Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6033
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6033, 316 aa
1>>>pF1KE6033 316 - 316 aa - 316 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9628+/-0.000504; mu= 17.8188+/- 0.031
mean_var=105.9887+/-29.778, 0's: 0 Z-trim(107.8): 297 B-trim: 977 in 1/52
Lambda= 0.124579
statistics sampled from 15465 (15874) to 15465 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.522), E-opt: 0.2 (0.186), width: 16
Scan time: 6.100
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 1215 229.9 5.2e-60
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 1189 225.2 1.3e-58
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 1186 224.7 2e-58
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 1166 221.1 2.3e-57
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 1012 193.4 5e-49
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 1007 192.5 9.5e-49
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 1007 192.5 9.5e-49
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 1007 192.5 9.5e-49
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 943 181.0 2.7e-45
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 909 174.9 1.9e-43
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 909 174.9 1.9e-43
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 909 174.9 1.9e-43
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 907 174.5 2.4e-43
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 891 171.7 1.8e-42
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 884 170.4 4.3e-42
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 876 169.0 1.2e-41
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 873 168.4 1.7e-41
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 865 167.0 4.7e-41
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 830 160.7 3.5e-39
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 760 148.1 2.2e-35
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 531 107.0 5.4e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 520 105.0 2.1e-22
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 213 49.9 9.7e-06
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 213 50.0 1e-05
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 204 48.4 3.4e-05
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 204 48.5 3.6e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 200 47.5 4.4e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 191 45.9 0.00014
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 190 45.7 0.00015
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 187 45.3 0.00027
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 185 44.8 0.0003
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 182 44.3 0.00046
NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 179 43.8 0.00065
NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 179 43.8 0.00067
NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 179 43.8 0.00068
NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 179 43.8 0.00068
NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 179 43.8 0.0007
NP_003599 (OMIM: 604620) psychosine receptor [Homo ( 337) 178 43.6 0.0007
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 179 43.9 0.00071
NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 179 43.9 0.00072
NP_001727 (OMIM: 113995) C5a anaphylatoxin chemota ( 350) 175 43.0 0.001
NP_061822 (OMIM: 600896) urotensin-2 receptor [Hom ( 389) 175 43.1 0.0011
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 170 42.1 0.0018
XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 171 42.4 0.0018
NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 171 42.4 0.0018
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 170 42.1 0.0019
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 170 42.2 0.002
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 170 42.2 0.002
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 170 42.2 0.0021
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 170 42.2 0.0022
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 1233 init1: 1208 opt: 1215 Z-score: 1198.3 bits: 229.9 E(85289): 5.2e-60
Smith-Waterman score: 1215; 55.1% identity (84.5% similar) in 303 aa overlap (3-305:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHT
..: ::: :.:.:::. :.:: .:...: ::...:.:: .:.. :::.:::
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PMYFFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MAYDRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHI
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FCEVPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FGTCSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 KGALRTLILGSAAGQSHKD
.::.. :.
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 1176 init1: 1176 opt: 1189 Z-score: 1173.0 bits: 225.2 E(85289): 1.3e-58
Smith-Waterman score: 1189; 56.5% identity (81.9% similar) in 310 aa overlap (5-314:3-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
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pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
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NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
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NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
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250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
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NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 LRTLILGSAAGQSHKD
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NP_009 FRRL-LGKEMGLTQS
300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 1186 init1: 1186 opt: 1186 Z-score: 1170.1 bits: 224.7 E(85289): 2e-58
Smith-Waterman score: 1186; 56.4% identity (85.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
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pF1KE6 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
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pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
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pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
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pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
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NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
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310
pF1KE6 LRTLILGSAAGQSHKD
: :.::
NP_001 LGRLLLGKRELGKE
310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 1159 init1: 1159 opt: 1166 Z-score: 1150.9 bits: 221.1 E(85289): 2.3e-57
Smith-Waterman score: 1166; 57.5% identity (83.0% similar) in 294 aa overlap (5-298:3-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
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pF1KE6 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
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XP_011 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
:::.:::.::.: .:.:::.: .::. ::. ::. :..: :..::.: : .: . ::
XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
::.::.:.: ::..:: .. :::: .:.::. ::::::: :: :::::.:: ::.:::::
XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
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pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
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XP_011 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRR
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 LRTLILGSAAGQSHKD
XP_011 GS
300
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 910 init1: 847 opt: 1012 Z-score: 1001.2 bits: 193.4 E(85289): 5e-49
Smith-Waterman score: 1012; 49.3% identity (79.1% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
:.. :... :::::.:: :. :..:: ..: :....::: :: . .::.::::::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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pF1KE6 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
:::.:.: :::: :: . :..:: :.: ::...:... .. ..:: : .. :.:::
NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
.:.:. :: .:: .: .:. .::.:..::.::::::: : .:...::..: :::.:
NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTP--KSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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pF1KE6 LRTLILGSAAGQSHKD
::
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 1007; 49.8% identity (79.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LRTLILGSAAGQSHKD
. :.
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 1015 init1: 996 opt: 1007 Z-score: 996.2 bits: 192.5 E(85289): 9.5e-49
Smith-Waterman score: 1007; 49.8% identity (79.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
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pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LRTLILGSAAGQSHKD
. :.
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 1015 init1: 996 opt: 1007 Z-score: 996.2 bits: 192.5 E(85289): 9.5e-49
Smith-Waterman score: 1007; 49.8% identity (79.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
. ....::::::. ::. ..:.:.:.:..: :.:.:: : ...:.:.: ::.::: :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LRTLILGSAAGQSHKD
. :.
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 977 init1: 933 opt: 943 Z-score: 934.1 bits: 181.0 E(85289): 2.7e-45
Smith-Waterman score: 943; 45.1% identity (78.2% similar) in 293 aa overlap (12-304:13-305)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 YFFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 YDRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 EVPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFG
..: :. :.:.:: : .. . .. : :. .:.:..:::.: ....: :: ::.:::.
NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKG
::.:::..: .:: . ::.::. .. :.. .:.:.:::.: :.:::.::.::::..:
NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 ALRTLILGSAAGQSHKD
::. :
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 970 init1: 906 opt: 909 Z-score: 901.1 bits: 174.9 E(85289): 1.9e-43
Smith-Waterman score: 909; 44.9% identity (78.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
: ::.:: . :::::.: ::: ...::...: .:. ..::: .:: .:: ::::::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
::::::: :::::. ...:..:.. . .:.:. ::..:.: .. . . . .:::::::
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
:...:::.::.: : : ..:: :..: :. . .. :.. : . : .:. .. :.::.
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
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pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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:. ..
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]