Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6012
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6012, 314 aa
1>>>pF1KE6012 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9159+/-0.0012; mu= 12.5466+/- 0.071
mean_var=213.6409+/-77.063, 0's: 0 Z-trim(102.5): 396 B-trim: 394 in 1/48
Lambda= 0.087747
statistics sampled from 6486 (6976) to 6486 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16
Scan time: 1.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 2092 278.6 4.4e-75
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1335 182.7 3.1e-46
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1145 158.7 5.4e-39
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1135 157.4 1.3e-38
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1120 155.6 5.1e-38
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 1080 150.5 1.7e-36
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1071 149.3 3.6e-36
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 1059 147.8 1e-35
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1040 145.4 5.4e-35
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1040 145.4 5.5e-35
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1033 144.5 1e-34
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 1033 144.5 1e-34
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1026 143.6 1.8e-34
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 1008 141.4 9e-34
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1000 140.3 1.8e-33
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 999 140.2 2e-33
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 995 139.7 2.8e-33
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 995 139.7 2.9e-33
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 994 139.6 3.1e-33
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 992 139.4 3.7e-33
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 990 139.1 4.4e-33
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 987 138.7 5.8e-33
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 986 138.6 6.3e-33
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 983 138.2 8.2e-33
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 981 137.9 9.7e-33
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 950 134.0 1.5e-31
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 946 133.5 2.1e-31
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 935 132.1 5.5e-31
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 925 130.9 1.3e-30
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 925 130.9 1.4e-30
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 923 130.6 1.6e-30
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 920 130.2 2e-30
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 910 129.0 4.9e-30
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 900 127.7 1.2e-29
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 899 127.6 1.3e-29
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 869 123.7 1.8e-28
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 855 122.0 6.1e-28
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 823 118.0 1e-26
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 808 116.0 3.8e-26
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 793 114.2 1.5e-25
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 790 113.8 1.9e-25
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 713 104.0 1.6e-22
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 686 100.7 1.8e-21
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 680 99.8 2.8e-21
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 672 98.8 5.7e-21
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 671 98.7 6.3e-21
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 656 96.8 2.4e-20
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 600 89.7 3.2e-18
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 594 88.9 5.3e-18
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 592 88.7 6.4e-18
>>CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 2092 init1: 2092 opt: 2092 Z-score: 1461.4 bits: 278.6 E(32554): 4.4e-75
