FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6060, 320 aa
1>>>pF1KE6060 320 - 320 aa - 320 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1383+/-0.00115; mu= 10.7940+/- 0.066
mean_var=159.8950+/-55.860, 0's: 0 Z-trim(102.7): 399 B-trim: 407 in 1/45
Lambda= 0.101428
statistics sampled from 6609 (7085) to 6609 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 2.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 2112 322.0 4e-88
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 2041 311.6 5.4e-85
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1867 286.1 2.4e-77
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1225 192.2 4.6e-49
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1218 191.1 9.5e-49
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1215 190.8 1.4e-48
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1210 190.0 2.1e-48
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1179 185.4 5e-47
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1167 183.7 1.7e-46
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 1165 183.4 2e-46
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1147 180.8 1.4e-45
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1143 180.2 1.9e-45
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1128 178.0 8.9e-45
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1128 178.0 8.9e-45
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 1101 174.0 1.3e-43
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 1099 173.7 1.7e-43
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 1098 173.6 1.8e-43
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 1095 173.2 2.7e-43
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 1068 169.2 3.9e-42
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 1067 169.0 4.2e-42
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 1059 167.9 9.6e-42
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1051 166.7 2.1e-41
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 1050 166.6 2.4e-41
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 1002 159.5 3.2e-39
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 998 158.9 4.6e-39
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 997 158.8 5.1e-39
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 992 158.1 8.5e-39
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 970 154.8 8e-38
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 956 152.8 3.3e-37
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 956 152.8 3.3e-37
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 953 152.4 4.5e-37
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 952 152.2 4.9e-37
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 952 152.2 5e-37
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 946 151.4 9.5e-37
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 939 150.3 1.9e-36
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 927 148.5 6.2e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 920 147.5 1.3e-35
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 920 147.6 1.4e-35
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 910 146.1 3.5e-35
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 904 145.2 6.4e-35
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 904 145.2 6.6e-35
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 900 144.6 9.6e-35
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 898 144.3 1.2e-34
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 896 144.0 1.4e-34
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 892 143.4 2.2e-34
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 891 143.3 2.4e-34
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 889 143.0 2.9e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 882 142.0 6.1e-34
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 881 141.8 6.6e-34
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 873 140.7 1.5e-33
>>CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 2112 init1: 2112 opt: 2112 Z-score: 1695.6 bits: 322.0 E(32554): 4e-88
Smith-Waterman score: 2112; 98.8% identity (99.4% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPMYFL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS31 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHRPMYFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMAYDR
::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS31 LSQLSLMDMMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPTLGGGECFLLAAMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCEAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCEAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFATCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFATCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKEALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKEALK
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
:::::::::::::::::::
CCDS31 RWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
310 320
>>CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 2041 init1: 2041 opt: 2041 Z-score: 1639.4 bits: 311.6 E(32554): 5.4e-85
Smith-Waterman score: 2041; 94.7% identity (98.4% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPMYFL
::::::::::::::::::::::::::::.:. ::::::.:.:::::::::::::::::::
CCDS31 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFGNSLMILLIHWDHRLHTPMYFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMAYDR
::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS31 LSQLSLMDMMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGVQIFFLPTLGGGECFLLAAMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCEAP
::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::.::::::::::::::::::.:
CCDS31 YAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSCWLLGAADGLLQAVVTLSFPYCGAHEIDHFFCETP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFATCS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS31 VLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLHMRSTEARKKAFATCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKEALK
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: :::
CCDS31 SHVAVVGLFYGAAIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVKNSEVKGALK
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
:::::::.:::::::::::
CCDS31 RWLGTCVNIKHQQNEAHRSR
310 320
>>CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1897 init1: 1867 opt: 1867 Z-score: 1502.0 bits: 286.1 E(32554): 2.4e-77
Smith-Waterman score: 1867; 90.1% identity (95.5% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPMYFL
:: . : :::::::::::::::::::.:. ::::::.:.:::::::::::::::::::
CCDS31 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFGNSLMILLIHWDHRLHTPMYFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMAYDR
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::
CCDS31 LSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGAQIFFLPTLGGGECFLLAAMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCEAP
::::::::::::::::::::::..: ::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS31 YAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMNLSCWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCETP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFATCS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS31 VLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLHMRSTEARKKAFATCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKEALK
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: ::
CCDS31 SHVAVVGLFYGAAIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVKNSEVKGALT
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 LWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
.: :: :...
CCDS31 RCMGRCVALSRE
310
>>CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1222 init1: 1222 opt: 1225 Z-score: 994.2 bits: 192.2 E(32554): 4.6e-49
Smith-Waterman score: 1225; 57.2% identity (84.6% similar) in 306 aa overlap (1-304:1-306)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEMRNTT--PDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPMY
: .:.: ::::::.:::. .: ::...:: .....:..:.:::. : .::::::
CCDS31 MARENSTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMAY
.:::::::::.::. ::::::: .::.:.:.:: :::..:::: :: :.::::::.:::
CCDS31 LLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYTSLLGSECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE
:::.:.:::::: .::: ..: :: ::.::..::....:::.:: :::..:: ::::.
