Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6055
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6055, 319 aa
1>>>pF1KE6055 319 - 319 aa - 319 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8981+/-0.00115; mu= 12.4046+/- 0.067
mean_var=112.7935+/-34.667, 0's: 0 Z-trim(103.3): 388 B-trim: 873 in 2/48
Lambda= 0.120763
statistics sampled from 6872 (7338) to 6872 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16
Scan time: 2.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 2100 377.4 8.2e-105
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 1394 254.4 8.8e-68
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 1130 208.4 6e-54
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 1128 208.1 7.7e-54
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 1127 207.9 9.6e-54
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 1099 203.0 2.5e-52
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 760 143.9 1.5e-34
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 757 143.4 2.2e-34
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 753 142.7 3.6e-34
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 752 142.5 4e-34
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 750 142.2 5.1e-34
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 747 141.7 7.6e-34
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 743 141.0 1.2e-33
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 736 139.8 2.8e-33
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 732 139.1 4.5e-33
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 721 137.1 1.7e-32
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 721 137.1 1.7e-32
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 712 135.6 5.3e-32
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 708 134.9 8.1e-32
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 707 134.7 9.3e-32
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 706 134.5 1e-31
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 704 134.2 1.3e-31
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 703 134.0 1.5e-31
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 702 133.8 1.7e-31
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 701 133.7 2e-31
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 697 133.0 3.1e-31
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 695 132.6 3.9e-31
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 694 132.4 4.4e-31
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 694 132.5 4.5e-31
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 692 132.1 5.8e-31
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 692 132.1 5.8e-31
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 683 130.5 1.7e-30
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 682 130.3 1.9e-30
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 682 130.4 1.9e-30
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 679 129.9 2.9e-30
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 674 128.9 4.9e-30
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 674 129.0 5e-30
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 674 129.0 5.1e-30
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 670 128.3 8.1e-30
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 652 125.1 7e-29
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 652 125.1 7.1e-29
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 644 123.7 1.9e-28
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 640 123.0 3.1e-28
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 617 119.1 5.3e-27
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 603 116.6 2.6e-26
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 595 115.2 7e-26
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 586 113.6 2e-25
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 582 112.9 3.3e-25
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 580 112.6 4.3e-25
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 575 111.7 7.9e-25
>>CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 (319 aa)
initn: 2100 init1: 2100 opt: 2100 Z-score: 1995.2 bits: 377.4 E(32554): 8.2e-105
Smith-Waterman score: 2100; 100.0% identity (100.0% similar) in 319 aa overlap (1-319:1-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDTSTSVTYDSSLQISQFILMGLPGIHEWQHWLSLPLTLLYLLALGANLLIIITIQHETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MDTSTSVTYDSSLQISQFILMGLPGIHEWQHWLSLPLTLLYLLALGANLLIIITIQHETV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LHEPMYHLLGILAVVDIGLATTIMPKILAIFWFDAKAISLPMCFAQIYAIHCFFCIESGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LHEPMYHLLGILAVVDIGLATTIMPKILAIFWFDAKAISLPMCFAQIYAIHCFFCIESGI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 FLCMAVDRYIAICRPLQYPSIVTKAFVFKATGFIMLRNGLLTIPVPILAAQRHYCSRNEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLCMAVDRYIAICRPLQYPSIVTKAFVFKATGFIMLRNGLLTIPVPILAAQRHYCSRNEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EHCLCSNLGVISLACDDITVNKFYQLMLAWVLVGSDMALVFSSYAVILHSVLRLNSAEAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EHCLCSNLGVISLACDDITVNKFYQLMLAWVLVGSDMALVFSSYAVILHSVLRLNSAEAM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SKALSTCSSHLILILFHTGIIVLSVTHLAEKKIPLIPVFLNVLHNVIPPALNPLACALRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SKALSTCSSHLILILFHTGIIVLSVTHLAEKKIPLIPVFLNVLHNVIPPALNPLACALRM
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 HKLRLGFQRLLGLGQDVSK
:::::::::::::::::::
CCDS31 HKLRLGFQRLLGLGQDVSK
310
>>CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1374 init1: 1192 opt: 1394 Z-score: 1330.4 bits: 254.4 E(32554): 8.8e-68
Smith-Waterman score: 1394; 66.3% identity (87.8% similar) in 312 aa overlap (1-311:4-315)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDTSTSVTYDSSLQISQFILMGLPGIHEWQHWLSLPLTLLYLLALGANLLIIITIQH
:..: ... .:..:.:.:::.:.:::: :::::::::.:::: ::.:: ::.: : .
