Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6033
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6033, 316 aa
1>>>pF1KE6033 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3152+/-0.00123; mu= 10.1483+/- 0.071
mean_var=199.2704+/-71.041, 0's: 0 Z-trim(102.5): 390 B-trim: 413 in 1/50
Lambda= 0.090856
statistics sampled from 6476 (6962) to 6476 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16
Scan time: 2.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 2063 284.0 1.1e-76
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1364 192.3 4e-49
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 1346 190.0 2.1e-48
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 1286 182.1 4.9e-46
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 1276 180.8 1.2e-45
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1262 179.1 4.6e-45
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 1241 176.2 2.9e-44
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 1219 173.3 2.1e-43
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 1215 172.8 3e-43
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 1199 170.7 1.3e-42
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 1194 170.1 2e-42
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 1189 169.4 3.2e-42
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 1186 169.0 4.2e-42
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 1173 167.3 1.4e-41
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1171 167.1 1.7e-41
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 1171 167.1 1.7e-41
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 1052 151.5 8.7e-37
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 1041 150.0 2.3e-36
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 1033 149.0 4.8e-36
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 1031 148.7 5.6e-36
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 1031 148.7 5.6e-36
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 1020 147.3 1.5e-35
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 1013 146.4 2.9e-35
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 1012 146.2 3.1e-35
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 1008 145.7 4.5e-35
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 1006 145.5 5.7e-35
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 1005 145.3 5.9e-35
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1003 145.1 7.2e-35
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 988 143.1 2.8e-34
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 978 141.8 6.8e-34
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 978 141.8 6.8e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 974 141.2 1e-33
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 973 141.1 1.1e-33
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 961 139.5 3.2e-33
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 960 139.4 3.5e-33
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 959 139.3 3.9e-33
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 955 138.8 5.6e-33
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 951 138.2 7.9e-33
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 947 137.7 1.1e-32
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 943 137.2 1.6e-32
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 942 137.0 1.8e-32
CCDS35011.1 OR13J1 gene_id:392309|Hs108|chr9 ( 312) 936 136.3 3.1e-32
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 933 135.9 4.1e-32
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 931 135.6 4.8e-32
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 929 135.3 5.8e-32
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 929 135.4 6.4e-32
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 928 135.2 6.4e-32
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 927 135.1 7e-32
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 924 134.7 9e-32
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 924 134.7 9.2e-32
>>CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 (316 aa)
initn: 2063 init1: 2063 opt: 2063 Z-score: 1490.5 bits: 284.0 E(32554): 1.1e-76
Smith-Waterman score: 2063; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LRTLILGSAAGQSHKD
::::::::::::::::
CCDS31 LRTLILGSAAGQSHKD
310
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1380 init1: 1357 opt: 1364 Z-score: 995.4 bits: 192.3 E(32554): 4e-49
Smith-Waterman score: 1364; 65.3% identity (88.4% similar) in 303 aa overlap (5-307:5-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
:.:: :.::::::.:.:: ::...:.::.:.:.:: ..:.. :: ::::::
CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
::::::: .:::::::.::: ::.... ::..:::::::::....:::.:::::: ::
CCDS31 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
::: :::.::.:..::.::.: .::. .::::: .:::. ..:.::::::.. :::..::
CCDS31 DRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFICE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
::.:.:::::::: :: :::.::.:...: :: .::::::::::::::. .:.:::.:
CCDS31 VPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
:::::.::::::::::..::::.. ...::::.:::::.::: ::::::::::::.: :
CCDS31 CSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKDMKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LRTLILGSAAGQSHKD
:: :. :
CCDS31 LRKLLSGKL
>>CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 1383 init1: 1340 opt: 1346 Z-score: 982.6 bits: 190.0 E(32554): 2.1e-48
Smith-Waterman score: 1346; 65.0% identity (87.5% similar) in 311 aa overlap (1-311:4-313)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHT
...::.:. ::.:::::: :::.. ::..:: .:.:..::::..::: :. .::
CCDS31 MGMVRHTNESNLAGFILLGFSDYPQLQKVLFVLILILYLLTILGNTTIILVSRLEPKLHM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PMYFFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAV
:::::::.:: . :::.:: :::::.. . ::..::::...:: . .:::.::.: ::
CCDS31 PMYFFLSHLSFLYRCFTSSVIPQLLVNLWEPMKTIAYGGCLVHLYNSHALGSTECVLPAV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MAYDRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHI
:. :::.::::::.: ..:: ..: .::. :::::. :.:.: .::.:::.:::: .::.
