Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6079
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6079, 324 aa
1>>>pF1KE6079 324 - 324 aa - 324 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6214+/-0.00116; mu= 14.0166+/- 0.069
mean_var=132.7770+/-44.517, 0's: 0 Z-trim(102.3): 362 B-trim: 403 in 1/46
Lambda= 0.111305
statistics sampled from 6488 (6904) to 6488 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 1.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 2123 353.2 1.6e-97
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1409 238.5 5.2e-63
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 1256 213.9 1.3e-55
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1120 192.1 4.9e-49
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1118 191.8 6.3e-49
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1095 188.1 7.9e-48
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1094 187.9 8.8e-48
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1093 187.8 9.9e-48
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1077 185.2 6.1e-47
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1075 184.9 7.5e-47
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1074 184.7 8.1e-47
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1074 184.8 8.9e-47
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1072 184.4 1e-46
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1070 184.1 1.3e-46
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1068 183.8 1.6e-46
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1064 183.1 2.5e-46
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1059 182.3 4.3e-46
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1058 182.1 4.8e-46
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1050 180.9 1.3e-45
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1047 180.4 1.6e-45
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 1043 179.7 2.6e-45
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1042 179.6 2.9e-45
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1042 179.6 2.9e-45
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1040 179.3 3.6e-45
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1037 178.8 5e-45
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1033 178.1 7.8e-45
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 1033 178.2 7.9e-45
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1029 177.5 1.2e-44
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1029 177.5 1.2e-44
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1029 177.5 1.3e-44
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1028 177.3 1.4e-44
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1027 177.2 1.5e-44
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1025 176.8 1.9e-44
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1024 176.7 2.1e-44
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1023 176.5 2.4e-44
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1022 176.4 2.7e-44
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 1021 176.2 3e-44
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1020 176.1 3.3e-44
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1013 174.9 7.3e-44
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1009 174.3 1.1e-43
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1008 174.1 1.3e-43
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1005 173.6 1.8e-43
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 1005 173.6 1.8e-43
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 1005 173.6 1.8e-43
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 1004 173.5 2e-43
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1003 173.3 2.2e-43
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 1001 173.0 2.8e-43
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 993 171.7 6.7e-43
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 993 171.7 6.8e-43
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 993 171.7 7e-43
>>CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 2123 init1: 2123 opt: 2123 Z-score: 1864.1 bits: 353.2 E(32554): 1.6e-97
Smith-Waterman score: 2123; 100.0% identity (100.0% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSHLHMPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSHLHMPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQYFVFCGMGLTECFLLAAMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQYFVFCGMGLTECFLLAAMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYMINHFFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYMINHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATGRTKAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATGRTKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKEIKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKEIKN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 AMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
310 320
>>CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1409 init1: 1409 opt: 1409 Z-score: 1244.6 bits: 238.5 E(32554): 5.2e-63
Smith-Waterman score: 1409; 67.3% identity (89.4% similar) in 303 aa overlap (6-308:8-310)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSHLHM
:.. :: :::::..:::... .::. :::.:: ::::::.:: ::. :.:::
CCDS31 MSITKAWNSSSVTMFILLGFTDHPELQALLFVTFLGIYLTTLAWNLALIFLIRGDTHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PMYFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQYFVFCGMGLTECFLLAA
:::::::::::.:::: :..::.::.:.. :::::::::::.:.: : ::::.::.::.:
CCDS31 PMYFFLSNLSFIDICYSSAVAPNMLTDFFWEQKTISFVGCAAQFFFFVGMGLSECLLLTA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MAYDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYMINHF
::::::::: .:::: ..... :: .:::::::::::::.:.. :... :::: .::::
CCDS31 MAYDRYAAISSPLLYPTIMTQGLCTRMVVGAYVGGFLSSLIQASSIFRLHFCGPNIINHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FCDLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATGRTKA
:::::::::::::::: :.::.:.: :.:: .: : .::::::::.::.:: :: :: ::
CCDS31 FCDLPPVLALSCSDTFLSQVVNFLVVVTVGGTSFLQLLISYGYIVSAVLKIPSAEGRWKA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FSTCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKEI
.:::::: .:::..:...:.:.:::::: :.::::::.::.::::..::.:::.:::::
CCDS31 CNTCASHLMVVTLLFGTALFVYLRPSSSYLLGRDKVVSVFYSLVIPMLNPLIYSLRNKEI
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 KNAMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
:.:. :..::
CCDS31 KDALWKVLERKKVFS
310
>>CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1259 init1: 1236 opt: 1256 Z-score: 1111.9 bits: 213.9 E(32554): 1.3e-55
Smith-Waterman score: 1256; 58.4% identity (83.4% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSHLHMPM
:. : : : .: :::::.:: :.. :: .:: .:. .::::::::.::.:::::: ::
CCDS31 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQYFVFCGMGLTECFLLAAMA
:::::::::.:.::.:::.:::::... ::.::.:::: :::.: :::.: :..:::
CCDS31 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYMINHFFC
:::::::::::::. ..: :::. ::.:::. :. .:... .. : ::: .: ::::
CCDS31 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATGRTKAFS
:.: .: :::.::: .:.: :... ::.:.::..:::::: ...::.:: ::.:::.
