FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6015, 315 aa
1>>>pF1KE6015 315 - 315 aa - 315 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6147+/-0.00135; mu= 14.0919+/- 0.079
mean_var=160.6238+/-53.529, 0's: 0 Z-trim(100.6): 380 B-trim: 368 in 1/49
Lambda= 0.101197
statistics sampled from 5737 (6174) to 5737 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.522), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 2029 309.3 2.5e-84
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1810 277.3 1.1e-74
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1180 185.3 5.2e-47
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1177 184.9 7e-47
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1132 178.3 6.8e-45
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1116 176.0 3.4e-44
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1101 173.8 1.5e-43
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1098 173.4 2.1e-43
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1092 172.5 4.1e-43
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1084 171.3 8.8e-43
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1083 171.2 9.5e-43
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1075 170.0 2.1e-42
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1058 167.5 1.2e-41
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1048 166.0 3.3e-41
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1047 165.9 3.6e-41
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1045 165.6 4.4e-41
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1045 165.6 4.6e-41
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1043 165.3 5.5e-41
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1032 163.7 1.7e-40
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1031 163.6 1.8e-40
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1027 163.0 2.8e-40
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1022 162.3 4.6e-40
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1016 161.4 8.5e-40
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1015 161.2 9.3e-40
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1012 160.8 1.3e-39
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1009 160.4 1.7e-39
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1006 159.9 2.3e-39
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CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 993 158.0 8.8e-39
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 989 157.4 1.3e-38
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 986 157.0 1.7e-38
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 985 156.9 1.9e-38
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 978 155.8 3.9e-38
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 973 155.1 6.5e-38
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 972 155.0 7.2e-38
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 971 154.8 7.9e-38
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 971 154.8 8e-38
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 965 154.0 1.5e-37
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 958 152.9 3e-37
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 955 152.5 4.1e-37
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 952 152.0 5.4e-37
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 949 151.7 8e-37
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 ( 313) 946 151.2 1e-36
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 943 150.7 1.4e-36
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 942 150.6 1.6e-36
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 940 150.3 1.8e-36
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 940 150.3 1.8e-36
CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 ( 325) 940 150.3 1.9e-36
>>CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 2029 init1: 2029 opt: 2029 Z-score: 1627.3 bits: 309.3 E(32554): 2.5e-84
Smith-Waterman score: 2029; 100.0% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYVLTMAGNLGIITLTSVDSRLQNPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYVLTMAGNLGIITLTSVDSRLQNPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLRHLAIINLGNSTVIAPKMLMNFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMMLAVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLRHLAIINLGNSTVIAPKMLMNFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMMLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSPCIFSVSYCSSNIINHFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSPCIFSVSYCSSNIINHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IAPLLALSCSDTYIPETIVFISAATNLVFSMITVLVSYFNIVLSILRIRSPEGRKKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IAPLLALSCSDTYIPETIVFISAATNLVFSMITVLVSYFNIVLSILRIRSPEGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CASHMIAVTVFYGTMLFMYLQPQTNHSLDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNNDVNVA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LKKFMENPCYSFKSM
:::::::::::::::
CCDS31 LKKFMENPCYSFKSM
310
>>CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1816 init1: 1583 opt: 1810 Z-score: 1454.5 bits: 277.3 E(32554): 1.1e-74
Smith-Waterman score: 1810; 88.6% identity (96.5% similar) in 316 aa overlap (1-315:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYVLTMAGNLGIITLTSVDSRLQNPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.:::
CCDS31 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYGLTMAGNLGIITLTSVDSRLQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLRHLAIINLGNSTVIAPKMLMNFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMMLAVMAY
:::.:::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::
CCDS31 FFLQHLALINLGNSTVIAPKMLINFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIMLALMAY
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSPCIFSVSYCSSNIINHFYCD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::
CCDS31 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSSYVFSVSYCSSNIINHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IAPLLALSCSDTYIPETIVFISAATNLVFSMITVLVSYFNIVLSILRIRSPEGRKKAFST
.:::::::::::.:::.::::::::.: :.: :::::::::::::.: : :::::::::
CCDS31 NVPLLALSCSDTYLPETVVFISAATNVVGSLIIVLVSYFNIVLSILKICSSEGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE6 CASHMIAVTVFYGTMLFMYLQPQTNHSLDTD-KMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNNDVNV
:::::.:::.::::.::::.::..::::::: :::::::::::::::::::::::.::..
