Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6018
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6018, 315 aa
1>>>pF1KE6018 315 - 315 aa - 315 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6468+/-0.00115; mu= 13.8422+/- 0.067
mean_var=190.8357+/-68.646, 0's: 0 Z-trim(103.0): 400 B-trim: 400 in 1/48
Lambda= 0.092842
statistics sampled from 6691 (7188) to 6691 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.563), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 1.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 2116 296.8 1.4e-80
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1859 262.4 3.3e-70
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1213 175.9 3.7e-44
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 1204 174.7 8.4e-44
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1199 174.0 1.3e-43
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1199 174.0 1.4e-43
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1197 173.7 1.6e-43
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1196 173.7 1.9e-43
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1179 171.3 8.6e-43
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1172 170.4 1.7e-42
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 1169 170.0 2.2e-42
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1169 170.1 2.4e-42
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1161 168.9 4.6e-42
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 1146 166.9 1.8e-41
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1111 162.2 4.8e-40
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1090 159.4 3.3e-39
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 1089 159.3 3.8e-39
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 1086 158.9 5.1e-39
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 1073 157.1 1.6e-38
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 1070 156.7 2.1e-38
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 1069 156.6 2.3e-38
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 1062 155.6 4.5e-38
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 1056 154.8 7.8e-38
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 1049 153.9 1.5e-37
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 1046 153.5 2e-37
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 1036 152.2 5.1e-37
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 1027 151.0 1.2e-36
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 1025 150.7 1.4e-36
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 938 139.1 4.5e-33
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 930 138.0 9.6e-33
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 929 137.8 1e-32
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 923 137.0 1.8e-32
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 923 137.0 1.8e-32
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 921 136.8 2.2e-32
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 920 136.6 2.4e-32
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 920 136.6 2.4e-32
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 919 136.5 2.6e-32
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 917 136.2 3.1e-32
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 916 136.1 3.5e-32
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 914 135.9 4.3e-32
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 905 134.6 9.6e-32
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 905 134.6 9.7e-32
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 904 134.5 1.1e-31
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 895 133.3 2.5e-31
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 893 133.0 2.9e-31
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 891 132.8 3.5e-31
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 885 131.9 6.1e-31
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 879 131.1 1.1e-30
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 876 130.8 1.5e-30