CCDS31 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALLYLSALAANTLILIIIWQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 ETVLHEPMYHLLGILAVVDIGLATTIMPKILAIFWFDAKAISLPMCFAQIYAIHCFFCIE
. :..::: .:::: .::.::::::.::::::::::::.:::: ::::::::: : .:
CCDS31 NPSLQQPMYIFLGILCMVDMGLATTIIPKILAIFWFDAKVISLPECFAQIYAIHFFVGME
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SGIFLCMAVDRYIAICRPLQYPSIVTKAFVFKATGFIMLRNGLLTIPVPILAAQRHYCSR
:::.:::: :::.:::.::.::::::.....::: :..:::::.. :::.::::: :::.
CCDS31 SGILLCMAFDRYVAICHPLRYPSIVTSSLILKATLFMVLRNGLFVTPVPVLAAQRDYCSK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 NEIEHCLCSNLGVISLACDDITVNKFYQLMLAWVLVGSDMALVFSSYAVILHSVLRLNSA
::::::::::::: :::::: :.. ::.:::. .:::..:.. :: .::.::::::::
CCDS31 NEIEHCLCSNLGVTSLACDDRRPNSICQLVLAWLGMGSDLSLIILSYILILYSVLRLNSA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EAMSKALSTCSSHLILILF-HTGIIVLSVTHLAEKKIPLIPVFLNVLHNVIPPALNPLAC
:: .:::::::::: :::: .: ..:.:::::.: : ::::.::::::.:::.::: .
CCDS31 EAAAKALSTCSSHLTLILFFYTIVVVISVTHLTEMKATLIPVLLNVLHNIIPPSLNPTVY
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 ALRMHKLRLGFQRLLGLGQDVSK
::. ..:: .::..:
CCDS31 ALQTKELRAAFQKVLFALTKEIRS
310 320
>>CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 961 init1: 961 opt: 1130 Z-score: 1082.0 bits: 208.4 E(32554): 6e-54
Smith-Waterman score: 1130; 52.8% identity (81.3% similar) in 305 aa overlap (12-314:10-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDTSTSVTYDSSLQISQFILMGLPGIHEWQHWLSLPLTLLYLLALGANLLIIITIQHETV
: . :.:.: . :::::::::.::.:::.::: ...:: :.
CCDS41 MTTHRNDTLSTEASDFLLNCFVRSPSWQHWLSLPLSLLFLLAVGANTTLLMTIWLEAS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LHEPMYHLLGILAVVDIGLATTIMPKILAIFWFDAKAISLPMCFAQIYAIHCFFCIESGI
::.:.:.::..:...:: : :..::.:.::::: . ::.: :: :.: ..::. .::
CCDS41 LHQPLYYLLSLLSLLDIVLCLTVIPKVLTIFWFDLRPISFPACFLQMYIMNCFLAMESCT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 FLCMAVDRYIAICRPLQYPSIVTKAFVFKATGFIMLRNGLLTIPVPILAAQRHYCSRNEI
:. :: :::.:::.::.::::.: :: ::. ::. :: :.:.:.:::.:: .::.:: :
CCDS41 FMVMAYDRYVAICHPLRYPSIITDHFVVKAAMFILTRNVLMTLPIPILSAQLRYCGRNVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EHCLCSNLGVISLACDDITVNKFYQLMLAWVLVGSDMALVFSSYAVILHSVLRLNSAEAM
:.:.:.:..: :.:::.:.:..::. .:.:.:::. :.: ::. ::..::::.. :.
CCDS41 ENCICANMSVSRLSCDDVTINHLYQFAGGWTLLGSDLILIFLSYTFILRAVLRLKAEGAV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE6 SKALSTCSSHLILILFHTGII-VLSVTHLAEKKI-PLIPVFLNVLHNVIPPALNPLACAL
.::::::.::..:::: . :. :. .::.:.::. : .::.:::::.::: ::::. ..
CCDS41 AKALSTCGSHFMLILFFSTILLVFVLTHVAKKKVSPDVPVLLNVLHHVIPAALNPIIYGV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 RMHKLRLGFQRLLGLGQDVSK
: .... :.:::: :
CCDS41 RTQEIKQGMQRLLKKGC
300 310
>>CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 951 init1: 932 opt: 1128 Z-score: 1080.0 bits: 208.1 E(32554): 7.7e-54
Smith-Waterman score: 1128; 51.0% identity (84.0% similar) in 312 aa overlap (6-315:7-318)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDTSTSVTYDSSLQISQFILMGLPGIHEWQHWLSLPLTLLYLLALGANLLIIITIQHET
: . .:.. .:.:.:. .:... :::::::::.::.:::.::: ..:::: :.
