FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6056, 319 aa
1>>>pF1KE6056 319 - 319 aa - 319 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8540+/-0.00122; mu= 12.3450+/- 0.071
mean_var=177.0049+/-66.450, 0's: 0 Z-trim(102.6): 430 B-trim: 425 in 1/47
Lambda= 0.096401
statistics sampled from 6474 (7018) to 6474 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 2.300
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 2092 304.2 8.7e-83
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1612 237.4 1.1e-62
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1596 235.2 5e-62
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1393 207.0 1.6e-53
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1387 206.2 2.9e-53
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1374 204.4 1e-52
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1369 203.7 1.6e-52
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1303 194.5 9.8e-50
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1281 191.4 7.7e-49
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 1248 186.9 2e-47
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 1246 186.5 2.3e-47
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1184 177.9 8.9e-45
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1123 169.5 3.3e-42
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1105 166.9 1.8e-41
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1104 166.8 2e-41
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1082 163.7 1.7e-40
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1064 161.2 9.4e-40
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1060 160.8 1.5e-39
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1053 159.7 2.7e-39
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1049 159.1 4e-39
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1047 158.9 4.9e-39
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1046 158.7 5.3e-39
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1041 158.0 8.7e-39
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1038 157.6 1.2e-38
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1037 157.5 1.3e-38
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 1037 157.5 1.3e-38
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 988 150.7 1.5e-36
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 976 149.0 4.7e-36
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 958 146.5 2.6e-35
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 951 145.5 5.1e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 938 143.7 1.8e-34
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 928 142.3 4.6e-34
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 917 140.8 1.4e-33
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 911 140.0 2.4e-33
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 906 139.3 3.9e-33
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 905 139.1 4.4e-33
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 900 138.4 6.9e-33
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 899 138.3 7.6e-33
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 898 138.2 8.5e-33
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 896 137.9 1e-32
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 896 137.9 1e-32
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 895 137.7 1.1e-32
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 894 137.6 1.2e-32
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 894 137.6 1.3e-32
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 891 137.2 1.7e-32
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 891 137.2 1.7e-32
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 888 136.8 2.2e-32
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 886 136.5 2.7e-32
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 885 136.3 2.9e-32
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 882 136.0 4.3e-32
>>CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 (319 aa)
initn: 2092 init1: 2092 opt: 2092 Z-score: 1599.7 bits: 304.2 E(32554): 8.7e-83
Smith-Waterman score: 2092; 100.0% identity (100.0% similar) in 319 aa overlap (1-319:1-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEPGNDTQISEFLLLGFSQEPGLQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MEPGNDTQISEFLLLGFSQEPGLQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLSNLSFADICVTSTTIPKMLMNIQTQNKVITYIACLMQMYFFILFAGFENFLLSVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FFLSNLSFADICVTSTTIPKMLMNIQTQNKVITYIACLMQMYFFILFAGFENFLLSVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRFVAICHPLHYMVIMNPHLCGLLVLASWTMSALYSLLQILMVVRLSFCTALEIPHFFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DRFVAICHPLHYMVIMNPHLCGLLVLASWTMSALYSLLQILMVVRLSFCTALEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LNQVIQLACSDSFLNHMVIYFTVALLGGGPLTGILYSYSKIISSIHAISSAQGKYKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LNQVIQLACSDSFLNHMVIYFTVALLGGGPLTGILYSYSKIISSIHAISSAQGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLSVVSLFYGAILGVYLSSAATRNSHSSATASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDIKRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CASHLSVVSLFYGAILGVYLSSAATRNSHSSATASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDIKRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LGIHLLWGTMKGQFFKKCP
:::::::::::::::::::
CCDS12 LGIHLLWGTMKGQFFKKCP
310
>>CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 (309 aa)
initn: 1614 init1: 1595 opt: 1612 Z-score: 1239.1 bits: 237.4 E(32554): 1.1e-62
Smith-Waterman score: 1612; 81.4% identity (93.4% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEPGNDTQISEFLLLGFSQEPGLQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
:. :.: : ::::::.:.:: :: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLSNLSFADICVTSTTIPKMLMNIQTQNKVITYIACLMQMYFFILFAGFENFLLSVMAY
::::::::.::: .:::.::::.::::.:::::: .:. :: ::.::.:..::::.::::
CCDS32 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRFVAICHPLHYMVIMNPHLCGLLVLASWTMSALYSLLQILMVVRLSFCTALEIPHFFCE
::::::::::::::::::.:::::::::: ::.: :.:: :::. : ::: .::::::::
CCDS32 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LNQVIQLACSDSFLNHMVIYFTVALLGGGPLTGILYSYSKIISSIHAISSAQGKYKAFST
.:::..:::::.::: .:.::.:::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::
CCDS32 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLSVVSLFYGAILGVYLSSAATRNSHSSATASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDIKRA
:::::::::::::. ::::::::::.:::..:.:::::::::::::::::::::: :: :
CCDS32 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LGIHLLWGTMKGQFFKKCP
.
