FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6053, 318 aa
1>>>pF1KE6053 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7903+/-0.00117; mu= 13.2259+/- 0.068
mean_var=190.6651+/-67.638, 0's: 0 Z-trim(103.2): 422 B-trim: 436 in 1/46
Lambda= 0.092884
statistics sampled from 6751 (7286) to 6751 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 2.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 2120 297.5 9.4e-81
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 1636 232.6 3.1e-61
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 1541 219.9 2.1e-57
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 1529 218.2 6.4e-57
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 1438 206.1 3e-53
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 1438 206.1 3e-53
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 1313 189.3 3.3e-48
CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 ( 310) 1267 183.1 2.4e-46
CCDS5149.1 OR2A4 gene_id:79541|Hs108|chr6 ( 310) 1252 181.1 9.6e-46
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 987 145.7 5.1e-35
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 953 141.1 1.1e-33
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 938 139.1 4.5e-33
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 933 138.5 7.6e-33
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 932 138.3 7.8e-33
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 927 137.6 1.2e-32
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 922 136.9 2e-32
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 921 136.8 2.2e-32
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 921 136.8 2.2e-32
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 920 136.6 2.4e-32
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 920 136.6 2.4e-32
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 919 136.5 2.6e-32
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 918 136.4 2.9e-32
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 918 136.4 2.9e-32
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 916 136.1 3.5e-32
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 914 135.8 4.2e-32
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 913 135.8 4.8e-32
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 910 135.3 6e-32
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 909 135.2 6.6e-32
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 908 135.0 7.3e-32
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 907 134.9 8.1e-32
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 904 134.5 1.1e-31
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 901 134.1 1.4e-31
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 898 133.7 1.9e-31
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 896 133.4 2.2e-31
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 896 133.4 2.2e-31
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 893 133.0 2.9e-31
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 893 133.0 2.9e-31
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 893 133.1 3e-31
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 891 132.8 3.6e-31
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 890 132.6 3.9e-31
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 890 132.6 3.9e-31
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 889 132.5 4.3e-31
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 888 132.4 4.7e-31
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 887 132.2 5.1e-31
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 887 132.2 5.1e-31
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 887 132.2 5.1e-31
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 886 132.2 5.9e-31
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 884 131.8 6.8e-31
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 884 131.8 6.9e-31
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 884 131.9 7.1e-31
>>CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 (318 aa)
initn: 2120 init1: 2120 opt: 2120 Z-score: 1563.3 bits: 297.5 E(32554): 9.4e-81
