FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6090, 325 aa
1>>>pF1KE6090 325 - 325 aa - 325 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7920+/-0.00127; mu= 12.9651+/- 0.076
mean_var=133.8570+/-45.606, 0's: 0 Z-trim(101.9): 370 B-trim: 821 in 2/43
Lambda= 0.110855
statistics sampled from 6249 (6712) to 6249 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.206), width: 16
Scan time: 1.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 2156 357.2 1e-98
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1465 246.6 1.9e-65
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1405 237.1 1.5e-62
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 1362 230.2 1.7e-60
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1273 215.9 3.3e-56
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 1237 210.2 1.8e-54
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1183 201.6 7.2e-52
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1154 196.9 1.8e-50
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 1123 192.0 5.7e-49
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1120 191.5 7.7e-49
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1119 191.3 8.6e-49
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 1115 190.7 1.3e-48
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1093 187.2 1.5e-47
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1073 184.0 1.4e-46
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1071 183.6 1.8e-46
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 1068 183.2 2.4e-46
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1061 182.0 5.3e-46
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1059 181.7 6.8e-46
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1040 178.7 5.5e-45
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1011 174.0 1.3e-43
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1006 173.3 2.5e-43
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 992 171.0 1.1e-42
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 981 169.2 3.8e-42
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 979 168.9 4.7e-42
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 970 167.5 1.3e-41
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 963 166.4 2.8e-41
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 956 165.3 6.1e-41
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 944 163.3 2.3e-40
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 943 163.2 2.6e-40
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CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 931 161.2 9.6e-40
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 922 159.8 2.6e-39
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 912 158.2 7.9e-39
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 910 157.9 1.1e-38
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 906 157.2 1.5e-38
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 899 156.1 3.4e-38
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 896 155.7 4.7e-38
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 893 155.2 7e-38
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 881 153.2 2.4e-37
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 803 140.8 1.4e-33
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 800 140.3 2e-33
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 760 134.0 1.8e-31
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 752 132.6 4e-31
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 747 131.8 7.1e-31
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 730 129.1 4.6e-30
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 723 128.0 1e-29
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 709 125.8 4.8e-29
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 690 122.7 3.9e-28
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 681 121.3 1e-27
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 677 120.6 1.6e-27
>>CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 (325 aa)
initn: 2156 init1: 2156 opt: 2156 Z-score: 1885.6 bits: 357.2 E(32554): 1e-98
Smith-Waterman score: 2156; 99.7% identity (99.7% similar) in 325 aa overlap (1-325:1-325)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILWLPFCGNHVIPHTY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS31 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILRLPFCGNHVIPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTKQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTKQI
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 YKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
:::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
310 320
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1488 init1: 1465 opt: 1465 Z-score: 1288.6 bits: 246.6 E(32554): 1.9e-65
Smith-Waterman score: 1465; 68.5% identity (87.7% similar) in 308 aa overlap (5-312:5-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
:::.:.: :::::::::.::::::.:::: ::.::..::.:::.::::. :::::
CCDS31 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
::::::::. :.::::.::::::::::.::. : : .:: :::::: :: ::...::.:
CCDS31 MFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILWLPFCGNHVIPHTY
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CCDS31 AYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILRLPFCGHNIVPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSLS
::: ::: :.:: ::::::::: .: .. :. .:: ::: :: ::::::....:::...
CCDS31 CEHRGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYIIVDVILIASSYVLILRAVFRLPSQDVRLKAFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTKQI
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CCDS31 TCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQI
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 YKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
. . ::..:..
CCDS31 REQIVKIFVQKE
310
>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 1425 init1: 1397 opt: 1405 Z-score: 1236.7 bits: 237.1 E(32554): 1.5e-62
Smith-Waterman score: 1405; 66.2% identity (87.1% similar) in 311 aa overlap (1-310:5-314)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSS
: : ::::::::::::::::: .::::: :: ::..::.:: ..:.::.:..:
CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LHQPMFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAV
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CCDS31 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
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120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LVAMAYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVI-GLGVFVRALIFVIPSILLILWLPFCGNHV
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CCDS31 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVL-RSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRI
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 IPHTYCEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEAR
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CCDS31 IPHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEAR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LKSLSTCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGV
::.:.:::::. :::::.:::.:::.:::::.:.:.::::.:::::::::: ::::::::
CCDS31 LKALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGV
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 RTKQIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
::::: . : .:.:.
