Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6035
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6035, 317 aa
1>>>pF1KE6035 317 - 317 aa - 317 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0268+/-0.00115; mu= 11.8063+/- 0.068
mean_var=183.4804+/-65.309, 0's: 0 Z-trim(102.9): 386 B-trim: 428 in 1/49
Lambda= 0.094685
statistics sampled from 6700 (7181) to 6700 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 2.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 2081 297.5 8.8e-81
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 1892 271.7 5.1e-73
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 1540 223.6 1.5e-58
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 1262 185.7 4.2e-47
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 1214 179.1 3.9e-45
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 1057 157.7 1.1e-38
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 988 148.2 7.5e-36
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 982 147.4 1.4e-35
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 975 146.5 2.7e-35
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 968 145.5 5.1e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 967 145.4 5.7e-35
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 963 144.8 8.2e-35
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 948 142.8 3.4e-34
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 946 142.6 4.4e-34
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 945 142.4 4.5e-34
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 945 142.4 4.6e-34
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 942 142.0 6.1e-34
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 941 141.8 6.6e-34
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 938 141.4 9e-34
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 938 141.4 9.1e-34
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 937 141.3 9.6e-34
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 936 141.1 1.1e-33
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 936 141.1 1.1e-33
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 933 140.7 1.4e-33
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 932 140.6 1.5e-33
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 929 140.2 2.1e-33
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 929 140.2 2.1e-33
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 928 140.0 2.2e-33
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 927 139.9 2.5e-33
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 925 139.6 3e-33
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 925 139.7 3.1e-33
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 924 139.5 3.5e-33
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 922 139.2 4e-33
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 920 138.9 4.8e-33
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 920 138.9 4.9e-33
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 920 139.0 4.9e-33
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 919 138.8 5.4e-33
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 918 138.7 5.9e-33
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 915 138.3 7.7e-33
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 912 137.8 1e-32
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 912 137.8 1e-32
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 912 137.9 1e-32
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 909 137.4 1.4e-32
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 908 137.3 1.5e-32
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 908 137.3 1.5e-32
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 907 137.2 1.6e-32
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 906 137.0 1.8e-32
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 905 136.9 2e-32
CCDS7968.1 OR10W1 gene_id:81341|Hs108|chr11 ( 305) 904 136.7 2.2e-32
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 903 136.6 2.4e-32
>>CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 2081 init1: 2081 opt: 2081 Z-score: 1563.8 bits: 297.5 E(32554): 8.8e-81
Smith-Waterman score: 2081; 100.0% identity (100.0% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 ALSRTFHKVLALRNCIP
:::::::::::::::::
CCDS77 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 (303 aa)
initn: 1892 init1: 1892 opt: 1892 Z-score: 1424.4 bits: 271.7 E(32554): 5.1e-73
Smith-Waterman score: 1892; 95.7% identity (98.0% similar) in 303 aa overlap (15-317:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
:::::::::::::::::::::::::: :: ::::::::::::::::
CCDS31 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::
CCDS31 DSPPVLRLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTHIAAAILKIPSAKGKNKAFS
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
::::::::::::::: ::::: ::::::::.::::::::::.:::::::::::::.::::
CCDS31 TCSSHLLVVSLFYISLSLTYFRPKSNNSPEGKKLLSLSYTVMTPMLNPIIYSLRNNEVKN
230 240 250 260 270 280
310
pF1KE6 ALSRTFHKVLALRNCIP
::::: :.::::::::
CCDS31 ALSRTVSKALALRNCIP
290 300
>>CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1582 init1: 1540 opt: 1540 Z-score: 1164.4 bits: 223.6 E(32554): 1.5e-58
Smith-Waterman score: 1540; 75.5% identity (90.5% similar) in 306 aa overlap (5-310:5-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
::: .:::.:.:::.: ::.:.:::: ::::::::: :: ::::::.:: :.:::
CCDS77 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::.::: ::::::
CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
::::::::.::::::::.. . :.::::::: :: ::::::::.::::::: :.::::::
CCDS77 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
:::::. ::::::..::. :...:.: ...: :::: ::.:: ..:...:::.:::.:::
CCDS77 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
:::.::::::::: .. :::: :.:. : ::::::::: ::::::::::::: ::.:::
CCDS77 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 ALSRTFHKVLALRNCIP
::.: .:..:
CCDS77 ALKRLIHRTLGSQKL
310
>>CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 (316 aa)
initn: 1199 init1: 1199 opt: 1262 Z-score: 959.1 bits: 185.7 E(32554): 4.2e-47
Smith-Waterman score: 1262; 61.4% identity (83.9% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
: : :...::::..:.. : :.: ::. ::.:: ::: :: ::. :: .: :..::
CCDS31 MICENHTRVTEFILLGFTNNP-EMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
::::.:::.::. :.::.::::: :.. :::.::.:::::::::: .:::::. ::
CCDS31 YFFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFFFFFGSSECFLLSMMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
:::.::::.:::: ::::. .: .::. : ::. .::.:....:::: : :.::::
CCDS31 YDRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMMALPFCGPNAVDHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
:.::::::: .::...:. :...:.: .:.: ::: ::::: .::.. :: :..::::
CCDS31 DGPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIITILRMSSATGRQKAFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
::::::.:::::: ..::::. ::::.:::::::.::::::.:::::::::.:::.:::.
