Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6047
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6047, 318 aa
1>>>pF1KE6047 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8994+/-0.00113; mu= 12.4769+/- 0.066
mean_var=127.5232+/-38.705, 0's: 0 Z-trim(104.2): 371 B-trim: 886 in 2/46
Lambda= 0.113574
statistics sampled from 7321 (7771) to 7321 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 2.160
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 2076 352.1 3.4e-97
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 1783 304.1 1.1e-82
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 1681 287.3 1e-77
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 1638 280.3 1.4e-75
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 1128 196.7 2e-50
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 1117 194.9 6.9e-50
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 856 152.2 5.1e-37
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 851 151.3 9e-37
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 822 146.6 2.5e-35
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 814 145.3 6.1e-35
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 812 145.0 7.5e-35
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 812 145.0 7.6e-35
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 803 143.5 2.1e-34
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 799 142.8 3.4e-34
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 795 142.2 5.3e-34
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 791 141.5 8.3e-34
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 790 141.4 9.4e-34
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 781 139.9 2.6e-33
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 777 139.2 4e-33
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 768 137.7 1.1e-32
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 765 137.3 1.6e-32
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 761 136.6 2.5e-32
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 753 135.3 6.2e-32
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 748 134.5 1.1e-31
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 743 133.7 2e-31
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 737 132.7 4e-31
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 734 132.2 5.4e-31
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 732 131.8 6.6e-31
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 728 131.2 1.1e-30
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 728 131.2 1.1e-30
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 727 131.0 1.2e-30
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 726 130.9 1.4e-30
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 720 129.9 2.6e-30
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 720 129.9 2.6e-30
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 716 129.2 4.1e-30
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 709 128.1 9e-30
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 708 127.9 1e-29
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 688 124.6 9.8e-29
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 687 124.5 1.1e-28
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 684 124.0 1.7e-28
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 679 123.2 2.7e-28
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 667 121.2 1.1e-27
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 657 119.6 3.3e-27
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 649 118.3 8.4e-27
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 637 116.3 3.3e-26
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 631 115.3 6.5e-26
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 625 114.3 1.3e-25
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 615 112.7 4.2e-25
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 603 110.7 1.5e-24
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 589 108.4 7.5e-24
>>CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 2076 init1: 2076 opt: 2076 Z-score: 1858.4 bits: 352.1 E(32554): 3.4e-97
Smith-Waterman score: 2076; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MIQPMASPSNSSTVPVSEFLLICFPNFQSWQHWLSLPLSLLFLLAMGANTTLLITIQLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MIQPMASPSNSSTVPVSEFLLICFPNFQSWQHWLSLPLSLLFLLAMGANTTLLITIQLEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SLHQPLYYLLSLLSLLDIVLCLTVIPKVLAIFWYDLRSISFPACFLQMFIMNSFLPMESC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SLHQPLYYLLSLLSLLDIVLCLTVIPKVLAIFWYDLRSISFPACFLQMFIMNSFLPMESC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TFMVMAYDRYVAICHPLRYPSIITNQFVAKASVFIVVRNALLTAPIPILTSLLHYCGENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TFMVMAYDRYVAICHPLRYPSIITNQFVAKASVFIVVRNALLTAPIPILTSLLHYCGENV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IENCICANLSVSRLSCDNFTLNRIYQFVAGWTLLGSDLFLIFLSYTFILRAVLRFKAEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IENCICANLSVSRLSCDNFTLNRIYQFVAGWTLLGSDLFLIFLSYTFILRAVLRFKAEGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AVKALSTCGSHFILILFFSTILLVVVLTNVARKKVPMDILILLNVLHHLIPPALNPIVYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AVKALSTCGSHFILILFFSTILLVVVLTNVARKKVPMDILILLNVLHHLIPPALNPIVYG
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 VRTKEIKQGIQKLLQRGR
::::::::::::::::::
CCDS31 VRTKEIKQGIQKLLQRGR
310
>>CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 (365 aa)
initn: 1844 init1: 1783 opt: 1783 Z-score: 1598.2 bits: 304.1 E(32554): 1.1e-82
Smith-Waterman score: 1783; 83.3% identity (97.4% similar) in 312 aa overlap (5-316:53-364)
10 20 30
pF1KE6 MIQPMASPSNSSTVPVSEFLLICFPNFQSWQHWL
::::::.::.::::::::::::::::::::
CCDS31 TTSRMYFLCFCTSLLRFKVHWVSRLIRKLYMASPSNDSTAPVSEFLLICFPNFQSWQHWL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 SLPLSLLFLLAMGANTTLLITIQLEASLHQPLYYLLSLLSLLDIVLCLTVIPKVLAIFWY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS31 SLPLSLLFLLAMGANTTLLITIQLEASLHQPLYYLLSLLSLLDIVLCLTVIPKVLAIFWF
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 DLRSISFPACFLQMFIMNSFLPMESCTFMVMAYDRYVAICHPLRYPSIITNQFVAKASVF
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::.::::.: ::
CCDS31 DLRSISFPACFLQMFIMNSFLTMESCTFMVMAYDRYVAICHPLRYPSIITDQFVARAVVF
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 IVVRNALLTAPIPILTSLLHYCGENVIENCICANLSVSRLSCDNFTLNRIYQFVAGWTLL
...:::... :.:.:.. :.::. :.:.::::.:::::.::::..:.:..::::::::::
CCDS31 VIARNAFVSLPVPMLSARLRYCAGNIIKNCICSNLSVSKLSCDDITFNQLYQFVAGWTLL
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 GSDLFLIFLSYTFILRAVLRFKAEGAAVKALSTCGSHFILILFFSTILLVVVLTNVARKK
::::.:: .::.:::..:::.:::::..::::::::::::::::::.:::.:.::.:::.