CCDS31 RTKQIRERVLRIFLKTNH
300 310
>>CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1383 init1: 1358 opt: 1362 Z-score: 1199.6 bits: 230.2 E(32554): 1.7e-60
Smith-Waterman score: 1362; 64.6% identity (87.8% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
: . :::::: :::::::::::: .:::::::: .::.:::.:: .:..::.:..:::.:
CCDS53 MPIANDTQFHTSSFLLLGIPGLEDVHIWIGFPFFSVYLIALLGNAAIFFVIQTEQSLHEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
:.: :::: . :..::::::::::::::.:.. : : . :.:::::: ::.::: :::::
CCDS53 MYYCLAMLDSIDLSLSTATIPKMLGIFWFNIKEISFGGYLSQMFFIHFFTVMESIVLVAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE6 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVI-GLGVFVRALIFVIPSILLILWLPFCGNHVIPHT
:.: :.:::.:: :. :::.:..:.: :..:. :.: .::: ..:.: :::::...::::
CCDS53 AFDRYIAICKPLWYTMILTSKIISLIAGIAVL-RSLYMVIPLVFLLLRLPFCGHRIIPHT
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 YCEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSL
::::::.:.:.:::::.::..:: .: :..:. .: ::...:: ::: ::. :::::.:
CCDS53 YCEHMGIARLACASIKVNIMFGLGSISLLLLDVLLIILSHIRILYAVFCLPSWEARLKAL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 STCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTKQ
.:::::. ::::: :::.:::.:: ::...:.::::.:::::::::: :::::::::::.
CCDS53 NTCGSHIGVILAFSTPAFFSFFTHCFGHDIPQYIHIFLANLYVVVPPTLNPVIYGVRTKH
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 IYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
: . : .:...
CCDS53 IRETVLRIFFKTDH
300 310
>>CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1325 init1: 1271 opt: 1273 Z-score: 1122.7 bits: 215.9 E(32554): 3.3e-56
Smith-Waterman score: 1273; 55.9% identity (85.5% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
:: : . ::: .:.:.:::::: .:.::. :::.::..::.:: :::::::....:..:
CCDS31 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLREP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
::::::.:.: :..:::...:.::::::.. . : . ::..:::.:: :: ::. ::.::
CCDS31 MFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLLAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILWLPFCGNHVIPHTY
:.: :::.: ::.:..:::..:. :.. . .: .....: . :: :::: :.: :.:
CCDS31 AFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHIIAHSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSLS
:::::.:.:::..:.:: :::: .. .:.....:..:::.:: ::::::.:.:.::.::
CCDS31 CEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFVLNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQLKALS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTKQI
:::.:: :: .:: :..:::.:::::...: :::::.::::...:: :::.:::::::::
CCDS31 TCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVRTKQI
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 YKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
. : .. ..
CCDS31 RERVLYVFTKK
310
>>CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 1220 init1: 757 opt: 1237 Z-score: 1091.4 bits: 210.2 E(32554): 1.8e-54
Smith-Waterman score: 1237; 54.1% identity (83.8% similar) in 314 aa overlap (1-313:7-318)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTD
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CCDS31 AILMAMAFDHYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDVFLLTCLPFCRTR
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CCDS31 IIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFGLPSQD
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CCDS31 GVKTKQIRD--KVILLFSKGTG
310 320
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CCDS53 MYFFLSMLAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNIAFDACVTQGFFVHMMFVGESAILLAM
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CCDS53 AFDRFVAICAPLRYTTVLTWPVVGRIALAVITRSFCIIFPVIFLLKRLPFCLTNIVPHSY
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CCDS53 CEHIGVARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVILIAVSYSLILRAVFRLPSQDARHKAL
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CCDS53 STCGSHLCVILMFYVPSFFTLLTHHFGRNIPQHVHILLANLYVAVPPMLNPIVYGVKTKQ
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CCDS53 IREGVAHRFFDIKTWCCTSPLGS
310 320
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CCDS31 PMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCVHSIYALESSILLA
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CCDS31 MAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLF-RSVAIVSPFIFLLRRLPYCGHRVMTH
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CCDS31 TYCEHMGIARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYGFILHAVFHLPSHDAQHK
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CCDS31 ALSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPILYGAR
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CCDS31 TKEIRSRLLKLLHLGKTSI
300 310
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CCDS41 MAQVRALHKIMALFSANSIGAMNNSDTRIAGCFLTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITALE
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CCDS41 GNGILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQ
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CCDS41 ILQAVFRLLSQDARSKALSTCGSHICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSVPCYVHILLASL
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CCDS41 YVVIPPMLNPVIYGVRTKPILEGAKQMFSNLAKGSK
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CCDS44 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYEDALHKP
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CCDS44 CDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVVSLSSADARQKAF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]