 init1: 1390 opt: 1390 Z-score: 1283.8 bits: 245.8 E(32554): 3.4e-65
Smith-Waterman score: 1390; 64.6% identity (85.2% similar) in 311 aa overlap (11-321:14-324)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFTCEWTIQIFLFSLFTTTYALTITGN
: .. : .. ::.::.: :: . .: .::.. . : ::. ::
CCDS32 MFFIIHSLVTSVFLTALGPQNRTMHFVTEFVLLGFHGQREMQSCFFSFILVLYLLTLLGN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 GAIAFVLWCDWRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFY
:::. .. : :::::::..::::.::::::.:::::.::::.::: :.:::.:::::::
CCDS32 GAIVCAVKLDRRLHTPMYILLGNFAFLEIWYISSTVPNMLVNILSEIKTISFSGCFLQFY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 FFFSLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLCAKLVILCWVCGFLWFLIPIVL
:::::::.::..:.:::.:.:::::::: ::.::::..: :: .::: ::: . .::::
CCDS32 FFFSLGTTECFFLSVMAYDRYLAICRPLHYPSIMTGKFCIILVCVCWVGGFLCYPVPIVL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 ISQMPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVL
:::.::::::::::.:::::: ::: :.::: .:.:::..:..::: :: :.::::::.
CCDS32 ISQLPFCGPNIIDHLVCDPGPLFALACISAPSTELICYTFNSMIIFGPFLSILGSYTLVI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KAVLGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVT
.::: .::..:: :::::::::: :::: :..:::::::: :. .::::: :: :. .:
CCDS32 RAVLCIPSGAGRTKAFSTCGSHLMVVSLFYGTLMVMYVSPTSGNPAGMQKIITLVYTAMT
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 PLFNPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
:..:::::::.::..: ::..:::
CCDS32 PFLNPLIYSLRNKDMKDALKRVLGLTVSQN
310 320 330
>>CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 (324 aa)
initn: 1286 init1: 1286 opt: 1286 Z-score: 1189.3 bits: 228.3 E(32554): 6.4e-60
Smith-Waterman score: 1286; 63.2% identity (83.4% similar) in 302 aa overlap (19-320:14-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFTCEWTIQIFLFSLFTTTYALTITGNGAI
:. .:.:::: :: : ::::::::: . :.::. :::::
CCDS32 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AFVLWCDWRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKNISFAGCFLQFYFFF
... :. ::::::..::::.::::::::::.:.::::.::. : :::.::::::::::
CCDS32 IYAVRCNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLCAKLVILCWVCGFLWFLIPIVLISQ
::::.:::.:.:::.:.:::::.:: :: ::: ..:.::: .::. ::: . ::: :::
CCDS32 SLGTTECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYISQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRIQLFCYTLSSLVIFGNFLFIIGSYTLVLKAV
.:::::::::: .:: : .::.:. :: . . :: ::::.: . ..:. :: :.: ::
CCDS32 LPFCGPNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHSTGMQKIETLFYAMVTPLF
. .::..::.::::::::::.:::: :...::::::: : : .::: :: :...::::
CCDS32 FQVPSAAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLF
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 NPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
:::::.:.::..: :::.::
CCDS32 NPLIYTLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
300 310 320
>>CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 (345 aa)
initn: 1273 init1: 1250 opt: 1260 Z-score: 1165.3 bits: 224.0 E(32554): 1.4e-58
Smith-Waterman score: 1260; 61.8% identity (83.0% similar) in 306 aa overlap (17-322:41-345)
10 20 30 40
pF1KE6 MCPLTLQVTGLMNVSEPNSSFAFVNEFILQGFTCEWTIQIFLFSLF
:..: .:.. ::: :: : ::.:: ::
CCDS32 INLIPHLCLHRHSVIAGAFTIHRHMKIFNSPSNSSTFTG-FILLGFPCPREGQILLFVLF
20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 TTTYALTITGNGAIAFVLWCDWRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSEKKN
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110 120 130 140 150 160
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170 180 190 200 210 220
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230 240 250 260 270 280
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290 300 310 320
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CCDS30 NPIIYSLRNKEIIKAIKRTIFQKGDKASLAHL
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CCDS53 VFTIWLAPSLHRPMYFFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFI
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CCDS53 NPAIYCLRNKEVKEAFRKTVMGRCHYPRDVQD
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CCDS30 SLGATECYLLTAMAYDRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLAGPVVEISLISR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]