Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6073
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6073, 321 aa
1>>>pF1KE6073 321 - 321 aa - 321 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1473+/-0.0012; mu= 11.0070+/- 0.070
mean_var=160.2041+/-54.378, 0's: 0 Z-trim(102.3): 373 B-trim: 384 in 1/47
Lambda= 0.101330
statistics sampled from 6449 (6893) to 6449 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.555), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 1.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42233.1 OR3A2 gene_id:4995|Hs108|chr17 ( 321) 2084 317.6 8.4e-87
CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 1876 287.2 1.2e-77
CCDS11023.1 OR3A1 gene_id:4994|Hs108|chr17 ( 315) 1725 265.1 5.2e-71
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 956 152.7 3.7e-37
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 917 147.0 1.9e-35
CCDS31094.1 OR13G1 gene_id:441933|Hs108|chr1 ( 307) 896 143.9 1.6e-34
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 896 143.9 1.6e-34
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 894 143.6 1.9e-34
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 893 143.5 2.1e-34
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 883 142.0 5.8e-34
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 879 141.4 8.8e-34
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 879 141.4 8.8e-34
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 876 141.0 1.2e-33
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 874 140.7 1.5e-33
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 871 140.2 2e-33
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 871 140.2 2e-33
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 870 140.1 2.2e-33
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 869 140.0 2.5e-33
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 867 139.7 2.9e-33
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 866 139.5 3.3e-33
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 866 139.5 3.4e-33
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 860 138.7 6.4e-33
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 857 138.2 8.1e-33
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 856 138.0 8.9e-33
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 856 138.1 9.1e-33
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 856 138.1 9.2e-33
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 855 137.9 1e-32
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 851 137.3 1.5e-32
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 851 137.3 1.5e-32
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 850 137.2 1.7e-32
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 849 137.0 1.8e-32
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 849 137.0 1.8e-32
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 849 137.0 1.9e-32
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 848 136.9 2e-32
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 847 136.7 2.2e-32
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 847 136.7 2.3e-32
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 847 136.7 2.3e-32
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 846 136.6 2.5e-32
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 846 136.7 2.7e-32
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 844 136.3 3e-32
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 844 136.3 3e-32
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 844 136.3 3.2e-32
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 839 135.6 5.1e-32
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 838 135.5 6.1e-32
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 836 135.1 6.9e-32
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 836 135.2 7.1e-32
CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 ( 316) 835 135.0 7.6e-32
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 835 135.0 7.7e-32
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 834 134.8 8.5e-32
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 833 134.7 9.2e-32
>>CCDS42233.1 OR3A2 gene_id:4995|Hs108|chr17 (321 aa)
initn: 2084 init1: 2084 opt: 2084 Z-score: 1671.9 bits: 317.6 E(32554): 8.4e-87
Smith-Waterman score: 2084; 100.0% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTTGGNLSILAAVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTTGGNLSILAAVLV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASLACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASLACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPLVLIITAYSHVAAAVLRIRSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPLVLIITAYSHVAAAVLRIRSV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EGRKKAFSTCGSHLTVVCLFFGRGIFNYMRLGSEEASDKDKGVGVFNTVINPMLNPLIYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EGRKKAFSTCGSHLTVVCLFFGRGIFNYMRLGSEEASDKDKGVGVFNTVINPMLNPLIYS
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LRNPDVQGALWQIFLGRRSLT
:::::::::::::::::::::
CCDS42 LRNPDVQGALWQIFLGRRSLT
310 320
>>CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 (321 aa)
initn: 1876 init1: 1876 opt: 1876 Z-score: 1507.5 bits: 287.2 E(32554): 1.2e-77
Smith-Waterman score: 1876; 90.3% identity (96.9% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTTGGNLSILAAVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTTGGNLSILAAVLV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASLACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS11 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPLVLIITAYSHVAAAVLRIRSV
:::::::::::::::::::::::::::::... .:: .:::.: ..:.::.::::.:::.
