Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6037
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6037, 317 aa
1>>>pF1KE6037 317 - 317 aa - 317 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9842+/-0.00132; mu= 11.9261+/- 0.077
mean_var=136.5685+/-44.503, 0's: 0 Z-trim(101.6): 379 B-trim: 777 in 2/45
Lambda= 0.109749
statistics sampled from 6136 (6602) to 6136 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.54), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16
Scan time: 1.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 2095 344.1 8.4e-95
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 1044 177.7 1.1e-44
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 1020 173.9 1.4e-43
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 1002 171.0 1e-42
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 998 170.4 1.7e-42
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 996 170.1 2e-42
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 990 169.2 4e-42
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 989 169.0 4.3e-42
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 985 168.4 6.8e-42
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 973 166.5 2.6e-41
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 953 163.3 2.2e-40
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 953 163.3 2.3e-40
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 953 163.3 2.3e-40
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 948 162.5 4e-40
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 942 161.5 7.5e-40
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 941 161.4 8.5e-40
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 934 160.3 1.8e-39
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 922 158.4 6.8e-39
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 915 157.3 1.5e-38
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 913 157.0 1.8e-38
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 907 156.0 3.5e-38
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 907 156.0 3.5e-38
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 905 155.7 4.4e-38
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 905 155.7 4.4e-38
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 901 155.1 6.7e-38
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 901 155.1 6.8e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 900 154.9 7.7e-38
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 896 154.3 1.2e-37
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 893 153.8 1.6e-37
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 892 153.6 1.8e-37
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 892 153.6 1.8e-37
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 890 153.3 2.3e-37
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 890 153.3 2.3e-37
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 890 153.3 2.3e-37
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 887 152.8 3.2e-37
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 886 152.7 3.8e-37
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 885 152.5 3.9e-37
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 885 152.5 4e-37
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 884 152.4 4.3e-37
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 884 152.4 4.4e-37
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 884 152.4 4.4e-37
CCDS34363.1 OR11A1 gene_id:26531|Hs108|chr6 ( 315) 884 152.4 4.4e-37
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 882 152.1 5.5e-37
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 881 151.9 6.1e-37
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 881 151.9 6.1e-37
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 879 151.6 7.8e-37
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 878 151.4 8.4e-37
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 878 151.5 9.2e-37
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 877 151.3 9.4e-37
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 877 151.3 9.5e-37
>>CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 2095 init1: 2095 opt: 2095 Z-score: 1815.5 bits: 344.1 E(32554): 8.4e-95