CCDS31 GSDLILIVISYSFILKVVLRIKAEGAVAKALSTCGSHFILILFFSTVLLVLVITNLARKR
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310
pF1KE6 VPMDILILLNVLHHLIPPALNPIVYGVRTKEIKQGIQKLLQRGR
.: :. ::::.::::::::::::::::::::::::::.::.:
CCDS31 IPPDVPILLNILHHLIPPALNPIVYGVRTKEIKQGIQNLLKRL
330 340 350 360
>>CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1723 init1: 1677 opt: 1681 Z-score: 1508.7 bits: 287.3 E(32554): 1e-77
Smith-Waterman score: 1681; 79.5% identity (94.6% similar) in 312 aa overlap (5-316:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MIQPMASPSNSSTVPVSEFLLICFPNFQSWQHWLSLPLSLLFLLAMGANTTLLITIQLEA
:. :::.:: :: ::.:::::.:::::::::::::::::::::::.:::::: :::
CCDS73 MTLPSNNSTSPVFEFFLICFPSFQSWQHWLSLPLSLLFLLAMGANATLLITIYLEA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SLHQPLYYLLSLLSLLDIVLCLTVIPKVLAIFWYDLRSISFPACFLQMFIMNSFLPMESC
:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::: ::::
CCDS73 SLHQPLYYLLSLLSLLDIVLCLTVIPKVLAIFWFDLRSISFPACFLQVFIMNSFLTMESC
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TFMVMAYDRYVAICHPLRYPSIITNQFVAKASVFIVVRNALLTAPIPILTSLLHYCGENV
:::.::::::::::.::.: ::::.::::.:..:.:.::.::: :::::.: :.::. ..
CCDS73 TFMIMAYDRYVAICKPLQYSSIITDQFVARAAIFVVARNGLLTMPIPILSSRLRYCAGHI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IENCICANLSVSRLSCDNFTLNRIYQFVAGWTLLGSDLFLIFLSYTFILRAVLRFKAEGA
:.::::.:.:::.::::..:::. :::: :::::::::.:: ::: :::..:::.:.::
CCDS73 IKNCICTNVSVSKLSCDDITLNQSYQFVIGWTLLGSDLILIVLSYFFILKTVLRIKGEGD
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AVKALSTCGSHFILILFFSTILLVVVLTNVARKKVPMDILILLNVLHHLIPPALNPIVYG
.:::.::::::::::::.:.:::.:.::.:::..: :. ::::.:::::::::::::::
CCDS73 MAKALGTCGSHFILILFFTTVLLVLVITNLARKRIPPDVPILLNILHHLIPPALNPIVYG
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 VRTKEIKQGIQKLLQRGR
:::::::::::.::.:
CCDS73 VRTKEIKQGIQNLLRRL
300 310
>>CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1662 init1: 1627 opt: 1638 Z-score: 1470.6 bits: 280.3 E(32554): 1.4e-75
Smith-Waterman score: 1638; 77.7% identity (93.3% similar) in 314 aa overlap (5-317:1-314)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MIQPMASPSNSS-TVPVSEFLLICFPNFQSWQHWLSLPLSLLFLLAMGANTTLLITIQLE
:.. :.. .. .:.::: :: :::::::::::::::::.:::::::.:: ::
CCDS41 MTTHRNDTLSTEASDFLLNCFVRSPSWQHWLSLPLSLLFLLAVGANTTLLMTIWLE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 ASLHQPLYYLLSLLSLLDIVLCLTVIPKVLAIFWYDLRSISFPACFLQMFIMNSFLPMES
::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::: ::::::::::.::: :: :::
CCDS41 ASLHQPLYYLLSLLSLLDIVLCLTVIPKVLTIFWFDLRPISFPACFLQMYIMNCFLAMES
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 CTFMVMAYDRYVAICHPLRYPSIITNQFVAKASVFIVVRNALLTAPIPILTSLLHYCGEN
:::::::::::::::::::::::::..::.::..::..::.:.: :::::.. :.:::.:
