Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6080
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6080, 324 aa
1>>>pF1KE6080 324 - 324 aa - 324 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2123+/-0.000608; mu= 16.3773+/- 0.038
mean_var=93.0846+/-23.923, 0's: 0 Z-trim(105.5): 298 B-trim: 1655 in 2/46
Lambda= 0.132934
statistics sampled from 13219 (13649) to 13219 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.484), E-opt: 0.2 (0.16), width: 16
Scan time: 5.250
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1049 212.4 1e-54
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XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 964 196.1 8e-50
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 964 196.1 8e-50
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 964 196.1 8.2e-50
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 934 190.3 4.3e-48
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 904 184.6 2.3e-46
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 885 181.0 2.9e-45
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 867 177.5 3.2e-44
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 867 177.5 3.2e-44
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 867 177.5 3.2e-44
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 866 177.3 3.6e-44
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 866 177.3 3.6e-44
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 851 174.4 2.7e-43
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 846 173.5 5.2e-43
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 840 172.3 1.2e-42
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 829 170.2 5e-42
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 827 169.8 6.5e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 814 167.3 3.7e-41
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 812 166.9 4.7e-41
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 492 105.6 1.4e-22
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 487 104.6 2.8e-22
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 198 49.2 1.3e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 198 49.2 1.5e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 188 47.3 5.2e-05
NP_000859 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine recep ( 458) 187 47.3 7.5e-05
NP_001243689 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine re ( 458) 187 47.3 7.5e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 180 45.8 0.00016
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 180 45.9 0.0002
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 178 45.5 0.00024
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 171 44.0 0.00051
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 169 43.7 0.0007
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 169 43.7 0.0007
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 170 44.0 0.00071
NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 169 43.7 0.00074
NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 169 43.7 0.00074
NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 169 43.7 0.00074
XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 170 44.0 0.00079
NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 168 43.6 0.00088
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 166 43.1 0.00097
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 166 43.1 0.00097
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 166 43.1 0.0011
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 166 43.1 0.0011
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 165 42.9 0.0011
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 163 42.5 0.0014
XP_011527129 (OMIM: 162651) PREDICTED: neurotensin ( 336) 161 42.1 0.0019
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 162 42.4 0.002
NP_002522 (OMIM: 162651) neurotensin receptor type ( 418) 161 42.2 0.0022
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 159 41.9 0.0032
NP_001727 (OMIM: 113995) C5a anaphylatoxin chemota ( 350) 157 41.4 0.0034
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 1049; 51.5% identity (79.7% similar) in 301 aa overlap (5-305:7-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAEVNIIYVTVFILKGITNRPELQAPCFGVFLVIYLVTVLGNLGLITLIKIDTRLHTP
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300 310 320
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::..:.:
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310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 998; 47.2% identity (78.8% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
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pF1KE6 GRYVAICSPLHYSTLMSRRVCIQLVAVPYIYSFLVALFHTVITFRLTYCGPNLINHFYCD
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310 320
pF1KE6 SKKALDKGCENLQILTFLKIRKLY
.....
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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pF1KE6 SKKALDKGCENLQILTFLKIRKLY
::.. .
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 964; 46.3% identity (76.5% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAEVNIIYVTVFILKGITNRPELQAPCFGVFLVIYLVTVLGNLGLITLIKIDTRLHTPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE6 YFLSHLAFVDLCYSSAITPKMMVNFVVERNTIPFHACATQLGYFLTFMITECFLLASMAY
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pF1KE6 GRYVAICSPLHYSTLMSRRVCIQLVAVPYIYSFLVALFHTVITFRLTYCGPNLINHFYCD
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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pF1KE6 SKKALDKGCENLQILTFLKIRKLY
::.. .
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 975 init1: 920 opt: 964 Z-score: 1015.3 bits: 196.1 E(85289): 8.2e-50
Smith-Waterman score: 964; 46.3% identity (76.5% similar) in 307 aa overlap (1-307:11-317)
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pF1KE6 MAEVNIIYVTVFILKGITNRPELQAPCFGVFLVIYLVTVLGNLGLITLIK
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pF1KE6 IDTRLHTPMYYFLSHLAFVDLCYSSAITPKMMVNFVVERNTIPFHACATQLGYFLTFMIT
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:.:. ::.::::::...: .::.:.: .:..: :.:: . : ::.:.:::: :::::.::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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::::. .: : ::.. .
