Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6027
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6027, 316 aa
1>>>pF1KE6027 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0111+/-0.00126; mu= 11.4599+/- 0.073
mean_var=117.6782+/-34.543, 0's: 0 Z-trim(101.8): 364 B-trim: 817 in 2/48
Lambda= 0.118230
statistics sampled from 6242 (6667) to 6242 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 2.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 2081 366.8 1.2e-101
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1174 212.1 4.5e-55
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1171 211.6 6.4e-55
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1166 210.8 1.2e-54
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1163 210.2 1.7e-54
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1155 208.9 4.2e-54
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1149 207.9 9.6e-54
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1142 206.7 2.1e-53
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1131 204.8 7.5e-53
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1120 202.9 2.6e-52
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1115 202.1 5.3e-52
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1110 201.2 8.7e-52
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1095 198.7 5.3e-51
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1094 198.5 5.8e-51
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1093 198.3 6.4e-51
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1090 197.8 9.6e-51
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1089 197.6 1e-50
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1088 197.4 1.2e-50
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1082 196.4 2.4e-50
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1081 196.3 2.7e-50
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1077 195.6 4.3e-50
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1068 194.0 1.3e-49
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 1056 192.0 5.1e-49
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1055 191.8 5.8e-49
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1053 191.5 7.3e-49
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1047 190.5 1.5e-48
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1047 190.5 1.5e-48
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1045 190.1 1.9e-48
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1045 190.1 1.9e-48
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1043 189.8 2.4e-48
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 1036 188.6 5.5e-48
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1034 188.2 7e-48
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1033 188.1 7.8e-48
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 1032 187.9 8.7e-48
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1029 187.4 1.3e-47
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1028 187.2 1.4e-47
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1028 187.2 1.4e-47
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1027 187.0 1.6e-47
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 1023 186.4 2.6e-47
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1023 186.4 2.7e-47
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 1020 185.9 3.8e-47
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1018 185.5 4.6e-47
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1017 185.3 5.1e-47
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1017 185.3 5.3e-47
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1016 185.2 5.9e-47
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1015 185.0 6.5e-47
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1015 185.0 6.6e-47
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1008 183.8 1.5e-46
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1006 183.5 2e-46
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1000 182.4 3.8e-46
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 2081 init1: 2081 opt: 2081 Z-score: 1938.2 bits: 366.8 E(32554): 1.2e-101
Smith-Waterman score: 2081; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 KDVKKALKKILWKHIL
::::::::::::::::
CCDS31 KDVKKALKKILWKHIL
310
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1196 init1: 1167 opt: 1174 Z-score: 1102.2 bits: 212.1 E(32554): 4.5e-55
Smith-Waterman score: 1174; 57.4% identity (83.2% similar) in 303 aa overlap (11-313:3-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
:.::::::.:.::.:.:.:: :: .::.::. ..::::::: :: .: :
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
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CCDS31 LHTPMYFFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
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CCDS31 LASMAYDRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
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CCDS31 EHFFCDAPPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
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CCDS31 QKAFSTCASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRN
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 KDVKKALKKILWKHIL
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CCDS31 KEVKSAFKKTVGKAKASIGFIF
300 310
>>CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1193 init1: 1149 opt: 1171 Z-score: 1099.5 bits: 211.6 E(32554): 6.4e-55
Smith-Waterman score: 1171; 57.3% identity (83.3% similar) in 300 aa overlap (11-310:5-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
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CCDS31 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQ
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
:::::::::: ::: : ::... :::::.:.:.::.: :.::: :: : : .::.:
CCDS31 LHTPMYFFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLL
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
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CCDS31 LSVMAFDRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
:::.:: :::: :: :::. : .:... .:: .: . :.::: :...::.. : :::
CCDS31 NHFFCDIPPLLLLSRSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGR
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250 260 270 280 290 300
pF1KE6 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
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CCDS31 FKALSTCTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRN
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 KDVKKALKKILWKHIL
::::.::::.
CCDS31 KDVKEALKKLKNKILF
300 310
>>CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1195 init1: 1160 opt: 1166 Z-score: 1094.6 bits: 210.8 E(32554): 1.2e-54
Smith-Waterman score: 1166; 55.5% identity (84.4% similar) in 301 aa overlap (11-311:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
: : ::::..:..: :. .:: .:::.: .::::. .:.:..:.
CCDS31 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
:. :::.:::.:::.: : :...:::::.:..: :.:: .::: :..::.:: .::..
