Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6013
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6013, 314 aa
1>>>pF1KE6013 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6953+/-0.00123; mu= 13.4096+/- 0.072
mean_var=127.4819+/-40.513, 0's: 0 Z-trim(102.2): 386 B-trim: 801 in 2/47
Lambda= 0.113593
statistics sampled from 6377 (6866) to 6377 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.549), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 1.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1253 217.5 1.1e-56
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 1159 202.0 4.9e-52
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1108 193.7 1.6e-49
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 1091 190.9 1.1e-48
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1087 190.2 1.7e-48
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CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 1032 181.2 8.9e-46
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1021 179.5 3.3e-45
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1019 179.1 4e-45
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1009 177.5 1.2e-44
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1007 177.1 1.5e-44
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 993 174.8 7.6e-44
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 989 174.2 1.2e-43
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 986 173.7 1.7e-43
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 974 171.7 6.5e-43
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 970 171.1 1e-42
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 944 166.8 2e-41
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CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 939 166.0 3.5e-41
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 930 164.5 9.7e-41
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CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 929 164.4 1.1e-40
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 908 160.9 1.2e-39
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CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 877 155.8 3.9e-38
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 873 155.2 6.2e-38
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 864 153.7 1.7e-37
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 860 153.0 2.7e-37
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 858 152.7 3.4e-37
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 858 152.7 3.5e-37
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 840 149.8 2.7e-36
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 840 149.8 2.8e-36
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 839 149.6 3e-36
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 819 146.3 2.9e-35
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 772 138.7 6.5e-33
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 743 133.9 1.6e-31
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 732 132.1 5.6e-31
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 724 130.8 1.5e-30
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CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 708 128.1 8.8e-30
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 694 125.8 4.3e-29
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 692 125.5 5.4e-29
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 652 119.0 5e-27
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 634 116.0 3.9e-26
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 594 109.4 3.6e-24
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 592 109.1 4.5e-24
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 582 107.5 1.5e-23
>>CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 (323 aa)
initn: 1250 init1: 1250 opt: 1253 Z-score: 1130.9 bits: 217.5 E(32554): 1.1e-56
Smith-Waterman score: 1253; 57.6% identity (82.2% similar) in 309 aa overlap (7-310:2-310)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MPTVNHSGTSHTVFH-----LLGIPGLQDQHMWISIPFFISYVTALLGNSLLIFIILTKR
: :. :.:: : :::::. :.:.:::. . :.::.::::.:: .:. .:
CCDS53 MSHTNVTIFHPAVFVLPGIPGLEAYHIWLSIPLCLIYITAVLGNSILIVVIVMER
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 SLHEPMYLFLCMLAGADIVLSTCTIPQALAIFWFRAGDISLDRCITQLFFIHSTFISESG
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CCDS53 NLHVPMYFFLSMLAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNIAFDACVTQGFFVHMMFVGESA
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pF1KE6 ILLVMAFDHYIAICYPLRYTTILTNALIKKICVTVSLRSYGTIFPIIFLLKRLTFCQNNI
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CCDS53 ILLAMAFDRFVAICAPLRYTTVLTWPVVGRIALAVITRSFCIIFPVIFLLKRLPFCLTNI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 IPHTFCEHIGLAKYACNDIRINIWYGFSILMSTVVLDVVLIFISYMLILHAVFHMPSPDA
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CCDS53 VPHSYCEHIGVARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVILIAVSYSLILRAVFRLPSQDA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CHKALNTFGSHVCIIILFYGSGIFTILTQRFGRHIPPCIHIPLANVCILAPPMLNPIIYG