CCDS31 MSCDRYVAVCRPLHYTVLMHIHLCMALASMAWLSGIATTLVQSTLTLQLPFCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FCEVPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKA
.:::::::::::: ::::::::::::..:::::: .:::: :.:..::::::::. ::::
CCDS31 ICEVPVLIKLACVGTTFNEAELFVASILFLIVPVSFILVSSGYIAHAVLRIKSATRRQKA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FGTCSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDV
:::: :::.:: ::::::::::::::. ::..::::::::::.:: .:::.::::: :.:
CCDS31 FGTCFSHLTVVTIFYGTIIFMYLQPAKSRSRDQGKFVSLFYTVVTRMLNPLIYTLRIKEV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 KGALRTLILGSAAGQSHKD
::::. .:..: :
CCDS31 KGALKK-VLAKALGVNIL
310
>>CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 1334 init1: 1286 opt: 1286 Z-score: 940.0 bits: 182.1 E(32554): 4.9e-46
Smith-Waterman score: 1286; 58.1% identity (85.1% similar) in 315 aa overlap (1-315:2-316)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPM
:: .: :: . :.::::: .:.:: :: ..: ::..:.::: .::: : .:::::
CCDS16 MMEIANVSSPEVFVLLGFSTRPSLETVLFIVVLSFYMVSILGNGIIILVSHTDVHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YFFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMA
::::.:: .:. ::::..::::... .::.::::::.:.:.. ::..::.:::.:.
CCDS16 YFFLANLPFLDMSFTTSIVPQLLANLWGPQKTISYGGCVVQFYISHWLGATECVLLATMS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YDRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFC
::::::.::::.: .::::..: .:: ..::.:: ::.. .::. :::::. .::.::
CCDS16 YDRYAAICRPLHYTVIMHPQLCLGLALASWLGGLTTSMVGSTLTMLLPLCGNNCIDHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 EVPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFG
:.:....::::::..:: :...:: ::...:. ::::::: :..:::.:.:: ::.:::.
CCDS16 EMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKG
:::::..:: .:::.:::::::::. :..::::..::::.::: :::.:::::: .::.
CCDS16 TCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEVKS
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 ALRTLILGSAAGQSHKD
::: ..: . :.. :
CCDS16 ALRHMVLENCCGSAGKLAQI
310 320
>>CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 (311 aa)
initn: 1269 init1: 728 opt: 1276 Z-score: 933.1 bits: 180.8 E(32554): 1.2e-45
Smith-Waterman score: 1276; 59.9% identity (84.9% similar) in 312 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
: :.: : ::.:.:::: :::: .::..:. :: :.:.::: .: . :: :::::::
CCDS34 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
::::.:: .:.:::::..::::... :.:.. :::::::.. ..:::.::.::.:::.
CCDS34 FFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
::::::::::.:.:::::..: .:: ..: .:...:::: .:.. .:::::: :.:.:::
CCDS34 DRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHR-LNHFFCE
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
.::..::::.:: .::..::: :. . ::. ::: :: :..::::.::.:::.:::::
CCDS34 MPVFLKLACADTEGTEAKMFVARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFGT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
:.:::.::..:::. :. ::: . :. .::::.:::::.::.:::.::::::::::::
CCDS34 CGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKGA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 L-RTLILGSAAGQSHKD
: ..: : .:
CCDS34 LWKVLWRGRDSG
300 310
>>CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 (357 aa)
initn: 1264 init1: 1240 opt: 1262 Z-score: 922.5 bits: 179.1 E(32554): 4.6e-45
Smith-Waterman score: 1262; 58.0% identity (84.9% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
:. .:.: . :.:: ::::: :: :...:. :.:...:: ..::: .: .::::::
CCDS46 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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CCDS46 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
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CCDS46 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
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CCDS34 FFLTNLSILDLCYTTTTVPHMLVNIGCNKKTISYAGCVAHLIIFLALGATECLLLAVMSF
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CCDS34 CGSHMIVVSLFYGTAIYMYLQPPSSTSKDWGKMVSLFYGIITSMLNSLIYSLRNKDMKEA
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CCDS34 FKRLMPRIFFCKK
310
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CCDS43 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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CCDS43 MMIKKNASSEDFFILLGFSNWPQLEVVLFVVILIFYLMTLTGNLFIIILSYVDSHLHTPM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]