Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6074
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6074, 323 aa
1>>>pF1KE6074 323 - 323 aa - 323 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7629+/-0.00151; mu= 8.1179+/- 0.086
mean_var=190.9048+/-64.228, 0's: 0 Z-trim(100.6): 431 B-trim: 386 in 1/48
Lambda= 0.092825
statistics sampled from 5646 (6160) to 5646 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.511), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16
Scan time: 1.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 2082 292.4 3.2e-79
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1479 211.7 6.9e-55
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1324 190.9 1.1e-48
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1301 187.8 9.6e-48
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1270 183.7 1.8e-46
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1252 181.2 9e-46
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1242 179.9 2.3e-45
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1241 179.7 2.5e-45
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1239 179.5 3e-45
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1231 178.4 6.3e-45
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1211 175.7 4.1e-44
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1210 175.6 4.5e-44
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1183 172.0 5.5e-43
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1183 172.0 5.5e-43
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1183 172.0 5.5e-43
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1176 171.1 1.1e-42
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1175 170.9 1.2e-42
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1113 162.6 3.7e-40
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1083 158.6 5.9e-39
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1073 157.3 1.5e-38
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1072 157.1 1.6e-38
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1055 154.8 7.9e-38
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1052 154.5 1.1e-37
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1043 153.2 2.4e-37
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1037 152.5 4.7e-37
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1020 150.2 2e-36
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1019 150.0 2.2e-36
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1005 148.2 8.2e-36
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1005 148.2 8.3e-36
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 999 147.4 1.4e-35
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 995 146.9 2.2e-35
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 990 146.1 3.3e-35
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 990 146.1 3.3e-35
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 986 145.6 4.8e-35
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 983 145.2 6.3e-35
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 982 145.1 7e-35
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 979 144.7 9.2e-35
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 979 144.7 9.5e-35
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 971 143.6 1.9e-34
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 960 142.1 5.3e-34
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 959 142.0 5.9e-34
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 949 140.7 1.5e-33
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 943 139.8 2.6e-33
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 939 139.3 3.7e-33
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 926 137.6 1.3e-32
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 918 136.5 2.7e-32
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 904 134.6 9.9e-32
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 881 131.6 8.5e-31
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 874 130.6 1.6e-30
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 869 129.9 2.5e-30
>>CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 (323 aa)
initn: 2082 init1: 2082 opt: 2082 Z-score: 1535.7 bits: 292.4 E(32554): 3.2e-79
Smith-Waterman score: 2082; 100.0% identity (100.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVWLKSSAAMAKAFSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVWLKSSAAMAKAFSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAAVRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAAVRK
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 IVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
:::::::::::::::::::::::
CCDS32 IVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
310 320
>>CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 (348 aa)
initn: 1471 init1: 1447 opt: 1479 Z-score: 1098.9 bits: 211.7 E(32554): 6.9e-55
Smith-Waterman score: 1479; 68.7% identity (89.3% similar) in 319 aa overlap (1-319:25-340)
10 20 30
pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYT
:...: : :.::::::: ::..:: : : ::.::
CCDS32 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 VIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMYFLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSG
.:.:::.:::::::::. ::.::::::.::::.:.: ::::::::::::: ..::::..
