Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6022
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6022, 315 aa
1>>>pF1KE6022 315 - 315 aa - 315 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6559+/-0.00118; mu= 13.6276+/- 0.069
mean_var=180.3316+/-65.669, 0's: 0 Z-trim(102.2): 419 B-trim: 380 in 1/49
Lambda= 0.095508
statistics sampled from 6335 (6863) to 6335 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.559), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 2.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 2087 300.9 8.6e-82
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 2078 299.6 2e-81
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 1890 273.8 1.3e-73
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 1494 219.2 3.4e-57
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 1416 208.4 5.9e-54
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 1390 204.8 7e-53
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1379 203.3 2e-52
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1363 201.1 9.4e-52
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1326 196.0 3.2e-50
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1318 195.0 7.4e-50
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 1248 185.3 5.4e-47
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1156 172.6 3.6e-43
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1138 170.2 2.1e-42
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1126 168.5 6.2e-42
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 1110 166.3 2.9e-41
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 1105 165.6 4.6e-41
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1098 164.6 9e-41
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1087 163.1 2.6e-40
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1083 162.5 3.8e-40
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1069 160.6 1.4e-39
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1068 160.5 1.6e-39
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 1064 159.9 2.3e-39
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 1047 157.6 1.2e-38
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1036 156.1 3.4e-38
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 1035 155.9 3.7e-38
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 1010 152.5 4e-37
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 1007 152.1 5.4e-37
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 979 148.2 7.9e-36
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 969 146.9 2.1e-35
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 967 146.6 2.5e-35
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 916 139.5 3.2e-33
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 910 138.7 5.6e-33
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 896 136.8 2.2e-32
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 890 136.0 3.9e-32
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 880 134.6 1e-31
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 878 134.3 1.2e-31
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 878 134.3 1.2e-31
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 877 134.1 1.3e-31
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 877 134.1 1.3e-31
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 876 134.0 1.5e-31
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 872 133.5 2.1e-31
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 869 133.0 2.8e-31
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 869 133.1 2.8e-31
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 869 133.1 2.8e-31
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 866 132.6 3.8e-31
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 863 132.3 5.4e-31
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 861 131.9 6.1e-31
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 861 132.0 6.2e-31
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 859 131.7 7.4e-31
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 859 131.7 7.5e-31
>>CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 (315 aa)
initn: 2087 init1: 2087 opt: 2087 Z-score: 1581.9 bits: 300.9 E(32554): 8.6e-82
Smith-Waterman score: 2087; 100.0% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MANITRMANHTGKLDFILMGLFRRSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MANITRMANHTGKLDFILMGLFRRSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKD
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 VMGALKKMLTVRFVL
:::::::::::::::
CCDS31 VMGALKKMLTVRFVL
310
>>CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 (315 aa)
initn: 2078 init1: 2078 opt: 2078 Z-score: 1575.2 bits: 299.6 E(32554): 2e-81
Smith-Waterman score: 2078; 99.4% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MANITRMANHTGKLDFILMGLFRRSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLH
::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MANITRMANHTGRLDFILMGLFRQSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKD
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 VMGALKKMLTVRFVL
:::::::::::::::
CCDS55 VMGALKKMLTVRFVL
310
>>CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 (348 aa)
initn: 1890 init1: 1890 opt: 1890 Z-score: 1434.8 bits: 273.8 E(32554): 1.3e-73
Smith-Waterman score: 1890; 91.3% identity (95.8% similar) in 311 aa overlap (1-311:29-339)
10 20 30
pF1KE6 MANITRMANHTGKLDFILMGLFRRSKHPALLS
::::: :::::: ::::.::::.:::::::
CCDS31 MDNITWMASHTGWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLC
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 VVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLHSPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMG
:::::::: :::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VVIFVVFLMALSGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMG
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 VNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGC
:::.::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS31 VNKISAPECGMQMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGC
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 WFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHHFFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLL
::::::::: .:::::.::: : :::::::::::: :::::::::: .::::::::::
CCDS31 WFLGSVDGFTFTPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 IPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTP
:::.::::::::::::.: ::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS31 IPVVIISSSYLLILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTP
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KE6 EKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVRFVL
::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS31 EKDMMVSVFYTILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVEPAFQKAME
310 320 330 340
>>CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1527 init1: 1484 opt: 1494 Z-score: 1140.3 bits: 219.2 E(32554): 3.4e-57
Smith-Waterman score: 1494; 71.3% identity (88.3% similar) in 307 aa overlap (6-312:2-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MANITRMANHTGKLDFILMGLFRRSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLH
:.::.: ::.:.:.: . .::. : ..:: .:: :.: : .:::::: :. ::
CCDS31 MRLANQTLGGDFFLLGIFSQISHPGRLCLLIFSIFLMAVSWNITLILLIHIDSSLH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLA
.::::::.::::.:..::::::::::..:. . .:. :: ::..:: :.:.: :::
CCDS31 TPMYFFINQLSLIDLTYISVTVPKMLVNQLAKDKTISVLGCGTQMYFYLQLGGAECCLLA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 TMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHH
.::::::::::::::: :::.:::::.:::::::.:::::::::::.:::::::: ::.:
CCDS31 AMAYDRYVAICHPLRYSVLMSHRVCLLLASGCWFVGSVDGFMLTPIAMSFPFCRSHEIQH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKK
:::::::: :::::::::. .::::::.:::::::.:: :: :.::.:.:::.:::::
CCDS31 FFCEVPAVLKLSCSDTSLYKIFMYLCCVIMLLIPVTVISVSYYYIILTIHKMNSVEGRKK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKD
::.:::::.::: ::::::.:.:::::::.::::::: : :::::::::::.:::.::::
CCDS31 AFTTCSSHITVVSLFYGAAIYNYMLPSSYQTPEKDMMSSFFYTILTPVLNPIIYSFRNKD
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 VMGALKKMLTVRFVL
: ::::::.:.
CCDS31 VTRALKKMLSVQKPPY
300 310
>>CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 (318 aa)
initn: 1428 init1: 1404 opt: 1416 Z-score: 1082.2 bits: 208.4 E(32554): 5.9e-54
Smith-Waterman score: 1416; 67.4% identity (86.5% similar) in 304 aa overlap (9-312:10-313)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MANITRMANHTGKLDFILMGLFRRSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHL
:.:.. :: : ::: .::: ::: .: :..:: ::.:::.:::::: . .:
CCDS31 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 HSPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLL
:.:::::::::.:::. :. :::::::. :: : . .: ::.:::.::::::.: :::
CCDS31 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFYLTLAGAEVFLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 ATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIH
:.::::::.:.:.::.::.:::.::: .:.:.:: :: :::..:::::::::::.: .:
CCDS31 AAMAYDRYAAVCRPLHYPLLMNQRVCQLLVSACWVLGMVDGLLLTPITMSFPFCQSRKIL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 HFFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRK
::::.::. :::::.:::.:::::::.:::: :. .::::: ::: .:::::: :..
CCDS31 SFFCETPALLKLSCSDVSLYKTLMYLCCILMLLAPIMVISSSYTLILHLIHRMNSAAGHR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KAFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNK
::.::::::. .:.:..::. ::::::::::: :.:::::.::::.::::::::::::::
CCDS31 KALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLPSSYHTAEQDMMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLRNK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 DVMGALKKMLTVRFVL
:: ::..:. :
CCDS31 DVTRALRSMMQSRMNQEK
310
>>CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 (318 aa)
initn: 1402 init1: 1378 opt: 1390 Z-score: 1062.8 bits: 204.8 E(32554): 7e-53
Smith-Waterman score: 1390; 66.4% identity (85.5% similar) in 304 aa overlap (9-312:10-313)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MANITRMANHTGKLDFILMGLFRRSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHL
:.:.. :: : ::: .::: ::: .: :..:: ::.:::.:::::: . .:
CCDS31 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 HSPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLL
:.:::::::::.:::. :. :::::::. :: : . .: ::.:::..:::::.: :::
CCDS31 HTPMYFFISQLALMDLMYLCVTVPKMLVGQVTGDDTISPSGCGIQMFFHLTLAGAEVFLL
70 80 90 100 110 120
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300 310
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310
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CCDS31 TPMYFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIF-YLTLIGGEFFLLG
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CCDS31 FFCEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRK
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CCDS31 AFATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKD
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CCDS31 VAAALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
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CCDS31 MEQSNYSVYADFILLGLFSNARFPWLLFALILLVFLTSIASNVVKIILIHIDSRLH
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CCDS31 TPMYFLLSQLSLRDILYISTIVPKMLVDQVMSQRAISFAGCTAQHFLYLTLAGAEFFLLG
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CCDS31 VTGALQKVVGRCVSSGKVTTF
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CCDS31 VVILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSSTDFTFMGLFNRKETSGLIFAIISIIF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]