CCDS31 LQIPMYYFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
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CCDS31 LAAMAYDRYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
:::.:: :::: :::.::..: ....:. ::: : ....:::.::.:.::.. : ::
CCDS31 NHFFCDIPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
:.::::::.:.:::.:.:..:::::.::.:::.. ::::.:::::..:..::.:::..:
CCDS31 SKTFSTCASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRN
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 KDVKKALKKILWKHIL
::::.::::.:
CCDS31 KDVKNALKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
300 310 320
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1215 init1: 1160 opt: 1163 Z-score: 1092.0 bits: 210.2 E(32554): 1.7e-54
Smith-Waterman score: 1163; 55.8% identity (81.0% similar) in 310 aa overlap (6-315:2-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
: :: : ::::.:::. :.:: ::: .:: .: ..::.:...::.::
CCDS79 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
:.::::::::.::::: : :...::::::...:::.::..::: ::::: .: :: :.
CCDS79 LQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
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CCDS79 LAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
:::.:: ::::::::.:: .: .. ...: . : : .:..:::. :...:::. :. ::
CCDS79 NHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
.:.::::::.: .:::. ::.::.: ::. :: . ::..:::::..:::::::::::.:
CCDS79 KKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRN
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 KDVKKALKKILWKHIL
:::: : .:.: ...
CCDS79 KDVKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1137 init1: 762 opt: 1155 Z-score: 1084.7 bits: 208.9 E(32554): 4.2e-54
Smith-Waterman score: 1155; 57.4% identity (84.2% similar) in 303 aa overlap (11-313:3-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
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CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
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CCDS31 LHTPMYFFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVECYL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
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CCDS31 LASMAYDRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
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CCDS31 NHFFCDIPPLLALSCSDTRISKLVVFV-AGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQ
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250 260 270 280 290 300
pF1KE6 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
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CCDS31 KKVFSTCASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRN
240 250 260 270 280 290
310
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CCDS31 KEVKSALWKILNKLYPQY
300
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10 20 30
pF1KE6 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLF
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CCDS32 LSLGRIKPSQSPRCSTSFMVVPSFSIAEHWRRMKGANLSQGMEFELLGLTTDPQLQRLLF
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40 50 60 70 80 90
pF1KE6 ALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLCLHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAE
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CCDS32 VVFLGMYTATLLGNLVMFLLIHVSATLHTPMYSLLKSLSFLDFCYSSTVVPQTLVNFLAK
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CCDS32 RKVISYFGCMTQMFFYAGFATSECYLIAAMAYDRYAAICNPLLYSTIMSPEVCASLIVGS
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CCDS32 YSAGFLNSLIHTGCIFSLKFCGAHVVTHFFCDGPPILSLSCVDTSLCEILLFIFAGFNLL
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220 230 240 250 260 270
pF1KE6 SCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGRHKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSM
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CCDS32 SCTLTILISYFLILNTILKMSSAQGRFKAFSTCASHLTAICLFFGTTLFMYLRPRSSYSL
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280 290 300 310
pF1KE6 EQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKNKDVKKALKKILWKHIL
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CCDS32 TQDRTVAVIYTVVIPVLNPLMYSLRNKDVKKALIKV-WGRKTME
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10 20 30
pF1KE6 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLL
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CCDS31 TFTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTDDFELQVFLFLLFFA
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pF1KE6 IYMANMVGNLGMIVLIKIDLCLHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAIS
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CCDS31 IYLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAKNKSIS
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pF1KE6 FHGCAAQFYFFGSFLGTECFLLAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGC
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CCDS31 FIGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVAGI
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CCDS31 LHATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEIVTILI
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pF1KE6 VLISYLCIFIAVLKMPSLEGRHKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKV
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CCDS31 VLISCDFILLSILKMHSAKGRQKAFSTCGSHLTGVTIYHGTILVSYMRPSSSYASDHDII
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280 290 300 310
pF1KE6 VSVFYTVIIPVLNPLIYSLKNKDVKKALKKILWKHIL
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CCDS31 VSIFYTIVIPKLNPIIYSLRNKEVKKAVKKMLKLVYK
310 320 330 340
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CCDS31 MSGLPSDMDLYK-LQLNNFTEVTMFILISFTEEFDVQVFLFLLFLAIYLFTLIGNLGLVV
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CCDS31 PIIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISFLGCATQMFLACTF
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CCDS31 GTTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVASILHATIHTVATFSLS
120 130 140 150 160 170
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CCDS31 FCGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEIVTILIVLISYGFILLAILK
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CCDS31 IIYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
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CCDS41 LNTPMYFFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLL
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CCDS41 QKAFSTCGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQN
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CCDS41 KEVKEALKKIIINKN
300
316 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]