Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6026
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6026, 315 aa
1>>>pF1KE6026 315 - 315 aa - 315 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9039+/-0.00125; mu= 12.2079+/- 0.073
mean_var=142.5075+/-46.858, 0's: 0 Z-trim(101.8): 386 B-trim: 783 in 2/47
Lambda= 0.107437
statistics sampled from 6207 (6679) to 6207 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.543), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 2.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 2057 331.4 5.6e-91
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 1980 319.5 2.2e-87
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1389 227.8 8.1e-60
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1305 214.8 6.8e-56
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 1233 203.7 1.6e-52
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1230 203.2 2.1e-52
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1108 184.3 1.1e-46
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1062 177.2 1.5e-44
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1058 176.5 2.3e-44
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1055 176.1 3.1e-44
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1018 170.4 1.7e-42
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1013 169.6 3e-42
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1005 168.3 6.8e-42
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1000 167.5 1.2e-41
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1000 167.6 1.2e-41
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 999 167.4 1.3e-41
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 998 167.3 1.6e-41
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 995 166.8 2e-41
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 994 166.6 2.3e-41
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 991 166.2 3.1e-41
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 990 166.0 3.5e-41
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 974 163.5 1.9e-40
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 974 163.5 1.9e-40
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 973 163.4 2.2e-40
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 972 163.2 2.4e-40
CCDS7782.1 OR5P2 gene_id:120065|Hs108|chr11 ( 322) 972 163.2 2.4e-40
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 970 162.9 2.9e-40
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 970 162.9 2.9e-40
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 969 162.7 3.2e-40
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 965 162.1 5e-40
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 964 162.0 5.6e-40
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 963 161.8 6.2e-40
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 959 161.2 9.6e-40
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 958 161.0 1.1e-39
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 958 161.0 1.1e-39
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 958 161.1 1.1e-39
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 957 160.9 1.2e-39
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 954 160.4 1.6e-39
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 954 160.4 1.6e-39
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 953 160.3 1.9e-39
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 953 160.3 1.9e-39
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 952 160.1 2e-39
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 950 159.8 2.5e-39
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 949 159.6 2.8e-39
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 948 159.5 3.1e-39
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 945 159.0 4.3e-39
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 945 159.0 4.3e-39
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 942 158.6 6.3e-39
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 939 158.1 8.2e-39
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 939 158.1 8.2e-39
>>CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 2057 init1: 2057 opt: 2057 Z-score: 1746.8 bits: 331.4 E(32554): 5.6e-91
Smith-Waterman score: 2057; 100.0% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSQLQTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MLSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSQLQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYFLASMAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYFLASMAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKIIAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNRDVILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKIIAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNRDVILA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 IQQMIRGKSFCKIAV
:::::::::::::::
CCDS53 IQQMIRGKSFCKIAV
310
>>CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1980 init1: 1980 opt: 1980 Z-score: 1682.3 bits: 319.5 E(32554): 2.2e-87
