FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6081, 324 aa
1>>>pF1KE6081 324 - 324 aa - 324 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0922+/-0.000563; mu= 17.2029+/- 0.035
mean_var=75.4192+/-18.030, 0's: 0 Z-trim(106.0): 242 B-trim: 1683 in 2/46
Lambda= 0.147684
statistics sampled from 13818 (14149) to 13818 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.482), E-opt: 0.2 (0.166), width: 16
Scan time: 6.150
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1182 262.0 1.2e-69
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1041 232.0 1.3e-60
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 975 217.9 2.2e-56
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 902 202.3 1e-51
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 901 202.1 1.2e-51
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 898 201.5 1.9e-51
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 898 201.5 2e-51
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 873 196.2 8e-50
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 859 193.2 6e-49
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 846 190.4 4.2e-48
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 846 190.4 4.2e-48
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 846 190.4 4.2e-48
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 846 190.4 4.2e-48
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 842 189.6 7.6e-48
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 840 189.1 1e-47
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 824 185.7 1.1e-46
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 802 181.0 2.7e-45
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 798 180.2 5e-45
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 792 178.9 1.2e-44
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 517 120.3 5.3e-27
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 517 120.3 5.3e-27
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 206 54.1 4.7e-07
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 192 51.1 3.9e-06
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 179 48.4 3.1e-05
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 179 48.4 3.4e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 177 47.9 3.5e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 176 47.7 4.1e-05
NP_001392 (OMIM: 602282) lysophosphatidic acid rec ( 364) 175 47.5 5.1e-05
XP_016869873 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
XP_016869883 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
XP_016869878 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
XP_016869880 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
XP_016869875 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
XP_016869881 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
XP_016869889 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
XP_016869890 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
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XP_016869893 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
XP_005251839 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
XP_016869891 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
XP_016869896 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
XP_016869885 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
XP_016869895 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
XP_016869879 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
XP_016869874 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 175 47.5 5.1e-05
NP_476500 (OMIM: 602282) lysophosphatidic acid rec ( 364) 175 47.5 5.1e-05
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 1203 init1: 1181 opt: 1182 Z-score: 1371.5 bits: 262.0 E(85289): 1.2e-69
Smith-Waterman score: 1182; 56.1% identity (83.5% similar) in 303 aa overlap (3-305:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIP
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pF1KE6 MYYFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAM
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240 250 260 270 280 290
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310 320
pF1KE6 NALKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
.: .:.:
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 1092 init1: 1035 opt: 1041 Z-score: 1209.2 bits: 232.0 E(85289): 1.3e-60
Smith-Waterman score: 1041; 49.8% identity (80.8% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPMY
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pF1KE6 YFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMAY
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pF1KE6 DLYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFFCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KE6 IPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSKTFST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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pF1KE6 CASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDVKNA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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310 320
pF1KE6 LKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
: ... :
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 975; 46.9% identity (78.2% similar) in 303 aa overlap (5-307:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPM
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:::::: ::.::: . .:.::. ... : . :. ..::::::.::.::.:::.:::..:.
NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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pF1KE6 ALKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
:::.: .:
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 926 init1: 893 opt: 902 Z-score: 1049.3 bits: 202.3 E(85289): 1e-51
Smith-Waterman score: 902; 42.2% identity (78.7% similar) in 301 aa overlap (5-305:2-302)
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pF1KE6 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPMY
:... :::...:.: :. .:: ::.:: ....::.:.:: :..:. :::
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: :.::: :: :.:.:....:: .. ... . :.: ::. : .::.::: : ..::::.
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NP_001 IPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFST
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NP_001 CSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAG
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pF1KE6 LKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
..:..
NP_001 IRKVFAFLKH
300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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Smith-Waterman score: 901; 43.9% identity (75.9% similar) in 294 aa overlap (12-305:15-308)
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pF1KE6 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQI
:..:::... :.:..:.: :. : .:..::...::: ..: :.
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pF1KE6 PMYYFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAA
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pF1KE6 MAYDLYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHF
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pF1KE6 FCDIPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSKT
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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pF1KE6 FSTCASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
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pF1KE6 KNALKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
..:.:.:.
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 898; 42.8% identity (75.6% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE6 YFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE6 DLYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSKTFST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE6 CASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDVKNA
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250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
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XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 947 init1: 890 opt: 898 Z-score: 1044.6 bits: 201.5 E(85289): 1.9e-51
Smith-Waterman score: 898; 42.8% identity (75.6% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE6 YFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE6 CASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDVKNA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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310 320
pF1KE6 LKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
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NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 947 init1: 890 opt: 898 Z-score: 1044.4 bits: 201.5 E(85289): 2e-51
Smith-Waterman score: 898; 42.8% identity (75.6% similar) in 311 aa overlap (1-311:11-321)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVN
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pF1KE6 ECLILAAMAYDLYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCG
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pF1KE6 SGGRSKTFSTCASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIY
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pF1KE6 SFRNKDVKNALKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
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XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 875 init1: 655 opt: 873 Z-score: 1015.5 bits: 196.2 E(85289): 8e-50
Smith-Waterman score: 873; 45.9% identity (73.3% similar) in 296 aa overlap (10-301:11-306)
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pF1KE6 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPM
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pF1KE6 YYFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKS----ISPYGCALQMFFFASFADAECLIL
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
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NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
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pF1KE6 HFFCDIPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRS
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NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 839 init1: 707 opt: 859 Z-score: 999.7 bits: 193.2 E(85289): 6e-49
Smith-Waterman score: 859; 44.0% identity (73.3% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-305)
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 YFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KE6 DLYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFFCD
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]