Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6072
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6072, 321 aa
1>>>pF1KE6072 321 - 321 aa - 321 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8541+/-0.00125; mu= 12.7357+/- 0.073
mean_var=133.2704+/-41.498, 0's: 0 Z-trim(101.5): 358 B-trim: 381 in 1/45
Lambda= 0.111098
statistics sampled from 6151 (6560) to 6151 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 2.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 ( 321) 2131 353.9 9.8e-98
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1596 268.1 6.2e-72
CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3 ( 321) 1556 261.7 5.4e-70
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 1535 258.4 5.5e-69
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1104 189.3 3.4e-48
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 1082 185.7 3.9e-47
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 ( 313) 1059 182.1 5.1e-46
CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 ( 313) 1046 180.0 2.2e-45
CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 ( 325) 1043 179.5 3.1e-45
CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 ( 310) 1035 178.2 7.3e-45
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1016 175.2 6.1e-44
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 998 172.3 4.6e-43
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 975 168.6 5.7e-42
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 967 167.3 1.4e-41
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 967 167.3 1.4e-41
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 960 166.2 3e-41
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 957 165.8 4.5e-41
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 953 165.1 6.6e-41
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 953 165.1 6.8e-41
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 949 164.4 1e-40
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 944 163.6 1.8e-40
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 940 163.0 2.8e-40
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 940 163.0 2.9e-40
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 939 162.8 3.2e-40
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 938 162.7 3.5e-40
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 936 162.4 4.4e-40
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 936 162.4 4.4e-40
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 935 162.2 5e-40
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 935 162.2 5.2e-40
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 930 161.4 8.5e-40
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 930 161.5 9.3e-40
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 924 160.4 1.7e-39
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 921 159.9 2.3e-39
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 921 159.9 2.3e-39
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 915 159.0 4.5e-39
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 914 158.8 5.1e-39
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 913 158.7 5.7e-39
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 911 158.3 7e-39
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 910 158.3 8.7e-39
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 907 157.7 1.1e-38
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 904 157.2 1.5e-38
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 901 156.7 2.1e-38
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 900 156.6 2.5e-38
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 899 156.4 2.7e-38
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 898 156.3 3e-38
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 892 155.3 5.8e-38
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 891 155.1 6.5e-38
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 891 155.1 6.5e-38
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 888 154.7 9e-38
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 888 154.7 9.1e-38
>>CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 (321 aa)
initn: 2131 init1: 2131 opt: 2131 Z-score: 1868.1 bits: 353.9 E(32554): 9.8e-98
