Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6038
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6038, 317 aa
1>>>pF1KE6038 317 - 317 aa - 317 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7331+/-0.000448; mu= 19.3818+/- 0.028
mean_var=96.7363+/-24.486, 0's: 0 Z-trim(110.6): 300 B-trim: 1158 in 1/49
Lambda= 0.130401
statistics sampled from 18602 (18971) to 18602 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 6.200
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 1175 231.9 1.3e-60
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 1164 229.8 5.6e-60
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 1140 225.3 1.2e-58
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 1112 220.0 4.9e-57
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 923 184.5 2.5e-46
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 907 181.5 2e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 902 180.5 3.9e-45
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 902 180.5 3.9e-45
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 902 180.5 3.9e-45
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 902 180.5 3.9e-45
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 891 178.5 1.6e-44
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 885 177.3 3.5e-44
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 875 175.4 1.3e-43
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 867 173.9 3.6e-43
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 859 172.4 1e-42
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 859 172.4 1e-42
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 859 172.5 1.1e-42
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 851 171.0 3e-42
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 838 168.5 1.6e-41
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 828 166.6 5.9e-41
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 541 112.6 1.1e-24
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 529 110.4 5.1e-24
NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 207 49.9 1e-05
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 191 46.9 8.3e-05
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 187 46.0 0.00012
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 187 46.1 0.00012
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 188 46.4 0.00013
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 187 46.1 0.00013
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 187 46.1 0.00013
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 187 46.2 0.00014
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 187 46.2 0.00014
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 184 45.5 0.00019
NP_005950 (OMIM: 125853,600804) melatonin receptor ( 362) 183 45.3 0.00022
XP_011541141 (OMIM: 125853,600804) PREDICTED: mela ( 362) 183 45.3 0.00022
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 179 44.6 0.00036
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 178 44.3 0.00038
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 179 44.6 0.00038
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 175 43.9 0.00064
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 175 43.9 0.00067
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 175 43.9 0.00069
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 174 43.7 0.00077
XP_005260196 (OMIM: 602779) PREDICTED: proteinase- ( 273) 171 42.9 0.00088
NP_005288 (OMIM: 601751) melanin-concentrating hor ( 422) 173 43.5 0.00089
XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 171 43.1 0.0011
NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 171 43.1 0.0011
XP_016877088 (OMIM: 607970) PREDICTED: probable G- ( 494) 169 42.9 0.0016
XP_016877086 (OMIM: 607970) PREDICTED: probable G- ( 494) 169 42.9 0.0016
XP_016877087 (OMIM: 607970) PREDICTED: probable G- ( 494) 169 42.9 0.0016
XP_016877085 (OMIM: 607970) PREDICTED: probable G- ( 494) 169 42.9 0.0016
NP_072093 (OMIM: 607970) probable G-protein couple ( 494) 169 42.9 0.0016
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 1212 init1: 1170 opt: 1175 Z-score: 1209.0 bits: 231.9 E(85289): 1.3e-60
Smith-Waterman score: 1175; 52.7% identity (82.0% similar) in 311 aa overlap (3-313:2-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPWLELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQLH
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLH
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVLA
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NP_001 TPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AMALDRYVASCKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLNN
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NP_001 VMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDH
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pF1KE6 FFCEVPAVIKLSCADTAMNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRHK
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NP_001 FFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
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pF1KE6 AFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNKD
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NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
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310
pF1KE6 MKGALRRLLARIWRLCG
..::..::.. :
NP_001 VRGAVKRLMG--WE
300 310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1164; 57.7% identity (83.3% similar) in 300 aa overlap (12-311:6-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPWLELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQLH
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pF1KE6 AMALDRYVASCKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLNN
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NP_009 VMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDD
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pF1KE6 FFCEVPAVIKLSCADTAMNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRHK
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NP_009 FVCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRK
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pF1KE6 AFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNKD
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NP_009 AFGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKE
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 MKGALRRLLARIWRLCG
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NP_009 VTRAFRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
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Smith-Waterman score: 1140; 58.1% identity (83.5% similar) in 291 aa overlap (12-302:6-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPWLELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQLH
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLH
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pF1KE6 SPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVLA
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XP_011 SPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLT
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pF1KE6 AMALDRYVASCKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLNN
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pF1KE6 FFCEVPAVIKLSCADTAMNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRHK
: :::::.:.::: ::..:. .:: .:...:::.:::.::: :. :::::.:.:::.:
XP_011 FVCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRK
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pF1KE6 AFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNKD
::::::::: .:.::: .: .:::: . :.::.:::..:::.. ::.:::. ::::::.