Smith-Waterman score: 1980; 95.6% identity (98.7% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSQLQTPMY
:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS53 MFSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSHLQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYFLASMAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS53 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYILASMAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
:::::::::::::::::::::. :::.:::::::.:.::.::::::::::::::::::::
CCDS53 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICVCLVTIPYMYGFLSGFSQSLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFNLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKIIAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNRDVILA
::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: :::::
CCDS53 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKITAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNTDVILA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 IQQMIRGKSFCKIAV
.::::::::: ::::
CCDS53 MQQMIRGKSFHKIAV
310
>>CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 (305 aa)
initn: 1042 init1: 1042 opt: 1389 Z-score: 1187.4 bits: 227.8 E(32554): 8.1e-60
Smith-Waterman score: 1389; 67.0% identity (87.9% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSQLQTPMY
: . : . .:::::::::: : :...:: .::..::.:: ::: ::.:.: .:.:.::::
CCDS53 MSNTNGSAITEFILLGLTDCPELQSLLFVLFLVVYLVTLLGNLGMIMLMRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYFLASMAL
::: .:.:::.::.::.::.: :..:: ::::.::::::: .::::..::::.::.::
CCDS53 FFLTNLAFVDLCYTSNATPQMSTNIVSE-KTISFAGCFTQCYIFIALLLTEFYMLAAMAY
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
:::::: .::.:: . :. .:: :.: ::.::: .:: :..:::.:.:: : :::::::
CCDS53 DRYVAIYDPLRYSVKTSRRVCICLATFPYVYGFSDGLFQAILTFRLTFCRSSVINHFYCA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
::::: :.:::: ::. :::. :::.::::: :.:.:: ::.:::.::.:::::::::::
CCDS53 DPPLIKLSCSDTYVKEHAMFISAGFNLSSSLTIVLVSYAFILAAILRIKSAEGRHKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKIIAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNRDVILA
:.::. ::::::::::::.:::..:.:::::::::::::.::.::::::::::.:: :
CCDS53 CGSHMMAVTLFYGTLFCMYIRPPTDKTVEESKIIAVFYTFVSPVLNPLIYSLRNKDVKQA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 IQQMIRGKSFCKIAV
.....:
CCDS53 LKNVLR
300
>>CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1319 init1: 1291 opt: 1305 Z-score: 1116.9 bits: 214.8 E(32554): 6.8e-56
Smith-Waterman score: 1305; 64.1% identity (86.9% similar) in 306 aa overlap (5-310:4-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSQLQTPMY
: :.::::::::::. :. .:: .:::::..:.:::: ::.::..:. :. :::
CCDS31 MRRNCTLVTEFILLGLTSRRELQILLFTLFLAIYMVTVAGNLGMIVLIQANAWLHMPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYFLASMAL
:::.::::::.:.::::::.::. ::::.:.::: .:..:: :::::: .:.:.:: ::.
CCDS31 FFLSHLSFVDLCFSSNVTPKMLEIFLSEKKSISYPACLVQCYLFIALVHVEIYILAVMAF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
:::.:::.:: :.:::::..: :.::::.:: :.:: .:. :..:.::: ::::::::
CCDS31 DRYMAICNPLLYGSRMSKSVCSFLITVPYVYGALTGLMETMWTYNLAFCGPNEINHFYCA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
::::: :::::: :...::.:::..:: ::::: .:::.:: ::..:::.:::.:::::
CCDS31 DPPLIKLACSDTYNKELSMFIVAGWNLSFSLFIICISYLYIFPAILKIRSTEGRQKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKIIAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNRDVILA
:.:::: ::.::.::: ::.::::..:::..:..::::: . :::: .::::::..: :
CCDS31 CGSHLTAVTIFYATLFFMYLRPPSKESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNLIIYSLRNKNVKEA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 IQQMIRGKSFCKIAV
. . . : .
CCDS31 LIKELSMKIYFS
300 310
>>CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1223 init1: 1223 opt: 1233 Z-score: 1056.6 bits: 203.7 E(32554): 1.6e-52
Smith-Waterman score: 1233; 57.9% identity (85.1% similar) in 309 aa overlap (4-312:2-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSQLQTPMY
:: : :::: ::::: :. ..: ::::.:.::: ::. ::.:: . :::.:::
CCDS31 MPNFTDVTEFTLLGLTCRQELQVLFFVVFLAVYMITLLGNIGMIILISISPQLQSPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYFLASMAL
:::.::::.:.:.::::::.::.:.::: :::::.::..:: .:::.: .: :.:: ::.
CCDS31 FFLSHLSFADVCFSSNVTPKMLENLLSETKTISYVGCLVQCYFFIAVVHVEVYILAVMAF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
:::.: :.:: :.:.::...:. :..:::.::: .: :: :. : :::..::::::::
CCDS31 DRYMAGCNPLLYGSKMSRTVCVRLISVPYVYGFSVSLICTLWTYGLYFCGNFEINHFYCA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
:::::..::. ...:...:.:.::.... :: ..:.:: .: .:..:.:::.::.:::::
CCDS31 DPPLIQIACGRVHIKEITMIVIAGINFTYSLSVVLISYTLIVVAVLRMRSADGRRKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKIIAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNRDVILA
:.:::: :..:::: . ::.: :.:.:::..:..::::: . :::::.::::::.:: :
CCDS31 CGSHLTAVSMFYGTPIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKEA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 IQQMIRGKSFCKIAV
... : :.. .
