FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6046, 318 aa
1>>>pF1KE6046 318 - 318 aa - 318 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8948+/-0.000488; mu= 18.3503+/- 0.030
mean_var=128.3119+/-39.580, 0's: 0 Z-trim(108.8): 344 B-trim: 1053 in 1/52
Lambda= 0.113225
statistics sampled from 16332 (16886) to 16332 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 6.690
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1114 194.1 3e-49
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 871 154.5 2.7e-37
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 866 153.6 4.8e-37
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 865 153.5 5.4e-37
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 853 151.5 2.1e-36
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XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 853 151.5 2.1e-36
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 840 149.4 9.1e-36
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 839 149.2 1e-35
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 839 149.2 1e-35
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 839 149.2 1e-35
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 835 148.6 1.6e-35
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 831 147.9 2.5e-35
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 825 146.9 4.9e-35
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 817 145.6 1.2e-34
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 797 142.4 1.2e-33
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 791 141.4 2.3e-33
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 788 140.9 3.3e-33
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 778 139.3 1e-32
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 763 136.8 5.7e-32
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 531 98.9 1.4e-20
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 491 92.4 1.3e-18
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 210 46.6 9.2e-05
XP_005264366 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 209 46.4 0.00011
XP_011531136 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 209 46.4 0.00011
XP_006712078 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 389) 209 46.5 0.00011
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XP_016859579 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 209 46.6 0.00012
XP_016859578 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 614) 209 46.8 0.00014
XP_011531130 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 674) 209 46.8 0.00015
NP_000224 (OMIM: 152790,176410,238320) lutropin-ch ( 699) 209 46.8 0.00015
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 202 45.4 0.00025
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 202 45.4 0.00025
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 202 45.4 0.00025
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 202 45.4 0.00025
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 202 45.4 0.00025
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 199 44.8 0.00033
XP_011531038 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 431) 196 44.4 0.0005
XP_011531037 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 431) 196 44.4 0.0005
XP_011531036 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 618) 196 44.6 0.00061
NP_852111 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) foll ( 669) 196 44.7 0.00064
NP_000136 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) foll ( 695) 196 44.7 0.00066
NP_001006633 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 194 44.1 0.00066
NP_001006629 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 194 44.1 0.00066
NP_001006630 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 194 44.1 0.00066
XP_011514071 (OMIM: 118493) PREDICTED: muscarinic ( 466) 194 44.1 0.00066
NP_001006632 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 194 44.1 0.00066
NP_001006627 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 194 44.1 0.00066
NP_001006628 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 194 44.1 0.00066
NP_000730 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholine ( 466) 194 44.1 0.00066
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1114 init1: 1114 opt: 1114 Z-score: 1005.1 bits: 194.1 E(85289): 3e-49
Smith-Waterman score: 1114; 53.2% identity (82.4% similar) in 301 aa overlap (5-305:3-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
:..... ::::::.. ... ..:.:: ..:..:::: .:::: .:..: : . ::
NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMY
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:.:.:: .:::: :::: ::::::.. :.:::.:. .:: . .:::::::. .:.:.::
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. :..:::::: .:::....:.:.. :. : .:: ::...: ::.:: :.: ::::::
NP_001 LNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTC
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.:::.:: :.:::::.:: :: :.:.::::...::..:::::: ::::.: .. :..:
NP_001 VSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 LWRRKKDPIGPLEHRPLH
: ::
NP_001 LCSRKDISGDK
300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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Smith-Waterman score: 871; 42.9% identity (75.6% similar) in 303 aa overlap (5-302:8-310)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHT
: :. . :.:.:.:. .:. :.:.: :.::..:::.:... : ::::
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE6 TMYFLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTV
:::.:.::::::.::.. . :..::.: . . :::..::. ::.: .: . ::.:
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pF1KE6 MAYDRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNF
:.:::: :. .:::::..:. : :: .::::.:: .: .. ..:. .:.:: ..:.:
NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 YCDVPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALL-VMLRSHSREGRSKA
.:.:: :..:.:.:: : :: .. .... .:. ....: :: :.. ..:: .: : .:.
NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LSTCASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMD--KAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEV
..::..:. .:.:.:.: . .: .: .: : ....::.::: ::: ::::::: :
NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 IMAMKKL--WRRKKDPIGPLEHRPLH
:.:.: :
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 866; 42.2% identity (74.2% similar) in 306 aa overlap (5-307:7-312)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTT
:.. :. :.:::. ::..:.: .: ..: . ..::. ..... ::::.:
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE6 MYFLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVM
:::.:.::::.:.:: : .:.:::..:: : .::. :: :..:: .. . :.:..:
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pF1KE6 AYDRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFY
:::::.:: .:: ::..:.. .: :.. :..:: . :.:. .... : .: . ...:.
NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE6 CDVPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYT-ALLVMLRSHSREGRSKAL
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pF1KE6 STCASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTF-P-MDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVI
::::::.. ::. ...:.:: . : :: .::.::: :.::: ::.::::.:
NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310
pF1KE6 MAMKKLWRRKKDPIGPLEHRPLH
: .:. : : :
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 855 init1: 585 opt: 865 Z-score: 785.2 bits: 153.5 E(85289): 5.4e-37
Smith-Waterman score: 865; 42.7% identity (75.1% similar) in 309 aa overlap (1-306:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
:. :..... ::::::... ::....: : ..: .::.::: ..... : .::: ::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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pF1KE6 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
:.:.::::.: : :. .:.::.:::: . ::::.::. :..:: .. . .:. .:::
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pF1KE6 DRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYCD
::: :: .:: :.:::..:: . :.....:... .:. . . .: :: . . .:.::
NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KE6 VPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALLVMLRS-HSREGRSKALST
: :.::.:.::.. : . :. . .::.:.::. .: . : :: ::: .:.::
NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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pF1KE6 CASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPM--DKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIMA
::::.... :... :::.: :: .. . ::..::.::.: ::::: ::.::.::: :
NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 MKKLWRRKKDPIGPLEHRPLH
. .. ::.