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 873 130.3 1.9e-30
>>CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 (315 aa)
initn: 2116 init1: 2116 opt: 2116 Z-score: 1560.0 bits: 296.8 E(32554): 1.4e-80
Smith-Waterman score: 2116; 100.0% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 METWVNQSYTDGFFLLGIFSHSTADLVLFSVVMAVFTVALCGNVLLIFLIYMDPHLHTPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 METWVNQSYTDGFFLLGIFSHSTADLVLFSVVMAVFTVALCGNVLLIFLIYMDPHLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLSQLSLMDLMLVCTNVPKMAANFLSGRKSISFVGCGIQIGLFVCLVGSEGLLLGLMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YFFLSQLSLMDLMLVCTNVPKMAANFLSGRKSISFVGCGIQIGLFVCLVGSEGLLLGLMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAISHPLHYPILMNQRVCLQITGSSWAFGIIDGLIQMVVVMNFPYCGLRKVNHFFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YDRYVAISHPLHYPILMNQRVCLQITGSSWAFGIIDGLIQMVVVMNFPYCGLRKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EMLSLLKLACVDTSLFEKVIFACCVFMLLFPFSIIVASYAHILGTVLQMHSAQAWKKALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EMLSLLKLACVDTSLFEKVIFACCVFMLLFPFSIIVASYAHILGTVLQMHSAQAWKKALA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSSHLTAVTLFYGAAMFIYLRPRHYRAPSHDKVASIFYTVLTPMLNPLIYSLRNREVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TCSSHLTAVTLFYGAAMFIYLRPRHYRAPSHDKVASIFYTVLTPMLNPLIYSLRNREVMG
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 ALRKGLDRCRIGSQH
:::::::::::::::
CCDS44 ALRKGLDRCRIGSQH
310
>>CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 (315 aa)
initn: 1859 init1: 1859 opt: 1859 Z-score: 1373.9 bits: 262.4 E(32554): 3.3e-70
Smith-Waterman score: 1859; 87.3% identity (96.2% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 METWVNQSYTDGFFLLGIFSHSTADLVLFSVVMAVFTVALCGNVLLIFLIYMDPHLHTPM
: ::::::::::::::::::: .::::::.::.:::::::::::::::::.: :::::
CCDS58 MGRWVNQSYTDGFFLLGIFSHSQTDLVLFSAVMVVFTVALCGNVLLIFLIYLDAGLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLSQLSLMDLMLVCTNVPKMAANFLSGRKSISFVGCGIQIGLFVCLVGSEGLLLGLMA
::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::::::.:: :::::::::::::
CCDS58 YFFLSQLSLMDLMLVCNIVPKMAANFLSGRKSISFVGCGIQIGFFVSLVGSEGLLLGLMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAISHPLHYPILMNQRVCLQITGSSWAFGIIDGLIQMVVVMNFPYCGLRKVNHFFC
::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::..:..:::: :.:.::::
CCDS58 YDRYVAVSHPLHYPILMNQRVCLQITGSSWAFGIIDGVIQMVAAMGLPYCGSRSVDHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EMLSLLKLACVDTSLFEKVIFACCVFMLLFPFSIIVASYAHILGTVLQMHSAQAWKKALA
:. .::::::.:::::. ..:::::::::.:::::.:::: :::.::...::::::::::
CCDS58 EVQALLKLACADTSLFDTLLFACCVFMLLLPFSIIMASYACILGAVLRIRSAQAWKKALA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSSHLTAVTLFYGAAMFIYLRPRHYRAPSHDKVASIFYTVLTPMLNPLIYSLRNREVMG
::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS58 TCSSHLTAVTLFYGAAMFMYLRPRRYRAPSHDKVASIFYTVLTPMLNPLIYSLRNGEVMG
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 ALRKGLDRCRIGSQH
:::::::::::::::
CCDS58 ALRKGLDRCRIGSQH
310
>>CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1229 init1: 1201 opt: 1213 Z-score: 906.4 bits: 175.9 E(32554): 3.7e-44
Smith-Waterman score: 1213; 54.7% identity (83.2% similar) in 309 aa overlap (4-312:3-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 METWVNQSYTDGFFLLGIFSHSTADLVLFSVVMAVFTVALCGNVLLIFLIYMDPHLHTPM
: ::.... :.:::::.:: . :: .:.:.:.::. :: ....:::.: .:::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLSQLSLMDLMLVCTNVPKMAANFLSGRKSISFVGCGIQIGLFVCLVGSEGLLLGLMA
::.:::: ::::::.:..::::: :.::: ::::..::. :: ..: :.::: .::..:.
CCDS31 YFLLSQLFLMDLMLICSTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYVSLLGSECFLLAVMS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAISHPLHYPILMNQRVCLQITGSSWAFGIIDGLIQMVVVMNFPYCGLRKVNHFFC
::::.:: :::.: :: ..: .:. :: .: .:..:. :....: ::: :.. ::::
CCDS31 YDRYIAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSMDAIIDAVATFSFSYCGSREIAHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EMLSLLKLACVDTSLFEKVIFACCVFMLLFPFSIIVASYAHILGTVLQMHSAQAWKKALA
.. ::: :.: :::.::::.: ::. :..:: .::.::::... .:..: :... .::..