Smith-Waterman score: 2131; 100.0% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNKENHSLIAEFILTGFTYHPKLKTVLFVVFFAIYLITMVGNIGLVALIYIEQRLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MNKENHSLIAEFILTGFTYHPKLKTVLFVVFFAIYLITMVGNIGLVALIYIEQRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IFLGNLVLMDSCCSSAITPKMLENFFSEDKRITLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLAAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IFLGNLVLMDSCCSSAITPKMLENFFSEDKRITLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DCYVAICNPLQYHTMMSKTLCIQMTAGAYLAGNLHPMIEVEFLLRLTFCGSHQINHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DCYVAICNPLQYHTMMSKTLCIQMTAGAYLAGNLHPMIEVEFLLRLTFCGSHQINHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VLPLYRLSCINPYINELVLFILAGSIQIFTIVLVSYFYILFTIFTMKSKEGRGKALSTCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VLPLYRLSCINPYINELVLFILAGSIQIFTIVLVSYFYILFTIFTMKSKEGRGKALSTCA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SHFLSVSIFCDSLLFMYARPGAVNEGDKDIPVAIFYTLVIPLLNPFIYSLRNKEVINIMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SHFLSVSIFCDSLLFMYARPGAVNEGDKDIPVAIFYTLVIPLLNPFIYSLRNKEVINIMK
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 KIMKKRKFCHILKQMSSPLAT
:::::::::::::::::::::
CCDS33 KIMKKRKFCHILKQMSSPLAT
310 320
>>CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 (308 aa)
initn: 1596 init1: 1147 opt: 1596 Z-score: 1404.9 bits: 268.1 E(32554): 6.2e-72
Smith-Waterman score: 1596; 74.4% identity (93.5% similar) in 308 aa overlap (1-306:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNKENHSLIAEFILTGFTYHPKLKTVLFVVFFAIYLITMVGNIGLVALIYIEQRLHTPMY
: .:::.. :::::::: ::.:::.::::::::::::.::::.:::::. ..:::::::
CCDS43 MAEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHRRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IFLGNLVLMDSCCSSAITPKMLENFFSEDKRITLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLAAMAY
::::::.:.::::. :::::::::::::.:::.:::: .:::::: .::.::::::::::
CCDS43 IFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSENKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DCYVAICNPLQYHTMMSKTLCIQMTAGAYLAGNLHPMIEVEFLLRLTFCGSHQINHFFCD
: ::::::::::: :::: ::::::.::..::::: ::.: ...::.::::..::::.::
CCDS43 DRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGSNHINHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 VLPLYRLSCINPYINELVLFILAGSIQIFTI--VLVSYFYILFTIFTMKSKEGRGKALST
.::::::::..::::::::::..::.:.::: ::.::.:::.::: :::::::.::.::
CCDS43 ILPLYRLSCVDPYINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFKMKSKEGRAKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CASHFLSVSIFCDSLLFMYARPGAVNEGDKDIPVAIFYTLVIPLLNPFIYSLRNKEVINI
:::::::::.: ::.:::.::. ..:::::::.::..:.:.::::::::::::.:::..
CCDS43 CASHFLSVSLFYGSLFFMYVRPNLLEEGDKDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNREVISV
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 MKKIMKKRKFCHILKQMSSPLAT
..::. :.
CCDS43 LRKILMKK
>>CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3 (321 aa)
initn: 1554 init1: 1124 opt: 1556 Z-score: 1370.0 bits: 261.7 E(32554): 5.4e-70
Smith-Waterman score: 1556; 75.2% identity (88.7% similar) in 319 aa overlap (1-317:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNKENHSLIAEFILTGFTYHPKLKTVLFVVFFAIYLITMVGNIGLVALIYIEQRLHTPMY
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CCDS33 MARENHSLAAEFILIGFTNYPELKTLLFVVFSAIYLVTMVGNLGLVALIYVERRLLTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IFLGNLVLMDSCCSSAITPKMLENFFSEDKRITLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLAAMAY
::::::.::::::: :.::::::::::::. :.:::::::::::::::::::::::.:::
CCDS33 IFLGNLALMDSCCSCAVTPKMLENFFSEDRIISLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLATMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DCYVAICNPLQYHTMMSKTLCIQMTAGAYLAGNLHPMIEVEFLLRLTFCGSHQINHFFCD
: :::::.::::::::::::::.::.::. ::::: ::.: .::::::: :..:.:::::
CCDS33 DRYVAICHPLQYHTMMSKTLCIRMTTGAFKAGNLHSMIHVGLLLRLTFCRSNKIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 VLPLYRLSCINPYINELVLFILAGSIQIFTI--VLVSYFYILFTIFTMKSKEGRGKALST
.:::::::: .: ::::...:.. :::::: ::.::. ::.:.: ::::::::::.::
CCDS33 ILPLYRLSCTDPSINELMIYIFSIPIQIFTIATVLISYLCILLTVFKMKSKEGRGKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CASHFLSVSIFCDSLLFMYARPGAVNEGDKDIPVAIFYTLVIPLLNPFIYSLRNKEVINI
::::::::::: :: :: :. .::::: ::::::..:::::::::::::::::::.
