Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6062
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6062, 320 aa
1>>>pF1KE6062 320 - 320 aa - 320 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0147+/-0.00116; mu= 11.4547+/- 0.068
mean_var=158.2722+/-56.466, 0's: 0 Z-trim(102.6): 385 B-trim: 887 in 2/47
Lambda= 0.101946
statistics sampled from 6526 (7035) to 6526 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 2.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 2132 326.5 1.8e-89
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1374 215.0 6.4e-56
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1271 199.8 2.3e-51
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1248 196.5 2.4e-50
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1233 194.2 1.1e-49
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 1187 187.5 1.3e-47
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1177 186.0 3.4e-47
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 1173 185.4 5e-47
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1143 181.0 1.1e-45
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1110 176.2 3.1e-44
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 1093 173.7 1.8e-43
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1091 173.4 2.1e-43
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1073 170.7 1.3e-42
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1063 169.2 3.8e-42
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1054 167.9 9.4e-42
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1042 166.1 3.2e-41
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1037 165.4 5.4e-41
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 1004 160.6 1.5e-39
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 992 158.8 5.2e-39
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 983 157.5 1.3e-38
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 982 157.3 1.4e-38
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 953 153.1 2.8e-37
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 949 152.5 4.4e-37
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 940 151.2 1.1e-36
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 933 150.1 2.1e-36
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 927 149.2 3.9e-36
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 922 148.5 6.6e-36
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 919 148.1 9.4e-36
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 916 147.6 1.2e-35
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 911 146.9 2e-35
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 909 146.6 2.4e-35
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 900 145.3 6.1e-35
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 894 144.4 1.2e-34
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 886 143.2 2.6e-34
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 876 141.7 7.1e-34
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 865 140.1 2.2e-33
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 856 138.8 5.5e-33
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 845 137.2 1.7e-32
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 838 136.2 3.7e-32
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 776 127.0 1.9e-29
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 752 123.5 2.2e-28
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 740 121.8 8.2e-28
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 739 121.6 8.3e-28
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 735 121.0 1.2e-27
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 721 118.9 5.3e-27
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 697 115.4 6.1e-26
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 694 115.0 8.2e-26
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 680 112.9 3.4e-25
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 653 108.9 5.3e-24
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 636 106.4 3e-23
>>CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 2132 init1: 2132 opt: 2132 Z-score: 1719.9 bits: 326.5 E(32554): 1.8e-89
Smith-Waterman score: 2132; 98.8% identity (99.4% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSASAMIIFNLSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVVGNCILLYLIVVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MPSASAMIIFNLSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVVGNCILLYLIVVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKTLSIFWLGAREITFPGCLTQMFFLHYNFVLDS
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKALSIFWLGAREITFPGCLTQMFFLHYNFVLDS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AILMAMAFDRYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDVFLLTCLPFCRTR
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AILMAMAFDHYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDVFLLTCLPFCRTR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFCLPSQD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS31 IIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFGLPSQD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ARQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFGHNVSRTFHIMFANLYIVIPPALNPMVY
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ACQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFGHNVSRTFHIMFANLYIVIPPALNPMVY
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 GVKTKQIRDKVILLFSKGTG
::::::::::::::::::::
CCDS31 GVKTKQIRDKVILLFSKGTG
310 320
>>CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 (323 aa)
initn: 1368 init1: 1340 opt: 1374 Z-score: 1117.4 bits: 215.0 E(32554): 6.4e-56
Smith-Waterman score: 1374; 63.3% identity (87.2% similar) in 305 aa overlap (11-315:5-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSASAMIIFNLSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVVGNCILLYLIVVE
:.. ..:. :.: :::::: .:.:..::.:.:::.::.:: ::. .::.:
CCDS53 MSHTNVTIFHPAVFVLPGIPGLEAYHIWLSIPLCLIYITAVLGNSILIVVIVME
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKTLSIFWLGAREITFPGCLTQMFFLHYNFVLDS
..:: ::.:::::::. :..:::. :::.:.:::: :..:.: .:.:: ::.:. :: .:
CCDS53 RNLHVPMYFFLSMLAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNIAFDACVTQGFFVHMMFVGES
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AILMAMAFDRYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDVFLLTCLPFCRTR
:::.::::::.::::.::::::.:: .. . :... ::::::.: .::: :::: :
CCDS53 AILLAMAFDRFVAICAPLRYTTVLTWPVVGRIALAVITRSFCIIFPVIFLLKRLPFCLTN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFCLPSQD
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CCDS53 IVPHSYCEHIGVARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVILIAVSYSLILRAVFRLPSQD
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ARQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFGHNVSRTFHIMFANLYIVIPPALNPMVY
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CCDS53 ARHKALSTCGSHLCVILMFYVPSFFTLLTHHFGRNIPQHVHILLANLYVAVPPMLNPIVY
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 GVKTKQIRDKVILLFSKGTG
::::::::. : :
CCDS53 GVKTKQIREGVAHRFFDIKTWCCTSPLGS
300 310 320
>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 1252 init1: 766 opt: 1271 Z-score: 1035.6 bits: 199.8 E(32554): 2.3e-51
Smith-Waterman score: 1271; 57.8% identity (83.8% similar) in 315 aa overlap (4-317:2-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSASAMIIFNLSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVVGNCILLYLIVVE
:. : : ....:. :.:.::::::. :.:::.:: ..:.::..:: ::..: .:
CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKTLSIFWLGAREITFPGCLTQMFFLHYNFVLDS
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CCDS31 QSLHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMES
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE6 AILMAMAFDRYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGIS-FRSFCIILPDVFLLTCLPFCRT
.:.:::::::.:::.::::: ::: : ::. ::. .::. ...: :::: ::::
CCDS31 IVLVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSK-IISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RIIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFCLPSQ
::::::::::.:.:.::::.:..:. .:. : .. ::::: .::..:: :::::::
CCDS31 RIIPHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLG-NISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DARQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFGHNVSRTFHIMFANLYIVIPPALNPMV
.:: :::.:::::. ::: :.::::::.:.::::::. . .::..::::.:.::::::..
