FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6065, 320 aa
1>>>pF1KE6065 320 - 320 aa - 320 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6764+/-0.00136; mu= 13.8522+/- 0.079
mean_var=202.5423+/-70.910, 0's: 0 Z-trim(101.6): 411 B-trim: 406 in 1/46
Lambda= 0.090119
statistics sampled from 6094 (6591) to 6094 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.541), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 1.970
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 1259 177.4 1.3e-44
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 1247 175.9 3.9e-44
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1235 174.3 1.1e-43
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 1193 168.8 4.9e-42
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 1186 167.9 9.3e-42
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 1174 166.4 2.8e-41
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 1171 166.0 3.6e-41
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CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 1152 163.5 2e-40
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 1138 161.7 7e-40
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1131 160.8 1.3e-39
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 1126 160.1 2.1e-39
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1122 159.7 3.2e-39
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 1106 157.5 1.3e-38
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 1007 144.7 9.7e-35
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 981 141.2 9.8e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 965 139.2 4.2e-33
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 955 137.9 1e-32
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 954 137.7 1.1e-32
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 954 137.8 1.2e-32
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 950 137.2 1.6e-32
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 946 136.7 2.3e-32
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CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 940 135.9 4e-32
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CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 922 133.6 2e-31
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CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 920 133.4 2.5e-31
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CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 909 131.9 6.5e-31
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 907 131.6 7.7e-31
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 906 131.5 8.4e-31
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 904 131.2 9.9e-31
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 904 131.3 1e-30
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 903 131.1 1.1e-30
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 900 130.7 1.4e-30
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 898 130.5 1.7e-30
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 898 130.5 1.7e-30
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 898 130.5 1.8e-30
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 896 130.2 2.1e-30
CCDS35396.1 OR13H1 gene_id:347468|Hs108|chrX ( 308) 895 130.1 2.3e-30
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 894 129.9 2.5e-30
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 893 129.8 2.7e-30
CCDS35011.1 OR13J1 gene_id:392309|Hs108|chr9 ( 312) 892 129.7 3e-30
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 892 129.7 3e-30
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 891 129.6 3.3e-30
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 890 129.5 3.7e-30
>>CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 (320 aa)
initn: 2094 init1: 2094 opt: 2094 Z-score: 1501.1 bits: 286.0 E(32554): 2.7e-77
Smith-Waterman score: 2094; 99.7% identity (100.0% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS46 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKDMKDA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
::::::::::::::::::::
CCDS46 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
310 320
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1293 init1: 1253 opt: 1262 Z-score: 916.6 bits: 177.8 E(32554): 9.8e-45
Smith-Waterman score: 1262; 59.7% identity (83.3% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY
: .: ::: :::::::.::..: .: : .:::.::::: .::. : :: ::::::
CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY
::: :::.::.:::::. :: :::: : :::.: ::. :::. . :::.::.::: :.
CCDS31 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE
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CCDS31 DRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFICE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
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CCDS31 VPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA
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CCDS31 CSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKDMKEA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
:.::.
CCDS31 LRKLLSGKL
>>CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 (314 aa)
initn: 1259 init1: 1259 opt: 1259 Z-score: 914.4 bits: 177.4 E(32554): 1.3e-44
Smith-Waterman score: 1259; 60.3% identity (85.9% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY
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CCDS31 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY
::: .:::::: :::: :::.: :: : ::::::.:: :::.... ::.:::::::::.:
CCDS31 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
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pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE
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CCDS31 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
.:::...:::.:...: .::.:.. .::.::..::.::.::..:::. .: ....::..:
CCDS31 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
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pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA
:::::::::.:::.:::::.::: .:.::: :: :::...:: ::::::::::...: :
CCDS31 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
: .:.
CCDS31 LGRLLLGKRELGKE
310
>>CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 (320 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPM
:. .: :: . :.:::::..:..: .: :: ::.....:: :::.: : .:::::
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:::: :: :::. :::::.::.:.:::::.::::: ::..:.:. :::..::.:::.::
CCDS16 YFFLANLPFLDMSFTTSIVPQLLANLWGPQKTISYGGCVVQFYISHWLGATECVLLATMS
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pF1KE6 YDRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLC
:::..:::.:::: :.:.:.::: . . : .:..:.: :::. :: :::: .:::.:
CCDS16 YDRYAAICRPLHYTVIMHPQLCLGLALASWLGGLTTSMVGSTLTMLLPLCGNNCIDHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 ELPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMN
:.: ....:::::. :: .. ....:. :: :::.:::.::.:::. .: ..:::.:
CCDS16 EMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKD
::.::..:::.:::.::.:::::.. .:..::::..:::::.::.:::::::::: ..:.
