FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6070, 321 aa
1>>>pF1KE6070 321 - 321 aa - 321 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4081+/-0.00123; mu= 9.5729+/- 0.072
mean_var=207.2739+/-74.630, 0's: 0 Z-trim(102.5): 384 B-trim: 421 in 1/46
Lambda= 0.089084
statistics sampled from 6525 (6991) to 6525 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.554), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 2.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1324 183.9 1.5e-46
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1227 171.4 8.3e-43
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 1167 163.7 1.7e-40
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1155 162.1 5e-40
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 1137 159.8 2.5e-39
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1137 159.8 2.5e-39
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 1137 159.9 2.5e-39
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 1127 158.6 6.3e-39
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 1125 158.3 7.3e-39
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 1116 157.1 1.6e-38
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 1110 156.4 2.8e-38
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1098 154.9 8.5e-38
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1083 152.9 3.1e-37
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1081 152.7 3.7e-37
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1074 151.7 6.9e-37
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 1066 150.7 1.4e-36
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1040 147.4 1.4e-35
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1033 146.5 2.6e-35
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1020 144.8 8.6e-35
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1014 144.0 1.5e-34
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1009 143.4 2.3e-34
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1008 143.3 2.5e-34
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 1008 143.3 2.6e-34
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1006 143.0 3e-34
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CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 997 141.9 6.6e-34
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CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 982 139.9 2.5e-33
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 982 139.9 2.5e-33
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 976 139.2 4.3e-33
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 959 137.0 1.9e-32
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 943 134.9 8.1e-32
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 939 134.4 1.2e-31
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 907 130.3 2e-30
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 902 129.7 3.2e-30
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 876 126.3 3.2e-29
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 871 125.7 5.1e-29
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 787 114.9 8.7e-26
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 777 113.6 2.1e-25
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 771 112.8 3.7e-25
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CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 753 110.6 2e-24
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CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 743 109.2 4.4e-24
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 619 93.3 2.8e-19
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 574 87.5 1.5e-17
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 572 87.2 1.8e-17
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1404 init1: 1323 opt: 1324 Z-score: 949.4 bits: 183.9 E(32554): 1.5e-46
Smith-Waterman score: 1324; 63.4% identity (85.0% similar) in 306 aa overlap (6-311:9-314)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MTILLNSSLQRATFFLTGFQGLEGLHGWISIPFCFIYLTVILGNLTILHVICTDATL
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CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 HGPMYYFLGMLAVTDLGLCLSTLPTVLGIFWFDTREIGIPACFTQLFFIHTLSSMESSVL
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CCDS31 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LSMSIDRYVAVCNPLHDSTVLTPACIVKMGLSSVLRSALLILPLPFLLKRFQYCHSHVLA
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CCDS31 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 HAYCLHLEIMKLACSSIIVNHIYGLFVVACTVGVDSLLIFLSYALILRTVLSIASHQERL
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CCDS31 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 RALNTCVSHICAVLLFYIPMIGLSLVHRFGEHLPRVVHLFMSYVYLLVPPLMNPIIYSIK
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CCDS31 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
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300 310 320
pF1KE6 TKQIRQRIIKKFQFIKSLRCFWKD
:::::.:. . : .
CCDS31 TKQIRDRVTHAFCY
310
>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1227 init1: 1227 opt: 1227 Z-score: 882.0 bits: 171.4 E(32554): 8.3e-43
Smith-Waterman score: 1227; 55.9% identity (86.5% similar) in 304 aa overlap (6-309:6-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTILLNSSLQRATFFLTGFQGLEGLHGWISIPFCFIYLTVILGNLTILHVICTDATLHGP
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CCDS31 MGDWNNSDAVEPIFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIESSLHQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYYFLGMLAVTDLGLCLSTLPTVLGIFWFDTREIGIPACFTQLFFIHTLSSMESSVLLSM
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CCDS31 MYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLESSVLLAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SIDRYVAVCNPLHDSTVLTPACIVKMGLSSVLRSALLILPLPFLLKRFQYCHSHVLAHAY
..::.::.:.::: :.:: . : :.::. .::: ..:: :.::....:::...:.::.