Smith-Waterman score: 2120; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEGNQTWITDITLLGFQVGPALAILLCGLFSVFYTLTLLGNGVIFGIICLDSKLHTPMYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MEGNQTWITDITLLGFQVGPALAILLCGLFSVFYTLTLLGNGVIFGIICLDSKLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLSHLAIIDMSYASNNVPKMLANLMNQKRTISFVPCIMQTFLYLAFAVTECLILVVMSYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FLSHLAIIDMSYASNNVPKMLANLMNQKRTISFVPCIMQTFLYLAFAVTECLILVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 RYVAICHPFQYTVIMSWRVCTILVLTSWSCGFALSLVHEILLLRLPFCGPRDVNHLFCEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RYVAICHPFQYTVIMSWRVCTILVLTSWSCGFALSLVHEILLLRLPFCGPRDVNHLFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LSVLKLACADTWVNQVVIFATCVFVLVGPLSLILVSYMHILGAILKIQTKEGRIKAFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LSVLKLACADTWVNQVVIFATCVFVLVGPLSLILVSYMHILGAILKIQTKEGRIKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SSHLCVVGLFFGIAMVVYMVPDSNQREEQEKMLSLFHSVFNPMLNPLIYSLRNAQLKGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSHLCVVGLFFGIAMVVYMVPDSNQREEQEKMLSLFHSVFNPMLNPLIYSLRNAQLKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 HRALQRKRSMRTVYGLCL
::::::::::::::::::
CCDS43 HRALQRKRSMRTVYGLCL
310
>>CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1672 init1: 1636 opt: 1636 Z-score: 1212.8 bits: 232.6 E(32554): 3.1e-61
Smith-Waterman score: 1636; 77.3% identity (92.5% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEGNQTWITDITLLGFQVGPALAILLCGLFSVFYTLTLLGNGVIFGIICLDSKLHTPMYF
::::.:::::::: ::::::: ::::::::.::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS43 MEGNKTWITDITLPRFQVGPALEILLCGLFSAFYTLTLLGNGVIFGIICLDCKLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLSHLAIIDMSYASNNVPKMLANLMNQKRTISFVPCIMQTFLYLAFAVTECLILVVMSYD
:::::::.:.::::: :::::.:::::. :::: ::::::::::::: .:::::::::::
CCDS43 FLSHLAIVDISYASNYVPKMLTNLMNQESTISFFPCIMQTFLYLAFAHVECLILVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 RYVAICHPFQYTVIMSWRVCTILVLTSWSCGFALSLVHEILLLRLPFCGPRDVNHLFCEI
::. ::::..:. .:::::::.:...:: .: :.:: .:.: ::::::...::.::::
CCDS43 RYADICHPLRYNSLMSWRVCTVLAVASWVFSFLLALVPLVLILSLPFCGPHEINHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LSVLKLACADTWVNQVVIFATCVFVLVGPLSLILVSYMHILGAILKIQTKEGRIKAFSTC
::::::::::::.:::::::.:::.::::: :.::::..::.:::.::. ::: ::::::
CCDS43 LSVLKLACADTWLNQVVIFAACVFILVGPLCLVLVSYLRILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SSHLCVVGLFFGIAMVVYMVPDSNQREEQEKMLSLFHSVFNPMLNPLIYSLRNAQLKGAL
:::::::::::: :.:.::.: : . :::.:.::::.:.:::::::::::::::..::::
CCDS43 SSHLCVVGLFFGSAIVTYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 HRALQRKRSMRTVYGLCL
.:::...:
CCDS43 RRALRKERLT
310
>>CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 (311 aa)
initn: 1168 init1: 1168 opt: 1541 Z-score: 1144.0 bits: 219.9 E(32554): 2.1e-57
Smith-Waterman score: 1541; 71.9% identity (91.3% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEGNQTWITDITLLGFQVGPALAILLCGLFSVFYTLTLLGNGVIFGIICLDSKLHTPMYF
: ::::.:.. :::: .. . .:: ::::..:..::::::.:.:.: :::.:::::::
CCDS43 MTKNQTWVTEFILLGFPLSLRIQMLLSGLFSLLYVFTLLGNGAILGLIWLDSRLHTPMYF
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70 80 90 100 110
pF1KE6 FLSHLAIIDMSYASNNVPKMLANL-MNQKRTISFVPCIMQTFLYLAFAVTECLILVVMSY
:::::::::.:::::::::::.:: .:...::::::: ::::::.::: :::::::.:::
CCDS43 FLSHLAIIDISYASNNVPKMLTNLGLNKRKTISFVPCTMQTFLYMAFAHTECLILVMMSY
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pF1KE6 DRYVAICHPFQYTVIMSWRVCTILVLTSWSCGFALSLVHEILLLRLPFCGPRDVNHLFCE
:::.:::::.::.::: : :::.:..:::.:: :.::: .:.::::::::...::.:::
CCDS43 DRYMAICHPLQYSVIMRWGVCTVLAVTSWACGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 ILSVLKLACADTWVNQVVIFATCVFVLVGPLSLILVSYMHILGAILKIQTKEGRIKAFST
:::::::::::::.:::::::. ::.::::: :.:::: .::.:::.::. ::: :::::
CCDS43 ILSVLKLACADTWLNQVVIFAASVFILVGPLCLVLVSYSRILAAILRIQSGEGRRKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CSSHLCVVGLFFGIAMVVYMVPDSNQREEQEKMLSLFHSVFNPMLNPLIYSLRNAQLKGA
::::::.:::::: :.:.::.: : . :::.:.::::.:.:::::::::::::::..:::
CCDS43 CSSHLCMVGLFFGSAIVMYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 LHRALQRKRSMRTVYGLCL
:.:.: ..::
CCDS43 LKRVLWKQRSK
310
>>CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1529 init1: 1529 opt: 1529 Z-score: 1135.4 bits: 218.2 E(32554): 6.4e-57
Smith-Waterman score: 1529; 70.3% identity (91.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEGNQTWITDITLLGFQVGPALAILLCGLFSVFYTLTLLGNGVIFGIICLDSKLHTPMYF
::.::::::.. :::::: ::: ..: :.: .::.:::.:::.:.:.: :::.::::::
CCDS43 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMYV
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 FLSHLAIIDMSYASNNVPKMLANLMNQKRTISFVPCIMQTFLYLAFAVTECLILVVMSYD
:::::::.::::::..::::::::. .:..:::.:::.:::::::::.:::::::.: ::