CCDS31 VNKAIT-KTYVRQ
300 310
>>CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 (307 aa)
initn: 1221 init1: 1221 opt: 1230 Z-score: 1054.2 bits: 203.2 E(32554): 2.1e-52
Smith-Waterman score: 1230; 59.5% identity (88.4% similar) in 301 aa overlap (5-305:3-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSQLQTPMY
: : ::::::::::. . ..: .::..:.::..::. :..::... ::..:::
CCDS31 MLNFTDVTEFILLGLTSRREWQVLFFIIFLVVYIITMVGNIGMMVLIKVSPQLNNPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYFLASMAL
:::.::::::. .::::::.::.:.::..:::.::::..::..::::: .:...::.::.
CCDS31 FFLSHLSFVDVWFSSNVTPKMLENLLSDKKTITYAGCLVQCFFFIALVHVEIFILAAMAF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
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CCDS31 DRYMAIGNPLLYGSKMSRVVCIRLITFPYIYGFLTSLAATLWTYGLYFCGKIEINHFYCA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
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CCDS31 DPPLIKMACAGTFVKEYTMIILAGINFTYSLTVIIISYLFILIAILRMRSAEGRQKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKIIAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNRDVILA
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CCDS31 CGSHLTAVIIFYGTLIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKKA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 IQQMIRGKSFCKIAV
....:
CCDS31 MMKVISRSC
300
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSQLQTPMY
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CCDS41 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYFLASMAL
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CCDS41 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
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CCDS41 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
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pF1KE6 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
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CCDS41 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
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CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
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310
pF1KE6 IQQMIRGKSFCKIAV
....: .:.
CCDS41 LKKIIINKN
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10 20 30 40
pF1KE6 MLSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCM
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CCDS31 MIFPSHDSQAFTSVDMEVGNCTILTEFILLGFSADSQWQPILFGVFLMLYLITLSGNMTL
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50 60 70 80 90 100
pF1KE6 ILLIRTNSQLQTPMYFFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFI
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CCDS31 VILIRTDSHLHTPMYFFIGNLSFLDFWYTSVYTPKILASCVSEDKRISLAGCGAQLFFSC
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pF1KE6 ALVITEFYFLASMALDRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFH
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CCDS31 VVAYTECYLLAAMAYDRHAAICNPLLYSGTMSTALCTGLVAGSYIGGFLNAIAHTANTFR
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pF1KE6 LSFCGSLEINHFYCADPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAI
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CCDS31 LHFCGKNIIDHFFCDAPPLVKMSCTNTRVYEKVLLGVVGFTVLSSILAILISYVNILLAI
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pF1KE6 FRIRSAEGRHKAFSTCASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKIIAVFYTFLSPML
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CCDS31 LRIHSASGRHKAFSTCASHLISVMLFYGSLLFMYSRPSSTYSLERDKVAALFYTVINPLL
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pF1KE6 NPLIYSLRNRDVILAIQQMIRGKSFCKIAV
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CCDS31 NPLIYSLRNKDIKEAFRKATQTIQPQT
310 320
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:.: ::::::.:::::: :. :: ::: ::::::.::: :: :: .: :.::::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMY
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pF1KE6 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYFLASMAL
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CCDS31 FFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAY
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pF1KE6 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
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CCDS31 DRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCD
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pF1KE6 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
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CCDS31 APPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFST
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CCDS31 CASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSA
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310
pF1KE6 IQQMIRGKSFCKIAV
... . ::.
CCDS31 FKKTV-GKAKASIGFIF
300 310
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CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMY
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CCDS31 FFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVECYLLASMAY
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CCDS31 DRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFCD
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CCDS31 IPPLLALSCSDTRISKLVVFV-AGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFST
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CCDS31 CASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKSA
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CCDS31 LWKILNKLYPQY
300
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]