CCDS31 AFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHGNALSHAF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CLHLEIMKLACSSIIVNHIYGLFVVACTVGVDSLLIFLSYALILRTVLSIASHQERLRAL
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CCDS31 CLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASREEQLKAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NTCVSHICAVLLFYIPMIGLSLVHRFGEHLPRVVHLFMSYVYLLVPPLMNPIIYSIKTKQ
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CCDS31 NTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPVLNPIVYSVRTKQ
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 IRQRIIKKFQFIKSLRCFWKD
:: :..::
CCDS31 IRLGILHKFVLRRRF
310
>>CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1182 init1: 1163 opt: 1167 Z-score: 840.4 bits: 163.7 E(32554): 1.7e-40
Smith-Waterman score: 1167; 54.8% identity (81.6% similar) in 305 aa overlap (5-309:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTILLNSSLQRATFFLTGFQGLEGLHGWISIPFCFIYLTVILGNLTILHVICTDATLHGP
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CCDS31 MSSSGSSHPFLLTGFPGLEEAHHWISVFFLFMYISILFGNGTLLLLIKEDHNLHEP
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pF1KE6 MYYFLGMLAVTDLGLCLSTLPTVLGIFWFDTREIGIPACFTQLFFIHTLSSMESSVLLSM
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CCDS31 MYFFLAMLAATDLGLALTTMPTVLGVLWLDHREIGSAACFSQAYFIHSLSFLESGILLAM
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pF1KE6 SIDRYVAVCNPLHDSTVLTPACIVKMGLSSVLRSALLILPLPFLLKRFQYCHSHVLAHAY
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CCDS31 AYDRFIAICNPLRYTSVLTNTRVVKIGLGVLMRGFVSVVPPIRPLYFFLYCHSHVLSHAF
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pF1KE6 CLHLEIMKLACSSIIVNHIYGLFVVACTVGVDSLLIFLSYALILRTVLSIASHQERLRAL
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CCDS31 CLHQDVIKLACADTTFNRLYPAVLVVFIFVLDYLIIFISYVLILKTVLSIASREERAKAL
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pF1KE6 NTCVSHICAVLLFYIPMIGLSLVHRFGEHLPRVVHLFMSYVYLLVPPLMNPIIYSIKTKQ
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CCDS31 ITCVSHICCVLVFYVTVIGLSLIHRFGKQVPHIVHLIMSYAYFLFPPLMNPITYSVKTKQ
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310 320
pF1KE6 IRQRIIKKFQFIKSLRCFWKD
:.. :.. :
CCDS31 IQNAILHLFTTHRIGT
300 310
>>CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1155 init1: 1155 opt: 1155 Z-score: 832.0 bits: 162.1 E(32554): 5e-40
Smith-Waterman score: 1155; 54.6% identity (84.1% similar) in 302 aa overlap (12-313:10-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTILLNSSLQRATFFLTGFQGLEGLHGWISIPFCFIYLTVILGNLTILHVICTDATLHGP
: :.:::. :::. :.:.: :.: .: ... :: .::... .. .:: :
CCDS31 MGLFNVTHPAFFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVILQAVRVEPSLHEP
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pF1KE6 MYYFLGMLAVTDLGLCLSTLPTVLGIFWFDTREIGIPACFTQLFFIHTLSSMESSVLLSM
:::::.::. .:... ..:::::: : ...:.: . ::. :.:.:: .: :::..::.:
CCDS31 MYYFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHFFSMMESGILLAM
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pF1KE6 SIDRYVAVCNPLHDSTVLTPACIVKMGLSSVLRSALLILPLPFLLKRFQYCHSHVLAHAY
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CCDS31 SFDRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRLPICRSNVLSHSY
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CCDS31 CLHPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVMATASREERLKAL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
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CCDS31 NTCVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVPPVLNPLIYSAKTKE
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 IRQRIIKKFQFIKSLRCFWKD
::. :.. :. ::