CCDS31 EARLKALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVI
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 YGVKTKQIRDKVILLFSKGTG
:::.:::::..:. .: :
CCDS31 YGVRTKQIRERVLRIFLKTNH
300 310
>>CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 (325 aa)
initn: 1231 init1: 758 opt: 1248 Z-score: 1017.2 bits: 196.5 E(32554): 2.4e-50
Smith-Waterman score: 1248; 55.2% identity (84.4% similar) in 315 aa overlap (7-318:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSASAMIIFNLSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVVGNCILLYLIVVE
:.. : ....:. :.:.:::::: .:.:::.::: .:..:..:: .: .: ..
CCDS31 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTD
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE6 HSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKTLSIFWLGAREITFPGCLTQMFFLHYNFVL-D
:::.:::.::.::: ::. :::: .:: :.:::.. : : : .:::::::.: ::.: .
CCDS31 SSLHQPMFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIH-NFTLME
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SAILMAMAFDRYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDVFLLTCLPFCRT
::.:.:::.: :::::.::.:..::: :.. ..:. :.. ...:...:. :::: .
CCDS31 SAVLVAMAYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILRLPFCGN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RIIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFCLPSQ
..::::::::.:.:.:.::.:.::. ::.:. : ... :. .::.::.::::::: ::..
CCDS31 HVIPHTYCEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCA-ICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DARQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFGHNVSRTFHIMFANLYIVIPPALNPMV
.:: :.:.:::::::::: :::::.::...::::.:: : .::..::::.:.:: :::..
CCDS31 EARLKSLSTCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVI
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 YGVKTKQIRD--KVILLFSKGTG
:::.:::: : ::: .:
CCDS31 YGVRTKQIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
300 310 320
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1215 init1: 744 opt: 1233 Z-score: 1005.5 bits: 194.2 E(32554): 1.1e-49
Smith-Waterman score: 1233; 56.6% identity (81.9% similar) in 309 aa overlap (7-315:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSASAMIIFNLSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVVGNCILLYLIVVE
: .: . . : :.:.:::::. .:.::..::::.:..:.::: .:..: .:
CCDS31 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKTLSIFWLGAREITFPGCLTQMFFLHYNFVLDS
::::.:::.::.::.: :: :::. .:: :.:::.. .::.: ::: ::::.:. ...
CCDS31 HSLHQPMFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMET
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AILMAMAFDRYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDVFLLTCLPFCRTR
..:..::.::.::::.::.:: ::: ::: : . :.. .. : :::. ::::
CCDS31 VLLVVMAYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILRLPFCGHN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFCLPSQD
:.::::::: :.: :::: :.::. ::. : : .: :::::: ::. :: ::: :::::
CCDS31 IVPHTYCEHRGLAGLACAPIKINIIYGLMV-ISYIIVDVILIASSYVLILRAVFRLPSQD
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 ARQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFGHNVSRTFHIMFANLYIVIPPALNPMVY
.: ::..::::::::.: ::::::::...::::.:. . .::..::::.:.::::::..:
CCDS31 VRLKAFNTCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIY
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 GVKTKQIRDKVILLFSKGTG
::.:::::.... .:
CCDS31 GVRTKQIREQIVKIFVQKE
300 310
>>CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 (335 aa)
initn: 654 init1: 654 opt: 1187 Z-score: 968.6 bits: 187.5 E(32554): 1.3e-47
Smith-Waterman score: 1187; 55.6% identity (81.6% similar) in 315 aa overlap (3-316:15-328)
10 20 30 40
pF1KE6 MPSASAMIIFNLSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVV
::... .: :. . .:.:::::::.:.:..:::::.::.:.
