FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6054, 319 aa
1>>>pF1KE6054 319 - 319 aa - 319 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1938+/-0.00169; mu= 11.0106+/- 0.098
mean_var=153.9718+/-53.478, 0's: 0 Z-trim(98.9): 382 B-trim: 648 in 2/42
Lambda= 0.103360
statistics sampled from 5064 (5550) to 5064 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.488), E-opt: 0.2 (0.17), width: 16
Scan time: 1.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 2046 318.1 5.6e-87
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CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1169 187.4 1.3e-47
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1132 181.8 5.9e-46
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1130 181.6 7.3e-46
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1102 177.4 1.3e-44
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1045 168.9 4.9e-42
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1031 166.8 2e-41
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1021 165.3 5.6e-41
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1018 164.8 7.7e-41
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1017 164.7 8.6e-41
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1011 163.8 1.6e-40
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1007 163.3 2.6e-40
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1005 162.9 3e-40
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1004 162.8 3.3e-40
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1001 162.3 4.5e-40
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 999 162.0 5.5e-40
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 996 161.6 7.5e-40
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 995 161.4 8.3e-40
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 987 160.2 1.9e-39
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 982 159.5 3.1e-39
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 982 159.5 3.2e-39
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CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 974 158.3 7.3e-39
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 971 157.8 1e-38
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 966 157.1 1.7e-38
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CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 956 155.6 4.8e-38
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CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 951 154.9 8.3e-38
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 949 154.6 9.7e-38
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 948 154.5 1.2e-37
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 947 154.3 1.2e-37
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CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 938 152.9 3.1e-37
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CCDS7782.1 OR5P2 gene_id:120065|Hs108|chr11 ( 322) 925 151.0 1.2e-36
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 920 150.3 2.1e-36
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 919 150.1 2.2e-36
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 915 149.5 3.3e-36
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 913 149.2 4.1e-36
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 912 149.0 4.4e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 912 149.1 4.5e-36
>>CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 (319 aa)
initn: 2046 init1: 2046 opt: 2046 Z-score: 1675.0 bits: 318.1 E(32554): 5.6e-87
Smith-Waterman score: 2046; 100.0% identity (100.0% similar) in 319 aa overlap (1-319:1-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNHVVKHNHTAVTKVTEFILMGITDNPGLQAPLFGLFLIIYLVTVIGNLGMVILTYLDSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MNHVVKHNHTAVTKVTEFILMGITDNPGLQAPLFGLFLIIYLVTVIGNLGMVILTYLDSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LHTPMYFFLRHLSITDLGYSTVIAPKMLVNFIVHKNTISYNWYATQLAFFEIFIISELFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LHTPMYFFLRHLSITDLGYSTVIAPKMLVNFIVHKNTISYNWYATQLAFFEIFIISELFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LSAMAYDRYVAICKPLLYVIIMAEKVLWVLVIVPYLYSTFVSLFLTIKLFKLSFCGSNII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSAMAYDRYVAICKPLLYVIIMAEKVLWVLVIVPYLYSTFVSLFLTIKLFKLSFCGSNII