CCDS31 IRRAIFRMFHHIKI
300 310
>>CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1163 init1: 722 opt: 1137 Z-score: 819.5 bits: 159.8 E(32554): 2.5e-39
Smith-Waterman score: 1137; 53.1% identity (80.9% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTILLNSSLQRATFFLTGFQGLEGLHGWISIPFCFIYLTVILGNLTILHVICTDATLHGP
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CCDS31 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNGTILFIIKTEPSLHGP
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pF1KE6 MYYFLGMLAVTDLGLCLSTLPTVLGIFWFDTREIGIPACFTQLFFIHTLSSMESSVLLSM
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CCDS31 MYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPETSSSACFAQEFFIHGFSVLESSVLLIM
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pF1KE6 SIDRYVAVCNPLHDSTVLTPACIVKMGLSSVLRSALLILPLPFLLKRFQYCHSHVLAHAY
:.::..:. :::. ...:: . ....:. ..: ::.::.:: :. ..::... :.:.:
CCDS31 SFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRSLRYCKKNQLSHSY
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pF1KE6 CLHLEIMKLACSSIIVNHIYGLFVVACTVGVDSLLIFLSYALILRTVLSIASHQERLRAL
::: ..::::::. .. :::.: . : . :: .:: .::.:::.:: .:::..:.:.::
CCDS31 CLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLM-VDFILIAVSYTLILKTVPGIASKKEELKAL
190 200 210 220 230
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pF1KE6 NTCVSHICAVLLFYIPMIGLSLVHRFGEHLPRVVHLFMSYVYLLVPPLMNPIIYSIKTKQ
::::::::::..::.:.:.:..::::. :. .....:. : :::::::.::.: .::::
CCDS31 NTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFAGHVSPLINVLMANVLLLVPPLMKPIVYCVKTKQ
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 IRQRIIKKFQFIKSLRCFWKD
:: :.. :. : ::
CCDS31 IRVRVVAKL-------CQWKI
300 310
>>CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 (313 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTILLNSSLQRATFFLTGFQGLEGLHGWISIPFCFIYLTVILGNLTILHVICTDATLHGP
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CCDS31 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNGTILFIIKTEPSLHEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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CCDS31 MYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLESSVLLIM
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 SIDRYVAVCNPLHDSTVLTPACIVKMGLSSVLRSALLILPLPFLLKRFQYCHSHVLAHAY
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CCDS31 SFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKNQLSHSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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CCDS31 CLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLM-VDFILIAVSYTLILKTVLGIASKKEQLKAL
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NTCVSHICAVLLFYIPMIGLSLVHRFGEHLPRVVHLFMSYVYLLVPPLMNPIIYSIKTKQ
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CCDS31 NTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPLTNPIVYCVKTKQ
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 IRQRIIKKFQFIKSLRCFWKD
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CCDS31 IRVRVVAKLCQRKI
300 310
>>CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 (321 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE6 MTILLNSSLQRATFFLTGFQGLEGLHGWISIPFCFIYLTVILGNLTILHVICT
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CCDS31 MFLSSRMITSVSPSTSTNSSFLLTGFSGMEQQYPWLSIPFSSIYAMVLLGNCMVLHVIWT
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 DATLHGPMYYFLGMLAVTDLGLCLSTLPTVLGIFWFDTREIGIPACFTQLFFIHTLSSME
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CCDS31 EPSLHQPMFYFLSMLALTDLCMGLSTVYTVLGILWGIIREISLDSCIAQSYFIHGLSFME
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CCDS31 SSVLLTMAFDRYIAICNPLRYSSILTNSRIIKIGLTIIGRSFFFITPPIICLKFFNYCHF