CCDS31 TCSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPMLNPIIYGLRNNEVKG
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 ALSRTF-HKVLALRNCIP
:..::. .:::
CCDS31 AVKRTITQKVLQKLDVF
300 310
>>CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1194 init1: 1156 opt: 1214 Z-score: 923.7 bits: 179.1 E(32554): 3.9e-45
Smith-Waterman score: 1214; 58.1% identity (83.8% similar) in 308 aa overlap (5-312:5-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
: . . ::::..::..: :.: :: .::.::.::: ::..: .. . :: ::
CCDS31 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFP-ELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
:.:: ::: .:..:. ::.:.:: .: .. : :::.:: .::::...:: .:::::..::
CCDS31 YLFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
:::..::: ::.::::::. . ::. ::. :. ::::::::.::::::: :..::.::
CCDS31 YDRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
..::::.:::::: ::::::..::::.::.: :::: :: :. ::::.::. :..::::
CCDS31 ETPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
::.::: :.::: ....::. :::. :::.:::.::.::..::.:::.::::::::.:
CCDS31 TCASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKR
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 ALSRTFHKVLALRNCIP
.: . ... . :
CCDS31 TLIKLWRRKVILHTF
300 310
>>CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 (312 aa)
initn: 1076 init1: 1007 opt: 1057 Z-score: 807.8 bits: 157.7 E(32554): 1.1e-38
Smith-Waterman score: 1057; 52.6% identity (80.2% similar) in 308 aa overlap (5-312:4-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
: . ..::.:..:: : ...:.::: .::::::.:. :: ::.... .: :.:::
CCDS34 MSANTSMVTEFLLLGFSHL-ADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
:::::.:: ::::.. : :: .: ::. :: ::: ::.::.:::..:: :::.::
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190 200 210 220 230 240
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CCDS34 EIQPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKAFS
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CCDS34 TCSSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNTEVKA
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310
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CCDS34 ALKRTIQKTVPMEI
300 310
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CCDS31 YFFLSNFSLLEICYVTIIIPRMLMDIWTQKGNISLFACATQMCFFLMLGGTECLLLTVMA
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CCDS31 DIPPILKLACGNIFVNEITVHVVAVVFITVPFLLIVVSYGKIISNILKLSSARGKAKAFS
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CCDS31 TCSSHLIVVILFFGAGTITYLQPKPHQFQRMGKLISLFYTILIPTLNPIIYTLRNKDIMV
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CCDS31 ALRKLLAKLLT
300
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CCDS11 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFH-EQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTI
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CCDS11 IRMDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPISLAGCATQMFFFVTFG
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CCDS11 CAR-KVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKI
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CCDS11 ASVEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITPLLNPV
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pF1KE6 IYSLRNSEVKNALSRTFHKVLALRNCIP
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CCDS11 VYTLRNKEVKDALCRAVGGKFS
300 310 320
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CCDS16 CEMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKAF
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CCDS16 SALRH-----MVLENCCGSAGKLAQI
300 310 320
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CCDS30 MEQVNKTVVREFVVLGFSSL-ARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHTPM
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CCDS30 YFFLAILSCSEICYTFVIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFFGSSHSFLLAAMG
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CCDS30 ALRRTIGQTFYPLS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]