CCDS31 DRYTAICHPLRYTNLMSPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDVVATFSFSYCGSREIAHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 APVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFAT
: :. :.:.:::.::. ..:::..:.. : ..:..::. .. ::. : : :.:.:::.:
CCDS31 FPSLLILSCSDTSIFEKILFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKEA
::::. :::..:::..: :.:: : :: ..::.::.:::..::.:::::::.::.:: .:
CCDS31 CSSHLLVVGMYYGAALFMYIRPTSDRSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 LKLWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
. ::
CCDS31 FMKILGKGKSGE
310
>>CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1218 init1: 1218 opt: 1218 Z-score: 988.7 bits: 191.1 E(32554): 9.5e-49
Smith-Waterman score: 1218; 56.8% identity (83.8% similar) in 303 aa overlap (2-304:4-306)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPMY
: .. . ::::::.:::. .: ::...:: .....:..:.:::. : .::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMAY
:::::: :::.::. .:::::: .::.:.:.:: :::..:::: :: :.::::::.:.:
CCDS31 FLLSQLFLMDLMLICSTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYVSLLGSECFLLAVMSY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE
::: :.:::::: .:: ..: :: ::.::. :....::::.:: :::..:: ::::.
CCDS31 DRYIAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSMDAIIDAVATFSFSYCGSREIAHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 APVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFAT
: :. :.: :::.::....:::..:.. : ..:..::. .. ::. : : :.:.:::.:
CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEKVLFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKEA
::::. :::..::::.: :.:: : :: .::.::.:::..::.:::::::.::.:: .:
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAGLFMYIRPTSDRSPMQDKLVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 LKLWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
:. ::
CCDS31 LRKVLGKGKCGE
310
>>CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 (347 aa)
initn: 1215 init1: 1215 opt: 1215 Z-score: 985.8 bits: 190.8 E(32554): 1.4e-48
Smith-Waterman score: 1215; 57.1% identity (84.5% similar) in 303 aa overlap (2-304:4-306)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHTPMY
: .. . ::::::.:::. : ::...:. :.....:..:.:::. : .::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPPHTFLFFLVLGIFLVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMAY
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CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCVTQIFFYISLSGSECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE
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CCDS31 DRYIAICHPLRYTNLMNPKICGLMATFSWILGSTDGIIDAVATFSFSFCGSREIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 APVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFAT
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CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRCKAFTT
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKEA
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CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAALFMYIRPTSDHSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 LKLWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
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CCDS31 FMKILGKGKSESELPHKLYVLLFAKFFFLISIFFYDVKILALIMYIA
310 320 330 340
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10 20 30 40 50
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CCDS31 MAWENQTFNSDFLLLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSIMVLLIYLDTQLHTPMY
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pF1KE6 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMAY
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CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYISLLGSECFLLAVMSY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE
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CCDS31 DRYTAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDAVATFSFSYCGSREIAHFCCD
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pF1KE6 APVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFAT
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CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIITSYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKEA
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CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAGLFMCIQPTSHHSPMQDKMVSVFYTIVTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 LKLWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
: ::
CCDS31 LMKILGKGKSGD
310
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10 20 30 40 50
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pF1KE6 YFLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMA
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CCDS58 YFFLSQLSLMDLMLVCNIVPKMAANFLSGRKSISFVGCGIQIGFFVSLVGSEGLLLGLMA
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CCDS58 YDRYVAVSHPLHYPILMNQRVCLQITGSSWAFGIIDGVIQMVAAMGLPYCGSRSVDHFFC
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pF1KE6 EAPVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFA
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CCDS58 EVQALLKLACADTSLFDTLLFACCVFMLLLPFSIIMASYACILGAVLRIRSAQAWKKALA
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pF1KE6 TCSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKE
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CCDS58 TCSSHLTAVTLFYGAAMFMYLRPRRYRAPSHDKVASIFYTVLTPMLNPLIYSLRNGEVMG
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300 310 320
pF1KE6 ALKLWLGTC-VNLKHQQNEAHRSR
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CCDS58 ALRKGLDRCRIGSQH
310
>>CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 (315 aa)
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pF1KE6 YFLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMA
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CCDS44 YFFLSQLSLMDLMLVCTNVPKMAANFLSGRKSISFVGCGIQIGLFVCLVGSEGLLLGLMA
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pF1KE6 YDRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFC
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CCDS44 YDRYVAISHPLHYPILMNQRVCLQITGSSWAFGIIDGLIQMVVVMNFPYCGLRKVNHFFC
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pF1KE6 EAPVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFA
: :..:::.:::.::.... :::.::: :::.:..::. ::..:: :.:..: :::.:
CCDS44 EMLSLLKLACVDTSLFEKVIFACCVFMLLFPFSIIVASYAHILGTVLQMHSAQAWKKALA
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pF1KE6 TCSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKE
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CCDS44 TCSSHLTAVTLFYGAAMFIYLRPRHYRAPSHDKVASIFYTVLTPMLNPLIYSLRNREVMG
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CCDS44 ALRKGLDRCRIGSQH
310
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CCDS31 MVWENQTFNSIFILLGIFNHSPTHTFLFSLVLGIFSLALMENISMVLLIYIEKQLHTPMY
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pF1KE6 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPSLGGGECFLLAAMAY
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CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTLPKMIFSYLSGKKSISLAGCGTQIFFYVSLLGAECFLLAVMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE
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CCDS31 DRYVAICHPLQYTILMNPKLCVFMTVASWTLGSLDGIIVLAAVLSFSYCSSLEIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 APVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFAT
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CCDS31 VAALLPLSCTETSAFERLLVICCVVMLIFPVSVIILSYSHVLRAVIHMGSGESRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
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CCDS31 CSSHLSVVGLYYGAAMFMYMRPASKHTPDQDKMVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVFRA
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CCDS31 LQKVLKKRKLI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]