130 140 150 160 170 180
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CCDS31 HILSHSFCLHQDLLRLACSDIRFNSYYALMLVICILLLDAILILFSYILILKSVLAVASQ
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 QERLRALNTCVSHICAVLLFYIPMIGLSLVHRFGEHLPRVVHLFMSYVYLLVPPLMNPII
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CCDS31 EERHKLFQTCISHICAVLVFYIPIISLTMVHRFGKHLSPVAHVLIGNIYILFPPLMNPII
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 YSIKTKQIRQRIIKKFQFIKSLRCFWKD
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CCDS31 YSVKTQQIHTRMLRLFSLKRY
310 320
>>CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 (326 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE6 MTILLNSSLQRAT-FFLTGFQGLEGLHGWISIPFCFIYLTVILGNLTILHV
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CCDS53 MSVQYSLSPQFMLLSNITQFSPIFYLTSFPGLEGIKHWIFIPFFFMYMVAISGNCFILII
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pF1KE6 ICTDATLHGPMYYFLGMLAVTDLGLCLSTLPTVLGIFWFDTREIGIPACFTQLFFIHTLS
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CCDS53 IKTNPRLHTPMYYLLSLLALTDLGLCVSTLPTTMGIFWFNSHSIYFGACQIQMFCIHSFS
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pF1KE6 SMESSVLLSMSIDRYVAVCNPLHDSTVLTPACIVKMGLSSVLRSALLILPLPFLLKRFQY
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CCDS53 FMESSVLLMMSFDRLVAICHPLRYSVIITGQQVVRAGLIVIFRGPVATIPIVLLLKAFPY
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 CHSHVLAHAYCLHLEIMKLACSSIIVNHIYGLFVVACTVGVDSLLIFLSYALILRTVLSI
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CCDS53 CGSVVLSHSFCLHQEVIQLACTDITFNNLYGLMVVVFTVMLDLVLIALSYGLILHTVAGL
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ASHQERLRALNTCVSHICAVLLFYIPMIGLSLVHRFGEHLPRVVHLFMSYVYLLVPPLMN
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CCDS53 ASQEEQRRAFQTCTAPLCAVLVFFVPMMGLSLVHRFGKHAPPAIHLLMANVYLFVPPMLN
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300 310 320
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CCDS53 PIIYSIKTKEIHRAIIKFLGLKKASK
310 320
>>CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 (312 aa)
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CCDS31 MSVLNNSEVK--LFLLIGIPGLEHAHIWFSIPICLMYLLAIMGNCTILFIIKTEPSLHEP
10 20 30 40 50
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CCDS31 MYYFLAMLAVSDMGLSLSSLPTMLRVFLFNAMGISPNACFAQEFFIHGFTVMESSVLLIM
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pF1KE6 SIDRYVAVCNPLHDSTVLTPACIVKMGLSSVLRSALLILPLPFLLKRFQYCHSHVLAHAY
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CCDS31 SLDRFLAIHNPLRYSSILTSNRVAKMGLILAIRSILLVIPFPFTLRRLKYCQKNLLSHSY
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CCDS31 CLHQDTMKLACSDNKTNVIYGFFIALCTM-LDLALIVLSYVLILKTILSIASLAERLKAL
180 190 200 210 220 230
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CCDS31 NTCVSHICAVLTFYVPIITLAAMHHFAKHKSPLVVILIADMFLLVPPLMNPIVYCVKTRQ
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pF1KE6 IRQRIIKKFQFIKSLRCFWKD
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CCDS31 IWEKILGKLLNVCGR
300 310
>>CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 (314 aa)
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CCDS31 MLGLNGTPFQPATLQLTGIPGIQTGLTWVALIFCILYMISIVGNLSILTLVFWEPALHQP
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 MYYFLGMLAVTDLGLCLSTLPTVLGIFWFDTREIGIPACFTQLFFIHTLSSMESSVLLSM
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CCDS31 MYYFLSMLALNDLGVSFSTLPTVISTFCFNYNHVAFNACLVQMFFIHTFSFMESGILLAM
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CCDS31 SLDRFVAICYPLRYVTVLTHNRILAMGLGILTKSFTTLFPFPFVVKRLPFCKGNVLHHSY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]