Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6067
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6067, 321 aa
1>>>pF1KE6067 321 - 321 aa - 321 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0984+/-0.0013; mu= 11.4094+/- 0.075
mean_var=186.1461+/-64.173, 0's: 0 Z-trim(101.8): 383 B-trim: 395 in 1/49
Lambda= 0.094004
statistics sampled from 6196 (6681) to 6196 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 1.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 2064 293.4 1.6e-79
CCDS42233.1 OR3A2 gene_id:4995|Hs108|chr17 ( 321) 1870 267.1 1.4e-71
CCDS11023.1 OR3A1 gene_id:4994|Hs108|chr17 ( 315) 1646 236.7 1.9e-62
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 980 146.4 2.9e-35
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 952 142.5 4e-34
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 938 140.6 1.5e-33
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 929 139.4 3.5e-33
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 926 139.0 4.6e-33
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 922 138.5 6.7e-33
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 919 138.1 8.9e-33
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 917 137.8 1.1e-32
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 914 137.4 1.4e-32
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 913 137.3 1.6e-32
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 913 137.3 1.6e-32
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 911 137.0 1.9e-32
CCDS31094.1 OR13G1 gene_id:441933|Hs108|chr1 ( 307) 908 136.6 2.5e-32
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 908 136.6 2.5e-32
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 907 136.4 2.8e-32
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 904 136.0 3.7e-32
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 900 135.5 5.3e-32
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 899 135.4 6e-32
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 893 134.6 1.1e-31
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 892 134.4 1.1e-31
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 892 134.4 1.1e-31
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 890 134.2 1.4e-31
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 889 134.0 1.5e-31
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 889 134.0 1.5e-31
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 888 133.9 1.7e-31
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 887 133.8 1.9e-31
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 885 133.4 2.2e-31
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 882 133.1 2.9e-31
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 881 132.9 3.2e-31
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 881 132.9 3.2e-31
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 879 132.6 3.8e-31
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 879 132.6 3.8e-31
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 879 132.7 3.9e-31
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 878 132.5 4.2e-31
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 877 132.4 4.6e-31
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 876 132.2 5.1e-31
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 875 132.1 5.6e-31
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 874 132.0 6.2e-31
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 874 132.0 6.3e-31
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 873 131.8 6.7e-31
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 873 131.8 6.8e-31
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 871 131.6 8.3e-31
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 870 131.4 8.9e-31
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 870 131.4 9e-31
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 870 131.5 9.3e-31
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 869 131.3 9.9e-31
CCDS31188.1 OR13A1 gene_id:79290|Hs108|chr10 ( 328) 867 131.0 1.2e-30
>>CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 (321 aa)
initn: 2064 init1: 2064 opt: 2064 Z-score: 1541.0 bits: 293.4 E(32554): 1.6e-79
Smith-Waterman score: 2064; 99.7% identity (99.7% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTIGGNLSILAAVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS11 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTTGGNLSILAAVLV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFVAAAFMAVAPLVFISVSYAHVVAAVLQIRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFVAAAFMAVAPLVFISVSYAHVVAAVLQIRSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EGRKKAFSTCGSHLTVVGIFYGTGVFSYMRLGSVESSDKDKGVGVFMTVINPMLNPLIYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EGRKKAFSTCGSHLTVVGIFYGTGVFSYMRLGSVESSDKDKGVGVFMTVINPMLNPLIYS
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LRNTDVQGALCQLLVGKRSLT
:::::::::::::::::::::
CCDS11 LRNTDVQGALCQLLVGKRSLT
310 320
>>CCDS42233.1 OR3A2 gene_id:4995|Hs108|chr17 (321 aa)
initn: 1870 init1: 1870 opt: 1870 Z-score: 1398.8 bits: 267.1 E(32554): 1.4e-71
Smith-Waterman score: 1870; 90.0% identity (96.6% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTIGGNLSILAAVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS42 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTTGGNLSILAAVLV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS42 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASLACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFVAAAFMAVAPLVFISVSYAHVVAAVLQIRSA
:::::::::::::::::::::::::::::... .:: .:::.: ..:.::.::::.:::.
CCDS42 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPLVLIITAYSHVAAAVLRIRSV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EGRKKAFSTCGSHLTVVGIFYGTGVFSYMRLGSVESSDKDKGVGVFMTVINPMLNPLIYS
::::::::::::::::: .:.: :.:.:::::: :.:::::::::: :::::::::::::
CCDS42 EGRKKAFSTCGSHLTVVCLFFGRGIFNYMRLGSEEASDKDKGVGVFNTVINPMLNPLIYS
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LRNTDVQGALCQLLVGKRSLT
::: :::::: :...:.::::
CCDS42 LRNPDVQGALWQIFLGRRSLT
310 320
>>CCDS11023.1 OR3A1 gene_id:4994|Hs108|chr17 (315 aa)
initn: 1646 init1: 1646 opt: 1646 Z-score: 1234.7 bits: 236.7 E(32554): 1.9e-62
Smith-Waterman score: 1646; 77.7% identity (94.6% similar) in 314 aa overlap (7-320:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTIGGNLSILAAVLV
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CCDS11 MQPESGANGTVIAEFILLGLLEAPGLQPVVFVLFLFAYLVTVRGNLSILAAVLV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
:::::.:::::::::::::::::.::::.::.::::.: .. :::.:::::::..:.:
CCDS11 EPKLHTPMYFFLGNLSVLDVGCISVTVPSMLSRLLSRKRAVPCGACLTQLFFFHLFVGVD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
:::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CFLLTAMAYDRFLAICRPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFVAAAFMAVAPLVFISVSYAHVVAAVLQIRSA
: .::::::::::::::::::::::::::... .:: .:...: .:: ::.::::.:::.
