FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6083, 324 aa
1>>>pF1KE6083 324 - 324 aa - 324 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8245+/-0.000474; mu= 18.8478+/- 0.029
mean_var=102.6531+/-27.105, 0's: 0 Z-trim(108.7): 223 B-trim: 1048 in 1/51
Lambda= 0.126587
statistics sampled from 16546 (16848) to 16546 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.54), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 4.770
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 805 158.3 1.9e-38
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 758 149.7 7.4e-36
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 581 117.4 3.9e-26
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 581 117.4 3.9e-26
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 581 117.4 4e-26
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 569 115.2 1.8e-25
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 569 115.2 1.8e-25
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 569 115.2 1.8e-25
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 540 109.9 7e-24
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 535 109.0 1.4e-23
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 527 107.5 3.7e-23
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 524 107.0 5.4e-23
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 507 103.9 4.5e-22
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 495 101.7 2.1e-21
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 492 101.2 3.1e-21
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 488 100.4 5.1e-21
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 486 100.1 6.5e-21
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 484 99.7 8.5e-21
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 482 99.3 1.1e-20
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 473 97.7 3.4e-20
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 451 93.7 5.5e-19
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 418 87.6 3.6e-17
NP_004942 (OMIM: 605741) G-protein coupled recepto ( 361) 181 44.4 0.00042
XP_016875894 (OMIM: 605741) PREDICTED: G-protein c ( 361) 181 44.4 0.00042
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 173 43.0 0.0012
NP_000675 (OMIM: 109630,607276) beta-1 adrenergic ( 477) 171 42.8 0.0018
NP_001307687 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine re ( 439) 170 42.5 0.0019
XP_006712545 (OMIM: 601122) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 456) 170 42.6 0.0019
NP_000858 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine recep ( 481) 170 42.6 0.002
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 166 41.6 0.0026
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 166 41.8 0.0032
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 166 41.8 0.0033
XP_016859481 (OMIM: 146928) PREDICTED: C-X-C chemo ( 360) 164 41.3 0.0036
NP_001548 (OMIM: 146928) C-X-C chemokine receptor ( 360) 164 41.3 0.0036
XP_016859480 (OMIM: 146928) PREDICTED: C-X-C chemo ( 360) 164 41.3 0.0036
XP_005246587 (OMIM: 146928) PREDICTED: C-X-C chemo ( 360) 164 41.3 0.0036
XP_016859479 (OMIM: 146928) PREDICTED: C-X-C chemo ( 360) 164 41.3 0.0036
NP_001161770 (OMIM: 146928) C-X-C chemokine recept ( 360) 164 41.3 0.0036
XP_016857927 (OMIM: 606916) PREDICTED: probable G- ( 451) 164 41.5 0.0041
NP_114142 (OMIM: 606916) probable G-protein couple ( 451) 164 41.5 0.0041
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 164 41.5 0.0043
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 161 40.7 0.0049
NP_001286 (OMIM: 601159) C-C chemokine receptor ty ( 355) 161 40.8 0.0052
NP_000902 (OMIM: 165195) delta-type opioid recepto ( 372) 160 40.6 0.0061
NP_116743 (OMIM: 601613) C-X-C chemokine receptor ( 327) 158 40.2 0.0073
NP_001707 (OMIM: 601613) C-X-C chemokine receptor ( 372) 158 40.2 0.0079
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 157 40.0 0.0083
>>NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [Homo (318 aa)
initn: 814 init1: 731 opt: 805 Z-score: 811.1 bits: 158.3 E(85289): 1.9e-38
Smith-Waterman score: 805; 41.0% identity (71.5% similar) in 305 aa overlap (12-315:6-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALLYLSALAANTLILIIIWQ
:... ... :::.:.::.. : ::..:: ::: :. .: :. :.