CCDS41 MAQVRALHKIMALFSANSIGAMNNSDTRIAGCFLTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITALE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 GNCILLYLIVVEHSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKTLSIFWLGAREITFPGCLTQ
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CCDS41 GNGILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQ
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 MFFLHYNFVLDSAILMAMAFDRYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDV
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CCDS41 MFFIHFLFI-HSAVLLAMAFDRYVAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPSI
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 FLLTCLPFCRTRIIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAH
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CCDS41 FLLEHLHYCQINIIAHTFCEHMGIAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYIH
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 ILCAVFCLPSQDARQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFG-HNVSRTFHIMFANL
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CCDS41 ILQAVFRLLSQDARSKALSTCGSHICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSVPCYVHILLASL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE6 YIVIPPALNPMVYGVKTKQIRDKVILLFSKGTG
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CCDS41 YVVIPPMLNPVIYGVRTKPILEGAKQMFSNLAKGSK
300 310 320 330
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Smith-Waterman score: 1177; 54.8% identity (81.9% similar) in 310 aa overlap (11-318:5-314)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MPSASAMIIFNLSSYN-PGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVVGNCILLYLIVV
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CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAALILVIAM
10 20 30 40 50
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pF1KE6 EHSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKTLSIFWLGAREITFPGCLTQMFFLHYNFVLD
...:: ::..:: .:..::: ::.. ::: :.:.:: : ::.: :::.::: .: ..:.
CCDS31 DNALHAPMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCVHSIYALE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SAILMAMAFDRYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDVFLLTCLPFCRT
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CCDS31 SSILLAMAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPFIFLLRRLPYCGH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RIIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFCLPSQ
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CCDS31 RVMTHTYCEHMGIARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYGFILHAVFHLPSH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DARQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFGHN-VSRTFHIMFANLYIVIPPALNPM
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CCDS31 DAQHKALSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPI
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 VYGVKTKQIRDKVILLFSKGTG
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CCDS31 LYGARTKEIRSRLLKLLHLGKTSI
300 310
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Smith-Waterman score: 1173; 54.5% identity (81.1% similar) in 312 aa overlap (7-317:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSASAMIIFNLSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVVGNCILLYLIVVE
: : : .... . :.:.::::::. :.:::.:: .:..:..:: ....: .:
CCDS53 MPIANDTQFHTSSFLLLGIPGLEDVHIWIGFPFFSVYLIALLGNAAIFFVIQTE
10 20 30 40 50
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pF1KE6 HSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKTLSIFWLGAREITFPGCLTQMFFLHYNFVLDS
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CCDS53 QSLHEPMYYCLAMLDSIDLSLSTATIPKMLGIFWFNIKEISFGGYLSQMFFIHFFTVMES
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 AILMAMAFDRYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGIS-FRSFCIILPDVFLLTCLPFCRT
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CCDS53 IVLVAMAFDRYIAICKPLWYTMILTSK-IISLIAGIAVLRSLYMVIPLVFLLLRLPFCGH
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 RIIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFCLPSQ
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CCDS53 RIIPHTYCEHMGIARLACASIKVNIMFGLG-SISLLLLDVLLIILSHIRILYAVFCLPSW
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 DARQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFGHNVSRTFHIMFANLYIVIPPALNPMV
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CCDS53 EARLKALNTCGSHIGVILAFSTPAFFSFFTHCFGHDIPQYIHIFLANLYVVVPPTLNPVI
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 YGVKTKQIRDKVILLFSKGTG
:::.::.::. :. .: :
CCDS53 YGVRTKHIRETVLRIFFKTDH
300 310
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CCDS31 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVE
10 20 30 40 50
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pF1KE6 HSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKTLSIFWLGAREITFPGCLTQMFFLHYNFVLDS
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CCDS31 QTLREPMFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEA
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pF1KE6 AILMAMAFDRYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDVFLLTCLPFCRTR
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CCDS31 EVLLAMAFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAH
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CCDS31 IIAHSYCEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFV-VSFFVLNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHD
180 190 200 210 220 230
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CCDS31 AQLKALSTCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIY
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::.:::::..:. .:.:
CCDS31 GVRTKQIRERVLYVFTKK
300 310
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CCDS44 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYE
10 20 30 40 50
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CCDS44 GVLMLMALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKLLPYCRGN
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pF1KE6 IIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFCLPSQD
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CCDS44 ILPHTYCDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVVSLSSAD
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CCDS44 ARQKAFNTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPIV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]