Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6025
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6025, 315 aa
1>>>pF1KE6025 315 - 315 aa - 315 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8266+/-0.00133; mu= 12.9439+/- 0.077
mean_var=179.6958+/-59.952, 0's: 0 Z-trim(101.6): 373 B-trim: 397 in 1/50
Lambda= 0.095676
statistics sampled from 6133 (6588) to 6133 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.541), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 2.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 2065 298.4 4.9e-81
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1977 286.2 2.2e-77
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1394 205.7 3.7e-53
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1306 193.6 1.7e-49
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1227 182.7 3.2e-46
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 1220 181.7 6.3e-46
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1094 164.3 1.1e-40
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1071 161.2 9.9e-40
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1069 160.9 1.2e-39
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1050 158.3 7.6e-39
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1023 154.5 1e-37
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1010 152.7 3.4e-37
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1008 152.4 4.1e-37
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1001 151.5 8.1e-37
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 994 150.5 1.6e-36
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 992 150.2 1.9e-36
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 992 150.3 1.9e-36
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 990 150.0 2.3e-36
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 987 149.6 3e-36
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 987 149.6 3.1e-36
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 986 149.4 3.4e-36
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 983 149.0 4.4e-36
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 983 149.0 4.5e-36
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 981 148.8 5.9e-36
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 978 148.3 7.3e-36
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 974 147.8 1.1e-35
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 969 147.1 1.7e-35
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 968 146.9 1.9e-35
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 968 146.9 1.9e-35
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 966 146.7 2.3e-35
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 966 146.7 2.3e-35
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 962 146.1 3.3e-35
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 962 146.1 3.3e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 958 145.6 5e-35
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 955 145.1 6.5e-35
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 954 145.1 7.6e-35
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 953 144.9 7.9e-35
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 952 144.7 8.7e-35
CCDS7782.1 OR5P2 gene_id:120065|Hs108|chr11 ( 322) 952 144.7 8.8e-35
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 949 144.4 1.2e-34
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 946 143.9 1.5e-34
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 946 143.9 1.5e-34
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 944 143.6 1.9e-34
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 938 142.8 3.3e-34
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 938 142.8 3.5e-34
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 936 142.5 4e-34
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 934 142.2 4.9e-34
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 933 142.1 5.3e-34
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 932 142.0 6e-34
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 928 141.4 8.6e-34
>>CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 2065 init1: 2065 opt: 2065 Z-score: 1568.3 bits: 298.4 E(32554): 4.9e-81
Smith-Waterman score: 2065; 99.7% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSHLQTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MFSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSHLQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYILASMAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYILASMAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICVCLVTIPYMYGFLSGFSQSLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICVCLVTIPYMYGFLSGFSQSLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFNLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFNLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKITAVFYTFLTPMLNPLIYSLRNTDVILA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS53 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKITAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNTDVILA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 MQQMIRGKSFHKIAV
:::::::::::::::
CCDS53 MQQMIRGKSFHKIAV
310
>>CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1977 init1: 1977 opt: 1977 Z-score: 1502.6 bits: 286.2 E(32554): 2.2e-77
Smith-Waterman score: 1977; 95.2% identity (98.7% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSHLQTPMY
:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS53 MLSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSQLQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYILASMAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS53 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYFLASMAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICVCLVTIPYMYGFLSGFSQSLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
:::::::::::::::::::::. :::.:::::::.:.::.::::::::::::::::::::
CCDS53 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFNLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKITAVFYTFLTPMLNPLIYSLRNTDVILA
::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::::: :::::
CCDS53 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKIIAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNRDVILA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 MQQMIRGKSFHKIAV
.::::::::: ::::
CCDS53 IQQMIRGKSFCKIAV
310
>>CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 (305 aa)
initn: 1047 init1: 1047 opt: 1394 Z-score: 1067.8 bits: 205.7 E(32554): 3.7e-53
Smith-Waterman score: 1394; 66.3% identity (87.9% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSHLQTPMY
: . : . .:::::::::: : :...:: .::..::.:: ::: ::.:.: .:.:.::::
CCDS53 MSNTNGSAITEFILLGLTDCPELQSLLFVLFLVVYLVTLLGNLGMIMLMRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYILASMAL
::: .:.:::.::.::.::.: :..:: ::::.::::::: .::::..::::.::.::
CCDS53 FFLTNLAFVDLCYTSNATPQMSTNIVSE-KTISFAGCFTQCYIFIALLLTEFYMLAAMAY
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICVCLVTIPYMYGFLSGFSQSLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
:::::: .::.:: . :. .:.::.:.::.::: .:. :..:::.:.:: : :::::::
CCDS53 DRYVAIYDPLRYSVKTSRRVCICLATFPYVYGFSDGLFQAILTFRLTFCRSSVINHFYCA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFNLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
::::: :.:::: ::. :::. ::::::::: :.:.:: ::.:::.::.:::::::::::
CCDS53 DPPLIKLSCSDTYVKEHAMFISAGFNLSSSLTIVLVSYAFILAAILRIKSAEGRHKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKITAVFYTFLTPMLNPLIYSLRNTDVILA
:.::. ::::::::::::.:::..:.:::::: ::::::..:.:::::::::: :: :
CCDS53 CGSHMMAVTLFYGTLFCMYIRPPTDKTVEESKIIAVFYTFVSPVLNPLIYSLRNKDVKQA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 MQQMIRGKSFHKIAV
.....:
CCDS53 LKNVLR
300
>>CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1319 init1: 1291 opt: 1306 Z-score: 1002.1 bits: 193.6 E(32554): 1.7e-49
Smith-Waterman score: 1306; 63.7% identity (86.6% similar) in 306 aa overlap (5-310:4-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSHLQTPMY
: :.::::::::::. :. .:: .:::::..:.:::: ::.::..:. :. :::
CCDS31 MRRNCTLVTEFILLGLTSRRELQILLFTLFLAIYMVTVAGNLGMIVLIQANAWLHMPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYILASMAL
:::.::::::.:.::::::.::. ::::.:.::: .:..:: :::::: .:.:::: ::.