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CCDS53 RHKALSTCGSHLCVILMFYVPSFFTLLTHHFGRNIPQHVHILLANLYVAVPPMLNPIVYG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 IKTKQIQEQVVQFLFIKQK
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CCDS53 VKTKQIREGVAHRFFDIKTWCCTSPLGS
300 310 320
>>CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 1163 init1: 1141 opt: 1159 Z-score: 1047.7 bits: 202.0 E(32554): 4.9e-52
Smith-Waterman score: 1159; 52.9% identity (79.8% similar) in 312 aa overlap (1-312:7-317)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MPTVNHSGTSHTVFHLLGIPGLQDQHMWISIPFFISYVTALLGNSLLIFIILTK
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CCDS31 MPSASAMIIFNLSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVVGNCILLYLIVVE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 RSLHEPMYLFLCMLAGADIVLSTCTIPQALAIFWFRAGDISLDRCITQLFFIHSTFISES
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CCDS31 HSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKALSIFWLGAREITFPGCLTQMFFLHYNFVLDS
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120 130 140 150 160 170
pF1KE6 GILLVMAFDHYIAICYPLRYTTILTNALIKKICVTVSLRSYGTIFPIIFLLKRLTFCQNN
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CCDS31 AILMAMAFDHYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDVFLLTCLPFCRTR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 IIPHTFCEHIGLAKYACNDIRINIWYGFSILMSTVVLDVVLIFISYMLILHAVFHMPSPD
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CCDS31 IIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFGLPSQD
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ACHKALNTFGSHVCIIILFYGSGIFTILTQRFGRHIPPCIHIPLANVCILAPPMLNPIIY
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CCDS31 ACQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFGHNVSRTFHIMFANLYIVIPPALNPMVY
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 GIKTKQIQEQVVQFLFIKQK
:.:::::...:. .:: :
CCDS31 GVKTKQIRDKVI-LLFSKGTG
310 320
>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 1097 init1: 751 opt: 1108 Z-score: 1002.5 bits: 193.7 E(32554): 1.6e-49
Smith-Waterman score: 1108; 52.6% identity (78.5% similar) in 312 aa overlap (1-312:5-314)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MPTVNHSGTSHTVFHLLGIPGLQDQHMWISIPFFISYVTALLGNSLLIFIILTKRS
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CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
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pF1KE6 LHEPMYLFLCMLAGADIVLSTCTIPQALAIFWFRAGDISLDRCITQLFFIHSTFISESGI
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CCDS31 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
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pF1KE6 LLVMAFDHYIAICYPLRYTTILTNALIKKICVTVSLRSYGTIFPIIFLLKRLTFCQNNII
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CCDS31 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRII
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180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PHTFCEHIGLAKYACNDIRINIWYGFSILMSTVVLDVVLIFISYMLILHAVFHMPSPDAC
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CCDS31 PHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNI-SLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEAR
190 200 210 220 230
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pF1KE6 HKALNTFGSHVCIIILFYGSGIFTILTQRFGRHIPPCIHIPLANVCILAPPMLNPIIYGI
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CCDS31 LKALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 KTKQIQEQVVQFLFIKQK
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CCDS31 RTKQIRERVLR-IFLKTNH
300 310
>>CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 (335 aa)
initn: 1021 init1: 584 opt: 1091 Z-score: 987.2 bits: 190.9 E(32554): 1.1e-48
Smith-Waterman score: 1091; 52.4% identity (79.5% similar) in 307 aa overlap (4-309:22-327)
10 20 30 40
pF1KE6 MPTVNHSGTSHTVFHLLGIPGLQDQHMWISIPFFISYVTALL
.:.: : . : :::::.. :.:.:::: : :.:::
CCDS41 MAQVRALHKIMALFSANSIGAMNNSDTRIAGCFLTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITALE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 GNSLLIFIILTKRSLHEPMYLFLCMLAGADIVLSTCTIPQALAIFWFRAGDISLDRCITQ
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CCDS41 GNGILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQ
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 LFFIHSTFISESGILLVMAFDHYIAICYPLRYTTILTNALIKKICVTVSLRSYGTIFPII
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CCDS41 MFFIHFLFI-HSAVLLAMAFDRYVAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPSI
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 FLLKRLTFCQNNIIPHTFCEHIGLAKYACNDIRINIWYGFSILMSTVVLDVVLIFISYML
:::..: .:: ::: ::::::.:.:. .:.:: ::.:::.. . .. ::..:: .::.
CCDS41 FLLEHLHYCQINIIAHTFCEHMGIAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYIH
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 ILHAVFHMPSPDACHKALNTFGSHVCIIILFYGSGIFTILTQRFGRHIPPC-IHIPLANV
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CCDS41 ILQAVFRLLSQDARSKALSTCGSHICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSVPCYVHILLASL
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE6 CILAPPMLNPIIYGIKTKQIQEQVVQFLFIKQK
.. ::::::.:::..:: : : . :..