CCDS31 CASHMMAVTIFYGTLLFMYVQPRSNHSLDTDDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKT
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 ALKKFMENPCYSFKSM
::..:: : :::::.:
CCDS31 ALQRFMTNLCYSFKTM
310
>>CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 (307 aa)
initn: 1180 init1: 1180 opt: 1180 Z-score: 957.5 bits: 185.3 E(32554): 5.2e-47
Smith-Waterman score: 1180; 57.3% identity (85.7% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYVLTMAGNLGIITLTSVDSRLQNPMY
:. .:.: .::::: .. :::::::: ::::.:..:..::: .: ::..::.:..:::
CCDS31 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLRHLAIINLGNSTVIAPKMLMNFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMMLAVMAY
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CCDS31 FSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFILSAMAY
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pF1KE6 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSPCIFSVSYCSSNIINHFYCD
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CCDS31 DRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCGSNVISHFYCD
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pF1KE6 IAPLLALSCSDTYIPETIVFISAATNLVFSMITVLVSYFNIVLSILRIRSPEGRKKAFST
.::: . ::.. : . .. .. ::. :.. :::::. :.:.: ...: :::::::::
CCDS31 DVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHSAEGRKKAFST
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pF1KE6 CASHMIAVTVFYGTMLFMYLQPQTNHSLDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNNDVNVA
:.::. .:.::::..::::.::...: .::::::::::::::::::::::::::..:. :
CCDS31 CGSHLTVVVVFYGSLLFMYMQPNSTHFFDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNEEVKNA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LKKFMENPCYSFKSM
. :..::
CCDS31 FYKLFEN
>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1209 init1: 1177 opt: 1177 Z-score: 955.1 bits: 184.9 E(32554): 7e-47
Smith-Waterman score: 1177; 57.0% identity (82.4% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYVLTMAGNLGIITLTSVDSRLQNPMY
:: : :..:::::.:... ::..:::..:: .:..:..::::.: : .:. :..:::
CCDS41 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
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pF1KE6 FFLRHLAIINLGNSTVIAPKMLMNFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMMLAVMAY
::: .::.... :.::.:::: ::: :... :: :::::: :: :..:: ..:: :::
CCDS41 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
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pF1KE6 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSPCIFSVSYCSSNIINHFYCD
:::::::::::::::.. .:. ::.. : :.: :. . : .::: :::.::::::
CCDS41 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
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pF1KE6 IAPLLALSCSDTYIPETIVFISAATNLVFSMITVLVSYFNIVLSILRIRSPEGRKKAFST
::: :.:::: . . .: :. .. :.. :.:::. :. .:::..: :::.:::::
CCDS41 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
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pF1KE6 CASHMIAVTVFYGTMLFMYLQPQTNHSLDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNNDVNVA
:.:::.:::.::::..::::::...:.::::::::::::..:::::::::::.:..:. :
CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LKKFMENPCYSFKSM
:::.. :
CCDS41 LKKIIINKN
>>CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 (319 aa)
initn: 1172 init1: 1124 opt: 1132 Z-score: 919.5 bits: 178.3 E(32554): 6.8e-45
Smith-Waterman score: 1132; 55.5% identity (84.4% similar) in 301 aa overlap (7-307:13-313)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYVLTMAGNLGIITLTSVDSR
:.:::::: :... : :: ::: .::..:..:. ::::.. :: .::.
CCDS31 MNHVVKHNHTAVTKVTEFILMGITDNPGLQAPLFGLFLIIYLVTVIGNLGMVILTYLDSK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LQNPMYFFLRHLAIINLGNSTVIAPKMLMNFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMM
:..:::::::::.: .:: :::::::::.::.:.:.: :. ::::. : .::.::...
CCDS31 LHTPMYFFLRHLSITDLGYSTVIAPKMLVNFIVHKNTISYNWYATQLAFFEIFIISELFI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LAVMAYDRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSPCIFSVSYCSSNII
:..::::::::::.::::........ .:: . :::. ... .. .:..:.:.::::
CCDS31 LSAMAYDRYVAICKPLLYVIIMAEKVLWVLVIVPYLYSTFVSLFLTIKLFKLSFCGSNII
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 NHFYCDIAPLLALSCSDTYIPETIVFISAATNLVFSMITVLVSYFNIVLSILRIRSPEGR
..:::: ::... :::: : :..: .. ::.::. ::.::. :...:::. : .::
CCDS31 SYFYCDCIPLMSILCSDTNELELIILIFSGCNLLFSLSIVLISYMFILVAILRMNSRKGR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KKAFSTCASHMIAVTVFYGTMLFMYLQPQTNHSLDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRN
::::::.::. .: .::::.::.::::...:.: ::::::::::.:::::::::::::
CCDS31 YKAFSTCSSHLTVVIMFYGTLLFIYLQPKSSHTLAIDKMASVFYTLLIPMLNPLIYSLRN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 NDVNVALKKFMENPCYSFKSM
..:. :::. . :
CCDS31 KEVKDALKRTLTNRFKIPI
310
>>CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1135 init1: 1110 opt: 1116 Z-score: 907.0 bits: 176.0 E(32554): 3.4e-44
Smith-Waterman score: 1116; 52.9% identity (81.4% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYVLTMAGNLGIITLTSVDSRLQNPMY
:. :: . ::::::.:.: ::::.::::.:: .::.:..::::. :: ..:.:..:::
CCDS73 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLRHLAIINLGNSTVIAPKMLMNFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMMLAVMAY
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310
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310
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CCDS84 LKKILNKNAFS
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CCDS31 FFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAY
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