Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6049
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6049, 318 aa
1>>>pF1KE6049 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6016+/-0.00123; mu= 14.5152+/- 0.072
mean_var=202.6622+/-71.001, 0's: 0 Z-trim(103.1): 454 B-trim: 384 in 1/49
Lambda= 0.090092
statistics sampled from 6661 (7237) to 6661 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 1.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 2029 277.3 1.1e-74
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 2022 276.4 2.1e-74
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 1390 194.2 1.1e-49
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 1389 194.1 1.2e-49
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 1376 192.5 4.2e-49
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 1284 180.4 1.6e-45
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1267 178.2 7.4e-45
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1255 176.7 2.2e-44
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1212 171.1 1e-42
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1164 164.9 8.5e-41
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 1099 156.4 2.7e-38
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1082 154.2 1.3e-37
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1070 152.7 3.9e-37
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 1061 151.4 8.3e-37
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1059 151.2 1e-36
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1055 150.7 1.4e-36
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 1050 150.0 2.3e-36
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1037 148.3 7.3e-36
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1035 148.1 8.7e-36
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1034 147.9 9.5e-36
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1022 146.4 2.8e-35
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 982 141.2 1e-33
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 973 140.0 2.4e-33
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 956 137.8 1.1e-32
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 955 137.7 1.2e-32
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 953 137.4 1.4e-32
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 944 136.2 3.2e-32
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 938 135.4 5.4e-32
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 926 133.9 1.6e-31
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 900 130.5 1.7e-30
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 885 128.6 6.4e-30
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 876 127.4 1.4e-29
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 873 127.0 1.9e-29
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 854 124.5 1e-28
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 840 122.8 4e-28
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 839 122.6 4.2e-28
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 835 122.1 6e-28
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 834 121.9 6.4e-28
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 834 121.9 6.4e-28
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 831 121.6 8.4e-28
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 829 121.3 1e-27
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 829 121.3 1e-27
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 827 121.0 1.2e-27
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 825 120.8 1.4e-27
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 823 120.5 1.7e-27
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 822 120.4 1.9e-27
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 821 120.3 2.1e-27
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 817 119.7 2.9e-27
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 815 119.5 3.5e-27
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 814 119.3 3.9e-27
>>CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 (318 aa)
initn: 2029 init1: 2029 opt: 2029 Z-score: 1454.1 bits: 277.3 E(32554): 1.1e-74
Smith-Waterman score: 2029; 97.8% identity (99.1% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS31 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFHLTLAGAEVFLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AAMAYDRYAAVCRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWALGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AAMAYDRYAAVCRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWVLGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SFSCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGRR
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SFFCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KALATCFSHMIIVLLFFGASFYTYMLPSSYHTAEQDVMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLRNK
:::::: ::::::::.:::::::::: :::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS31 KALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLRSSYHTAEQDMMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLRNK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 DVTRALRSMMQSRMNQEK
::::::::::::::::::
CCDS31 DVTRALRSMMQSRMNQEK
310
>>CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 (318 aa)
initn: 2022 init1: 2022 opt: 2022 Z-score: 1449.2 bits: 276.4 E(32554): 2.1e-74
Smith-Waterman score: 2022; 97.2% identity (98.7% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AAMAYDRYAAVCRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWALGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AAMAYDRYAAVCRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWVLGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SFSCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGRR
:: :::::::::::::::::: : :::::::::.::::::::::::::::::::::::.:
CCDS31 SFFCETPALLKLSCSDVSLYKTLMYLCCILMLLAPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGHR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KALATCFSHMIIVLLFFGASFYTYMLPSSYHTAEQDVMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLRNK
:::::: ::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS31 KALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLPSSYHTAEQDMMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLRNK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 DVTRALRSMMQSRMNQEK
::::::::::::::::::
CCDS31 DVTRALRSMMQSRMNQEK
310
>>CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 (315 aa)
initn: 1404 init1: 1379 opt: 1390 Z-score: 1005.3 bits: 194.2 E(32554): 1.1e-49
Smith-Waterman score: 1390; 66.4% identity (84.9% similar) in 304 aa overlap (10-313:9-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
:.:. :: : ::: .::: ::: .: :..:: ::.:::.:::::: . .:
CCDS55 MANITRMANHTGRLDFILMGLFRQSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
:.:::::::::.:::. :. :::::::. :: : . .: ::.:::.::::::.: :::
CCDS55 HSPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AAMAYDRYAAVCRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWALGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
:.::::::.:.:.::.::.:::.::: .:.:.:: :: :::..:::::::::::.: .:
CCDS55 ATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SFSCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGRR
: ::.::. :::::.:::. : ::::.:::: :. .::::: ::: .:::::: ::.