CCDS41 YVVIPPMLNPVIYGVRTKPILEGAKQMFSNLAKGSK
300 310 320 330
>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1088 init1: 941 opt: 1087 Z-score: 983.9 bits: 190.2 E(32554): 1.7e-48
Smith-Waterman score: 1087; 51.2% identity (80.3% similar) in 299 aa overlap (14-311:15-313)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MPTVNHSGTSHTVFHLLGIPGLQDQHMWISIPFFISYVTALLGNSLLIFIILTKRSLHE
: : :::::. :.::.::: :..::.::. ::..: .::
CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAALILVIAMDNALHA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PMYLFLCMLAGADIVLSTCTIPQALAIFWFRAGDISLDRCITQLFFIHSTFISESGILLV
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CCDS31 PMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCVHSIYALESSILLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MAFDHYIAICYPLRYTTILTNALIKKICVTVSLRSYGTIFPIIFLLKRLTFCQNNIIPHT
::::.:.::: ::::::::..:.: .: . .:: . . :.::::.:: .: . .. ::
CCDS31 MAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPFIFLLRRLPYCGHRVMTHT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FCEHIGLAKYACNDIRINIWYGFSILMSTVVLDVVLIFISYMLILHAVFHMPSPDACHKA
.:::.:.:. :: .: .:: ::... . .. :: .:: ::: .:::::::.:: :: :::
CCDS31 YCEHMGIARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYGFILHAVFHLPSHDAQHKA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LNTFGSHVCIIILFYGSGIFTILTQRFGRH-IPPCIHIPLANVCILAPPMLNPIIYGIKT
:.: :::. ::..:: ..:..::.:::.: .: .:: :::. .:.::.::::.:: .:
CCDS31 LSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPILYGART
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 KQIQEQVVQFLFIKQK
:.:. .....: .
CCDS31 KEIRSRLLKLLHLGKTSI
310
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQP
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 NTCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQ
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310
pF1KE6 IQEQVVQFLFIKQK
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CCDS31 IREQIVK-IFVQKE
300 310
>>CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 (313 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS53 MYYCLAMLDSIDLSLSTATIPKMLGIFWFNIKEISFGGYLSQMFFIHFFTVMESIVLVAM
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CCDS53 AFDRYIAICKPLWYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVIPLVFLLLRLPFCGHRIIPHTY
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CCDS53 CEHMGIARLACASIKVNIMFGLGSI-SLLLLDVLLIILSHIRILYAVFCLPSWEARLKAL
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CCDS53 NTCGSHIGVILAFSTPAFFSFFTHCFGHDIPQYIHIFLANLYVVVPPTLNPVIYGVRTKH
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310
pF1KE6 IQEQVVQFLFIKQK
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CCDS53 IRETVLRIFFKTDH
300 310
>>CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 (342 aa)
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10 20 30 40
pF1KE6 MPTVNHSGTSHTVFHLLGIPGLQDQHMWISIPFFISYVTALLGNSLLI
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CCDS31 MTETSLSSQCFPMSVLNNTIAEPLIFLLMGIPGLKATQYWISIPFCLLYVVAVSGNSMIL
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pF1KE6 FIILTKRSLHEPMYLFLCMLAGADIVLSTCTIPQALAIFWFRAGDISLDRCITQLFFIHS
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CCDS31 FVVLCERSLHKPMYYFLSMLSATDLSLSLCTLSTTLGVFWFEAREINLNACIAQMFFLHG
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CCDS31 FTFMESGVLLAMAFDRFVAICYPLRYTTILTNARIAKIGMSMLIRNVAVMLPVMLFVKRL
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CCDS31 SFCSSMVLSHSYCYHVDLIQLSCTDNRINSILGLFALLSTTGFDCPCILLSYILIIRSVL
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230 240 250 260 270 280
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CCDS31 SIASSEERRKAFNTCTSHISAVSIFYLPLISLSLVHRYGHSAPPFVHIIMANVFLLIPPV
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290 300 310
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CCDS31 LNPIIYSVKIKQIQKAIIKVLIQKHSKSNHQLFLIRDKAIYE
310 320 330 340
>>CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 (325 aa)
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CCDS31 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
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pF1KE6 MYLFLCMLAGADIVLSTCTIPQALAIFWFRAGDISLDRCITQLFFIHSTFISESGILLVM
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CCDS31 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
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pF1KE6 AFDHYIAICYPLRYTTILTNALIKKICVTVSLRSYGTIFPIIFLLKRLTFCQNNIIPHTF
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CCDS31 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILRLPFCGNHVIPHTY
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pF1KE6 CEHIGLAKYACNDIRINIWYGFSILMSTVVLDVVLIFISYMLILHAVFHMPSPDACHKAL
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CCDS31 CEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICN-LVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSL
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CCDS31 STCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTKQ
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pF1KE6 IQEQVVQFLFIKQK
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CCDS31 IYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
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>>CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 (321 aa)
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CCDS44 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYEDALHKP
10 20 30 40 50 60
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CCDS44 MYYFLAMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFTHTFTGMESGVLMLM
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CCDS44 ALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKLLPYCRGNILPHTY
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CCDS44 CDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVVSLSSADARQKAF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]