NP_689 MMVDPNGNESSATYFILIGLPGLEEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIYIVRT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKVISLPERFAQIYAIHFFVGME
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NP_689 EHSLHEPMYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSLSGME
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSLILKATLFMVLRNGLFVTPVPVLAAQRDYCSK
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NP_689 STVLLAMAFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLPFCRS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDLSLIILSYILILYSVLRLNSA
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NP_689 NILSHSYCLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKTVLGL-TR
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 EAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTH-LTEMKATLIPVLLNVLHNIIPPSLNPTV
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NP_689 EAQAKAFGTCVSHVCAVFIFYVPFIGLSMVHRFSKRRDSPLPVILANIYLLVPPVLNPIV
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 YALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
:...:::.: :..:
NP_689 YGVKTKEIR---QRILRLFHVATHASEP
300 310
>>NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [Homo (320 aa)
initn: 736 init1: 659 opt: 758 Z-score: 764.7 bits: 149.7 E(85289): 7.4e-36
Smith-Waterman score: 758; 38.3% identity (70.3% similar) in 300 aa overlap (12-308:2-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALLYLSALAANTLILIIIWQ
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NP_110 MSSCNFTHATFVLIGIPGLEKAHFWVGFPLLSMYVVAMFGNCIVVFIVRT
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pF1KE6 NPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKVISLPERFAQIYAIHFFVGME
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NP_110 ERSLHAPMYLFLCMLAAIDLALSTSTMPKILALFWFDSREISFEACLTQMFFIHALSAIE
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pF1KE6 SGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSLILKATLFMVLRNGLFVTPVPVLAAQRDYCSK
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NP_110 STILLAMAFDRYVAICHPLRHAAVLNNTVTAQIGIVAVVRGSLFFFPLPLLIKRLAFCHS
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pF1KE6 NEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDLSLIILSYILILYSVLRLNSA
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NP_110 NVLSHSYCVHQDVMKLAYADTLPNVVYGLTAILLVMGVDVMFISLSYFLIIRTVLQLPSK
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250 260 270 280 290
pF1KE6 EAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATLIPVLLNVLHNI---IPPSLNP
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NP_110 SERAKAFGTCVSHIGVVLAFYVPLIGLSVVH--RFGNSLHPIVRVVMGDIYLLLPPVINP
240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 TVYALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
.:. .::..:
NP_110 IIYGAKTKQIRTRVLAMFKISCDKDLQAVGGK
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>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 606 init1: 480 opt: 581 Z-score: 590.1 bits: 117.4 E(85289): 3.9e-26
Smith-Waterman score: 581; 33.1% identity (68.5% similar) in 308 aa overlap (10-315:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALLYLSALAANTLILIIIWQ
.:.... .::::.:::. . :: : . . .::... .: ::.. .
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSI
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pF1KE6 NPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKVISLPERFAQIYAIHFFVGME
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XP_011 DSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMD
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pF1KE6 SGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSL--ILKATLFMVLRNGLFVTPVPVLAAQRDYC
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pF1KE6 SKNEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDLSLIILSYILILYSVLRLN
. : : : .:. . .:.:.: . : . : . : : . . :. ::. : .::..
XP_011 ADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVP
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pF1KE6 SAEAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATLIPVLLNVLHNIIPPSLNPT
:... ::.:::.:::...:.::. .... . :. .: .. .::.... : :::
XP_011 STKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEK-DTMATVLYTVVTPMLNPF
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300 310 320
pF1KE6 VYALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
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XP_011 IYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 606 init1: 480 opt: 581 Z-score: 590.1 bits: 117.4 E(85289): 3.9e-26
Smith-Waterman score: 581; 33.1% identity (68.5% similar) in 308 aa overlap (10-315:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALLYLSALAANTLILIIIWQ
.:.... .::::.:::. . :: : . . .::... .: ::.. .
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKVISLPERFAQIYAIHFFVGME
. :. :::.::. : .::. .. : .::.:: .....::. ..:.: . .:: :.
NP_036 DSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMD
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pF1KE6 SGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSL--ILKATLFMVLRNGLFVTPVPVLAAQRDYC
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NP_036 NFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVV--ANLNVLLHTLLMAPLSFC
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pF1KE6 SKNEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDLSLIILSYILILYSVLRLN
. : : : .:. . .:.:.: . : . : . : : . . :. ::. : .::..
NP_036 ADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVP
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SAEAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATLIPVLLNVLHNIIPPSLNPT
:... ::.:::.:::...:.::. .... . :. .: .. .::.... : :::
NP_036 STKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEK-DTMATVLYTVVTPMLNPF
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300 310 320
pF1KE6 VYALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
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NP_036 IYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 606 init1: 480 opt: 581 Z-score: 590.0 bits: 117.4 E(85289): 4e-26
Smith-Waterman score: 581; 33.1% identity (68.5% similar) in 308 aa overlap (10-315:11-315)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALLYLSALAANTLILIIIW
.:.... .::::.:::. . :: : . . .::... .: ::.. .