Smith-Waterman score: 2095; 99.4% identity (99.4% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MQPYTKNWTQVTEFVMMGFAGIHEAHLLFFILFLTMYLFTLVENLAIILVVGLDHRLRRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MQPYTKNWTQVTEFVMMGFAGIHEAHLLFFILFLTMYLFTLVENLAIILVVGLDHRLRRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYFFLTHLSCLEIWYTSVTVPKMLAGFIGVDGGKNISYAGCLSQLFIFTFLGATECFLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS31 MYFFLTHLSCLEIWYTSVTVPKMLAGFIGVDGGKNISYADCLSQLFIFTFLGATECFLLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AMAYDRYVAICMPLHYGAFVSWGTCIRLAAACWLVGFLTPILPIYLLSQLTFCGPNVIDH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS31 AMAYDRYVAICMPLHYGAFVSWGTCIRLAAACWLVGFLTPILPIYLLSQLTFYGPNVIDH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FSCDASPLLALSCSDVTWKETVDFLVSLAVLLASSMVIAVSYGNIVWTLLHIRSAAERWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FSCDASPLLALSCSDVTWKETVDFLVSLAVLLASSMVIAVSYGNIVWTLLHIRSAAERWK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AFSTCAAHLTVVSLFYGTLFFMYVQTKVTSSINFNKVVSVFYSVVTPMLNPLIYSLRNKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AFSTCAAHLTVVSLFYGTLFFMYVQTKVTSSINFNKVVSVFYSVVTPMLNPLIYSLRNKE
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 VKGALGRVFSLNFWKGQ
:::::::::::::::::
CCDS31 VKGALGRVFSLNFWKGQ
310
>>CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 (327 aa)
initn: 1045 init1: 786 opt: 1044 Z-score: 915.9 bits: 177.7 E(32554): 1.1e-44
Smith-Waterman score: 1044; 49.4% identity (79.0% similar) in 310 aa overlap (10-317:9-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MQPYTKNWTQVTEFVMMGFAGIHEAHLLFFILFLTMYLFTLVENLAIILVVGLDHRLRRP
.:.:::..:: . ..:.: :.: :...:.:: ::... :..:
CCDS77 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE6 MYFFLTHLSCLEIWYTSVTVPKMLAGFIGV--DGGKNISYAGCLSQLFIFTFLGATECFL
:::::...: :::::..::.:::::::.: : :. ::. ::..::..: :: ::: :
CCDS77 MYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LAAMAYDRYVAICMPLHYGAFVSWGTCIRLAAACWLVGFLTPILPIYLLSQLTFCGPNVI
::.::::::.:::.:::: ..:: :...::. : :: .. ..:.: :..::::.:
CCDS77 LAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNII
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DHFSCDASPLLALSCSDVTWKETVDFLVSLAVLLASSMVIAVSYGNIVWTLLHIRSAAER
.:: ::.:::: :::.:.. : .::.... .::. : ..:: :. ...:: ::: :
CCDS77 NHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 WKAFSTCAAHLTVVSLFYGTLFFMYVQTKVTSSINFNKVVSVFYSVVTPMLNPLIYSLRN
.:::::::.::::: .::.. .:.:.. :. :... ::.:::.:.:..:.:::.:: :::
CCDS77 YKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 KEVKGALGRVFSLNFWKGQ
.::: :: .:.... :
CCDS77 QEVKRAL--CCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
300 310 320
>>CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 (311 aa)
initn: 1070 init1: 498 opt: 1020 Z-score: 895.7 bits: 173.9 E(32554): 1.4e-43
Smith-Waterman score: 1020; 49.8% identity (78.9% similar) in 303 aa overlap (6-308:4-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MQPYTKNWTQVTEFVMMGFAGIHEAHLLFFILFLTMYLFTLVENLAIILVVGLDHRLRRP
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CCDS43 MELENQTRVTKFILVGFPGSLSMRAAMFLIFLVAYILTVAENVIIILLVLQNRPLHKP
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYFFLTHLSCLEIWYTSVTVPKMLAGFIGVDGGKNISYAGCLSQLFIFTFLGATECFLLA
:::::..:: :: :: ::::::.: .: .:.. .::.. :. ::..: : ::: :::
CCDS43 MYFFLANLSFLETWYISVTVPKLLFSFWSVNN--SISFTLCMIQLYFFIALMCTECVLLA
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AMAYDRYVAICMPLHYGAFVSWGTCIRLAAACWLVGFLTPILPIYLLSQLTFCGPNVIDH
::::::::::: :::: ...: : :.::: . : .:: . ::..: :.:::::::.:
CCDS43 AMAYDRYVAICRPLHYPTIMSHGLCFRLALGSWAIGFGISLAKIYFISCLSFCGPNVINH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FSCDASPLLALSCSDVTWKETVDFLVSLAVLLASSMVIAVSYGNIVWTLLHIRSAAERWK
: :: ::.: :::.:.. : :::...:...: .. ..::: :. :.: . .. . :
CCDS43 FFCDISPVLNLSCTDMSITELVDFILALVIFLFPLFITVLSYGCILATILCMPTG--KQK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AFSTCAAHLTVVSLFYGTLFFMYVQTKVTSSINFNKVVSVFYSVVTPMLNPLIYSLRNKE
::::::.::.::..::....:::.. .: ..:.::..:.::..::: :::.:: :::.:
CCDS43 AFSTCASHLVVVTIFYSAIIFMYARPRVIHAFNMNKIISIFYAIVTPSLNPFIYCLRNRE
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 VKGALGRVFSLNFWKGQ
:: :: ..