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 967 init1: 925 opt: 934 Z-score: 984.4 bits: 190.3 E(85289): 4.3e-48
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pF1KE6 MAEVNIIYVTVFILKGITNRPELQAPCFGVFLVIYLVTVLGNLGLITLIKIDTRLHTPM
:: .: ::: :... :.. : .:::::.... ::.::.::..:..:::::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YYFLSHLAFVDLCYSSAITPKMMVNFVVERNTIPFHACATQLGYFLTFMITECFLLASMA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YGRYVAICSPLHYSTLMSRRVCIQLVAVPYIYSFLVALFHTVITFRLTYCGPNLINHFYC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DDLPFLALSCSDTHMKEILIFAFAGFDMISSSSIVLTSYIFIIAAILRIRSTQGQHKAIS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCGSHMVTVTIFYGTLIFMYLQPKSNHSLDTDKMASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKD
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 ASKKALDKGCENLQILTFLKIRKLY
: :. . :
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 870 init1: 707 opt: 904 Z-score: 953.3 bits: 184.6 E(85289): 2.3e-46
Smith-Waterman score: 904; 45.5% identity (75.9% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAEVNIIYVTVFILKGITNRPELQAPCFGVFLVIYLVTVLGNLGLITLIKIDTRLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFLSHLAFVDLCYSSAITPKMMVNFVVERNTIPFHACATQLGYFLTFMITECFLLASMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KE6 GRYVAICSPLHYSTLMSRRVCIQLVAVPYIYSFLVALFHTVITFRLTYCGPNLINHFYCD
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DLPFLALSCSDTHMKEILIFAFAGFDMISSSSIVLTSYIFIIAAILRIRSTQGQHKAIST
.: :. .::: .:. :: .. .. ..:.:: ::.......:: :. ::.::
NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
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pF1KE6 CGSHMVTVTIFYGTLIFMYLQPKSNHSLDTDKMASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKDA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 SKKALDKGCENLQILTFLKIRKLY
.:
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 876 init1: 848 opt: 885 Z-score: 933.5 bits: 181.0 E(85289): 2.9e-45
Smith-Waterman score: 885; 45.7% identity (75.2% similar) in 311 aa overlap (1-307:1-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAEVNIIYVTVFILKGITNRP-ELQAPCFGVFLVIYLVTVLGNLGLITLIKI-DTRLHTP
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGN-SLIILVTLADPMLHSP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 MYYFLSHLAFVDLCYSSAITPKMMVNFVVERNTIPFHACATQLGYFLTFMITECFLLASM
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NP_835 MYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATM
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120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AYGRYVAICSPLHYSTLMSRRVCIQLVAVPYIYSFLVALFHTVITFRLTYCGPNLINHFY
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NP_835 AYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CDDLPFLALSCSDTHMKEILIFAFAGFDMIS--SSSIVLTSYIFIIAAILRIRSTQGQHK
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NP_835 CDSPPVLKLVCADTALFEI--YAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 AISTCGSHMVTVTIFYGTLIFMYLQPKSNHSLDTDKMASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKE
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NP_835 AFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSE
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 VKDASKKALDKGCENLQILTFLKIRKLY
::.: .... :
NP_835 VKNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 897 init1: 855 opt: 867 Z-score: 914.8 bits: 177.5 E(85289): 3.2e-44
Smith-Waterman score: 867; 43.0% identity (76.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAEVNIIYVTVFILKGITNRPELQAPCFGVFLVIYLVTVLGNLGLITLIKIDTRLHTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFLSHLAFVDLCYSSAITPKMMVNFVVERNTIPFHACATQLGYFLTFMITECFLLASMAY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GRYVAICSPLHYSTLMSRRVCIQLVAVPYIYSFLVALFHTVITFRLTYCGPNLINHFYCD
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DLPFLALSCSDTHMKEILIFAFAGFDMISSSSIVLTSYIFIIAAILRIRSTQGQHKAIST
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHMVTVTIFYGTLIFMYLQPKSNHSLDTDKMASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKDA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 SKKALDKGCENLQILTFLKIRKLY
.: : :
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 897 init1: 855 opt: 867 Z-score: 914.8 bits: 177.5 E(85289): 3.2e-44
Smith-Waterman score: 867; 43.0% identity (76.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAEVNIIYVTVFILKGITNRPELQAPCFGVFLVIYLVTVLGNLGLITLIKIDTRLHTPMY
:. : .:. ::: :... . .. : .:::.:.:::::: .. ::..:.:::::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFLSHLAFVDLCYSSAITPKMMVNFVVERNTIPFHACATQLGYFLTFMITECFLLASMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GRYVAICSPLHYSTLMSRRVCIQLVAVPYIYSFLVALFHTVITFRLTYCGPNLINHFYCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DLPFLALSCSDTHMKEILIFAFAGFDMISSSSIVLTSYIFIIAAILRIRSTQGQHKAIST
: . :.: :: .:. :.. . ... .:: ::: ::..::.:.: .:..::. :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHMVTVTIFYGTLIFMYLQPKSNHSLDTDKMASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKDA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
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.: : :
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
324 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 09:19:23 2016 done: Tue Nov 8 09:19:24 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]