FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6032, 316 aa
1>>>pF1KE6032 316 - 316 aa - 316 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0775+/-0.000544; mu= 17.1284+/- 0.034
mean_var=84.2020+/-20.006, 0's: 0 Z-trim(107.3): 383 B-trim: 1674 in 2/45
Lambda= 0.139770
statistics sampled from 14822 (15340) to 14822 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.505), E-opt: 0.2 (0.18), width: 16
Scan time: 5.180
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 923 196.7 5.2e-50
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 892 190.4 4e-48
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 892 190.4 4e-48
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 892 190.4 4e-48
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 880 188.0 2.1e-47
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 878 187.6 2.8e-47
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 870 186.0 8.7e-47
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 858 183.6 4.6e-46
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 856 183.2 5.9e-46
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 856 183.2 6.1e-46
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 856 183.2 6.1e-46
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 856 183.2 6.2e-46
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 842 180.4 4.3e-45
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 839 179.7 6.6e-45
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 832 178.3 1.7e-44
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 826 177.1 4e-44
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 818 175.5 1.2e-43
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 813 174.5 2.5e-43
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 804 172.7 9e-43
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 683 148.3 1.9e-35
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 511 113.6 5.4e-25
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 506 112.6 1.1e-24
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 225 56.0 1.4e-07
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 225 56.0 1.5e-07
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 224 55.8 1.6e-07
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 224 55.8 1.6e-07
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 224 55.8 1.6e-07
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 224 55.8 1.6e-07
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 224 55.8 1.6e-07
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 224 55.8 1.6e-07
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 224 55.8 1.6e-07
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 224 55.8 1.7e-07
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 223 55.6 1.8e-07
XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 223 55.6 1.8e-07
NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 223 55.6 1.9e-07
XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 223 55.7 2e-07
XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 223 55.7 2e-07
XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 223 55.7 2e-07
XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 223 55.7 2e-07
XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 223 55.7 2e-07
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 219 54.8 3.4e-07
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 216 54.1 4.4e-07
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 202 51.3 3.2e-06
NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor iso ( 390) 200 51.0 4.7e-06
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 198 50.6 6.1e-06
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 198 50.6 6.1e-06
NP_001305783 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 365) 190 48.9 1.8e-05
XP_016883344 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 365) 190 48.9 1.8e-05
XP_016856350 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 189 48.9 2.7e-05
XP_016856351 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 189 48.9 2.7e-05
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 963 init1: 747 opt: 923 Z-score: 1018.9 bits: 196.7 E(85289): 5.2e-50
Smith-Waterman score: 923; 47.5% identity (77.1% similar) in 301 aa overlap (1-301:4-302)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MTNTSSSDFTLLGLLVNSEAAGIVFTVILAVFLGAVTANLVMIFLIQVDSRLHTPMY
...:. ..: :::: . .. ..: :.:.:.: .: .::..: :..:::.::::::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FLLSQLSIMDTLFICTTVPKLLADMVSKEKIISFVACGIQIFLYLTMIGSEFFLLGLMAY
