Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6087
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6087, 325 aa
1>>>pF1KE6087 325 - 325 aa - 325 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9840+/-0.00053; mu= 17.9548+/- 0.033
mean_var=84.0227+/-20.465, 0's: 0 Z-trim(106.5): 348 B-trim: 1743 in 2/49
Lambda= 0.139919
statistics sampled from 14132 (14574) to 14132 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.49), E-opt: 0.2 (0.171), width: 16
Scan time: 5.800
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 1160 244.8 1.8e-64
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 1155 243.8 3.6e-64
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 1155 243.8 3.6e-64
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 1083 229.2 8.6e-60
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 1031 218.7 1.2e-56
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 920 196.3 6.9e-50
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 868 185.8 1e-46
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 846 181.4 2.1e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 841 180.4 4.4e-45
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 839 180.0 5.7e-45
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 835 179.2 1e-44
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 835 179.2 1e-44
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 835 179.2 1e-44
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 834 179.0 1.1e-44
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 812 174.5 2.5e-43
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 798 171.7 1.8e-42
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 790 170.1 5.4e-42
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 781 168.3 1.9e-41
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 768 165.6 1.2e-40
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 761 164.2 3.1e-40
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 576 126.9 5.6e-29
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 568 125.3 1.7e-28
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 246 60.4 8e-09
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 246 60.4 8.2e-09
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 211 53.2 8.5e-07
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 210 53.2 1.3e-06
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 204 51.9 2.6e-06
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 204 51.9 2.8e-06
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 204 51.9 2.8e-06
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 204 51.9 2.8e-06
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 197 50.4 6.4e-06
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 195 50.0 8.2e-06
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 194 49.8 9.2e-06
NP_004215 (OMIM: 300207) melatonin-related recepto ( 617) 186 48.5 4.4e-05
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 177 46.4 0.00011
XP_011541141 (OMIM: 125853,600804) PREDICTED: mela ( 362) 176 46.2 0.00012
NP_005950 (OMIM: 125853,600804) melatonin receptor ( 362) 176 46.2 0.00012
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 176 46.2 0.00013
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 176 46.3 0.00014
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 174 45.8 0.00015
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 173 45.6 0.00018
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 172 45.5 0.00024
NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 171 45.2 0.00026
NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 171 45.2 0.00026
NP_000858 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine recep ( 481) 172 45.5 0.00026
NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 171 45.2 0.00027
NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 171 45.2 0.00027
NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 171 45.2 0.00027
NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 171 45.2 0.00027
NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 171 45.3 0.00027
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 1152 init1: 1152 opt: 1160 Z-score: 1278.3 bits: 244.8 E(85289): 1.8e-64
Smith-Waterman score: 1160; 54.5% identity (81.2% similar) in 314 aa overlap (12-325:9-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTLCSFLQISRNMHQENQTTITEFILLGLSNQAEHQNLLFVLFLSMYVVTVVGNGLIIV
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIIL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AISLDIYLHTPMYLFLAYLSFADISSISNSVPKMLVNIQTNSQSISYESCITQMYFSIVF
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XP_011 SVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VVTDNLLLGTMAFDHFVAICHPLNYTTFMRARFGTLLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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XP_011 VDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLS
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FCDHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTMINELVLFIVGLSVIIFPFVLIFFSYVCIIRAVLG
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XP_011 FCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLK
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250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTIALLFYGTTVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMMNP
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XP_011 VPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNP
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 FIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
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XP_011 FIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 1152 init1: 1152 opt: 1155 Z-score: 1273.0 bits: 243.8 E(85289): 3.6e-64
Smith-Waterman score: 1155; 54.5% identity (81.4% similar) in 312 aa overlap (14-325:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTLCSFLQISRNMHQENQTTITEFILLGLSNQAEHQNLLFVLFLSMYVVTVVGNGLIIV
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIIL
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AISLDIYLHTPMYLFLAYLSFADISSISNSVPKMLVNIQTNSQSISYESCITQMYFSIVF
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XP_011 SVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VVTDNLLLGTMAFDHFVAICHPLNYTTFMRARFGTLLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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XP_011 VDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLS
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FCDHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTMINELVLFIVGLSVIIFPFVLIFFSYVCIIRAVLG
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XP_011 FCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLK
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTIALLFYGTTVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMMNP
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XP_011 VPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNP
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 FIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
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XP_011 FIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 1152 init1: 1152 opt: 1155 Z-score: 1273.0 bits: 243.8 E(85289): 3.6e-64
Smith-Waterman score: 1155; 54.5% identity (81.4% similar) in 312 aa overlap (14-325:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTLCSFLQISRNMHQENQTTITEFILLGLSNQAEHQNLLFVLFLSMYVVTVVGNGLIIV
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIIL
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AISLDIYLHTPMYLFLAYLSFADISSISNSVPKMLVNIQTNSQSISYESCITQMYFSIVF
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NP_036 SVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMF
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pF1KE6 VVTDNLLLGTMAFDHFVAICHPLNYTTFMRARFGTLLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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NP_036 VDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLS
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pF1KE6 FCDHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTMINELVLFIVGLSVIIFPFVLIFFSYVCIIRAVLG
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NP_036 FCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLK
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pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTIALLFYGTTVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMMNP
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NP_036 VPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNP
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 FIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
:::::::. .::::.:...: . :.