XP_011 AFGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKE
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310
pF1KE6 MKGALRRLLARIWRLCG
.:
XP_011 QKRRGS
300
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 1112 init1: 1112 opt: 1112 Z-score: 1144.9 bits: 220.0 E(85289): 4.9e-57
Smith-Waterman score: 1112; 54.7% identity (83.3% similar) in 300 aa overlap (10-309:6-305)
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pF1KE6 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPWLELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQLH
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pF1KE6 SPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVLA
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pF1KE6 AMALDRYVASCKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLNN
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pF1KE6 FFCEVPAVIKLSCADTAMNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRHK
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pF1KE6 AFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNKD
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NP_001 AFGTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNRE
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pF1KE6 MKGALRRLLARIWRLCG
.:::: :::
NP_001 VKGALGRLLLGKRELGKE
300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 960 init1: 923 opt: 923 Z-score: 952.8 bits: 184.5 E(85289): 2.5e-46
Smith-Waterman score: 923; 44.3% identity (75.0% similar) in 296 aa overlap (16-311:13-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPWLELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQLH
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLH
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pF1KE6 SPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVLA
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NP_001 TPMYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMT
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pF1KE6 AMALDRYVASCKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLNN
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NP_001 AMAYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRH
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pF1KE6 FFCEVPAVIKLSCADTAMNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRHK
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NP_001 FFCDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSK
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pF1KE6 AFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNKD
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NP_001 AFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKE
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pF1KE6 MKGALRRLLARIWRLCG
.: ::.:: :
NP_001 IKDALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 907; 44.6% identity (78.6% similar) in 294 aa overlap (16-309:14-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPWLELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQLH
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQ
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pF1KE6 SPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVLA
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NP_006 TPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AMALDRYVASCKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLNN
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NP_006 AMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FFCEVPAVIKLSCADTAMNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRHK
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NP_006 FFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNKD
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NP_006 TFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKD
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 MKGALRRLLARIWRLCG
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NP_006 VKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 888 init1: 888 opt: 902 Z-score: 931.4 bits: 180.5 E(85289): 3.9e-45
Smith-Waterman score: 902; 45.2% identity (74.8% similar) in 301 aa overlap (16-315:12-312)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPW-LELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQL
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPML
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 HSPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVL
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NP_835 HSPMYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLL
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 AAMALDRYVASCKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLN
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NP_835 ATMAYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVN
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 NFFCEVPAVIKLSCADTAMNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRH
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NP_835 HFFCDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKH
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pF1KE6 KAFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNK
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NP_835 KAFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNS
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 DMKGALRRLLARIWRLCG
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NP_835 EVKNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 880 init1: 880 opt: 902 Z-score: 931.4 bits: 180.5 E(85289): 3.9e-45
Smith-Waterman score: 902; 44.0% identity (75.8% similar) in 318 aa overlap (1-317:1-310)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPW-LELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQL
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NP_036 MGTDNQTWVSE----FILLGLSS-DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRL
10 20 30 40 50
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pF1KE6 HSPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVL
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NP_036 HTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLL
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 AAMALDRYVASCKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLN
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NP_036 AVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFID
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 NFFCEVPAVIKLSCADTAMNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRH
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NP_036 HISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRK
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 KAFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNK
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NP_036 KAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 DMKGALRRLLARIWRLCG
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NP_036 EVKGAWQKLL---WKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 880 init1: 880 opt: 902 Z-score: 931.4 bits: 180.5 E(85289): 3.9e-45
Smith-Waterman score: 902; 44.0% identity (75.8% similar) in 318 aa overlap (1-317:1-310)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPW-LELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQL
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XP_011 MGTDNQTWVSE----FILLGLSS-DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRL
10 20 30 40 50
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pF1KE6 HSPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVL
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XP_011 HTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AAMALDRYVASCKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLN
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XP_011 AVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFID
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 NFFCEVPAVIKLSCADTAMNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRH
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XP_011 HISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KAFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNK
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XP_011 KAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 DMKGALRRLLARIWRLCG
..::: ..:: :.. :
XP_011 EVKGAWQKLL---WKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 880 init1: 880 opt: 902 Z-score: 931.4 bits: 180.5 E(85289): 3.9e-45
Smith-Waterman score: 902; 44.0% identity (75.8% similar) in 318 aa overlap (1-317:1-310)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPW-LELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQL
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XP_011 MGTDNQTWVSE----FILLGLSS-DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 HSPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVL
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XP_011 HTPMYFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AAMALDRYVASCKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLN
:.:: ::::: : :.:...:: .:: .:. .:.::: .: ::...: :::.: . ..
XP_011 AVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFID
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 NFFCEVPAVIKLSCADTAMNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRH
.. ::. ::..:.:.::. :.. . : ....:. :.:::: : ..:.::: .::.
XP_011 HISCELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KAFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNK
::: ::.::: .:.: : ::. :.:: :: : : :..:.::.:.:: :::. :.::::
XP_011 KAFHTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 DMKGALRRLLARIWRLCG
..::: ..:: :.. :
XP_011 EVKGAWQKLL---WKFSGLTSKLAT
300 310
317 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 08:57:08 2016 done: Tue Nov 8 08:57:09 2016
Total Scan time: 6.200 Total Display time: 0.000
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]