:.: .::. : : . ::. :. ..:..:.:.:. :. .....: . .. ::..:.:
NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DRYVAVCNPLRYPVLMNRKKCLLLAAGAWFGGSLDGFLLTPITMNVPYCGSRSINHFFCE
:::::.::::::: .:. : :. ::.:.: .: : . . : . . .:: :: :: :::::
NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 IPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKAFTT
::.: :: .:: : ... :..::::. .: .::. :..:. .: :. : :::.:
NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDVIGA
:.::: :: .:::.:. ::. :.: . .:.: ::.::.:::::::::::::::::: .:
NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 FKKVFACCSSARKVATSDA
..::
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 950 init1: 877 opt: 892 Z-score: 984.9 bits: 190.4 E(85289): 4e-48
Smith-Waterman score: 892; 44.5% identity (77.6% similar) in 308 aa overlap (7-313:10-317)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MTNTSSSDFTLLGLLVNSEAAGIVFTVILAVFLGAVTANLVMIFLIQVDSRLHTPMY
:.: :::: . .. .:...:.... .: .: ....::..:::::::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FLLSQLSIMDTLFICTTVPKLLADMVSKEKIISFVACGIQIFLYLTMIGSEFFLLGLMAY
:.:..::..:. . ..::.::: .....: : : .:. :.:. :.. : :: ::..:::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DRYVAVCNPLRYPVLMNRKKCLLLAAGAWFGGSLDGFLLTPITMNVPYCGSRSINHFFCE
:::::::. ::: ..:. : :: .: .: ... . : ::...:.: .. :.:. ::
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 IPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKAFTT
. ::..:::.::: :. ... ...:. :. .. :: :. :: .. : ::::::: :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDVIGA
:.::::::.. ::.:..::. :.: . :.:. :.::.:.::::::.:::::::.: ::
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 FKKVFACCSS-ARKVATSDA
..:.. :. . :.::
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 950 init1: 877 opt: 892 Z-score: 984.9 bits: 190.4 E(85289): 4e-48
Smith-Waterman score: 892; 44.5% identity (77.6% similar) in 308 aa overlap (7-313:10-317)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MTNTSSSDFTLLGLLVNSEAAGIVFTVILAVFLGAVTANLVMIFLIQVDSRLHTPMY
:.: :::: . .. .:...:.... .: .: ....::..:::::::::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FLLSQLSIMDTLFICTTVPKLLADMVSKEKIISFVACGIQIFLYLTMIGSEFFLLGLMAY
:.:..::..:. . ..::.::: .....: : : .:. :.:. :.. : :: ::..:::
NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DRYVAVCNPLRYPVLMNRKKCLLLAAGAWFGGSLDGFLLTPITMNVPYCGSRSINHFFCE
:::::::. ::: ..:. : :: .: .: ... . : ::...:.: .. :.:. ::
NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 IPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKAFTT
. ::..:::.::: :. ... ...:. :. .. :: :. :: .. : ::::::: :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDVIGA
:.::::::.. ::.:..::. :.: . :.:. :.::.:.::::::.:::::::.: ::
NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 FKKVFACCSS-ARKVATSDA
..:.. :. . :.::
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 950 init1: 877 opt: 892 Z-score: 984.9 bits: 190.4 E(85289): 4e-48
Smith-Waterman score: 892; 44.5% identity (77.6% similar) in 308 aa overlap (7-313:10-317)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MTNTSSSDFTLLGLLVNSEAAGIVFTVILAVFLGAVTANLVMIFLIQVDSRLHTPMY
:.: :::: . .. .:...:.... .: .: ....::..:::::::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FLLSQLSIMDTLFICTTVPKLLADMVSKEKIISFVACGIQIFLYLTMIGSEFFLLGLMAY
:.:..::..:. . ..::.::: .....: : : .:. :.:. :.. : :: ::..:::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DRYVAVCNPLRYPVLMNRKKCLLLAAGAWFGGSLDGFLLTPITMNVPYCGSRSINHFFCE
:::::::. ::: ..:. : :: .: .: ... . : ::...:.: .. :.:. ::
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 IPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKAFTT
. ::..:::.::: :. ... ...:. :. .. :: :. :: .. : ::::::: :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDVIGA
:.::::::.. ::.:..::. :.: . :.:. :.::.:.::::::.:::::::.: ::
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 FKKVFACCSS-ARKVATSDA
..:.. :. . :.::
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 922 init1: 874 opt: 880 Z-score: 971.9 bits: 188.0 E(85289): 2.1e-47
Smith-Waterman score: 880; 45.0% identity (77.3% similar) in 300 aa overlap (4-303:7-306)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MTNTSSSDFTLLGLLVNSEAAGIVFTVILAVFLGAVTANLVMIFLIQVDSRLHTPMY
:: ..:.:::: . : :.: .:... .: .:: ::.::..::.::::::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FLLSQLSIMDTLFICTTVPKLLADMVSKEKIISFVACGIQIFLYLTMIGSEFFLLGLMAY
:.:..::..:. : .::.:::..:..: :::..: .:....... .: .:.:::::
NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DRYVAVCNPLRYPVLMNRKKCLLLAAGAWFGGSLDGFLLTPITMNVPYCGSRSINHFFCE
:::.:.: :: : ..:.: : .::::. .: :. .. : . .. .: : :.::::.
NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 IPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKAFTT
: ..::.:.:: : :.. : . .. . .: .::: .:..: : :.:::..::.:
NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDVIGA
:.::::.. .::.. .:::. :.: .. .::::.:.:::.: :::::::::::.:.: :
NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 FKKVFACCSSARKVATSDA
. .:..
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 800 init1: 800 opt: 878 Z-score: 969.8 bits: 187.6 E(85289): 2.8e-47
Smith-Waterman score: 878; 42.2% identity (76.1% similar) in 306 aa overlap (1-302:1-303)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MTNTSSSD-FTLLGLLVNSEAAGI---VFTVILAVFLGAVTANLVMIFLIQVDSRLHTPM
:.: ::. : :::. :: :. .:.:.:. .: ....: ..:.: .: .::.::
NP_009 MVNQSSTPGFLLLGF---SEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YFLLSQLSIMDTLFICTTVPKLLADMVSKEKIISFVACGIQIFLYLTMIGSEFFLLGLMA
::.::.::..: : . ::..:... . .: :::. :..:::..:.. .: .:: .::
NP_009 YFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YDRYVAVCNPLRYPVLMNRKKCLLLAAGAWFGGSLDGFLLTPITMNVPYCGSRSINHFFC
.:::::::.::.: .... . : ::. :: : ... . :: :...:.: .:... : :
NP_009 FDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 EIPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKAFT
:.::...:.: ::: : . . :..:..:.:.: .::. : .. :. ::.::.:::
NP_009 EVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDVIG
:::::::::..::.... .:. :.. .. :. : . ::.. :: ::::::.::::.:
NP_009 TCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTR
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 AFKKVFACCSSARKVATSDA
::....
NP_009 AFRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 816 init1: 816 opt: 870 Z-score: 961.0 bits: 186.0 E(85289): 8.7e-47
Smith-Waterman score: 870; 42.7% identity (75.7% similar) in 300 aa overlap (4-302:7-306)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MTNTSSSDFTLLGLL-VNSEAAGIVFTVILAVFLGAVTANLVMIFLIQVDSRLHTPM
: :.: :... . .: ...: ..:...: .. .: ..:.. .: ::.::
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YFLLSQLSIMDTLFICTTVPKLLADMVSKEKIISFVACGIQIFLYLTMIGSEFFLLGLMA
::.: .::... : . :::.:. ..... :::..:. :..... . .: :::. ::
NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YDRYVAVCNPLRYPVLMNRKKCLLLAAGAWFGGSLDGFLLTPITMNVPYCGSRSINHFFC
::::::.:.::.:::.::.. :::..:: : . . : .. :.::. ..:::::
NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 EIPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKAFT
. : ::::.::::.:.: . .:...:: .: ::. : .: ..:::.:..:::.
NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDVIG
:::::: :::.:: .. :: :.: ..::. :..: ::.:::::::.::::::..: .
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 AFKKVFACCSSARKVATSDA
:....:
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 817 init1: 817 opt: 858 Z-score: 948.0 bits: 183.6 E(85289): 4.6e-46
Smith-Waterman score: 858; 43.3% identity (74.2% similar) in 298 aa overlap (4-301:10-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MTNTSSSDFTLLGLLVNSEAAGIVFTVILAVFLGAVTANLVMIFLIQVDSRLHT
.: . : :.:. . ..:.:.: .: .. .:: .:.: .::.:::
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PMYFLLSQLSIMDTLFICTTVPKLLADMVSKEKIISFVACGIQIFLYLTMIGSEFFLLGL
::::.::.::..: . ...:.::... . :: ::...: ::... :.. .: :: .
NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MAYDRYVAVCNPLRYPVLMNRKKCLLLAAGAWFGGSLDGFLLTPITMNVPYCGSRSINHF
:.::::.::: ::.: :::. . : :::...: .: .. : . .:. :: :: :...::
NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FCEIPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKA
:::.::.:.:.:.:: . : ..: ...:::. .: :::. :. .: :: :. : .:.
NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FTTCSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDV
: ::..:: .::.:. :. :. : : .. .: : .. :::.::: ::::::.:::: :
NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 IGAFKKVFACCSSARKVATSDA
:: :..
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 778 init1: 778 opt: 856 Z-score: 946.0 bits: 183.2 E(85289): 5.9e-46
Smith-Waterman score: 856; 42.4% identity (76.1% similar) in 297 aa overlap (1-293:1-294)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MTNTSSSD-FTLLGLLVNSEAAGI---VFTVILAVFLGAVTANLVMIFLIQVDSRLHTPM
:.: ::. : :::. :: :. .:.:.:. .: ....: ..:.: .: .::.::
XP_011 MVNQSSTPGFLLLGF---SEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YFLLSQLSIMDTLFICTTVPKLLADMVSKEKIISFVACGIQIFLYLTMIGSEFFLLGLMA
::.::.::..: : . ::..:... . .: :::. :..:::..:.. .: .:: .::
XP_011 YFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YDRYVAVCNPLRYPVLMNRKKCLLLAAGAWFGGSLDGFLLTPITMNVPYCGSRSINHFFC
.:::::::.::.: .... . : ::. :: : ... . :: :...:.: .:... : :
XP_011 FDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 EIPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKAFT
:.::...:.: ::: : . . :..:..:.:.: .::. : .. :. ::.::.:::
XP_011 EVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDVIG
:::::::::..::.... .:. :.. .. :. : . ::.. :: ::::::.::::.
XP_011 TCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKR
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 AFKKVFACCSSARKVATSDA
XP_011 RGS
300
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 852 init1: 852 opt: 856 Z-score: 945.8 bits: 183.2 E(85289): 6.1e-46
Smith-Waterman score: 856; 43.5% identity (75.7% similar) in 301 aa overlap (2-301:4-304)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MTNTSS-SDFTLLGLLVNSEAAGIVFTVILAVFLGAVTANLVMIFLIQVDSRLHTPMY
:: :: :.: :::: . . ..:. .:...:..: .::..:. ...:: ::::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FLLSQLSIMDTLFICTTVPKLLADMVSKEKIISFVACGIQIFLYLTMIGSEFFLLGLMAY
:.::.::..: : :::::.::. . . . ::: .: :... . .. . :::..:::
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DRYVAVCNPLRYPVLMNRKKCLLLAAGAWFGGSLDGFLLTPITMNVPYCGSRSINHFFCE
:..::::.::.: . :... : ::.:: : ..:. .: : . . .:.. .:.::::.
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 IPAVLKLACADTSLYETLMYICCVLMLLIPISIISTSYSLILLTIHRMPSAEGRKKAFTT
. .:::.:.:: : :... .:... :. : .:: : :. ..::..:: :::.:
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CSSHLTVVSIFYGAAFYTYVLPQSFHTPEQDKVVSAFYTIVTPMLNPLIYSLRNKDVIGA
:.:::.:: .::.. . .: : : :. :.: .....::.:::::::.::::::. . ::
NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 FKKVFACCSSARKVATSDA
.:::
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
316 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 08:53:43 2016 done: Tue Nov 8 08:53:44 2016
Total Scan time: 5.180 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]