NP_036 FIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 1109 init1: 1077 opt: 1083 Z-score: 1194.5 bits: 229.2 E(85289): 8.6e-60
Smith-Waterman score: 1083; 52.4% identity (82.4% similar) in 307 aa overlap (14-320:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTLCSFLQISRNMHQENQTTITEFILLGLSNQAEHQNLLFVLFLSMYVVTVVGNGLIIV
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIIL
10 20 30 40
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pF1KE6 AISLDIYLHTPMYLFLAYLSFADISSISNSVPKMLVNIQTNSQSISYESCITQMYFSIVF
:.: : .::::::.::. :::.:: ::..::::::.::. :..::: .:.::.:: ..:
NP_001 AVSSDSHLHTPMYFFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMF
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pF1KE6 VVTDNLLLGTMAFDHFVAICHPLNYTTFMRARFGTLLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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NP_001 AGMDTFLLAVMAYDRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLT
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pF1KE6 FCDHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTMINELVLFIVGLSVIIFPFVLIFFSYVCIIRAVLG
: . .:::::. : .::..::.:..:..::... . .:: . :.::: :. ...:
NP_001 FSTGTEIPHFFCEPAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMG
170 180 190 200 210 220
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pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTIALLFYGTTVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMMNP
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NP_001 MSSTKGKYKAFSTCGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNP
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 FIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
:::::::::.::::..:..:
NP_001 FIYSLRNKDVKGALERLLSRADSCP
290 300 310
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1031; 49.7% identity (78.8% similar) in 312 aa overlap (14-325:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTLCSFLQISRNMHQENQTTITEFILLGLSNQAEHQNLLFVLFLSMYVVTVVGNGLIIV
: ::. .::.:::.:.. :.: .:: .:::::.:::::: :::.
NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIIL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AISLDIYLHTPMYLFLAYLSFADISSISNSVPKMLVNIQTNSQSISYESCITQMYFSIVF
::: : ::::.:.::: :::.:. ..:..::::::.:.....::: .:.::.:: . .
NP_002 AISSDSRLHTPVYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSL
50 60 70 80 90 100
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pF1KE6 VVTDNLLLGTMAFDHFVAICHPLNYTTFMRARFGTLLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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NP_002 VALDNLILAVMAYDRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVT
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pF1KE6 FCDHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTMINELVLFIVGLSVIIFPFVLIFFSYVCIIRAVLG
:: . ..::.. ::...::. .::. ::. .: ....:: ....::: ::::.:
NP_002 FCGSRKIHYIFCEMYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILR
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pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTIALLFYGTTVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMMNP
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NP_002 IPSVSKKYKAFSTCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVK-DSVATVMYAVVTPMMNP
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 FIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
::::::::::.::: .:...... :
NP_002 FIYSLRNKDMHGALGRLLDKHFKRLT
290 300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 933 init1: 906 opt: 920 Z-score: 1016.6 bits: 196.3 E(85289): 6.9e-50
Smith-Waterman score: 920; 45.9% identity (76.2% similar) in 307 aa overlap (18-324:7-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTLCSFLQISRNMHQENQTTITEFILLGLSNQAEHQNLLFVLFLSMYVVTVVGNGLIIV
: : .:::::::. .. : : .::..::..:.. ..:: ...