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 840 init1: 633 opt: 853 Z-score: 774.6 bits: 151.5 E(85289): 2.1e-36
Smith-Waterman score: 853; 44.5% identity (74.0% similar) in 308 aa overlap (1-304:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
:. .:.:.:. :.:::::. . . ..:. : ..:. ::.:::::.. :. : ::: ::
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pF1KE6 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFF-FHFIGGIKIFLLTVMA
:.:.::::.:.:.: :.:.::.. . . :::: :::::..: : :. . :::.:::
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVD-MDNFLLAVMA
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pF1KE6 YDRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYC
::...:. .::::: :.. .::::.:. :: . .. ... : : ::. . . .:.:
NP_036 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
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pF1KE6 DVPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALL-VMLRSHSREGRSKALS
:: :.::.:.:: . :....:...:: . :: .:.:: . ..:. : .:: ::.:
NP_036 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
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pF1KE6 TCASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMDK--AVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIM
::.::.::: :.. : :: :. . .: ..::::.::::::: ::.:::. .
NP_036 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
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pF1KE6 AMKKLWRRKKDPIGPLEHRPLH
:.::. :
NP_036 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 853; 44.5% identity (74.0% similar) in 308 aa overlap (1-304:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE6 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFF-FHFIGGIKIFLLTVMA
:.:.::::.:.:.: :.:.::.. . . :::: :::::..: : :. . :::.:::
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVD-MDNFLLAVMA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YDRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYC
::...:. .::::: :.. .::::.:. :: . .. ... : : ::. . . .:.:
XP_011 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DVPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALL-VMLRSHSREGRSKALS
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XP_011 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMDK--AVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIM
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XP_011 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 AMKKLWRRKKDPIGPLEHRPLH
:.::. :
XP_011 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 840 init1: 633 opt: 853 Z-score: 774.5 bits: 151.5 E(85289): 2.1e-36
Smith-Waterman score: 853; 44.5% identity (74.0% similar) in 308 aa overlap (1-304:11-317)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVT
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE6 SDPHLHTTMYFLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFF-FHFIGG
: ::: :::.:.::::.:.:.: :.:.::.. . . :::: :::::..: : :.
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVD-
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 IKIFLLTVMAYDRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFC
. :::.:::::...:. .::::: :.. .::::.:. :: . .. ... : : ::
XP_011 MDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFC
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 GPDKLDNFYCDVPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALL-VMLRSH
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XP_011 ADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 SREGRSKALSTCASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMDK--AVSVLYTIVTPMLNPAI
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XP_011 STKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFI
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE6 YTLRNKEVIMAMKKLWRRKKDPIGPLEHRPLH
:.:::. . :.::. :
XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 788 init1: 622 opt: 840 Z-score: 763.1 bits: 149.4 E(85289): 9.1e-36
Smith-Waterman score: 840; 42.2% identity (74.4% similar) in 308 aa overlap (1-304:1-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQV-WELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTM
: .: .... :.:...:.. :.. ..: .: ..:..:. :: ::.... .:: ::. :
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YFLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMA
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YDRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYC
::::.:: .:::: .:::: . : : :::: :: . :: . ...:::: .:...:.:
NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DVPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALLV-MLRSHSREGRSKALS
: : ..::.:.:: ..:. . .. ::... :..: ::: . . .:. : .:. ::.:
NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCASHIAVVTLIFVPCIYVYTRP-FRTFPMDKAV-SVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIM
::.::. ::.:... .: : . : .: . :. ::.::::::: ::.:::.::
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 AMKKLWRRKKDPIGPLEHRPLH
:... ...
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 828 init1: 569 opt: 839 Z-score: 762.2 bits: 149.2 E(85289): 1e-35
Smith-Waterman score: 839; 44.8% identity (73.1% similar) in 308 aa overlap (1-303:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
:.: :::..: :.. ..:..:. .:. . .: : .: .:::: .:::.. ::.::::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYCD
:::.:. . :.:. ::. .:: : .:::.::: : :: :.:.:::.: .:.. :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 VPQLIKLACTDTFVLEL-LMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALLVMLRSHSREGRSKALST
. ...:::.:: :. .:::. :. ::::. . ..:. .:::::.::. :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFP---MDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIM
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSS-PSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 AMKKL-WRRKKDPIGPLEHRPLH
: .:: :.
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 828 init1: 569 opt: 839 Z-score: 762.2 bits: 149.2 E(85289): 1e-35
Smith-Waterman score: 839; 44.8% identity (73.1% similar) in 308 aa overlap (1-303:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
:. :.. :. :.:::::. :. : .:..: ..: .::.:: :::... : .::: ::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
:.: :::..: :.. ..:..:. .:. . .: : .: .:::: .:::.. ::.::::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYCD
:::.:. . :.:. ::. .:: : .:::.::: : :: :.:.:::.: .:.. :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 VPQLIKLACTDTFVLEL-LMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALLVMLRSHSREGRSKALST
. ...:::.:: :. .:::. :. ::::. . ..:. .:::::.::. :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFP---MDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIM
::::..::.: . :..: .: . : ..: ::.:.:.:::::: ::.::::::
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSS-PSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 AMKKL-WRRKKDPIGPLEHRPLH
: .:: :.
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]