CCDS32 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLANLSFIDVCVASFATPKMIADFLVERKTISFDA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 CIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAYDRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHT
:.:::::.:::::.::::::::::::::::::::.:...::::.:.:::.::: :...::
CCDS32 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 LSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCDLPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVS
:::.::::::::::: ::::::::: ::::::.:.:.. .:::..::.::::.: :::
CCDS32 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 SYIIILVTVWLKSSAAMAKAFSTLASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDKFLAIFYT
:: .::::: .:::.:::: :::..::.:: ::::::::::::::. .:: ::.:::
CCDS32 SYTVILVTVRNRSSASMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYT
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320
pF1KE6 VFTPVLNPIIYTLRNRDMKAAVRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
.:: .:::.::::::...:::. :. ..::.: :..:.:.:
CCDS32 IFTLILNPVIYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKP---SQVSVVIRNVLFLETK
310 320 330 340
>>CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 (311 aa)
initn: 1333 init1: 1305 opt: 1324 Z-score: 987.3 bits: 190.9 E(32554): 1.1e-48
Smith-Waterman score: 1324; 61.1% identity (87.9% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
: ..: :.::::::::: .: ::::.: .::..:.. ::::.:::. .. :. :.::::
CCDS32 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYVTSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
:::.::::.::::..::::::..::. ..:::: ::.:::: .: :.:.::.:::.:::
CCDS32 FLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIERKTISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD
::..::::::.: .::.:: :...: :::::...:..:.:.:::.::::::: :::::::
CCDS32 DRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVWLKSSAAMAKAFSTL
:: : .:::.:.: .::. ..:::..::: : :. :: :::. : .::.. .::.:::
CCDS32 LPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALIISYTIILIGVRCRSSSGSSKALSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAAVRK
..::.::::::::::..:.:::. :.::::..:::: ::.::::::.:::.:.:::. :
CCDS32 TAHITVVILFFGPCIYFYIWPFSRLPVDKFLSVFYTVCTPLLNPIIYSLRNEDVKAAMWK
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 IVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
. :...
CCDS32 LRNRHVNSWKN
310
>>CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 (310 aa)
initn: 1337 init1: 1127 opt: 1301 Z-score: 970.6 bits: 187.8 E(32554): 9.6e-48
Smith-Waterman score: 1301; 63.3% identity (86.2% similar) in 305 aa overlap (1-303:1-304)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHS-PM
:: .: :.:::::: :::.:..:: :.: :: .:..:.::::::..:: :: ::: ::
CCDS32 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YFLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGG-EMVLLVSM
:::::::.:.:. ::::::::: :::: .. :::.::.:::::.: :::: ::::::::
CCDS32 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLH-FTGGAEMVLLVSM
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AYDRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFF
::::::::::::.:...:: .:: ::. ::.:..::..::..::::::.:::: :::::
CCDS32 AYDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRLVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CDLPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVWLKSSAAMAKAFS
:::: : ::::.:.:.. :... .::.:::: : ::. :: .::... ..... .::.:
CCDS32 CDLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAIRQRAAGSTSKALS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TLASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAAV
: ..:: :: ::::::::.:: ::. .::.:..:::.:::.::::::::::..::::.
CCDS32 TCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKAAM
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 RKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
.:. :
CCDS32 KKLQNRRVTFQ
300 310
>>CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 (343 aa)
initn: 1300 init1: 1257 opt: 1270 Z-score: 947.7 bits: 183.7 E(32554): 1.8e-46
Smith-Waterman score: 1270; 60.3% identity (86.9% similar) in 305 aa overlap (5-309:36-340)
10 20 30
pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVL
:.: ::::.:::: ::: .... : .:::.
CCDS32 SLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFALFSVI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 YTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMYFLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISF
:.: ::::::::.:: . .:..:::::::::::::. :::::::.: ..:. ...:::
CCDS32 YVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNTPMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQKVISF
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 SGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAYDRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLV
.::..:::..::. : :::::::::.::::::::::.:..::....:..::. :: ..:.
CCDS32 AGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSWLLGLL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 HTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCDLPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLL
:. :. :.:::::::::::::.::::: ::::::.: :.....::.::::.::: : .:
CCDS32 HSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGIISLSCFIIL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 VSSYIIILVTVWLKSSAAMAKAFSTLASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDKFLAIF
. :: .::.:. .: ....:: :::..::.:::::::::::::.::: .:::::.:
CCDS32 LISYSLILITIKNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSVDKFLAVF
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320
pF1KE6 YTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAAVRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
::..::.::::::::::..:: ...:. .. :
CCDS32 YTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKLWRAFVNSREDT
310 320 330 340
>>CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 (304 aa)
initn: 1272 init1: 1233 opt: 1252 Z-score: 935.3 bits: 181.2 E(32554): 9e-46
Smith-Waterman score: 1252; 60.3% identity (87.0% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300)
10 20 30 40 50 60
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310
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.
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300
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.
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CCDS30 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
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CCDS30 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
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CCDS30 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTL
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 ASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAAVRK
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CCDS30 LRKWDAHSSVKF
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