CCDS32 MKTFFRGKQ
>>CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 (309 aa)
initn: 1596 init1: 1596 opt: 1596 Z-score: 1227.1 bits: 235.2 E(32554): 5e-62
Smith-Waterman score: 1596; 81.7% identity (93.0% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEPGNDTQISEFLLLGFSQEPGLQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
::: ::: ::::.:::.:.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MEPENDTGISEFVLLGLSEEPELQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLSNLSFADICVTSTTIPKMLMNIQTQNKVITYIACLMQMYFFILFAGFENFLLSVMAY
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CCDS12 FFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMCFFVLFGGLDSLLLAVMAY
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pF1KE6 DRFVAICHPLHYMVIMNPHLCGLLVLASWTMSALYSLLQILMVVRLSFCTALEIPHFFCE
:::::::::::: :::::.:::::::::: ..:: :: : :::. ::::: :::::::::
CCDS12 DRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWMIAALNSLSQSLMVLWLSFCTDLEIPHFFCE
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pF1KE6 LNQVIQLACSDSFLNHMVIYFTVALLGGGPLTGILYSYSKIISSIHAISSAQGKYKAFST
:::::.:::::.::: : .::...::.::::.::: :::::.:::.::::::::::::::
CCDS12 LNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
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pF1KE6 CASHLSVVSLFYGAILGVYLSSAATRNSHSSATASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDIKRA
::::::::::: . :::::.::::.:::.::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS12 CASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVATPMLNPFIYSLRNKDIKRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LGIHLLWGTMKGQFFKKCP
:
CCDS12 LKMSFRGKQ
>>CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 1393 init1: 1393 opt: 1393 Z-score: 1074.4 bits: 207.0 E(32554): 1.6e-53
Smith-Waterman score: 1393; 69.4% identity (90.7% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEPGNDTQISEFLLLGFSQEPGLQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
:: : :..:.:::::.:..: ::: ::::::::::::::::::::::. ::::::::::
CCDS32 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 FFLSNLSFADICVTSTTIPKMLMNIQTQNKVITYIACLMQMYFFILFAGFENFLLSVMAY
::::::::.::: :::.::::..::...: :.:..:: :.::...:::...:::.::::
CCDS32 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 DRFVAICHPLHYMVIMNPHLCGLLVLASWTMSALYSLLQILMVVRLSFCTALEIPHFFCE
:::::::::::: ::::: :::::::::: . .::..::.. ::.: :. ::::::::
CCDS32 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LNQVIQLACSDSFLNHMVIYFTVALLGGGPLTGILYSYSKIISSIHAISSAQGKYKAFST
::...:::...::..:.: ..:::: :..:::.:::.:.::. ..::..::::::::
CCDS32 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLSVVSLFYGAILGVYLSSAATRNSHSSATASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDIKRA
:.::: :::::::. ::::::::.:..:.::.::::::..::::::::::::::::.: :
CCDS32 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LGIHLLWGTMKGQFFKKCP
:
CCDS32 LERLLSRADSCP
310
>>CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 (320 aa)
initn: 1387 init1: 1387 opt: 1387 Z-score: 1069.8 bits: 206.2 E(32554): 2.9e-53
Smith-Waterman score: 1387; 69.9% identity (87.1% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEPGNDTQISEFLLLGFSQEPGLQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
:: ::.:. .:::::::: .: .:::::::::::: :::::::: ::::::::::
CCDS12 METGNQTHAQEFLLLGFSATSEIQFILFGLFLSMYLVTFTGNLLIILAICSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLSNLSFADICVTSTTIPKMLMNIQTQNKVITYIACLMQMYFFILFAGFENFLLSVMAY
::::::::::.: ::::.::::.:: :::: ::: .:: :..:: :. ..:.::.::::
CCDS12 FFLSNLSFADLCFTSTTVPKMLLNILTQNKFITYAGCLSQIFFFTSFGCLDNLLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 DRFVAICHPLHYMVIMNPHLCGLLVLASWTMSALYSLLQILMVVRLSFCTALEIPHFFCE
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CCDS12 DRFVAVCHPLHYTVIMNPQLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTVLRLSFCTEMEIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 LNQVIQLACSDSFLNHMVIYFTVALLGGGPLTGILYSYSKIISSIHAISSAQGKYKAFST
: .:..:::::.:.:..::::....:: .:::..:: ::. :: :::: :.:::::
CCDS12 LLEVLKLACSDTFINNVVIYFATGVLGVISFTGIFFSYYKIVFSILRISSAGRKHKAFST
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pF1KE6 CASHLSVVSLFYGAILGVYLSSAATRNSHSSATASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDIKRA
:.::::::.::::. .::::::::: .:..: .::::::.:::::::::::::: :.:::
CCDS12 CGSHLSVVTLFYGTGFGVYLSSAATPSSRTSLVASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNTDMKRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LGIHLLWGTMKGQFFKKCP
::
CCDS12 LGRLLSRATFFNGDITAGLS
310 320
>>CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 (319 aa)
initn: 1411 init1: 1033 opt: 1374 Z-score: 1060.1 bits: 204.4 E(32554): 1e-52
Smith-Waterman score: 1374; 66.7% identity (88.7% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEPGNDTQISEFLLLGFSQEPGLQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
:: ::.:....::::::... .: .: ::::::::::..:::::::. ::::::::::