CCDS16 TCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEVKS
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 ALKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
::....
CCDS16 ALRHMVLENCCGSAGKLAQI
310 320
>>CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 (316 aa)
initn: 1241 init1: 1217 opt: 1235 Z-score: 897.5 bits: 174.3 E(32554): 1.1e-43
Smith-Waterman score: 1235; 55.7% identity (85.9% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY
:...: :: .::.:::::..:..: .: ... ::...:.::::.::. :::.::::::
CCDS31 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY
::: ::: .:.:::::. ::.::.. :::.:: ::. :::: : ::: ::.:::::.:
CCDS31 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE
::..:.:.::.:...:.:..: .. : .: .:.. :.::..:: ::. :::..::
CCDS31 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
.:.:.:.:::::: : .:. .......:..:::.:::.:..:::: :: :...::..:
CCDS31 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA
:.:::.:: .::::::.:::::.:: ::.::::..::::..:: :::.:::::::..: :
CCDS31 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
:. :.
CCDS31 LRTLILGSAAGQSHKD
310
>>CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 (311 aa)
initn: 1193 init1: 1193 opt: 1193 Z-score: 868.1 bits: 168.8 E(32554): 4.9e-42
Smith-Waterman score: 1193; 56.8% identity (82.7% similar) in 301 aa overlap (5-305:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHT
: :: :::.:::: :..:... :: ::::.::.:: ::. : :::.:::
CCDS43 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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CCDS43 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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120 130 140 150 160 170
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CCDS43 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LCELPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKA
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CCDS43 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 MNTCGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNM
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CCDS43 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
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300 310 320
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CCDS43 RGAVKRLMGWE
310
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10 20 30 40 50
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CCDS43 YFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLRGPEKTISYAGCMVQLYFVLALGITECVLLVVMS
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CCDS43 YDRYVAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLVAASWVIGFTISALHSSFTFWVPLCGHRLVDHFFC
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CCDS43 EVPALLRLSCVDTHANELTLMVMSSIFVLIPLILILTTYGAIARAVLSMQSTTGLQKVFR
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CCDS43 TCGAHLMVVSLFFIPVMCMYLQPPSENSPDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKHVKG
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 ALKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
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CCDS43 AAKRLLGWEWGK
310
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10 20 30 40 50
pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHT
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CCDS31 MGMVRHTNESNLAGFILLGFSDYPQLQKVLFVLILILYLLTILGNTTIILVSRLEPKLHM
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CCDS31 PMYFFLSHLSFLYRCFTSSVIPQLLVNLWEPMKTIAYGGCLVHLYNSHALGSTECVLPAV
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CCDS31 MSCDRYVAVCRPLHYTVLMHIHLCMALASMAWLSGIATTLVQSTLTLQLPFCGHRQVDHF
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CCDS31 ICEVPVLIKLACVGTTFNEAELFVASILFLIVPVSFILVSSGYIAHAVLRIKSATRRQKA
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pF1KE6 MNTCGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNM
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CCDS31 FGTCFSHLTVVTIFYGTIIFMYLQPAKSRSRDQGKFVSLFYTVVTRMLNPLIYTLRIKEV
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pF1KE6 KDALKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
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CCDS31 KGALKKVLAKALGVNIL
310
>>CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 (313 aa)
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CCDS34 MNWENESSPKEFILLGFSDRAWLQMPLFVVLLISYTITIFGNVSIMMVCILDPKLHTPMY
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CCDS34 FFLTNLSILDLCYTTTTVPHMLVNIGCNKKTISYAGCVAHLIIFLALGATECLLLAVMSF
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CCDS34 DRYVAVCRPLHYVVIMNYWFCLRMAAFSWLIGFGNSVLQSSLTLNMPRCGHQEVDHFFCE
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CCDS34 VPALLKLSCADTKPIEAELFFFSVLILLIPVTLILISYGFIAQAVLKIRSAEGRQKAFGT
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CCDS34 CGSHMIVVSLFYGTAIYMYLQPPSSTSKDWGKMVSLFYGIITSMLNSLIYSLRNKDMKEA
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CCDS34 FKRLMPRIFFCKK
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CCDS46 MVNQSSPMGFLLLGFSEHPALERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSVLYPRLHSPMY
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CCDS46 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVMSLVQSIVQTPSTLHLPFCPHQQIDDFLCE
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pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
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CCDS46 VPSLIRLSCGDTSYNEIQLAVSSVIFVVVPLSLILASYGATAQAVLRINSATAWRKAFGT
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