Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6060
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6060, 320 aa
1>>>pF1KE6060 320 - 320 aa - 320 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2518+/-0.000453; mu= 16.0397+/- 0.028
mean_var=105.0072+/-28.413, 0's: 0 Z-trim(108.4): 265 B-trim: 983 in 1/51
Lambda= 0.125160
statistics sampled from 16123 (16506) to 16123 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16
Scan time: 5.510
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 898 173.6 4.6e-43
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 892 172.5 9.9e-43
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XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 892 172.5 9.9e-43
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 891 172.3 1.1e-42
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 878 170.0 5.5e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 873 169.1 1.1e-41
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NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 844 163.9 4e-40
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NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 829 161.2 2.6e-39
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 822 159.9 6.3e-39
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 801 156.1 9e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 797 155.4 1.4e-37
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 785 153.2 6.4e-37
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 777 151.8 1.8e-36
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 777 151.8 1.8e-36
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 771 150.7 3.7e-36
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 728 142.9 8e-34
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 550 110.8 3.9e-24
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 498 101.4 2.6e-21
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 209 49.2 1.4e-05
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 208 49.1 1.7e-05
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 199 47.5 5.2e-05
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 199 47.5 5.5e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 197 47.0 5.8e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 197 47.1 6.4e-05
NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 196 47.0 7.7e-05
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 195 46.8 8.5e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 183 44.5 0.00035
XP_005260196 (OMIM: 602779) PREDICTED: proteinase- ( 273) 182 44.3 0.00035
NP_001269833 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 291) 180 43.9 0.00047
XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 328) 180 44.0 0.00051
XP_006714884 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 331) 180 44.0 0.00051
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 180 44.0 0.00053
XP_005265875 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 366) 180 44.0 0.00055
XP_011532740 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 389) 180 44.1 0.00057
NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 180 44.1 0.00057
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 179 43.8 0.00057
NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 180 44.1 0.00057
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NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 180 44.1 0.00058
XP_011532739 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 402) 180 44.1 0.00058
NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 180 44.1 0.00059
NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 180 44.1 0.00059
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 180 44.1 0.00059
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NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 180 44.1 0.0006
NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 180 44.1 0.0006
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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10 20 30 40 50 60
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310 320
pF1KE6 LWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
:: ..:
NP_009 RLLGKEMGLTQS
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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. ::
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE6 LK--LWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
. ::
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE6 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMAY
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pF1KE6 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE
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pF1KE6 APVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFAT
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pF1KE6 CSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKEA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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pF1KE6 LK--LWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
. ::
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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Smith-Waterman score: 891; 45.9% identity (79.1% similar) in 292 aa overlap (9-300:11-300)
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pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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pF1KE6 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE
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pF1KE6 APVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFAT
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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pF1KE6 LKLWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
:.
NP_003 LRKVATRNFP
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>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
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Smith-Waterman score: 878; 44.3% identity (77.4% similar) in 296 aa overlap (1-296:1-296)
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pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPMYFL
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pF1KE6 LSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMAYDR
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XP_011 LSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCEAP
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XP_011 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFATCS
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XP_011 ALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKEALK
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XP_011 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRRGS
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 866 init1: 866 opt: 873 Z-score: 869.6 bits: 169.1 E(85289): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 873; 43.2% identity (77.1% similar) in 301 aa overlap (5-304:7-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMAY
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 APVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFAT
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKEA
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NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 L-KLWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
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NP_001 LGRLLLGKRELGKE
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 826 init1: 771 opt: 854 Z-score: 851.1 bits: 165.7 E(85289): 1.1e-40
Smith-Waterman score: 854; 42.0% identity (76.3% similar) in 295 aa overlap (10-304:15-309)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PMYFLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAA
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MAYDRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FCEAPVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FATCSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 KEALKLWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
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NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 836 init1: 836 opt: 844 Z-score: 841.3 bits: 163.9 E(85289): 4e-40
Smith-Waterman score: 844; 43.2% identity (77.1% similar) in 292 aa overlap (9-299:11-302)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFN-HTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YFLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMA
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YDRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 EAPVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFA
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKE
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 ALKLWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
::
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 838 init1: 838 opt: 838 Z-score: 835.5 bits: 162.8 E(85289): 8.4e-40
Smith-Waterman score: 838; 44.2% identity (75.7% similar) in 292 aa overlap (10-300:13-303)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YFLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMA
::.::.::..:: .:.::::: .. : ...:. .:: .: :.. ..: .: :..:::
NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YDRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 EAPVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSL-ILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAF
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NP_001 DMPQLLILSCTDT-FFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAF
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ATCSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVK
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NP_001 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK
240 250 260 270 280 290
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.:::
NP_001 DALKRLQKRKCC
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 09:08:52 2016 done: Tue Nov 8 09:08:53 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]