CCDS31 DFPSLLILSCNDTSIFEKVLFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSSHLTAVTLFYGAAMFIYLRPRHYRAPSHDKVASIFYTVLTPMLNPLIYSLRNREVMG
:::::: .: ..:::..:.:.:: :.: .::..:.:::.::::::::::::::.::
CCDS31 TCSSHLMVVGMYYGAGLFMYIRPTSDRSPMQDKLVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTR
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 ALRKGLDRCRIGSQH
:::: : . . :
CCDS31 ALRKVLGKGKCGE
300 310
>>CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 (311 aa)
initn: 1239 init1: 1192 opt: 1204 Z-score: 899.9 bits: 174.7 E(32554): 8.4e-44
Smith-Waterman score: 1204; 53.9% identity (85.1% similar) in 308 aa overlap (4-311:3-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 METWVNQSYTDGFFLLGIFSHSTADLVLFSVVMAVFTVALCGNVLLIFLIYMDPHLHTPM
: ::.... :.:::::.:: . :::.:...:..:: :. ...:::.. .:::::
CCDS31 MVWENQTFNSIFILLGIFNHSPTHTFLFSLVLGIFSLALMENISMVLLIYIEKQLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLSQLSLMDLMLVCTNVPKMAANFLSGRKSISFVGCGIQIGLFVCLVGSEGLLLGLMA
::.:::::::::::.::..::: ..:::.::::..::: :: ..: :.:.: .::..::
CCDS31 YFLLSQLSLMDLMLICTTLPKMIFSYLSGKKSISLAGCGTQIFFYVSLLGAECFLLAVMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAISHPLHYPILMNQRVCLQITGSSWAFGIIDGLIQMVVVMNFPYCGLRKVNHFFC
::::::: :::.: :::: ..:. .: .::..: .::.: ...:..: ::. ...::::
CCDS31 YDRYVAICHPLQYTILMNPKLCVFMTVASWTLGSLDGIIVLAAVLSFSYCSSLEIHHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EMLSLLKLACVDTSLFEKVIFACCVFMLLFPFSIIVASYAHILGTVLQMHSAQAWKKALA
.. .:: :.:..:: ::... ::: ::.:: :.:. ::.:.: .:..: :... .::..
CCDS31 DVAALLPLSCTETSAFERLLVICCVVMLIFPVSVIILSYSHVLRAVIHMGSGESRRKAFT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSSHLTAVTLFYGAAMFIYLRPRHYRAPSHDKVASIFYTVLTPMLNPLIYSLRNREVMG
::::::..: :.::::::.:.:: ..:..::..: :::.::::::::::::::.::.
CCDS31 TCSSHLSVVGLYYGAAMFMYMRPASKHTPDQDKMVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVFR
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 ALRKGLDRCRIGSQH
::.: : . ..
CCDS31 ALQKVLKKRKLI
300 310
>>CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1199 init1: 1199 opt: 1199 Z-score: 896.2 bits: 174.0 E(32554): 1.3e-43
Smith-Waterman score: 1199; 56.2% identity (83.9% similar) in 304 aa overlap (6-309:3-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 METWVNQSYTDGFFLLGIFSHSTADLVLFSVVMAVFTVALCGNVLLIFLIYMDPHLHTPM
: :::. :.:::.:.:. : ::: .:... ..: :: :.:.::. : .:::::
CCDS31 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFGNSLMILLIHWDHRLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLSQLSLMDLMLVCTNVPKMAANFLSGRKSISFVGCGIQIGLFVCLVGSEGLLLGLMA
::.::::::::.::: :.::::::..:.: :.:: .::: :: .. : :.: .::. ::
CCDS31 YFLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGAQIFFLPTLGGGECFLLAAMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAISHPLHYPILMNQRVCLQITGSSWAFGIIDGLIQMVVVMNFPYCGLRKVNHFFC
::::.:. :::.:: ::. ..::... : : .: :::.: :....::::: ....::::
CCDS31 YDRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMNLSCWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EMLSLLKLACVDTSLFEKVIFACCVFMLLFPFSIIVASYAHILGTVLQMHSAQAWKKALA
: :..:::.:::.::.... :::.::: :::.:..::. ::..::.:.:..: :::.:
CCDS31 ETPVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLHMRSTEARKKAFA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSSHLTAVTLFYGAAMFIYLRPRHYRAPSHDKVASIFYTVLTPMLNPLIYSLRNREVMG
:::::...: ::::::.: :.::. .:. .::::.: :::..::.:::::::..: :: :
CCDS31 TCSSHVAVVGLFYGAAIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVKNSEVKG
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 ALRKGLDRCRIGSQH
:: . . ::
CCDS31 ALTRCMGRCVALSRE
300 310
>>CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 1228 init1: 1187 opt: 1199 Z-score: 896.1 bits: 174.0 E(32554): 1.4e-43
Smith-Waterman score: 1199; 55.9% identity (83.7% similar) in 306 aa overlap (10-315:7-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 METWVNQSYTDGFFLLGIFSHSTADLVLFSVVMAVFTVALCGNVLLIFLIYMDPHLHTPM
: :.:::.:.:. : ::: .:... ..: :: :.:.::. : .:::::
CCDS31 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFGNSLMILLIHWDHRLHTPM
10 20 30 40 50
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CCDS31 AFMKILGKGKSESELPHKLYVLLFAKFFFLISIFFYDVKILALIMYIA
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