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SYFYCDCIPLMSILCSDTNELELIILIFSGCNLLFSLSIVLISYMFILVAILRMNSRKGR
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CCDS31 SYFYCDCIPLMSILCSDTNELELIILIFSGCNLLFSLSIVLISYMFILVAILRMNSRKGR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YKAFSTCSSHLTVVIMFYGTLLFIYLQPKSSHTLAIDKMASVFYTLLIPMLNPLIYSLRN
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 KEVKDALKRTLTNRFKIPI
:::::::::::::::::::
CCDS31 KEVKDALKRTLTNRFKIPI
310
>>CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 (307 aa)
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Smith-Waterman score: 1307; 64.3% identity (86.4% similar) in 308 aa overlap (6-313:3-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNHVVKHNHTAVTKVTEFILMGITDNPGLQAPLFGLFLIIYLVTVIGNLGMVILTYLDSK
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CCDS31 MGQHN---LTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LHTPMYFFLRHLSITDLGYSTVIAPKMLVNFIVHKNTISYNWYATQLAFFEIFIISELFI
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CCDS31 LHTPMYFSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFI
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LSAMAYDRYVAICKPLLYVIIMAEKVLWVLVIVPYLYSTFVSLFLTIKLFKLSFCGSNII
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CCDS31 LSAMAYDRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCGSNVI
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SYFYCDCIPLMSILCSDTNELELIILIFSGCNLLFSLSIVLISYMFILVAILRMNSRKGR
:.:::: .::. .:::...:.::. ..:: ::. :. :::.:::.::.:: .:.: .::
CCDS31 SHFYCDDVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHSAEGR
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250 260 270 280 290 300
pF1KE6 YKAFSTCSSHLTVVIMFYGTLLFIYLQPKSSHTLAIDKMASVFYTLLIPMLNPLIYSLRN
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CCDS31 KKAFSTCGSHLTVVVVFYGSLLFMYMQPNSTHFFDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRN
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 KEVKDALKRTLTNRFKIPI
.:::.:. . . :
CCDS31 EEVKNAFYKLFEN
300
>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 (309 aa)
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Smith-Waterman score: 1169; 57.5% identity (81.7% similar) in 306 aa overlap (9-314:3-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNHVVKHNHTAVTKVTEFILMGITDNPGLQAPLFGLFLIIYLVTVIGNLGMVILTYLDSK
: :..:::::.:.::. :. ::: ::: ::: ::.::::...: :..
CCDS41 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTS
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pF1KE6 LHTPMYFFLRHLSITDLGYSTVIAPKMLVNFIVHKNTISYNWYATQLAFFEIFIISELFI
:.::::::: .:...:. ::.::.:::: ::. ..:.::.. ::::. : :.::: ..
CCDS41 LNTPMYFFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLL
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pF1KE6 LSAMAYDRYVAICKPLLYVIIMAEKVLWVLVIVPYLYSTFVSLFLTIKLFKLSFCGSNII
:..::::::::::.::::...:. . :: ::: :: ...:: :: :.::.: :::.
CCDS41 LASMAYDRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIV
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pF1KE6 SYFYCDCIPLMSILCSDTNELELIILIFSGCNLLFSLSIVLISYMFILVAILRMNSRKGR
..:::: .::. . :::: .: :. .: .. :: ::..:::::. :::::.: .::
CCDS41 NHFYCDDMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGR
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pF1KE6 YKAFSTCSSHLTVVIMFYGTLLFIYLQPKSSHTLAIDKMASVFYTLLIPMLNPLIYSLRN
::::::.::. .: .:::::.:.::::.:::.: :::::::::..:::::::::::.:
CCDS41 QKAFSTCGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQN
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 KEVKDALKRTLTNRFKIPI
::::.:::. . :.
CCDS41 KEVKEALKKIIINKN
300
>>CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 (315 aa)
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Smith-Waterman score: 1132; 55.5% identity (84.4% similar) in 301 aa overlap (13-313:7-307)
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pF1KE6 MNHVVKHNHTAVTKVTEFILMGITDNPGLQAPLFGLFLIIYLVTVIGNLGMVILTYLDSK
:.:::::: :... : :: ::: .::..:..:. ::::.. :: .::.
CCDS31 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYVLTMAGNLGIITLTSVDSR
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pF1KE6 LHTPMYFFLRHLSITDLGYSTVIAPKMLVNFIVHKNTISYNWYATQLAFFEIFIISELFI
:..:::::::::.: .:: :::::::::.::.:.:.: :. ::::. : .::.::...
