FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6066, 320 aa
1>>>pF1KE6066 320 - 320 aa - 320 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0444+/-0.00145; mu= 11.4913+/- 0.084
mean_var=181.5741+/-66.432, 0's: 0 Z-trim(99.9): 405 B-trim: 364 in 1/45
Lambda= 0.095180
statistics sampled from 5401 (5896) to 5401 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.498), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16
Scan time: 1.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 2049 294.9 5.5e-80
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 1457 213.6 1.6e-55
CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 ( 329) 1256 186.1 3.3e-47
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 1114 166.6 2.5e-41
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 1092 163.5 2e-40
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 1079 161.7 6.8e-40
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CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 1021 153.8 1.7e-37
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 1007 151.9 6.5e-37
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CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 979 148.0 9.2e-36
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 953 144.4 1.1e-34
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 951 144.2 1.3e-34
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 950 144.0 1.4e-34
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 950 144.0 1.4e-34
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 944 143.2 2.6e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 943 143.1 2.9e-34
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 937 142.2 5e-34
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 932 141.5 8e-34
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 930 141.3 9.9e-34
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 928 141.0 1.2e-33
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 923 140.3 1.9e-33
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 923 140.3 1.9e-33
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 916 139.3 3.7e-33
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 910 138.5 6.6e-33
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CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 907 138.1 8.7e-33
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 901 137.3 1.5e-32
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 900 137.1 1.7e-32
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 900 137.1 1.7e-32
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 892 136.1 3.7e-32
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 891 135.9 4e-32
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 891 135.9 4e-32
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 887 135.4 6e-32
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 885 135.1 7.5e-32
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 882 134.7 9.3e-32
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 880 134.5 1.2e-31
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 879 134.3 1.2e-31
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 879 134.3 1.2e-31
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 879 134.3 1.3e-31
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 878 134.1 1.4e-31
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 878 134.1 1.4e-31
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 877 134.0 1.5e-31
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 876 133.8 1.7e-31
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 876 133.9 1.8e-31
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 875 133.7 1.8e-31
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 874 133.6 2e-31
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 873 133.4 2.2e-31
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 871 133.2 2.7e-31
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 871 133.2 2.7e-31
>>CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 2049 init1: 2049 opt: 2049 Z-score: 1549.5 bits: 294.9 E(32554): 5.5e-80
Smith-Waterman score: 2049; 99.4% identity (100.0% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTII
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RIDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPMSLAGCATQMFFFVTFGI
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS11 RMDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPISLAGCATQMFFFVTFGI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIGLIVAITQVTSVFRLPFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIGLIVAITQVTSVFRLPFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ARKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKIAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ARKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKIAS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITPLLNPVVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITPLLNPVVY
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 TLRNKEVKDALCRAVGGKFS
::::::::::::::::::::
CCDS11 TLRNKEVKDALCRAVGGKFS
310 320
>>CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1477 init1: 1457 opt: 1457 Z-score: 1110.3 bits: 213.6 E(32554): 1.6e-55
Smith-Waterman score: 1457; 71.8% identity (89.3% similar) in 309 aa overlap (12-320:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTII
:::.::: ...:.: ::::: ..::::: :::..:::::..::::::::
CCDS30 MKRKNFTEVSEFIFLGFSSFGKHQITLFVVFLTVYILTLVANIIIVTII
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RIDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPMSLAGCATQMFFFVTFGI
:: :::::::::::::..:::::::::.:::: ::. .::.::::::::::::: ..
CCDS30 CIDHHLHTPMYFFLSMLASSETVYTLVIVPRMLLSLIFHNQPISLAGCATQMFFFVILAT
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIGLIVAITQVTSVFRLPFC
.::::::::::::::::: :::: :::.: : ::: :. .::: .:. .::..: ::::
CCDS30 NNCFLLTAMGYDRYVAICRPLRYTVIMSKGLCAQLVCGSFGIGLTMAVLHVTAMFNLPFC
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ARKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKIAS
. : :::::: :::::::::::.:::.. .: .:. ::.::.::::::.::.::.:::
CCDS30 GTVVDHFFCDIYPVMKLSCIDTTINEIINYGVSSFVIFVPIGLIFISYVLVISSILQIAS
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 VEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITPLLNPVVY
.:::::.::::.::::::::: .::::::::::::.. :.: ..:::::.::::::::::
CCDS30 AEGRKKTFATCVSHLTVVIVHCGCASIAYLKPKSESSIEKDLVLSVTYTIITPLLNPVVY
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KE6 TLRNKEVKDALCRAVGGKFS
.::::::::::::.:: ..:
CCDS30 SLRNKEVKDALCRVVGRNIS
290 300
>>CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 (329 aa)
initn: 1179 init1: 664 opt: 1256 Z-score: 960.9 bits: 186.1 E(32554): 3.3e-47
Smith-Waterman score: 1256; 67.6% identity (88.7% similar) in 284 aa overlap (12-293:1-284)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQ-QITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTI
: . : :..:.:.:.:::::..: ....: :::.::.:::.::.::.::
CCDS30 MPKLNSTFVTEFLFEGFSSFRRQHKLVFFVVFLTLYLLTLSGNVIIMTI
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 IRIDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPMSLAGCATQMFFFVTFG
::.: :::::::::: ::: ::: ::..:.:.:::.:.. ::.. .::::.::..:::
CCDS30 IRLDHHLHTPMYFFLCMLSISETCYTVAIIPHMLSGLLNPHQPIATQSCATQLFFYLTFG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 ITNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIGLIVAITQVTSVFRLPF
:.::::::.::::::::::::::: :::.:: :::. :. .::: .::.:::::: :::
CCDS30 INNCFLLTVMGYDRYVAICNPLRYSVIMGKRACIQLASGSLGIGLGMAIVQVTSVFGLPF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 C-ARKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKI
: : . :::::.: ..::.: :::::::.....:: :::.:::::::::::::::::::
CCDS30 CDAFVISHFFCDVRHLLKLACTDTTVNEIINFVVSVCVLVLPMGLVFISYVLIISTILKI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ASVEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITPLLNPV
::.::.:::::::::::::::.::.:::: ::::::... .:.::::::: .:
CCDS30 ASAEGQKKAFATCASHLTVVIIHYGCASIIYLKPKSQSSLGQDRLISVTYTHHSPTEPCC
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 VYTLRNKEVKDALCRAVGGKFS
CCDS30 VQPEEQGGQRCSAQSRGAKNSVSLMKRGCEGFSFAFINMY
290 300 310 320
>>CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 1097 init1: 584 opt: 1114 Z-score: 855.4 bits: 166.6 E(32554): 2.5e-41
Smith-Waterman score: 1114; 52.8% identity (82.5% similar) in 320 aa overlap (3-320:12-330)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLA
. . : .. ::.:..:.:.. ::::. : :..:: ::: ::.. :.