CCDS43 VKEALKKLAYCQASRSD
300 310
>>CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1020 init1: 747 opt: 1002 Z-score: 880.2 bits: 171.0 E(32554): 1e-42
Smith-Waterman score: 1002; 49.2% identity (79.2% similar) in 303 aa overlap (5-307:3-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MQPYTKNWTQVTEFVMMGFAGIHEAHLLFFILFLTMYLFTLVENLAIILVVGLDHRLRRP
: ::.::.::...:: .. ... .:.:.: .::.:.. :: :.::: :: ::. :
CCDS30 MDTGNWSQVAEFIILGFPHLQGVQIYLFLLLLLIYLMTVLGNLLIFLVVCLDSRLHTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYFFLTHLSCLEIWYTSVTVPKMLAGFIGVDGGKNISYAGCLSQLFIFTFLGATECFLLA
:: :.. :: :. ::..:.:::::.... :.::..::: :...: ::::::.::.
CCDS30 MYHFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEK--KTISFSGCLLQIYFFHSLGATECYLLT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AMAYDRYVAICMPLHYGAFVSWGTCIRLAAACWLVGFLTPILPIYLLSQLTFCGPNVIDH
:::::::.::: :::: .... : ..: .::: :. :.. : :.:.: ::::: :.:
CCDS30 AMAYDRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLAGPVVEISLISRLPFCGPNRIQH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FSCDASPLLALSCSDVTWKETVDFLVSLAVLLASSMVIAVSYGNIVWTLLHIRSAAERWK
:: :.:.:.:.:.. . :::... .::. ..: :: .:. :.:.: ::: . :
CCDS30 VFCDFPPVLSLACTDTSINVLVDFVINSCKILATFLLILCSYVQIICTVLRIPSAAGKRK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AFSTCAAHLTVVSLFYGTLFFMYVQTKVTSSINFNKVVSVFYSVVTPMLNPLIYSLRNKE
:.::::.:.::: .:::... :::: : . :........: :::.::.:::.::::::::
CCDS30 AISTCASHFTVVLIFYGSILSMYVQLKKSYSLDYDQALAVVYSVLTPFLNPFIYSLRNKE
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 VKGALGRVFSLNFWKGQ
.: :. :
CCDS30 IKEAVRRQLKRIGILA
300 310
>>CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 (331 aa)
initn: 1041 init1: 738 opt: 998 Z-score: 876.5 bits: 170.4 E(32554): 1.7e-42
Smith-Waterman score: 998; 49.0% identity (77.5% similar) in 306 aa overlap (6-311:4-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MQPYTKNWTQVTEFVMMGFAGIHEAHLLFFILFLTMYLFTLVENLAIILVVGLDHRLRRP
.: :.: :...:: . :.:.::: :::.:::::::::.: . :.::
CCDS42 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYFFLTHLSCLEIWYTSVTVPKMLAGFIGVDGGKNISYAGCLSQLFIFTFLGATECFLLA
::.::. .: :::::.: .:::: ::. . : ::..::..::..:. : ::: :::
CCDS42 MYYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQ--KRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AMAYDRYVAICMPLHYGAFVSWGTCIRLAAACWLVGFLTPILPIYLLSQLTFCGPNVIDH
.:::::::::: ::.: ..:. : :..:.. .. :: .. . ..:..:::: ::..:
CCDS42 SMAYDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FSCDASPLLALSCSDVTWKETVDFLVSLAVLLASSMVIAVSYGNIVWTLLHIRSAAERWK
: :: ::.: :.:.: . : :::.... .:. .. .::..:. ..:.: ::. :.
CCDS42 FFCDISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AFSTCAAHLTVVSLFYGTLFFMYVQTKVTSSINFNKVVSVFYSVVTPMLNPLIYSLRNKE
:: :::.:::::..:: .:.::::. .. .: . ::..::.:.:.::.:::::: :::::
CCDS42 AFFTCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKE
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 VKGALGRVFSLNFWKGQ
:.:: ..:.:
CCDS42 FKNALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
300 310 320 330
>>CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 1015 init1: 716 opt: 996 Z-score: 875.0 bits: 170.1 E(32554): 2e-42
Smith-Waterman score: 996; 48.3% identity (77.0% similar) in 296 aa overlap (10-305:8-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MQPYTKNWTQVTEFVMMGFAGIHEAHLLFFILFLTMYLFTLVENLAIILVVGLDHRLRRP
.: :::..:: .::.:.::...::.::.:: :.... : :.::
CCDS53 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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CCDS31 IKNAMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
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