CCDS41 CTFMVMAYDRYVAICHPLRYPSIITDHFVVKAAMFILTRNVLMTLPIPILSAQLRYCGRN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 VIENCICANLSVSRLSCDNFTLNRIYQFVAGWTLLGSDLFLIFLSYTFILRAVLRFKAEG
:::::::::.::::::::. :.:..:::..:::::::::.:::::::::::::::.::::
CCDS41 VIENCICANMSVSRLSCDDVTINHLYQFAGGWTLLGSDLILIFLSYTFILRAVLRLKAEG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 AAVKALSTCGSHFILILFFSTILLVVVLTNVARKKVPMDILILLNVLHHLIPPALNPIVY
:..::::::::::.::::::::::: :::.::.::: :. .:::::::.:: :::::.:
CCDS41 AVAKALSTCGSHFMLILFFSTILLVFVLTHVAKKKVSPDVPVLLNVLHHVIPAALNPIIY
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 GVRTKEIKQGIQKLLQRGR
::::.:::::.:.::..:
CCDS41 GVRTQEIKQGMQRLLKKGC
300 310
>>CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 (319 aa)
initn: 957 init1: 932 opt: 1128 Z-score: 1018.9 bits: 196.7 E(32554): 2e-50
Smith-Waterman score: 1128; 51.0% identity (84.0% similar) in 312 aa overlap (7-318:6-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MIQPMASPSNSSTVPVSEFLLICFPNFQSWQHWLSLPLSLLFLLAMGANTTLLITIQLEA
: . .:.. .:.:.:. .:... :::::::::.::.:::.::: ..:::: :.
CCDS31 MDTSTSVTYDSSLQISQFILMGLPGIHEWQHWLSLPLTLLYLLALGANLLIIITIQHET
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SLHQPLYYLLSLLSLLDIVLCLTVIPKVLAIFWYDLRSISFPACFLQMFIMNSFLPMESC
::.:.:.::..:...:: : :..::.:::::.: ..::.: :: :.. .. :. .::
CCDS31 VLHEPMYHLLGILAVVDIGLATTIMPKILAIFWFDAKAISLPMCFAQIYAIHCFFCIESG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TFMVMAYDRYVAICHPLRYPSIITNQFVAKASVFIVVRNALLTAPIPILTSLLHYCGENV
:. :: :::.:::.::.::::.:. :: ::. ::..::.::: :.:::.. :::..:
CCDS31 IFLCMAVDRYIAICRPLQYPSIVTKAFVFKATGFIMLRNGLLTIPVPILAAQRHYCSRNE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IENCICANLSVSRLSCDNFTLNRIYQFVAGWTLLGSDLFLIFLSYTFILRAVLRFKAEGA
::.:.:.::.: :.::..:.:..::.. .:.:.:::. :.: ::. ::..:::... :
CCDS31 IEHCLCSNLGVISLACDDITVNKFYQLMLAWVLVGSDMALVFSSYAVILHSVLRLNSAEA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AVKALSTCGSHFILILFFSTILLVVVLTNVARKKVPMDILILLNVLHHLIPPALNPIVYG
::::::.::.::::: . :. :. .:..:.::.:. : ..:::::..:::::::.. .
CCDS31 MSKALSTCSSHLILILFHTGII-VLSVTHLAEKKIPL-IPVFLNVLHNVIPPALNPLACA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 VRTKEIKQGIQKLLQRGR
.: .... :.:.:: :.
CCDS31 LRMHKLRLGFQRLLGLGQDVSK
300 310
>>CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1135 init1: 982 opt: 1117 Z-score: 1009.1 bits: 194.9 E(32554): 6.9e-50
Smith-Waterman score: 1117; 52.6% identity (82.7% similar) in 306 aa overlap (9-314:11-315)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MIQPMASPSNSSTVPVSEFLLICFPNFQSWQHWLSLPLSLLFLLAMGANTTLLITIQL
:::: ::::.:. ::...::::::::::.::.: :..::: .:: :
CCDS31 MNHMSASLKISNSSKFQVSEFILLGFPGIHSWQHWLSLPLALLYLSALAANTLILIIIWQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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