CCDS31 LQNPMYFFLRHLAIINLGNSTVIAPKMLMNFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMM
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pF1KE6 LSAMAYDRYVAICKPLLYVIIMAEKVLWVLVIVPYLYSTFVSLFLTIKLFKLSFCGSNII
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CCDS31 LAVMAYDRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSPCIFSVSYCSSNII
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pF1KE6 SYFYCDCIPLMSILCSDTNELELIILIFSGCNLLFSLSIVLISYMFILVAILRMNSRKGR
..:::: ::... :::: : :..: .. ::.::. ::.::. :...:::. : .::
CCDS31 NHFYCDIAPLLALSCSDTYIPETIVFISAATNLVFSMITVLVSYFNIVLSILRIRSPEGR
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pF1KE6 YKAFSTCSSHLTVVIMFYGTLLFIYLQPKSSHTLAIDKMASVFYTLLIPMLNPLIYSLRN
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CCDS31 KKAFSTCASHMIAVTVFYGTMLFMYLQPQTNHSLDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRN
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310
pF1KE6 KEVKDALKRTLTNRFKIPI
..:. :::. . :
CCDS31 NDVNVALKKFMENPCYSFKSM
300 310
>>CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 (316 aa)
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pF1KE6 MNHVVKHNHTAVTKVTEFILMGITDNPGLQAPLFGLFLIIYLVTVIGNLGMVILTYLDSK
:.:::::: :... : :: ::: .::..: .:. ::::.. :: .::.
CCDS31 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYGLTMAGNLGIITLTSVDSR
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pF1KE6 LHTPMYFFLRHLSITDLGYSTVIAPKMLVNFIVHKNTISYNWYATQLAFFEIFIISELFI
:.:::::::.::.. .:: :::::::::.::.:.:.: :. ::::. : .::.::...
CCDS31 LQTPMYFFLQHLALINLGNSTVIAPKMLINFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIM
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 LSAMAYDRYVAICKPLLYVIIMAEKVLWVLVIVPYLYSTFVSLFLTIKLFKLSFCGSNII
:. ::::::::::.::::........ .:: . :::. ... .. .:..:.:.::::
CCDS31 LALMAYDRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSSYVFSVSYCSSNII
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SYFYCDCIPLMSILCSDTNELELIILIFSGCNLLFSLSIVLISYMFILVAILRMNSRKGR
..:::: .::... :::: : ...: .. :.. :: :::.::. :...::.. : .::
CCDS31 NHFYCDNVPLLALSCSDTYLPETVVFISAATNVVGSLIIVLVSYFNIVLSILKICSSEGR
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 YKAFSTCSSHLTVVIMFYGTLLFIYLQPKSSHTLAID-KMASVFYTLLIPMLNPLIYSLR
::::::.::. .: .:::::::.:.::.:.:.: : :::::::::.::::::::::::
CCDS31 KKAFSTCASHMMAVTIFYGTLLFMYVQPRSNHSLDTDDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLR
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 NKEVKDALKRTLTNRFKIPI
::.:: ::.: .::
CCDS31 NKDVKTALQRFMTNLCYSFKTM
300 310
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1117 init1: 1096 opt: 1102 Z-score: 914.3 bits: 177.4 E(32554): 1.3e-44
Smith-Waterman score: 1102; 54.5% identity (81.6% similar) in 299 aa overlap (13-311:5-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNHVVKHNHTAVTKVTEFILMGITDNPGLQAPLFGLFLIIYLVTVIGNLGMVILTYLDSK
:.::::::.:.::.: :: ::: .::.:::.:..:::::. : :::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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310
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300 310
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CCDS31 GNLGMITLICLNSQLHTPMYYFLSNLSLMDLCYSSVITPKMLVNFVSEKNIISYAGCMSQ
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CCDS31 ILSSILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENVASVFYTT
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CCDS31 VIPMLNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF
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CCDS31 LHTPMYFFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYL
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CCDS31 LTAMAYDRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHII
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CCDS31 NHYFCDVLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGR
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CCDS31 SKAFGTCSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRN
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