CCDS30 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 GNIIIVTIIRIDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPMSLAGCATQ
::. :...:..: :::::::::..:::::: ::.::::.:: .:..... .:. :: :
CCDS30 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MFFFVTFGITNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIG-LIVAITQ
::::. :.::::.:: .::::::.:::.::.: ..:. .. .:. .::.:: .....:
CCDS30 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLA-AACAIGGFLASLTV
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE6 VTSVFRLPFC-ARKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYV
:. :: :::: : :: :.:::: :. :.: .: :::.. .: .:::::::. .. .::.
CCDS30 VNLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNEFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 LIISTILKIASVEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYT
:. ::::: :.:::.:::.::::::.::::::.:::. ::.: .. . ..:.:..::::
CCDS30 CILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYT
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE6 VITPLLNPVVYTLRNKEVKDALCRAVGGKFS
..::::::.::.::::.:. :. ...: : :
CCDS30 IVTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
300 310 320 330
>>CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 1074 init1: 579 opt: 1092 Z-score: 839.4 bits: 163.5 E(32554): 2e-40
Smith-Waterman score: 1092; 53.7% identity (79.6% similar) in 309 aa overlap (12-319:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTII
: . : : :::: :::: : :. ::..::.::..::..:..:. :
CCDS30 MGQTNVTSWRDFVFLGFSSSGELQLLLFALFLSLYLVTLTSNVFIIIAI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RIDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPMSLAGCATQMFFFVTFGI
:.: :::::::.:::.:: ::: ::: :.:::::.:.: .: .: .:::.:::: ....
CCDS30 RLDSHLHTPMYLFLSFLSFSETCYTLGIIPRMLSGLAGGDQAISYVGCAAQMFFSASWAC
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIGLIVAITQVTSVFRLPFC
::::::.:::.::::::: ::.: :: : :::. . : . .. .. .:.: ::
CCDS30 TNCFLLAAMGFDRYVAICAPLHYASHMNPTLCAQLVITSFLTGYLFGLGMTLVIFHLSFC
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE6 A-RKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKIA
. ... ::::: ::..:.: :: .:. .:.:.:::.: . .. :::. :...::.:
CCDS30 SSHEIQHFFCDTPPVLSLACGDTGPSELRIFILSLLVLLVSFFFITISYAYILAAILRIP
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SVEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITPLLNPVV
:.::.::::.::::::::::.::.:::..::.::. . :.::::..::::.::::::.:
CCDS30 SAEGQKKAFSTCASHLTVVIIHYGCASFVYLRPKASYSLERDQLIAMTYTVVTPLLNPIV
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE6 YTLRNKEVKDALCRAVGGKFS
:.:::. .. :: : :..
CCDS30 YSLRNRAIQTALRNAFRGRLLGKG
290 300 310
>>CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 (314 aa)
initn: 1001 init1: 803 opt: 1079 Z-score: 829.7 bits: 161.7 E(32554): 6.8e-40
Smith-Waterman score: 1079; 53.3% identity (83.3% similar) in 300 aa overlap (18-316:8-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTII
:..:.:.. ::::. : :. :: .:: ::. :..:. :...:
CCDS30 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANVTIMAVI
10 20 30 40 50
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CCDS30 YSLRNKEFKSALRRTIGQTFYPLS
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CCDS30 VLDRALHIPMYFFLAILSCSEICYTFIIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFLGC
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CCDS30 SHSFLLAVMGYDRYIAICNPLRYSVLMGHGVCMGLVAAACACGFTVAQIITSLVFHLPFY
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CCDS30 SSNQLHHFFCDIAPVLKLASHHNHFSQIVIFMLCTLVLAIPLLLILVSYVHILSAILQFP
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CCDS30 STLGRCKAFSTCVSHLIIVTVHYGCASFIYLRPQSNYSSSQDALISVSYTIITPLFNPMI
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CCDS30 YSLRNKEFKSALCKIVRRTISLL
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CCDS31 CTHSTLRTPMYFFLSNLSFLELCYTTVVVPLMLSNILGAQKPISLAGCGAQMFFFVTLGS
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CCDS31 TDCFLLAIMAYDRYVAICHPLHYTLIMTRELCTQMLGGALGLALFPSLQLTALIFTLPFC
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CCDS31 GHHQEINHFLCDVPPVLRLACADIRVHQAVLYVVSILVLTIPFLLICVSYVFITCAILSI
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CCDS31 MICENHTRVTEFILLGFTNNPEMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVT
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CCDS31 SVDLALQTPMYFFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFFFFFGS
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