CCDS11 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFVAAAFMAVAPLVFISVSYAHVVAAVLQIRSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EGRKKAFSTCGSHLTVVCLFFGRGIFNYMRLGSEEASDKDKGVGVFNTVINPMLNPLIYS
::::::::::::::::: .:.: :.:.:::::: :.:::::::::: :::::::::::::
CCDS11 EGRKKAFSTCGSHLTVVGIFYGTGVFSYMRLGSVESSDKDKGVGVFMTVINPMLNPLIYS
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LRNPDVQGALWQIFLGRRSLT
::: :::::: :...:.::::
CCDS11 LRNTDVQGALCQLLVGKRSLT
310 320
>>CCDS11023.1 OR3A1 gene_id:4994|Hs108|chr17 (315 aa)
initn: 1725 init1: 1725 opt: 1725 Z-score: 1388.3 bits: 265.1 E(32554): 5.2e-71
Smith-Waterman score: 1725; 81.5% identity (94.6% similar) in 314 aa overlap (7-320:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTTGGNLSILAAVLV
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CCDS11 MQPESGANGTVIAEFILLGLLEAPGLQPVVFVLFLFAYLVTVRGNLSILAAVLV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
:::::.:::::::::::::::::.::::.::.::::.: .. :::.:::::::..:.:
CCDS11 EPKLHTPMYFFLGNLSVLDVGCISVTVPSMLSRLLSRKRAVPCGACLTQLFFFHLFVGVD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASLACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
:::::::::::.::::.:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS11 CFLLTAMAYDRFLAICRPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPLVLIITAYSHVAAAVLRIRSV
: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::. .: ::::::::::::
CCDS11 NVINHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPMALIVISYIHVAAAVLRIRSV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EGRKKAFSTCGSHLTVVCLFFGRGIFNYMRLGSEEASDKDKGVGVFNTVINPMLNPLIYS
::::::::::::::::: .:.: :::::::::: . :::::.::.:::::::::::.:::
CCDS11 EGRKKAFSTCGSHLTVVAIFYGSGIFNYMRLGSTKLSDKDKAVGIFNTVINPMLNPIIYS
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 LRNPDVQGALWQIFLGRRSLT
.::::::.:.:... :::::
CCDS11 FRNPDVQSAIWRMLTGRRSLA
300 310
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 973 init1: 946 opt: 956 Z-score: 780.7 bits: 152.7 E(32554): 3.7e-37
Smith-Waterman score: 956; 45.6% identity (79.3% similar) in 305 aa overlap (14-312:5-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTTGGNLSILAAVLV
:.::..:::.::. . .:.: ..:......:. : :::. :. ....
CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
.:.::.:::.:::::. .:. : .:: :. .:::.:..::: .:. ::: : ...: .
CCDS46 DPHLHTPMYYFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASLACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
:.::.:::::: .:::.:: ::. .:... .:.:. : .: :...::: : :::
CCDS46 CLLLAAMAYDRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPLVLIITAYSHVAAAVLRIRSV
:..:.:.::.: :. :::..:..::: :...: ... ::.. :. .: . ...:::.:
CCDS46 NQINYFFCDIPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTILRIQSS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EGRKKAFSTCGSHLTVVCLFFGRGIFNYMRLGSEEASDKDKGVGVFNTVINPMLNPLIYS
:::.::::::.:::..: ::.: .::.:.: : . ::. :.:. .:..:::::.::.
CCDS46 EGRRKAFSTCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYT
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 LRNPDVQ------GALWQIFLGRRSLT
::: :.. :. ::
CCDS46 LRNKDIKEAVKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
300 310 320
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 895 init1: 624 opt: 917 Z-score: 750.1 bits: 147.0 E(32554): 1.9e-35
Smith-Waterman score: 917; 45.5% identity (77.4% similar) in 301 aa overlap (14-314:3-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTTGGNLSILAAVLV
: : :.:::::::.. ..: ... .:: ::.: :: .... .
CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
. .::.::::::.:::..:.: ....: .. : : ..::::.: .:.::: .: ..
CCDS31 DSHLHTPMYFFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASLACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
:.::..::::: :.:.:: :.: :. : .:...: . .: :: :... :.:::
CCDS31 CYLLASMAYDRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPLVLIITAYSHVAAAVLRIRSV
::.:::.::.: :. ::::.:....:..:..:: . : ::..:. : . .. :..:.
CCDS31 NEINHFFCDIPPLLALSCSDTRISKLVVFVAGFNVFFTLLVILIS-YFFICITIQRMHSA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EGRKKAFSTCGSHLTVVCLFFGRGIFNYMRLGSEEASDKDKGVGVFNTVINPMLNPLIYS
::.::.::::.::::.. .:.: :: :.. .: .. : :: ..:: ::. :::::::::
CCDS31 EGQKKVFSTCASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYS
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 LRNPDVQGALWQIFLGRRSLT
::: .:..:::.:.
CCDS31 LRNKEVKSALWKILNKLYPQY
290 300
>>CCDS31094.1 OR13G1 gene_id:441933|Hs108|chr1 (307 aa)
initn: 882 init1: 882 opt: 896 Z-score: 733.5 bits: 143.9 E(32554): 1.6e-34
Smith-Waterman score: 896; 42.5% identity (76.7% similar) in 301 aa overlap (14-314:2-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTTGGNLSILAAVLV
:...:.:::.:::.. :.: ..:...:..:::. ::. :. : .
CCDS31 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIY
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
. ::.::: :: .:.:.:. : : .: ::: .:. ..:::: .:.::::.: : .
CCDS31 NNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAE
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