CCDS43 FLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCYD
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 RYVAICHPFQYTVIMSWRVCTILVLTSWSCGFALSLVHEILLLRLPFCGPRDVNHLFCEI
::::::::.:::.::.:::::.:. : : .: :.::: :.::::::::. .::.::.:
CCDS43 RYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHFFCQI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LSVLKLACADTWVNQVVIFATCVFVLVGPLSLILVSYMHILGAILKIQTKEGRIKAFSTC
.::.::::::: .::::.:: .:.::::: :.::::.::: :::.::. ::: ::::::
CCDS43 MSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SSHLCVVGLFFGIAMVVYMVPDSNQREEQEKMLSLFHSVFNPMLNPLIYSLRNAQLKGAL
:::::::::::: :.:.::.: :.. .:..:.::::.:.:::.:::::::::::..::::
CCDS43 SSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 HRALQRKRSMRTVYGLCL
.:.: ..:::
CCDS43 KRVLWKQRSM
310
>>CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1437 init1: 1437 opt: 1438 Z-score: 1069.5 bits: 206.1 E(32554): 3e-53
Smith-Waterman score: 1438; 66.4% identity (87.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEGNQTWITDITLLGFQVGPALAILLCGLFSVFYTLTLLGNGVIFGIICLDSKLHTPMYF
: ::: .:.. :::: .:: . .:: ::::.:: .::::::.:.:.: :::.:::::::
CCDS56 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
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pF1KE6 FLSHLAIIDMSYASNNVPKMLANLMNQKRTISFVPCIMQTFLYLAFAVTECLILVVMSYD
::::::..:..:. :.::.:::::.. . :::. :. :::: :.:. .:::.::.::::
CCDS56 FLSHLAVVDIAYTRNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 RYVAICHPFQYTVIMSWRVCTILVLTSWSCGFALSLVHEILLLRLPFCGPRDVNHLFCEI
::::::::..:.:::.:::: :..:::.:: :.:.: .:.::::: ::...::.::::
CCDS56 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALAHVVLILRLPFSGPHEINHFFCEI
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 LSVLKLACADTWVNQVVIFATCVFVLVGPLSLILVSYMHILGAILKIQTKEGRIKAFSTC
::::.:::::::.:::::::.::: :::: ::.:::: :::.:::.::. ::: ::::::
CCDS56 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
190 200 210 220 230 240
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pF1KE6 SSHLCVVGLFFGIAMVVYMVPDSNQREEQEKMLSLFHSVFNPMLNPLIYSLRNAQLKGAL
:::::::::::: :...::.: : . :::.:.. ::.: ::: ::::::::::...::::
CCDS56 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 HRALQRKRSMRTVYGLCL
.::: ..
CCDS56 RRALGKESHS
310
>>CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1437 init1: 1437 opt: 1438 Z-score: 1069.5 bits: 206.1 E(32554): 3e-53
Smith-Waterman score: 1438; 66.4% identity (87.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEGNQTWITDITLLGFQVGPALAILLCGLFSVFYTLTLLGNGVIFGIICLDSKLHTPMYF
: ::: .:.. :::: .:: . .:: ::::.:: .::::::.:.:.: :::.:::::::
CCDS43 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 FLSHLAIIDMSYASNNVPKMLANLMNQKRTISFVPCIMQTFLYLAFAVTECLILVVMSYD
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250 260 270 280 290 300
310
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.::: ..
CCDS43 RRALGKESHS
310
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10 20 30 40 50 60
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CCDS55 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
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CCDS55 FSHLCVIGLFYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
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310
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CCDS55 KRVLGVERAL
310
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CCDS51 MGDNITSIREFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
10 20 30 40 50 60
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CCDS51 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
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CCDS51 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
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CCDS51 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFRTC
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CCDS51 FSHLCVIGLVYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
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CCDS51 KRVLGVERAL
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10 20 30
pF1KE6 MEGNQTWITDITLLGFQVGPALAILLCGLF
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CCDS31 INSHVVILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSSTDFTFMGLFNRKETSGLIFAII
30 40 50 60 70 80
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CCDS31 SIIFFTALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLDQRT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]