CCDS33 CASHFLSVSIFYICLL-MYIGPS--EEGDKDTPVAIFYAIVIPLLNPFIYSLRNKEVINV
250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 MKKIMKKRKFCHILKQMSSPLAT
.::::.. .:::: :
CCDS33 LKKIMRNY---NILKQTCSIANLFLIY
300 310 320
>>CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 (316 aa)
initn: 1535 init1: 1116 opt: 1535 Z-score: 1351.9 bits: 258.4 E(32554): 5.5e-69
Smith-Waterman score: 1535; 72.2% identity (91.3% similar) in 309 aa overlap (1-307:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNKENHSLIAEFILTGFTYHPKLKTVLFVVFFAIYLITMVGNIGLVALIYIEQRLHTPMY
: .:::.. :::::::: ::.:::.::::::::::::.::::.:::::. . :::::::
CCDS33 MVEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHCRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IFLGNLVLMDSCCSSAITPKMLENFFSEDKRITLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLAAMAY
::::::.:.::::. ::::::::::::: :::.:::: .:::::: .::.:::::::.::
CCDS33 IFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSEGKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAVAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DCYVAICNPLQYHTMMSKTLCIQMTAGAYLAGNLHPMIEVEFLLRLTFCGSHQINHFFCD
: ::::::::::: :::: ::::::.::..::::: ::.: ...::.::: ..::::.::
CCDS33 DRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGLNHINHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 VLPLYRLSCINPYINELVLFILAGSIQIFTI--VLVSYFYILFTIFTMKSKEGRGKALST
.::::::::..:.::::::::..::.:.::: ::.::.:::.::: :::::::.::.::
CCDS33 TLPLYRLSCVDPFINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFRMKSKEGRAKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CASHFLSVSIFCDSLLFMYARPGAVNEGDKDIPVAIFYTLVIPLLNPFIYSLRNKEVINI
::::: :::.: :..:.: ::. ..:: .:::.::..:.:.::::::::::::::::..
CCDS33 CASHFSSVSLFYGSIFFLYIRPNLLEEGGNDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNKEVISV
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 MKKIMKKRKFCHILKQMSSPLAT
..::. : :
CCDS33 LRKILLKIKSQGSVNK
310
>>CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 (314 aa)
initn: 1129 init1: 824 opt: 1104 Z-score: 978.6 bits: 189.3 E(32554): 3.4e-48
Smith-Waterman score: 1104; 52.4% identity (83.1% similar) in 307 aa overlap (1-305:6-312)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MNKENHSLIAEFILTGFTYHPKLKTVLFVVFFAIYLITMVGNIGLVALIYIEQRL
:...: .:..::.:::.::.:. : ::.::..:::::.: :.::.:::. . .:
CCDS33 MSNEDMEQDNTTLLTEFVLTGLTYQPEWKMPLFLVFLVIYLITIVWNLGLIALIWNDPQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 HTPMYIFLGNLVLMDSCCSSAITPKMLENFFSEDKRITLYECMAQFYFLCLAETTDCFLL
: :::.:::.:...:. ::..::::: ::..... :.: ::: ::. . .. ::.::::
CCDS33 HIPMYFFLGSLAFVDAWISSTVTPKMLVNFLAKNRMISLSECMIQFFSFAFGGTTECFLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AAMAYDCYVAICNPLQYHTMMSKTLCIQMTAGAYLAGNLHPMIEVEFLLRLTFCGSHQIN
:.:::: :::::.:: : ..:...:::.. : ..:.: :: .:. ...:::::.:. :.
CCDS33 ATMAYDRYVAICKPLLYPVIMNNSLCIRLLAFSFLGGFLHALIHEVLIFRLTFCNSNIIH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 HFFCDVLPLYRLSCINPYINELVLFILAGSIQIFTIVLV--SYFYILFTIFTMKSKEGRG
::.::..::. .:: .: :: :..:::.::::.:::: : :: . ::::. :: .:
CCDS33 HFYCDIIPLFMISCTDPSINFLMVFILSGSIQVFTIVTVLNSYTFALFTILKKKSVRGVR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KALSTCASHFLSVSIFCDSLLFMYARPGAVNEGDKDIPVAIFYTLVIPLLNPFIYSLRNK
::.:::..:.::::.. :.::: ::.. . :.:. ..:::..::::::.:::::::
CCDS33 KAFSTCGAHLLSVSLYYGPLIFMYLRPASPQADDQDMIDSVFYTIIIPLLNPIIYSLRNK
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 EVINIMKKIMKKRKFCHILKQMSSPLAT
.::. . :..:.
CCDS33 QVIDSFTKMVKRNV
310
>>CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 (309 aa)
initn: 1091 init1: 775 opt: 1082 Z-score: 959.6 bits: 185.7 E(32554): 3.9e-47
Smith-Waterman score: 1082; 49.8% identity (82.4% similar) in 307 aa overlap (1-305:3-309)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MNKENHSLIAEFILTGFTYHPKLKTVLFVVFFAIYLITMVGNIGLVALIYIEQRLHTP
... :..:..::.:::.: .: :....::::...::::::::.::..::. . .:: :
CCDS33 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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310
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CCDS33 FIKMLKRNVKVSY
310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]