Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6028
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6028, 316 aa
1>>>pF1KE6028 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2280+/-0.0014; mu= 10.5270+/- 0.081
mean_var=174.3876+/-59.740, 0's: 0 Z-trim(99.9): 373 B-trim: 338 in 1/47
Lambda= 0.097122
statistics sampled from 5475 (5904) to 5475 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.508), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16
Scan time: 2.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 2018 296.2 2.3e-80
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1810 267.0 1.4e-71
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1191 180.3 1.7e-45
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1180 178.7 5e-45
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1130 171.7 6.5e-43
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1071 163.5 2e-40
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1068 163.1 2.7e-40
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1053 160.9 1.1e-39
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1053 160.9 1.1e-39
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1051 160.6 1.4e-39
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1051 160.7 1.4e-39
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1047 160.1 2e-39
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1047 160.1 2.1e-39
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1046 160.0 2.2e-39
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1042 159.4 3.4e-39
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1040 159.1 4e-39
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1040 159.1 4.1e-39
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1034 158.3 7.3e-39
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1033 158.1 8e-39
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1033 158.1 8e-39
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1032 158.0 8.8e-39
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1027 157.4 1.5e-38
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1026 157.2 1.6e-38
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1010 154.9 7.4e-38
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1007 154.5 1e-37
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1005 154.2 1.2e-37
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 993 152.5 3.9e-37
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 989 152.0 5.7e-37
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 987 151.7 6.9e-37
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 987 151.7 7.2e-37
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 981 150.9 1.3e-36
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 979 150.6 1.5e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 979 150.6 1.5e-36
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 974 149.9 2.5e-36
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 973 149.7 2.7e-36
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 971 149.5 3.3e-36
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 969 149.2 4e-36
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 966 148.8 5.4e-36
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 958 147.6 1.2e-35
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 957 147.5 1.3e-35
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 953 146.9 1.9e-35
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 951 146.7 2.5e-35
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 950 146.5 2.5e-35
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 944 145.7 4.6e-35
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 942 145.4 5.5e-35
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 941 145.3 6.2e-35
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 939 145.0 7.3e-35
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 937 144.7 9e-35
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 936 144.6 1e-34
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 934 144.3 1.2e-34
>>CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 2018 init1: 2018 opt: 2018 Z-score: 1556.3 bits: 296.2 E(32554): 2.3e-80
Smith-Waterman score: 2018; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYGLTMAGNLGIITLTSVDSRLQTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYGLTMAGNLGIITLTSVDSRLQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLQHLALINLGNSTVIAPKMLINFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIMLALMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLQHLALINLGNSTVIAPKMLINFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIMLALMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSSYVFSVSYCSSNIINHFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSSYVFSVSYCSSNIINHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NVPLLALSCSDTYLPETVVFISAATNVVGSLIIVLVSYFNIVLSILKICSSEGRKKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NVPLLALSCSDTYLPETVVFISAATNVVGSLIIVLVSYFNIVLSILKICSSEGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHMMAVTIFYGTLLFMYVQPRSNHSLDTDDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CASHMMAVTIFYGTLLFMYVQPRSNHSLDTDDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKT
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 ALQRFMTNLCYSFKTM
::::::::::::::::
CCDS31 ALQRFMTNLCYSFKTM
310
>>CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1816 init1: 1583 opt: 1810 Z-score: 1398.8 bits: 267.0 E(32554): 1.4e-71
Smith-Waterman score: 1810; 88.6% identity (96.5% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYGLTMAGNLGIITLTSVDSRLQTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.:::
CCDS31 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYVLTMAGNLGIITLTSVDSRLQNPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLQHLALINLGNSTVIAPKMLINFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIMLALMAY
:::.:::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::
CCDS31 FFLRHLAIINLGNSTVIAPKMLMNFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMMLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSSYVFSVSYCSSNIINHFYCD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::
CCDS31 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSPCIFSVSYCSSNIINHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NVPLLALSCSDTYLPETVVFISAATNVVGSLIIVLVSYFNIVLSILKICSSEGRKKAFST
.:::::::::::.:::.::::::::.: :.: :::::::::::::.: : :::::::::
CCDS31 IAPLLALSCSDTYIPETIVFISAATNLVFSMITVLVSYFNIVLSILRIRSPEGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHMMAVTIFYGTLLFMYVQPRSNHSLDTDDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKT
:::::.:::.::::.::::.::..::::::: :::::::::::::::::::::::.::..