CCDS12 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLSNLSFADICVTSTTIPKMLMNIQTQNKVITYIACLMQMYFFILFAGFENFLLSVMAY
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CCDS12 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRFVAICHPLHYMVIMNPHLCGLLVLASWTMSALYSLLQILMVVRLSFCTALEIPHFFCE
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CCDS12 DRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTILRLSFCTNMEIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LNQVIQLACSDSFLNHMVIYFTVALLGGGPLTGILYSYSKIISSIHAISSAQGKYKAFST
..:..:::::.:.:..:.::.. .:: :: :::.:::.:.::. .: :.:..:::::
CCDS12 PSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFSSVLRVS-ARGQHKAFST
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLSVVSLFYGAILGVYLSSAATRNSHSSATASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDIKRA
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CCDS12 CGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTPMLNPFIYSLRNKDMKGS
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310
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:: :: .:
CCDS12 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
300 310
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10 20 30 40 50 60
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CCDS32 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAISSDSHLHTPMY
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pF1KE6 FFLSNLSFADICVTSTTIPKMLMNIQTQNKVITYIACLMQMYFFILFAGFENFLLSVMAY
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CCDS32 FFLSNLSWVDICFSTCIVPKMLVNIQTENKAISYMDCLTQVYFSMFFPILDTLLLTVMAY
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CCDS32 DRFVAVCHPLHYMIIMNPHLCGLLVFVTWLIGVMTSLLHISLMMHLIFCKDFEIPHFFCE
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CCDS32 LTYILQLACSDTFLNSTLIYFMTGVLGVFPLLGIIFSYSRIASSIRKMSSSGGKQKALST
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CCDS32 CGSHLSVVSLFYGTGIGVHFTSAVTHSSQKISVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
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310
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::
CCDS32 LGSLLSRAASCL
310
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10 20 30
pF1KE6 MEPGNDTQISEFLLLGFSQEPGLQPFLFGLFLSMYLVTV
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CCDS32 MPMQLLLTDFIIFSIRFIINSMEARNQTAISKFLLLGLIEDPELQPVLFSLFLSMYLVTI
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40 50 60 70 80 90
pF1KE6 LGNLLIILATISDSHLHTPMYFFLSNLSFADICVTSTTIPKMLMNIQTQNKVITYIACLM
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CCDS32 LGNLLILLAVISDSHLHTPMYFFLSNLSFLDICLSTTTIPKMLVNIQAQNRSITYSGCLT
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pF1KE6 QMYFFILFAGFENFLLSVMAYDRFVAICHPLHYMVIMNPHLCGLLVLASWTMSALYSLLQ
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CCDS32 QICFVLFFAGLENCLLAAMAYDRYVAICHPLRYTVIMNPRLCGLLILLSLLTSVVNALLL
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pF1KE6 ILMVVRLSFCTALEIPHFFCELNQVIQLACSDSFLNHMVIYFTVALLGGGPLTGILYSYS
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CCDS32 SLMVLRLSFCTDLEIPLFFCELAQVIQLTCSDTLINNILIYFAACIFGGVPLSGIILSYT
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pF1KE6 KIISSIHAISSAQGKYKAFSTCASHLSVVSLFYGAILGVYLSSAATRNSHSSATASVMYT
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CCDS32 QITSCVLRMPSASGKHKAVSTCGSHLSIVLLFYGAGLGVYISSVVTDSPRKTAVASVMYS
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280 290 300 310
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CCDS32 VFPQMVNPFIYSLRNKDMKGTLRKFIGRIPSLLWCAICFGFRFLE
310 320 330 340
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CCDS32 MKAGNFSDTPEFFLLGLSGDPELQPILFMLFLSMYLATMLGNLLIILAVNSDSHLHTPMY
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CCDS32 FLLSILSLVDICFTSTTMPKMLVNIQAQAQSINYTGCLTQICFVLVFVGLENGILVMMAY
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CCDS32 DRFVAICHPLRYNVIMNPKLCGLLLLLSFIVSVLDALLHTLMVLQLTFCIDLEIPHFFCE
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pF1KE6 LNQVIQLACSDSFLNHMVIYFTVALLGGGPLTGILYSYSKIISSIHAISSAQGKYKAFST
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CCDS32 LAHILKLACSDVLINNILVYLVTSLLGVVPLSGIIFSYTRIVSSVMKIPSAGGKYKAFSI
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pF1KE6 CASHLSVVSLFYGAILGVYLSSAATRNSHSSATASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDIKRA
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CCDS32 CGSHLIVVSLFYGTGFGVYLSSGATHSSRKGAIASVMYTVVTPMLNPLIYSLRNKDMLKA
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:
CCDS32 LRKLISRIPSFH
310
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10 20 30 40
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CCDS45 MSYFPILFFFFLKRCPSYTEPQNLTGVSEFLLLGLSEDPELQPVLAGLFLSMYLVTVLGN
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CCDS45 MLQLTCFKDVDISNFFCDPSQLLHLRCSDTFINEMVIYFMGAIFGCLPISGILFSYYKIV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]