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLML
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AISLDIYLHTPMYLFLAYLSFADISSISNSVPKMLVNIQTNSQSISYESCITQMYFSIVF
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NP_006 LIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VVTDNLLLGTMAFDHFVAICHPLNYTTFMRARFGTLLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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NP_006 ADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILK
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FCDHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTMINELVLFIVGLSVIIFPFVLIFFSYVCIIRAVLG
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NP_006 YCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLK
170 180 190 200 210 220
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pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTIALLFYGTTVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMMNP
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NP_006 IRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNP
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 FIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
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NP_006 LIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
290 300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 861 init1: 839 opt: 868 Z-score: 959.9 bits: 185.8 E(85289): 1e-46
Smith-Waterman score: 868; 42.6% identity (76.9% similar) in 312 aa overlap (14-324:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTLCSFLQISRNMHQENQTTITEFILLGLSNQAEHQNLLFVLFLSMYVVTVVGNGLIIV
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMIL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AISLDIYLHTPMYLFLAYLSFADISSISNSVPKMLVNIQTNSQSISYESCITQMYFSIVF
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NP_003 LIRIDSQLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISL
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pF1KE6 VVTDNLLLGTMAFDHFVAICHPLNYTTFMRARFGTLLTVISWFLSNIIA-LTHTLLLIQL
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NP_003 ATTECILFGLMAYDRYAAICRPLLYSLIM-SRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSL
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pF1KE6 LFCDHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTMINELVLFIVGLSVIIFPFVLIFFSYVCIIRAVL
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NP_003 SFCDSNVIHHFFCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIF
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pF1KE6 GVSSTQGKWKAFSTCGSHLTIALLFYGTTVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMMN
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NP_003 SMHSGEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLN
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300 310 320
pF1KE6 PFIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
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NP_003 PLIYSLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
290 300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 870 init1: 700 opt: 846 Z-score: 936.0 bits: 181.4 E(85289): 2.1e-45
Smith-Waterman score: 846; 41.7% identity (75.9% similar) in 307 aa overlap (14-320:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTLCSFLQISRNMHQENQTTITEFILLGLSNQAEHQNLLFVLFLSMYVVTVVGNGLIIV
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLIS
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pF1KE6 AISLDIYLHTPMYLFLAYLSFADISSISNSVPKMLVNIQTNSQSISYESCITQMYFSIVF
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NP_003 LVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIF
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pF1KE6 VVTDNLLLGTMAFDHFVAICHPLNYTTFMRARFGTLLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
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NP_003 GCTQCALLAVMSYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLP
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pF1KE6 FCDHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTMINELVLFIVGLSVIIFPFVLIFFSYVCIIRAVLG
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NP_003 YRGSNSIAHFFCEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVK
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pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTIALLFYGTTVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMMNP
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NP_003 MKSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQ--EKSVSVFYAIVTPMLNP
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 FIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
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NP_003 LIYSLRNKDVKAALRKVATRNFP
290 300
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 858 init1: 793 opt: 841 Z-score: 930.4 bits: 180.4 E(85289): 4.4e-45
Smith-Waterman score: 841; 44.1% identity (74.7% similar) in 304 aa overlap (18-320:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MKTLCSFLQISRNMHQENQTTITEFILLGLSN-QAEHQNLLFVLFLSMYVVTVVGNGLII
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLII
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pF1KE6 VAISLDIYLHTPMYLFLAYLSFADISSISNSVPKMLVNIQTNSQSISYESCITQMYFSIV
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NP_835 LVTLADPMLHSPMYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFF
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pF1KE6 FVVTDNLLLGTMAFDHFVAICHPLNYTTFMRARFGTLLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQL
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NP_835 FGVAECFLLATMAYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSF
110 120 130 140 150 160
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pF1KE6 LFCDHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTMINELVLFIVGLSVIIFPFVLIFFSYVCIIRAVL
:: : . ::::: :.::: :.:: . :. .. . :...: .::. ::. : :.:
NP_835 PFCGTNKVNHFFCDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAIL
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pF1KE6 GVSSTQGKWKAFSTCGSHLTIALLFYGTTVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMMN
. :..:: ::::::.::: .. ::: .. .::.:.:.. .. :. .. .::::::.:
NP_835 KIPSAKGKHKAFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLN
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pF1KE6 PFIYSLRNKDMKGALRKLINRKISSL
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NP_835 PIIYSLRNSEVKNALSRTFHKVLALRNCIP
290 300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 859 init1: 837 opt: 839 Z-score: 928.3 bits: 180.0 E(85289): 5.7e-45
Smith-Waterman score: 839; 40.9% identity (74.1% similar) in 301 aa overlap (18-318:8-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKTLCSFLQISRNMHQENQTTITEFILLGLSNQAEHQNLLFVLFLSMYVVTVVGNGLIIV
: .. :::.:.:: . . ..::. : .:..:..:: .::.
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIII
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 AISLDIYLHTPMYLFLAYLSFADISSISNSVPKMLVNIQTNSQSISYESCITQMYFSIVF
:: .::::::.::. ::: :. ..:.:..:::. ..::: .:. :.:: ...
NP_001 LSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLAL
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pF1KE6 VVTDNLLLGTMAFDHFVAICHPLNYTTFMRARFGTLLTVISWFLSNIIALTHTLLLIQLL
.:. .:: .:..:...:.:.::.::..:. :: ::.: :: . . :. . . .
NP_001 GTTECVLLVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVP
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 FCDHNTLPHFFCDLAPLLKLSCSDTMINELVLFIVGLSVIIFPFVLIFFSYVCIIRAVLG
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NP_001 LCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILR
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pF1KE6 VSSTQGKWKAFSTCGSHLTIALLFYGTTVGVYFFPSSTHPEDTDKIGAVLFTVVTPMMNP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]