CCDS11 NVINHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFAVGFIMAGTPMALIVISYIHVAAAVLRIRSV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EGRKKAFSTCGSHLTVVGIFYGTGVFSYMRLGSVESSDKDKGVGVFMTVINPMLNPLIYS
:::::::::::::::::.::::.:.:.::::::.. :::::.::.: :::::::::.:::
CCDS11 EGRKKAFSTCGSHLTVVAIFYGSGIFNYMRLGSTKLSDKDKAVGIFNTVINPMLNPIIYS
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 LRNTDVQGALCQLLVGKRSLT
.:: :::.:. ..:.:.:::
CCDS11 FRNPDVQSAIWRMLTGRRSLA
300 310
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 1023 init1: 972 opt: 980 Z-score: 746.5 bits: 146.4 E(32554): 2.9e-35
Smith-Waterman score: 980; 46.1% identity (83.2% similar) in 297 aa overlap (14-310:5-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTIGGNLSILAAVLV
:.::..:::.::. . .:.: ..:......:. :.:::. :. ....
CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
.:.::.:::.:::::. .:. : .:: :. .:::.:..::: .:. ::: : ...: .
CCDS46 DPHLHTPMYYFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
:.::.:::::: .:::.:: ::. .:... .:.:. :: .: :...::: : :::
CCDS46 CLLLAAMAYDRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFVAAAFMAVAPLVFISVSYAHVVAAVLQIRSA
:..:.:.::.: :. :::..:..::: :. ...:.. .:.. : .:: .....:.:.:.
CCDS46 NQINYFFCDIPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTILRIQSS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EGRKKAFSTCGSHLTVVGIFYGTGVFSYMRLGSVESSDKDKGVGVFMTVINPMLNPLIYS
:::.::::::.:::..: .:::...:.:.: :. : ::. :.:...:..:::::.::.
CCDS46 EGRRKAFSTCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYT
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 LRNTDVQGALCQLLVGKRSLT
::: :.. :.
CCDS46 LRNKDIKEAVKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
300 310 320
>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 (308 aa)
initn: 952 init1: 952 opt: 952 Z-score: 726.1 bits: 142.5 E(32554): 4e-34
Smith-Waterman score: 952; 49.0% identity (77.3% similar) in 304 aa overlap (14-317:5-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTIGGNLSILAAVLV
: . .:.:.: ::.: :.: .:.:.: :.::. :::... . :
CCDS31 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
: ::.:::.::..:: .: .: .: :: .:..:.:: :. :. ::::: ... .
CCDS31 SPLLHTPMYYFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKNTILYSECMVQLFFFVVFVVAE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 CFLLTAMAYDRLLAICQPLTYSTRMSQTVQRMLVAASWACAFTNALTHTVAMSTLNFCGP
.::::::::: .:::.:: :.. ::. : .:: :.. .: .::::: :: :.::
CCDS31 GYLLTAMAYDRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NEVNHFYCDLPQLFQLSCSSTQLNELLLFVAAAFMAVAPLVFISVSYAHVVAAVLQIRSA
. .::..::. :..::::.:.:::::::. :.: ...: . ..:::: .. ..:.:::.
CCDS31 HIINHYFCDVLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILHIRSS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 EGRKKAFSTCGSHLTVVGIFYGTGVFSYMRLGSVESSDKDKGVGVFMTVINPMLNPLIYS
:::.:::.::.::: .: ::.:. .: :.. : .: :..: .::.:.. :::::::::
CCDS31 EGRSKAFGTCSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYS
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 LRNTDVQGALCQLLVGKRSLT
::: ::. :: ..::::
CCDS31 LRNKDVKKALRKVLVGK
300
>>CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 (314 aa)
initn: 957 init1: 938 opt: 938 Z-score: 715.8 bits: 140.6 E(32554): 1.5e-33
Smith-Waterman score: 938; 46.3% identity (77.7% similar) in 309 aa overlap (12-320:3-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSLQKLMEPEAGTNRTAVAEFILLGLVQTEEMQPVVFVLLLFAYLVTIGGNLSILAAVLV
::: .. ..:::::. . ... ..::..:.:::.:. :: .:. . .
CCDS31 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EPKLHAPMYFFLGNLSVLDVGCITVTVPAMLGRLLSHKSTISYDACLSQLFFFHLLAGMD
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CCDS31 DPHLHTPMYFFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVE
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CCDS10 SLRNRYLKGALKKV-VGRVVFSV
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CCDS32 TFLLAVMAYDRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTG
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CCDS32 TEIPHFFCEPAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSST
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CCDS32 LRNKDVKGALERLLSRADSCP
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CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]