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE6 QNPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKVISLPERFAQIYAIHFFVGM
. :. :::.::. : .::. .. : .::.:: .....::. ..:.: . .:: :
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE6 ESGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSL--ILKATLFMVLRNGLFVTPVPVLAAQRDY
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVV--ANLNVLLHTLLMAPLSF
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pF1KE6 CSKNEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDLSLIILSYILILYSVLRL
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XP_011 CADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKV
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 NSAEAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATLIPVLLNVLHNIIPPSLNP
:... ::.:::.:::...:.::. .... . :. .: .. .::.... : :::
XP_011 PSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEK-DTMATVLYTVVTPMLNP
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pF1KE6 TVYALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
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XP_011 FIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 542 init1: 449 opt: 569 Z-score: 578.2 bits: 115.2 E(85289): 1.8e-25
Smith-Waterman score: 569; 32.6% identity (66.8% similar) in 313 aa overlap (10-319:1-309)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALL--YLSALAANTLILIII
...... ::::::::. . .:. .:: . .: :. .. .: ::...:
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSS--DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLI
10 20 30 40
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pF1KE6 WQNPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKVISLPERFAQIYAIHFFVG
. :. :::.:: : .::.. ::...:..:: : . :.: . ::.. . :
XP_011 RLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MESGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSLILKATLFMVLRNGLFVTPVPV-LAAQRDY
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XP_011 IEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWV-SGFISSPVQTAITFQLPM
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CSKNEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDLSLIILSYILILYSVLRL
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XP_011 CRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 NSAEAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATLIPVLLNVLHNIIPPSLNP
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XP_011 QSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSS-PSVLQEKLFSVFYAILTPMLNP
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 TVYALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
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XP_011 MIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
290 300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 542 init1: 449 opt: 569 Z-score: 578.2 bits: 115.2 E(85289): 1.8e-25
Smith-Waterman score: 569; 32.6% identity (66.8% similar) in 313 aa overlap (10-319:1-309)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALL--YLSALAANTLILIII
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSS--DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLI
10 20 30 40
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pF1KE6 WQNPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKVISLPERFAQIYAIHFFVG
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XP_011 RLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MESGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSLILKATLFMVLRNGLFVTPVPV-LAAQRDY
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XP_011 IEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWV-SGFISSPVQTAITFQLPM
110 120 130 140 150 160
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pF1KE6 CSKNEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDLSLIILSYILILYSVLRL
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XP_011 CRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 NSAEAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATLIPVLLNVLHNIIPPSLNP
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XP_011 QSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSS-PSVLQEKLFSVFYAILTPMLNP
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 TVYALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
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XP_011 MIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
290 300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 542 init1: 449 opt: 569 Z-score: 578.2 bits: 115.2 E(85289): 1.8e-25
Smith-Waterman score: 569; 32.6% identity (66.8% similar) in 313 aa overlap (10-319:1-309)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALL--YLSALAANTLILIII
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSS--DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLI
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 WQNPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKVISLPERFAQIYAIHFFVG
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NP_036 RLDSRLHTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MESGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSLILKATLFMVLRNGLFVTPVPV-LAAQRDY
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NP_036 IEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWV-SGFISSPVQTAITFQLPM
110 120 130 140 150 160
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pF1KE6 CSKNEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDLSLIILSYILILYSVLRL
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NP_036 CRNKFIDHISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 NSAEAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATLIPVLLNVLHNIIPPSLNP
.: :. ::. ::.::::.. . : ... . . ..: :..:.. :. : :::
NP_036 QSREGRKKAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSS-PSVLQEKLFSVFYAILTPMLNP
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 TVYALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
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NP_036 MIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
290 300 310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 487 init1: 427 opt: 540 Z-score: 549.7 bits: 109.9 E(85289): 7e-24
Smith-Waterman score: 540; 33.8% identity (64.3% similar) in 305 aa overlap (18-320:6-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALLYLSALAANTLILIIIWQ
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIY
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKVISLPERFAQIYAIHFFVGME
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NP_001 NNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE6 SGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSLILKATLFMVLRNGLFVTPVPVLAAQR-DYCS
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NP_001 MVLFTTMAYDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCV-ALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCG
110 120 130 140 150 160
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pF1KE6 KNEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVL-AWLGMGSDLSLIILSYILILYSVLRLN
: :.: .: . .:.:. : : . : :..: :. : .:: .:. ..::.
NP_001 PNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIG-DFILTCISYGFIIVAILRIR
170 180 190 200 210 220
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pF1KE6 SAEAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATLIPVLLNVLHNIIPPSLNPT
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NP_001 TVEGKRKAFSTCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVV-AALYTLVTPTLNPM
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 VYALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
::..:..:..:...:: ::. :
NP_001 VYSFQNREMQAGIRKV-FAFLKH
290 300
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 509 init1: 273 opt: 535 Z-score: 544.5 bits: 109.0 E(85289): 1.4e-23
Smith-Waterman score: 535; 34.7% identity (65.3% similar) in 303 aa overlap (17-311:9-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALLYLSALAANTLILIIIWQ
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE6 NPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFD----AKVISLPERFAQIYAIHFF
. .:..:::.::. . .... .:. :::.:: : . ...::. ..:.: ::
NP_003 HSTLHKPMYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLY---FF
60 70 80 90 100
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pF1KE6 VGM---ESGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSLILKATLFMVLRNGLFVTPVPV-LA
.:. : .: ::.:::.:::.::.:: ::.. : .. . .:. .. : : :
NP_003 LGLGCTECVLLAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAA-GSWAGGFGISMVKVFLI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 AQRDYCSKNEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDLSLIILSYILILY
. .::. : :.: .:. . .:.: : . ...:: . . . ::. ::. :
NP_003 SGLSYCGPNIINHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITG
170 180 190 200 210 220
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pF1KE6 SVLRLNSAEAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATLIPVLLNVLHNIIP
.:... :: . ::.:::.::::....::. . : .. ..: :..::. .:
NP_003 AVMHIPSAAGRYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFI-YARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]