CCDS31 MIQPMASPSNSSTVPVSEFLLICFPNFQSWQHWLSLPLSLLFLLAMGANTTLLITIQLEA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 VLHEPMYHLLGILAVVDIGLATTIMPKILAIFWFDAKAISLPMCFAQIYAIHCFFCIESG
::.:.:.::..:...:: : :..::.:::::.: ..::.: :: :.. .. :. .::
CCDS31 SLHQPLYYLLSLLSLLDIVLCLTVIPKVLAIFWYDLRSISFPACFLQMFIMNSFLPMESC
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 IFLCMAVDRYIAICRPLQYPSIVTKAFVFKATGFIMLRNGLLTIPVPILAAQRHYCSRNE
:. :: :::.:::.::.::::.:. :: ::. ::..::.::: :.:::.. :::..:
CCDS31 TFMVMAYDRYVAICHPLRYPSIITNQFVAKASVFIVVRNALLTAPIPILTSLLHYCGENV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 IEHCLCSNLGVISLACDDITVNKFYQLMLAWVLVGSDMALVFSSYAVILHSVLRLNSAEA
::.:.:.::.: :.::..:.:..::.. .:.:.:::. :.: ::. ::..:::... :
CCDS31 IENCICANLSVSRLSCDNFTLNRIYQFVAGWTLLGSDLFLIFLSYTFILRAVLRFKAEGA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 MSKALSTCSSHLILILFHTGIIVLSV-THLAEKKIPL-IPVFLNVLHNVIPPALNPLACA
::::::.::.::::: . :... : :..:.::.:. : ..:::::..:::::::.. .
CCDS31 AVKALSTCGSHFILILFFSTILLVVVLTNVARKKVPMDILILLNVLHHLIPPALNPIVYG
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 LRMHKLRLGFQRLLGLGQDVSK
.: .... :.:.:: :.
CCDS31 VRTKEIKQGIQKLLQRGR
310
>>CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 (365 aa)
initn: 991 init1: 967 opt: 1127 Z-score: 1078.3 bits: 207.9 E(32554): 9.6e-54
Smith-Waterman score: 1127; 50.6% identity (83.4% similar) in 308 aa overlap (6-311:55-362)
10 20 30
pF1KE6 MDTSTSVTYDSSLQISQFILMGLPGIHEWQHWLSL
: . ::. .:.:.:. .:... :::::::
CCDS31 SRMYFLCFCTSLLRFKVHWVSRLIRKLYMASPSNDSTAPVSEFLLICFPNFQSWQHWLSL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 PLTLLYLLALGANLLIIITIQHETVLHEPMYHLLGILAVVDIGLATTIMPKILAIFWFDA
::.::.:::.::: ..:::: :. ::.:.:.::..:...:: : :..::.:::::::
CCDS31 PLSLLFLLAMGANTTLLITIQLEASLHQPLYYLLSLLSLLDIVLCLTVIPKVLAIFWFDL
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 KAISLPMCFAQIYAIHCFFCIESGIFLCMAVDRYIAICRPLQYPSIVTKAFVFKATGFIM
..::.: :: :.. .. :. .:: :. :: :::.:::.::.::::.: :: .:. :..
CCDS31 RSISFPACFLQMFIMNSFLTMESCTFMVMAYDRYVAICHPLRYPSIITDQFVARAVVFVI
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 LRNGLLTIPVPILAAQRHYCSRNEIEHCLCSNLGVISLACDDITVNKFYQLMLAWVLVGS
::.....:::.:.:. .::. : :..:.::::.: .:.::::: :..::.. .:.:.::
CCDS31 ARNAFVSLPVPMLSARLRYCAGNIIKNCICSNLSVSKLSCDDITFNQLYQFVAGWTLLGS
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 DMALVFSSYAVILHSVLRLNSAEAMSKALSTCSSHLILILFHTGII-VLSVTHLAEKKIP
:. :. ::. ::. :::... :..::::::.::.::::: . .. :: .:.::.:.::
CCDS31 DLILIVISYSFILKVVLRIKAEGAVAKALSTCGSHFILILFFSTVLLVLVITNLARKRIP
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310
pF1KE6 L-IPVFLNVLHNVIPPALNPLACALRMHKLRLGFQRLLGLGQDVSK
.:..::.::..:::::::.. ..: .... :.: ::
CCDS31 PDVPILLNILHHLIPPALNPIVYGVRTKEIKQGIQNLLKRL
330 340 350 360
>>CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 929 init1: 910 opt: 1099 Z-score: 1052.8 bits: 203.0 E(32554): 2.5e-52
Smith-Waterman score: 1099; 50.0% identity (82.9% similar) in 304 aa overlap (10-311:7-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDTSTSVTYDSSLQISQFILMGLPGIHEWQHWLSLPLTLLYLLALGANLLIIITIQHETV
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