Smith-Waterman score: 2092; 99.7% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLGLNGTPFQPATLQLTGIPGIQTGLTWVALIFCILYMISIVGNLSILTLVFWEPALHQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MLGLNGTPFQPATLQLTGIPGIQTGLTWVALIFCILYMISIVGNLSILTLVFWEPALHQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYYFLSMLALNDLGVSFSTLPTVISTFCFNYNHVAFNACLVQMFFIHTFSFMESGILLAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MYYFLSMLALNDLGVSFSTLPTVISTFCFNYNHVAFNACLVQMFFIHTFSFMESGILLAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SLDRFVAICYPLRYVTVLTHNRILAMGLGILTKSFTTLFPFPFLVKRLPFCKGNVLHHSY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS31 SLDRFVAICYPLRYVTVLTHNRILAMGLGILTKSFTTLFPFPFVVKRLPFCKGNVLHHSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CLHPDLMKVACGDIHVNNIYGLLVIIFTYGMDSTFILLSYALILRAMLVIISQEQRLKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CLHPDLMKVACGDIHVNNIYGLLVIIFTYGMDSTFILLSYALILRAMLVIISQEQRLKAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NTCMSHICAVLAFYVPIIAVSMIHRFWKSAPPVVHVMMSNVYLFVPPMLNPIIYSVKTKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NTCMSHICAVLAFYVPIIAVSMIHRFWKSAPPVVHVMMSNVYLFVPPMLNPIIYSVKTKE
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 IRKGILKFFHKSQA
::::::::::::::
CCDS31 IRKGILKFFHKSQA
310
>>CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1335 init1: 1335 opt: 1335 Z-score: 943.5 bits: 182.7 E(32554): 3.1e-46
Smith-Waterman score: 1335; 61.8% identity (87.7% similar) in 301 aa overlap (10-310:8-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MLGLNGTPFQPATLQLTGIPGIQTGLTWVALIFCILYMISIVGNLSILTLVFWEPALHQP
.:: . ::::::.... .:.. .:..: ... :: :: : ::.::.:
CCDS31 MGLFNVTHPAFFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVILQAVRVEPSLHEP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYYFLSMLALNDLGVSFSTLPTVISTFCFNYNHVAFNACLVQMFFIHTFSFMESGILLAM
::::::::...:...:..:::::. :::.: ...:.:::.:::.:: ::.:::::::::
CCDS31 MYYFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHFFSMMESGILLAM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SLDRFVAICYPLRYVTVLTHNRILAMGLGILTKSFTTLFPFPFLVKRLPFCKGNVLHHSY
:.::.:::: ::::.:::: . : ::::: ..:: ::::.:::.::::.:..::: :::
CCDS31 SFDRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRLPICRSNVLSHSY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CLHPDLMKVACGDIHVNNIYGLLVIIFTYGMDSTFILLSYALILRAMLVIISQEQRLKAL
:::::.:..::.:: .:.::::.:.. :.::: ::.:::.::::.... :.:.:::::
CCDS31 CLHPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVMATASREERLKAL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NTCMSHICAVLAFYVPIIAVSMIHRFWKSAPPVVHVMMSNVYLFVPPMLNPIIYSVKTKE
:::.::: ::::::::.:.:: .::: : .: .::.::::::::::.:::.:::.::::
CCDS31 NTCVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVPPVLNPLIYSAKTKE
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 IRKGILKFFHKSQA
::..:...::
CCDS31 IRRAIFRMFHHIKI
300 310
>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1130 init1: 1130 opt: 1145 Z-score: 813.5 bits: 158.7 E(32554): 5.4e-39
Smith-Waterman score: 1145; 50.8% identity (84.6% similar) in 305 aa overlap (5-309:6-309)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLGLNGTPFQPATLQLTGIPGIQTGLTWVALIFCILYMISIVGNLSILTLVFWEPALHQ
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CCDS31 MGDWNNSDAVEPIFI-LRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIESSLHQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PMYYFLSMLALNDLGVSFSTLPTVISTFCFNYNHVAFNACLVQMFFIHTFSFMESGILLA
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CCDS31 PMYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLESSVLLA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MSLDRFVAICYPLRYVTVLTHNRILAMGLGILTKSFTTLFPFPFLVKRLPFCKGNVLHHS
:..:::::::.::.: :.::.. : .::. : .:. ...: :.:... .:.::.: :.
CCDS31 MAFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHGNALSHA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 YCLHPDLMKVACGDIHVNNIYGLLVIIFTYGMDSTFILLSYALILRAMLVIISQEQRLKA
.::: :.....: : ..:.:::: :.: : :.:: ::::::.::: ..: : :.:..:::
CCDS31 FCLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASREEQLKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LNTCMSHICAVLAFYVPIIAVSMIHRFWKSAPPVVHVMMSNVYLFVPPMLNPIIYSVKTK
::::.::::.:: :.::.:.:::.::: : :.::..:...::..::.::::.:::.::
CCDS31 LNTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPVLNPIVYSVRTK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 EIRKGILKFFHKSQA
.:: :::. :
CCDS31 QIRLGILHKFVLRRRF
300 310
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1163 init1: 1133 opt: 1135 Z-score: 806.7 bits: 157.4 E(32554): 1.3e-38
Smith-Waterman score: 1135; 52.9% identity (82.5% similar) in 308 aa overlap (2-309:6-312)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLGLNGTPFQPATLQLTGIPGIQTGLTWVALIFCILYMISIVGNLSILTLVFWEPA
:: :.. ::. :.::::.. :... .:..:..:: :: .:: .. : .
CCDS31 MTLGSLG-NSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LHQPMYYFLSMLALNDLGVSFSTLPTVISTFCFNYNHVAFNACLVQMFFIHTFSFMESGI
::.::: ::::::: :::.:. :::::.. : . ... .::..:.:::: :::.::..