CCDS31 FFLSHLSFVDLCFSSNVTPKMLEIFLSEKKSISYPACLVQCYLFIALVHVEIYILAVMAF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICVCLVTIPYMYGFLSGFSQSLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
:::.:::.:: :.:::::..: :.:.::.:: :.:. ... :..:.::: ::::::::
CCDS31 DRYMAICNPLLYGSRMSKSVCSFLITVPYVYGALTGLMETMWTYNLAFCGPNEINHFYCA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFNLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
::::: :::::: :...::.:::.::: ::::: .:::.:: ::..:::.:::.:::::
CCDS31 DPPLIKLACSDTYNKELSMFIVAGWNLSFSLFIICISYLYIFPAILKIRSTEGRQKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKITAVFYTFLTPMLNPLIYSLRNTDVILA
:.:::: ::.::.::: ::.::::..:::..:..::::: . :::: .:::::: .: :
CCDS31 CGSHLTAVTIFYATLFFMYLRPPSKESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNLIIYSLRNKNVKEA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 MQQMIRGKSFHKIAV
. . . : .
CCDS31 LIKELSMKIYFS
300 310
>>CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 (307 aa)
initn: 1265 init1: 1220 opt: 1227 Z-score: 943.2 bits: 182.7 E(32554): 3.2e-46
Smith-Waterman score: 1227; 59.1% identity (88.4% similar) in 301 aa overlap (5-305:3-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSHLQTPMY
: : ::::::::::. . ..: .::..:.::..::. :..::... .:..:::
CCDS31 MLNFTDVTEFILLGLTSRREWQVLFFIIFLVVYIITMVGNIGMMVLIKVSPQLNNPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYILASMAL
:::.::::::. .::::::.::.:.::..:::.::::..::..::::: .:..:::.::.
CCDS31 FFLSHLSFVDVWFSSNVTPKMLENLLSDKKTITYAGCLVQCFFFIALVHVEIFILAAMAF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICVCLVTIPYMYGFLSGFSQSLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
:::.:: .:: :.:.::. .:. :.:.::.::::.... .: :. : :::..::::::::
CCDS31 DRYMAIGNPLLYGSKMSRVVCIRLITFPYIYGFLTSLAATLWTYGLYFCGKIEINHFYCA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFNLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
::::: .::. : ::...:...::.:.. :: .:..:::::. ::.:.::::::.:::::
CCDS31 DPPLIKMACAGTFVKEYTMIILAGINFTYSLTVIIISYLFILIAILRMRSAEGRQKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKITAVFYTFLTPMLNPLIYSLRNTDVILA
:.:::: : .:::::. ::.: :.:.:::..:..::::: . :::::.:::::: :: :
CCDS31 CGSHLTAVIIFYGTLIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKKA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 MQQMIRGKSFHKIAV
:...:
CCDS31 MMKVISRSC
300
>>CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1214 init1: 1214 opt: 1220 Z-score: 938.0 bits: 181.7 E(32554): 6.3e-46
Smith-Waterman score: 1220; 58.6% identity (85.4% similar) in 302 aa overlap (4-305:2-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MFSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSHLQTPMY
:: : :::: ::::: :. ..: ::::.:.::: ::. ::.:: . .::.:::
CCDS31 MPNFTDVTEFTLLGLTCRQELQVLFFVVFLAVYMITLLGNIGMIILISISPQLQSPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYILASMAL
:::.::::.:.:.::::::.::.:.::: :::::.::..:: .:::.: .: :::: ::.
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CCDS31 DRYMAGCNPLLYGSKMSRTVCVRLISVPYVYGFSVSLICTLWTYGLYFCGNFEINHFYCA
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CCDS31 DPPLIQIACGRVHIKEITMIVIAGINFTYSLSVVLISYTLIVVAVLRMRSADGRRKAFST
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310
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... :
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300 310
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CCDS41 LKKIIINKN
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CCDS31 FFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAY
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CCDS31 DRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCD
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CCDS31 APPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFST
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CCDS31 DRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFCD
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CCDS31 LWKILNKLYPQY
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