Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6084
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6084, 324 aa
1>>>pF1KE6084 324 - 324 aa - 324 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9891+/-0.000516; mu= 17.4492+/- 0.032
mean_var=104.9519+/-29.069, 0's: 0 Z-trim(108.4): 345 B-trim: 1941 in 2/45
Lambda= 0.125193
statistics sampled from 15942 (16453) to 15942 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.541), E-opt: 0.2 (0.193), width: 16
Scan time: 6.400
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 928 179.1 1e-44
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NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 897 173.5 5.1e-43
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 897 173.5 5.1e-43
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 894 173.0 7.4e-43
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 887 171.7 1.7e-42
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 875 169.5 7.9e-42
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 871 168.8 1.3e-41
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 867 168.1 2.2e-41
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 867 168.1 2.2e-41
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 854 165.7 1.1e-40
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 852 165.4 1.4e-40
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 844 163.9 3.8e-40
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 825 160.5 4.1e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 810 157.8 2.7e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 803 156.5 6.5e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 784 153.1 7.2e-37
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 704 138.7 1.6e-32
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 510 103.6 5.6e-22
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 500 101.8 2e-21
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 216 50.6 5.6e-06
XP_016882097 (OMIM: 600551) PREDICTED: G-protein c ( 362) 207 49.0 1.8e-05
XP_016882096 (OMIM: 600551) PREDICTED: G-protein c ( 362) 207 49.0 1.8e-05
NP_005273 (OMIM: 600551) G-protein coupled recepto ( 362) 207 49.0 1.8e-05
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 207 49.0 1.9e-05
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 206 48.8 2e-05
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 206 48.8 2.1e-05
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 206 48.9 2.2e-05
NP_003599 (OMIM: 604620) psychosine receptor [Homo ( 337) 203 48.2 2.9e-05
XP_005246154 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362) 199 47.5 4.9e-05
XP_016860005 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362) 199 47.5 4.9e-05
NP_064707 (OMIM: 610376) atypical chemokine recept ( 362) 199 47.5 4.9e-05
XP_005246155 (OMIM: 610376) PREDICTED: atypical ch ( 362) 199 47.5 4.9e-05
XP_011535972 (OMIM: 605108) PREDICTED: neuromedin- ( 321) 198 47.3 5.2e-05
NP_064552 (OMIM: 605108) neuromedin-U receptor 2 [ ( 415) 198 47.4 6.1e-05
NP_848566 (OMIM: 300513) glucose-dependent insulin ( 335) 191 46.0 0.00013
NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 190 45.9 0.00016
XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 190 45.9 0.00016
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 189 45.7 0.00016
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 183 44.6 0.00036
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 182 44.4 0.00039
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 181 44.3 0.00046
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 180 44.0 0.00047
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 180 44.0 0.00047
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 180 44.0 0.00047
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 180 44.0 0.00048
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 180 44.1 0.00052
NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor iso ( 390) 180 44.1 0.00056
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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10 20 30 40 50
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300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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310 320
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NP_003 ALRKVATRNFP
300
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE6 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
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XP_011 AWQKLLWKF-SGLTSKLAT
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 897; 43.0% identity (77.3% similar) in 309 aa overlap (11-319:10-317)
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pF1KE6 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM
..:.: :: . ::.. . ..::.. .: ...:::..::::::::
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pF1KE6 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLMA
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NP_036 AWQKLLWKF-SGLTSKLAT
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>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 897; 43.0% identity (77.3% similar) in 309 aa overlap (11-319:10-317)
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pF1KE6 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM
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XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
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pF1KE6 EIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFA
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XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
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pF1KE6 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
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XP_011 AWQKLLWKF-SGLTSKLAT
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>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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pF1KE6 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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60 70 80 90 100 110
pF1KE6 MYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAF
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVA
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 AALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 883 init1: 863 opt: 887 Z-score: 883.8 bits: 171.7 E(85289): 1.7e-42
Smith-Waterman score: 887; 45.0% identity (75.9% similar) in 291 aa overlap (8-297:4-294)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MGMEGLLQNST-NFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTP
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 MYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLM
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XP_011 MYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFF
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XP_011 AFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFV
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 CEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAF
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XP_011 CEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAF
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 ATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVA
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XP_011 GTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQK
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 AALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
XP_011 RRGS
300
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 912 init1: 869 opt: 875 Z-score: 871.9 bits: 169.5 E(85289): 7.9e-42
Smith-Waterman score: 875; 45.4% identity (75.2% similar) in 302 aa overlap (11-312:10-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLMA
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NP_003 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
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pF1KE6 YDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFC
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NP_003 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFA
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NP_003 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAA
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NP_003 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
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NP_003 ALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 905 init1: 859 opt: 871 Z-score: 868.0 bits: 168.8 E(85289): 1.3e-41
Smith-Waterman score: 871; 43.5% identity (74.9% similar) in 299 aa overlap (11-308:10-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPA-FPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTP
..:.: .. . :. . .::: ..:..:.. .: ..::. : ::.:
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 MYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLM
:::.: .::... . . ::::: ::..: ::::::::.:..... . .: :::. :
NP_835 MYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFF
:::::::.:.::.::..::.:. ....:: : . . : .::::: . ..::::
NP_835 AYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAF
:. : :::: :.::.:.: . .:...:: .: :::.: .. .. ::.:..:::
NP_835 CDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVA
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NP_835 STCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVK
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 AALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
:: ... .
NP_835 NALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 857 init1: 857 opt: 867 Z-score: 864.1 bits: 168.1 E(85289): 2.2e-41
Smith-Waterman score: 867; 42.7% identity (74.6% similar) in 307 aa overlap (3-308:1-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MGMEGLLQNS-TNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTP
: : :.: ..:.: :: .: :::.. .:...... .::..:: . .:: ::::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 MYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLM
:::.::.::..: . :::::: . . . .:::: :: .:... . .. . :::..:
XP_011 MYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AYDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFF
:::..::::.::.: :....: ..:.: :: ..:. .. : . . :: . :.:::
XP_011 AYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAF
:.. .:::::.:: : :... . .:... :. : .:: :: :: .. :..:: :::
XP_011 CDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVA
.::.::. :: .::.. . . : : :. ::: .....::..::::::.::::::. .
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]