CCDS55 HFFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KALATCFSHMIIVLLFFGASFYTYMLPSSYHTAEQDVMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLRNK
::.::: ::. .:.::.::. ::::::::::: :.:.:::.::::.::::::::::::::
CCDS55 KAFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 DVTRALRSMMQSRMNQEK
:: ::..:. :
CCDS55 DVMGALKKMLTVRFVL
300 310
>>CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 (315 aa)
initn: 1402 init1: 1377 opt: 1389 Z-score: 1004.6 bits: 194.1 E(32554): 1.2e-49
Smith-Waterman score: 1389; 66.4% identity (85.2% similar) in 304 aa overlap (10-313:9-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
:.:.. :: : ::: .::: ::: .: :..:: ::.:::.:::::: . .:
CCDS31 MANITRMANHTGKLDFILMGLFRRSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
:.:::::::::.:::. :. :::::::. :: : . .: ::.:::.::::::.: :::
CCDS31 HSPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AAMAYDRYAAVCRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWALGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
:.::::::.:.:.::.::.:::.::: .:.:.:: :: :::..:::::::::::.: .:
CCDS31 ATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SFSCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGRR
: ::.::. :::::.:::. : ::::.:::: :. .::::: ::: .:::::: ::.
CCDS31 HFFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KALATCFSHMIIVLLFFGASFYTYMLPSSYHTAEQDVMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLRNK
::.::: ::. .:.::.::. ::::::::::: :.:.:::.::::.::::::::::::::
CCDS31 KAFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 DVTRALRSMMQSRMNQEK
:: ::..:. :
CCDS31 DVMGALKKMLTVRFVL
300 310
>>CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 (348 aa)
initn: 1454 init1: 1365 opt: 1376 Z-score: 995.1 bits: 192.5 E(32554): 4.2e-49
Smith-Waterman score: 1376; 66.8% identity (86.4% similar) in 301 aa overlap (10-310:37-337)
10 20 30
pF1KE6 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLL
:.:. .:: : ::: .::: ::: .: :..
CCDS31 MASHTGWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLCVVIFVV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 FLMALTGNALLILLIHSEPRLHTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISP
:::::.:::.:::::: . .::::::::::::.:::. :. :::::::. :: : . ::
CCDS31 FLMALSGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKISA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 SGCGIQMFFYLTLAGAEVFLLAAMAYDRYAAVCRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWALGMV
::.:::::.::::.: ::::.::::::.:.:.::.::.:::.::: .: :.:: :: :
CCDS31 PECGMQMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGCWFLGSV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 DGLLLTPITMSFPFCQSRKILSFSCETPALLKLSCSDVSLYKMLTYLCCILMLLTPIMVI
::. .:::::.::: ::.: : ::.::.:.:::::.:::... ::::.:::: :...:
CCDS31 DGFTFTPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLLIPVVII
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 SSSYTLILHLIHRMNSAAGRRKALATCFSHMIIVLLFFGASFYTYMLPSSYHTAEQDVMV
:::: ::: :: :::: ::.::.::: ::. .:.::.::..::::::::::: :.:.::
CCDS31 SSSYLLILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTPEKDMMV
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KE6 SAFYTIFTPVLNPLIYSLRNKDVTRALRSMMQSRMNQEK
:.::::.:::.:::::::::::: ::..:.
CCDS31 SVFYTILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVEPAFQKAME
310 320 330 340
>>CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1328 init1: 1284 opt: 1284 Z-score: 930.9 bits: 180.4 E(32554): 1.6e-45
Smith-Waterman score: 1284; 62.1% identity (83.7% similar) in 301 aa overlap (10-310:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
::: . :: : :.:.. .: . : . : .::::.. : :::::: . :
CCDS31 MRLANQTLGGDFFLLGIFSQISHPGRLCLLIFSIFLMAVSWNITLILLIHIDSSL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
::::::::.::.:.:: :. ::::::::.:.. : ::: ::: ::.::: :.::: ::
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310
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CCDS31 KAFATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNK
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CCDS31 DVAAALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
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CCDS31 MEQSNYSVYADFILLGLFSNARFPWLLFALILLVFLTSIASNVVKIILIHIDSRL
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CCDS31 GLMSYDRYVAICNPLHYPVLMSRKICWLIVAAAWLGGSIDGFLLTPVTMQFPFCASREIN
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CCDS31 DVTGALQKVVGRCVSSGKVTTF
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10 20 30
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CCDS31 LTINSHVVILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYN-TSSTDFTFMGLFNRKETSGLIF
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CCDS31 AIISIIFFTALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]