Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6024
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6024, 315 aa
1>>>pF1KE6024 315 - 315 aa - 315 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9285+/-0.00121; mu= 12.1667+/- 0.070
mean_var=142.3270+/-45.700, 0's: 0 Z-trim(102.6): 377 B-trim: 827 in 2/48
Lambda= 0.107505
statistics sampled from 6544 (7021) to 6544 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.561), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 2.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 2040 328.9 3.2e-90
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 1540 251.3 7.2e-67
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 1469 240.3 1.4e-63
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 1278 210.7 1.2e-54
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 1173 194.4 9.7e-50
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 1152 191.1 9.3e-49
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1033 172.7 3.4e-43
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1009 169.0 4.8e-42
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 993 166.5 2.6e-41
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 984 165.1 6.5e-41
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 984 165.1 6.5e-41
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 979 164.3 1.1e-40
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 974 163.5 1.9e-40
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 955 160.6 1.5e-39
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 952 160.1 2e-39
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 952 160.2 2.1e-39
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 951 160.0 2.3e-39
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 951 160.0 2.3e-39
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 950 159.8 2.6e-39
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 949 159.7 2.8e-39
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 948 159.5 3.1e-39
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 948 159.5 3.1e-39
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 943 158.7 5.3e-39
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 942 158.6 6e-39
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 937 157.8 1e-38
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 937 157.8 1e-38
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 937 157.8 1e-38
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 934 157.3 1.4e-38
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 934 157.3 1.4e-38
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 934 157.4 1.5e-38
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 933 157.2 1.6e-38
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 931 156.9 2e-38
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 929 156.6 2.4e-38
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 928 156.4 2.7e-38
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 924 155.8 4.1e-38
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 921 155.3 5.7e-38
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 920 155.1 6.3e-38
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 920 155.2 6.4e-38
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 919 155.0 7.1e-38
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 918 154.9 8.1e-38
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 916 154.5 9.7e-38
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 915 154.4 1.1e-37
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 913 154.1 1.3e-37
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 912 153.9 1.5e-37
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 912 154.0 1.6e-37
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 910 153.6 1.9e-37
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 908 153.3 2.3e-37
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 908 153.3 2.3e-37
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 907 153.1 2.6e-37
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 907 153.1 2.6e-37
>>CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 2040 init1: 2040 opt: 2040 Z-score: 1733.1 bits: 328.9 E(32554): 3.2e-90
Smith-Waterman score: 2040; 100.0% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 ALKRLIHRTLGSQKL
:::::::::::::::
CCDS77 ALKRLIHRTLGSQKL
310
>>CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 1582 init1: 1540 opt: 1540 Z-score: 1314.0 bits: 251.3 E(32554): 7.2e-67
Smith-Waterman score: 1540; 75.5% identity (90.5% similar) in 306 aa overlap (5-310:5-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
::: .:::.:.:::.: ::.:.:::: ::::::::: :: ::::::.:: :.:::
CCDS77 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::.::: ::::::
CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
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CCDS77 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
:::::. ::::::..::. :...:.: ...: :::: ::.:: ..:...:::.:::.:::
CCDS77 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
:::.::::::::: .. :::: :.:. : ::::::::: ::::::::::::: ::.:::
CCDS77 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 ALKRLIHRTLGSQKL
::.: .:..:
CCDS77 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 (303 aa)
initn: 1510 init1: 1468 opt: 1469 Z-score: 1254.7 bits: 240.3 E(32554): 1.4e-63
Smith-Waterman score: 1469; 74.7% identity (90.5% similar) in 296 aa overlap (15-310:1-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
.:::.: ::.:.:::: :::::::::::: ::::::.:: :.:::
CCDS31 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::.::: ::::::
CCDS31 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
::::::::.::::::::.. . :.::::::: :: ::::::::.::::::: :.::::::
CCDS31 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
:::::. ::::::..::. :...:.: ...: :::: ::..: ..:...:::.::..:::
CCDS31 DSPPVLRLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTHIAAAILKIPSAKGKNKAFS
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
:::.::::::::: . ::::::.:. : :.::::::: ::.:::::::::: ::.:::
CCDS31 TCSSHLLVVSLFYISLSLTYFRPKSNNSPEGKKLLSLSYTVMTPMLNPIIYSLRNNEVKN
230 240 250 260 270 280
310
pF1KE6 ALKRLIHRTLGSQKL
::.: . ..:
CCDS31 ALSRTVSKALALRNCIP
290 300
>>CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 (316 aa)
initn: 1281 init1: 1220 opt: 1278 Z-score: 1094.4 bits: 210.7 E(32554): 1.2e-54
Smith-Waterman score: 1278; 61.0% identity (84.4% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
:. :: : :.::.:..:. . :.:. ::..::.:: :::.:: ::. :: .: :::.::
CCDS31 MICENHTRVTEFILLGFTN-NPEMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
::::.:::.::. :.::.::::: :. :::.::.::::::::::..:: ::. ::
CCDS31 YFFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFFFFFGSSECFLLSMMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
:::.::::.:::: :::.. : .: .::.:: :. .::.:....:::::: :.::::
CCDS31 YDRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMMALPFCGPNAVDHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
:.:::. :: .::...:..::..:.:::.::: ::: ::.::. ::.:: :: :...:::
CCDS31 DGPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIITILRMSSATGRQKAFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
:::.::.::::::.:: :::.::.:. : :::::.::: ::.:::::::::. ::.:::.
CCDS31 TCSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPMLNPIIYGLRNNEVKG
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 ALKRLIHRTLGSQKL
:.:: : . . :::
CCDS31 AVKRTITQKV-LQKLDVF
300 310
>>CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 (312 aa)
initn: 1163 init1: 1128 opt: 1173 Z-score: 1006.5 bits: 194.4 E(32554): 9.7e-50
Smith-Waterman score: 1173; 57.9% identity (81.6% similar) in 309 aa overlap (2-310:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
: : ..:.::.:..:: :. .::.::: .::::::.:. :: ::.... .:.::::::
CCDS34 MSANTSMVTEFLLLGFSHLA-DLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
:::::.:: ::::.. : :: .: :. :: ::: ::.::.::::.::::::.::
CCDS34 YFFLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRHISRSGCALQMFFFLFFGATECCLLAAMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
::::.:::.::.::....: : :::...: : :. .: .:::.:::::: . .:::
CCDS34 YDRYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
. ::. :::.:::. ::. . ::.:.:: :: :::::: ::: ::::.::. :...:::
CCDS34 EIQPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKAFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
:::.::..:::::.::.. :.::..: . . :.:: .::::.::::::: :: ::::
CCDS34 TCSSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNTEVKA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 ALKRLIHRTLGSQKL
:::: :..:.
CCDS34 ALKRTIQKTVPMEI
300 310
>>CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1180 init1: 1115 opt: 1152 Z-score: 988.8 bits: 191.1 E(32554): 9.3e-49
Smith-Waterman score: 1152; 54.5% identity (83.8% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
: .: . : ::.:..:: . :::. :: .::.::.::::::..: .. ...:. ::
CCDS31 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFP-ELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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310
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