CCDS31 LHEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LLAMSLDRFVAICYPLRYVTVLTHNRILAMGLGILTKSFTTLFPFPFLVKRLPFCKGNVL
::.:..:::::::.::.::..::.. : .:: : .: . .::.::..::.:.: . ::
CCDS31 LLSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 HHSYCLHPDLMKVACGDIHVNNIYGLLVIIFTYGMDSTFILLSYALILRAMLVIISQEQR
:::::: ..::.::.:...:.:::..::. : :.:: .::.:::::::..: : :. .:
CCDS31 SHSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAER
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 LKALNTCMSHICAVLAFYVPIIAVSMIHRFWKSAPPVVHVMMSNVYLFVPPMLNPIIYSV
.::::::.::::::: ::.:.:..:.:::: :.:: .:.:.:. .::. ::..:::.:::
CCDS31 FKALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 KTKEIRKGILKFFHKSQA
:::.:: . . :
CCDS31 KTKQIRDRVTHAFCY
300 310
>>CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 (342 aa)
initn: 1142 init1: 1120 opt: 1120 Z-score: 796.1 bits: 155.6 E(32554): 5.1e-38
Smith-Waterman score: 1120; 51.6% identity (81.9% similar) in 304 aa overlap (4-307:16-319)
10 20 30 40
pF1KE6 MLGLNGTPFQPATLQLTGIPGIQTGLTWVALIFCILYMISIVGNLSIL
::.: .: . : ::::... :... ::.::.... :: ::
CCDS31 MTETSLSSQCFPMSVLNNTIAEPLIFLLMGIPGLKATQYWISIPFCLLYVVAVSGNSMIL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 TLVFWEPALHQPMYYFLSMLALNDLGVSFSTLPTVISTFCFNYNHVAFNACLVQMFFIHT
.:. : .::.:::::::::. .::..:. :: :....: :. .. .:::..::::.:
CCDS31 FVVLCERSLHKPMYYFLSMLSATDLSLSLCTLSTTLGVFWFEAREINLNACIAQMFFLHG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 FSFMESGILLAMSLDRFVAICYPLRYVTVLTHNRILAMGLGILTKSFTTLFPFPFLVKRL
:.:::::.::::..::::::::::::.:.::. :: .:...: .. ....: ..::::
CCDS31 FTFMESGVLLAMAFDRFVAICYPLRYTTILTNARIAKIGMSMLIRNVAVMLPVMLFVKRL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 PFCKGNVLHHSYCLHPDLMKVACGDIHVNNIYGLLVIIFTYGMDSTFILLSYALILRAML
::.. :: :::: : ::....: : ..:.: ::.... : :.: ::::: ::.:..:
CCDS31 SFCSSMVLSHSYCYHVDLIQLSCTDNRINSILGLFALLSTTGFDCPCILLSYILIIRSVL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 VIISQEQRLKALNTCMSHICAVLAFYVPIIAVSMIHRFWKSAPPVVHVMMSNVYLFVPPM
: :.:.: ::.::: ::: :: ::.:.:..:..::. .:::: ::..:.::.:..::.
CCDS31 SIASSEERRKAFNTCTSHISAVSIFYLPLISLSLVHRYGHSAPPFVHIIMANVFLLIPPV
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE6 LNPIIYSVKTKEIRKGILKFFHKSQA
::::::::: :.:.:.:.:
CCDS31 LNPIIYSVKIKQIQKAIIKVLIQKHSKSNHQLFLIRDKAIYE
310 320 330 340
>>CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 (326 aa)
initn: 1061 init1: 1061 opt: 1080 Z-score: 768.9 bits: 150.5 E(32554): 1.7e-36
Smith-Waterman score: 1080; 48.7% identity (79.9% similar) in 314 aa overlap (1-314:12-324)
10 20 30 40
pF1KE6 MLGLNGTPFQPATLQLTGIPGIQTGLTWVALIFCILYMISIVGNLSILT
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300 310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]