CCDS31 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKEIKN
:::::::::.::: ::.:.:. ::. : . :. .:.::..:::..::.:::.::::::.
CCDS31 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 AMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
:... ..:
CCDS31 ALKRLQKRKCC
310
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1148 init1: 1120 opt: 1120 Z-score: 993.9 bits: 192.1 E(32554): 4.9e-49
Smith-Waterman score: 1120; 51.7% identity (80.5% similar) in 302 aa overlap (5-306:6-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSHLHMP
:: :.::.:::::. .:...: ::..:: :: . : :..:. ::..: ::. :
CCDS79 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 MYFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQYFVFCGMGLTECFLLAAM
::::::::::.:.:: :. .:::: ....:.:.::. ::: :.. :: .. :: :.::::
CCDS79 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AYDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYMINHFF
:::::.::::::::::..:. .:....: .:.:: .::...: .. .: .:::::
CCDS79 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CDLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATGRTKAF
:::::.: :::.:: .: . . : :. ....::: .:. .:.:: : .:: :.:
CCDS79 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 STCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKEIK
::::::::.::.. :. .:.: ::: :: : ::..:.::.. :::.::.:::.:::..:
CCDS79 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 NAMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
.: .:..
CCDS79 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 (327 aa)
initn: 1138 init1: 1106 opt: 1118 Z-score: 991.9 bits: 191.8 E(32554): 6.3e-49
Smith-Waterman score: 1118; 54.1% identity (81.1% similar) in 307 aa overlap (1-307:16-321)
10 20 30 40
pF1KE6 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLS
: :: : ::.:.:::::.: : . .:: .:: :::.::. :..
CCDS31 MIFPSHDSQAFTSVDMEVG-NCTILTEFILLGFSADSQWQPILFGVFLMLYLITLSGNMT
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 LIALIKMDSHLHMPMYFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQYFVF
:. ::. ::::: :::::..::::::. :.: .::.:.. ..:.: ::..::..: :
CCDS31 LVILIRTDSHLHTPMYFFIGNLSFLDFWYTSVYTPKILASCVSEDKRISLAGCGAQLFFS
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 CGMGLTECFLLAAMAYDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVY
: .. :::.:::::::::.:::::::::. .: .:: .:.:.:.::::... .: ...
CCDS31 CVVAYTECYLLAAMAYDRHAAICNPLLYSGTMSTALCTGLVAGSYIGGFLNAIAHTANTF
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 QHDFCGPYMINHFFCDLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAA
. ::: .:.::::: ::.. .::..: . : : . : . . :.:..:::: :. :
CCDS31 RLHFCGKNIIDHFFCDAPPLVKMSCTNTRVYEKVLLGVVGFTVLSSILAILISYVNILLA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 VVKISSATGRTKAFSTCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPV
...: ::.:: :::::::::: .: ::::: .::: ::::.:::.::::...::... :.
CCDS31 ILRIHSASGRHKAFSTCASHLISVMLFYGSLLFMYSRPSSTYSLERDKVAALFYTVINPL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE6 VNPIIYSFRNKEIKNAMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
.::.:::.:::.::.:.::: .
CCDS31 LNPLIYSLRNKDIKEAFRKATQTIQPQT
300 310 320
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1120 init1: 1095 opt: 1095 Z-score: 972.1 bits: 188.1 E(32554): 7.9e-48
Smith-Waterman score: 1095; 53.5% identity (80.5% similar) in 303 aa overlap (4-306:9-311)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSH
:::.: ::.:.::::::.:... :: ::: .:. ... ::..:.:::.:
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CCDS31 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
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CCDS31 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
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CCDS31 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
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CCDS31 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
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300 310 320
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CCDS31 KDVKKALKKILWKHIL
310
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CCDS31 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
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CCDS31 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
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CCDS31 ALANVISRKRTSSFL
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CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPM
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CCDS31 YFFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMA
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CCDS31 YDRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFC
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CCDS31 DAPPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFS
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CCDS31 TCASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKS
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CCDS31 AFKKTVGKAKA-SIG--FIF
300 310
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10 20 30
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CCDS31 TFTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTDDFELQVFLFLLFFA
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CCDS31 IYLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAKNKSIS
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CCDS31 FIGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGI
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CCDS31 YYFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMA
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CCDS31 YDRYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFFC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]