CCDS31 CASHMIAVTVFYGTMLFMYLQPQTNHSLDTD-KMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNNDVNV
250 260 270 280 290
310
pF1KE6 ALQRFMTNLCYSFKTM
::..:: : :::::.:
CCDS31 ALKKFMENPCYSFKSM
300 310
>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1197 init1: 1028 opt: 1191 Z-score: 930.2 bits: 180.3 E(32554): 1.7e-45
Smith-Waterman score: 1191; 58.1% identity (83.1% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYGLTMAGNLGIITLTSVDSRLQTPMY
:: : :..:::::.:... ::..:::..:: .: .:..::::.: : .:. :.::::
CCDS41 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLQHLALINLGNSTVIAPKMLINFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIMLALMAY
:::..::.... :.::.:::: ::: :... :: :::::: :: :..:: ..:: :::
CCDS41 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSSYVFSVSYCSSNIINHFYCD
:::::::::::::::.. .:. ::.. : :.: :. . .: .::: :::.::::::
CCDS41 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NVPLLALSCSDTYLPETVVFISAATNVVGSLIIVLVSYFNIVLSILKICSSEGRKKAFST
..::: :.:::: . . .: :. ..::.::.:::. :. .::.. :.:::.:::::
CCDS41 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHMMAVTIFYGTLLFMYVQPRSNHSLDTDDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKT
:.:::.:::::::::.:::.:: :.:.:::: ::::::::..:::::::::::.::.::
CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTD-KMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKE
250 260 270 280 290
310
pF1KE6 ALQRFMTNLCYSFKTM
::.... :
CCDS41 ALKKIIINKN
300
>>CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 (307 aa)
initn: 1186 init1: 1018 opt: 1180 Z-score: 921.9 bits: 178.7 E(32554): 5e-45
Smith-Waterman score: 1180; 57.1% identity (85.4% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYGLTMAGNLGIITLTSVDSRLQTPMY
:. .:.: .::::: .. :::::::: ::::.: .:..::: .: ::..::.:.::::
CCDS31 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLQHLALINLGNSTVIAPKMLINFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIMLALMAY
: ..:::...::::::: ::.: ::.: ..: :.: ::.::. ::.::.:: ..:. :::
CCDS31 FSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFILSAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSSYVFSVSYCSSNIINHFYCD
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CCDS31 DRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCGSNVISHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NVPLLALSCSDTYLPETVVFISAATNVVGSLIIVLVSYFNIVLSILKICSSEGRKKAFST
.:::: . ::.. : . .. .. :...:..::::::. :.:.: .. :.:::::::::
CCDS31 DVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHSAEGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHMMAVTIFYGTLLFMYVQPRSNHSLDTDDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKT
:.::. .:..:::.:::::.:: :.: .::: :::::::::::::::::::::::..::.
CCDS31 CGSHLTVVVVFYGSLLFMYMQPNSTHFFDTD-KMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNEEVKN
250 260 270 280 290
310
pF1KE6 ALQRFMTNLCYSFKTM
:. ... :
CCDS31 AFYKLFEN
300
>>CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 (319 aa)
initn: 1157 init1: 943 opt: 1130 Z-score: 883.8 bits: 171.7 E(32554): 6.5e-43
Smith-Waterman score: 1130; 55.6% identity (84.1% similar) in 302 aa overlap (7-308:13-313)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYGLTMAGNLGIITLTSVDSR
:.:::::: :... : :: ::: .::..: .:. ::::.. :: .::.
CCDS31 MNHVVKHNHTAVTKVTEFILMGITDNPGLQAPLFGLFLIIYLVTVIGNLGMVILTYLDSK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LQTPMYFFLQHLALINLGNSTVIAPKMLINFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIM
:.:::::::.::.. .:: :::::::::.::.:.:.: :. ::::. : .::.::...
CCDS31 LHTPMYFFLRHLSITDLGYSTVIAPKMLVNFIVHKNTISYNWYATQLAFFEIFIISELFI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LALMAYDRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSSYVFSVSYCSSNII
:. ::::::::::.::::........ .:: . :::. ... .. .:..:.:.::::
CCDS31 LSAMAYDRYVAICKPLLYVIIMAEKVLWVLVIVPYLYSTFVSLFLTIKLFKLSFCGSNII
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 NHFYCDNVPLLALSCSDTYLPETVVFISAATNVVGSLIIVLVSYFNIVLSILKICSSEGR
..:::: .::... :::: : ...: .. :.. :: :::.::. :...::.. : .::
CCDS31 SYFYCDCIPLMSILCSDTNELELIILIFSGCNLLFSLSIVLISYMFILVAILRMNSRKGR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KKAFSTCASHMMAVTIFYGTLLFMYVQPRSNHSLDTDDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLR
::::::.::. .: .:::::::.:.::.:.:.: : :::::::::.::::::::::::
CCDS31 YKAFSTCSSHLTVVIMFYGTLLFIYLQPKSSHTLAID-KMASVFYTLLIPMLNPLIYSLR
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 NKDVKTALQRFMTNLCYSFKTM
::.:: ::.: .::
CCDS31 NKEVKDALKRTLTNRFKIPI
300 310
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1077 init1: 915 opt: 1071 Z-score: 839.2 bits: 163.5 E(32554): 2e-40
Smith-Waterman score: 1071; 51.8% identity (82.1% similar) in 301 aa overlap (4-304:2-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYGLTMAGNLGIITLTSVDSRLQTPMY
:: :.::::::.:... ::::::::.::: .: .:..::::.: : .:: :.::::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLQHLALINLGNSTVIAPKMLINFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIMLALMAY
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:...
CCDS31 AFKKTVGKAKASIGFIF
300 310
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CCDS31 ALKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
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300
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CCDS53 MSNTNGSAITEFILLGLTDCPELQSLLFVLFLVVYLVTLLGNLGMIMLMRLDSRLHTPMY
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300
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]